科学家发现RNA甲基化识别蛋白YTHDF1的重要功能
10月25日,《自然-通讯》(Nature Communications)以YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression 为题,在线发表了中国科学院昆明动物研究所陈勇彬学科组的最新研究成果。该研究揭示了YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能和分子调控机理。 陈勇彬学科组前期与昆明动物所吴东东学科组合作,利用进化生物学的方法,筛选得到一系列青藏高原家养哺乳动物低氧适应的关键新分子,并发现许多已报道的肿瘤明星基因在高原家养哺乳动物中受到正选择,提示低氧适应新基因在低氧实体瘤中具有潜在重要功能。研究发现,YTHDF1作为m6A修饰后的RNA结合蛋白家族成员之一,在高原家养哺乳动物中低表达,而在正常肺上皮细胞中抑制其表达可以抵抗低氧诱导的细胞凋亡。深入研究发现,YTHDF1在非小细胞肺癌肿瘤组织和细胞系中均高表......阅读全文
中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构
2014年3月10日,在百年老牌杂志《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemistry)发表的一项最新研究中,中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员,报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A
说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN
华人学者Nature-Methods揭示RNA甲基化的复杂性
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m6A)是真
Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A
说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN
RNA蛋白免疫沉淀技术简介
RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合
推动癌症发展的RNA结合蛋白
最近,一项关于白血病细胞基因表达的研究,发现了一种RNA结合蛋白,在推动癌症的发展过程中起着重要的作用。该蛋白通常活跃在胎儿组织,在成年人体内是关闭的,但它在一些癌细胞中被再度活化。这种表达模式使它成为抗癌药物的一个有吸引力的靶标,因为阻断它的活动,不太可能造成严重的副作用。 这项新的研究,发
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(二)
2.4 m6A参与肿瘤免疫过程最初的文献报道,m6A甲基化通过靶向IL-7/STAT5/SOCS轴参与调控T细胞稳态。Toll样受体(TLRs)是内源性免疫系统中最保守的分子,是针对病原体的第一道防线。带有m6A甲基化修饰的RNA分子不能活化部分TLR分子,这一过程导致TLR受体不能识别包含病毒核
研究揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制
m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞
研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(一)
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(一)
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)
那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢? 首先,提取病毒RNA 无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
研究揭示叶绿体核糖体RNA甲基化修饰的机制和功能
核糖体RNA(rRNA)的甲基化修饰是生物界中普遍存在的一种转录后修饰机制,可以改变rRNA分子的局部空间结构,从而优化核糖体的蛋白翻译效率。不同物种之间的rRNA甲基化程度存在明显差别,是rRNA进化的标志性事件之一。叶绿体是高等植物中重要的细胞器,由蓝细菌经过内共生过程演化而来,具有自己的核
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(三)
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(三)上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL
RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表观遗传研究热点(一)
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和DNA甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布Nature, Cell和Science等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化
我国首次发现RNA甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟
我国科研人员在国际上首次发现脊椎动物的配子成熟需要甲基转移酶mettl3催化的m6A甲基化修饰,从而揭开了该甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟这一此前尚未为人所知的秘密。(2018(第二届)模式动物与重大疾病动物模型研究与应用研讨会) 记者13日从中国科学院水生生物研究所了解到,该所科研人员以模
抗甲基化干扰的小分子RNA芯片研究取得新进展
小分子RNA,包括siRNA(small interfering RNA)、miRNA(microRNA)、piRNA(piwi- interacting RNA)等,多次被美国《科学》杂志评为“十大科技突破”和“十大科学进展”,是当前生命科学研究的前沿热点。大量实验证据表明,这些小分子
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(四)
3. 多组学联合运用找靶点:转录组测序甲基化测序,双剑合璧 多个表达谱数据取交集找到靶基因(DOI: 10.1002/hep.29683) 甲基化数据同表达谱数据取交集(http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.02.01)1)云序生物推荐MeRIP-seq测序技
RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表观遗传研究热点(二)
那么如何检测RNA的甲基化水平呢?Epigentek推出市场上唯一一款RNA甲基化定量检测试剂盒:·EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(比色法)是一组优化的、完整的的试剂组合,可以通过比色的方法定量RNA中N6-甲基腺嘌呤(m6A)。它可以直
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(三)
随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性 如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用,我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒(OP-0002),该试剂盒可以快速提取核蛋白,同时可确保提取后的酶活性保持完整。 收集了核提取物后,进行甲
科研人员研发RNA甲基化7甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤(m7G)修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一,广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区,对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰,然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。 中国科
北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016
诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合
科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。 近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—
PLoS-Genet:何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日,北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
华中农大科研团队开发出新型植物RNA甲基化编辑工具
9月4日,华中农业大学棉花遗传改良团队在《先进科学》杂志在线发表了其最新研究成果,该团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。以往对植物中m6A功能分析研究,多数是利用遗传扰动如敲除、超表达方式进行。然而,直接增加或删除m6A系统的任何关键组分会导致植物中m6A
如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶...2
1)转移性HCC当中,METTL3调控的m6A修饰可以影响DGCR8对pri-miRNA加工过程。METTL14也可以通过调控DGCR8识别或者结合pri-miRNA的过程来影响pri-miRNA的加工成熟,实验证明METTL14的敲除会导致pri-miR126的加工停滞,成熟miR126表达量的下