SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略
大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(或已知BAC序列)进行系统分析,设计标记开发方案,后期根据前期的方案,构建SLAF-seq文库,筛选特异性长度片段进行高通量测序,将获得测序深度和质量满足要求的SLAF片段来代表目标物种的全基因组信息。它具有以下优势: 1. 高深度测序保证分型准确; 2. 简化的策略降低测序成本; 3. 前期简化方案预测保障标记数量最优; 4. 采用double index技术能适用于大群体。 在文章中,我们用水稻和大豆数据验证了SLAF-seq技术的有效性,2个结果都显示预测的和实际的结果一致性非......阅读全文
高通量组织研磨仪的设计要求
在种子检验工作中,有时候需要对植物组织(如水稻、玉米、小麦、豆子、花生等)进行研磨,如果采用传统的研磨方式,一次只能对一种样品进行研磨,速度比较慢,因此为了对其进行改进,使其更加贴近现代种子检验的要求,托普云农研发了一款专业的高通量组织研磨仪。 高通量组织研磨仪在设计的时候,充分考虑了
基因组高通量测序的原理
测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和标准M
遗传病家系的高通量测序
摘要 高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 前言 我国是一个多民族的人口大国,也是遗传病家系资源比较丰富的国家之一。遗传病家
TILLING高通量点突变筛选方法
TILLING-高通量点突变筛选方法 反向遗传学方法是功能基因组研究的重要方法。为了克服传统的基因敲除方法的局限性,TILLING(Targeting Induced Local Lesions In Genomes)技术通过化学诱变的方法产生的大量点突变个体,可以对部分功能缺失的基因及基因
高通量测序--锁定病原体“命门”
《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。“对埃博拉病毒的研究和控制是高通量测序技术(二代测序技术)全面应用的首次‘实战’。”日前,在由中国医学科学院、北京协和医学院主办的第
高通量单细胞技术获得新突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
高通量农药残留检测仪简介
高通量农药残留检测仪(прибор для обнаружения остатков пестицидов )-高通量農藥殘留檢測儀拥有24个检测通道,可以同时测试多个样品,循环检测,即放即检,每个样品由程序控制分别独立工作,不会互相干扰。农产品农药残留检测关于保证农产品安全以及顾客的健康安全具有重
如何提取土壤中的高通量核酸?
土壤是指地球表面的一层疏松的物质,由各种颗粒状矿物质、有机物质、水分、空气、微生物等组成,能生长植物。土壤微生物的数量很大,1克土壤中就含有4000~7000种近10亿个细菌。1亩地耕层土壤中,微生物的重量能达到300-3000公斤。而其中90%以上的微生物都是无法直接培养的。因此,提取土壤中的微生
llumina高通量测序平台的应用(二)
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描
llumina高通量测序平台的应用(一)
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
高通量筛选的技术进展相关介绍
我国进行药物高通量筛选的优势首先是化合物来源广泛,且多为天然;其次是对化合物生物活性的筛选目的较明确,无目的合成的化合物较少;第三,我国传统药物为筛选研究提供了一个巨大的资源库,可从中药中提取分离筛选新的化合物。这些优势为药物的高通量筛选打下了坚实基础。 我国药物高通量筛选初现规模:药物高通量
如何实现高通量的单细胞分选?
单细胞分选通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。 为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现高通量分选。 首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响激光聚焦,降低空间
使用高通量组织研磨仪的原因
样品前处理在实验分析过程中是一个既耗时又非常容易产生误差的步骤,样品处理的效果将直接影响后续分析的最终结果,因此,为了提高分析测定效率,提高测定结果的准确性及代表性,在样品研磨过程中一定要借助高通量组织研磨仪这类专业的设备才行。 因为食品样品属于复合基质体系,多含有蛋白、油脂,碳水化合物、
温室型高通量植物表型平台概述
温室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量植株(从幼苗到成熟植株即可)进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像、根系近红外成像、高光谱成像中的一种或多种,每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头,结合样品旋转装置,就可以对植株进行3D形
高通量基因分析仪相关介绍
高通量基因分析仪是一种用于预防医学与公共卫生学领域的仪器,于2013年01月04日启用。 技术指标 1、通量:有三种通量的测序芯片灵活可选,分别是50M、500M、1.5-2G,可供不同通量需求的项目灵活选择. 2、半导体测序芯片,125万个反应微孔。 3、运行速度:每轮反应2小时内可以
高通量组织研磨仪的酵母制备过程
酵母是单细胞真菌,它可以将糖发酵成酒精和二氧化碳,常被人们作为发酵剂,可用于酿造生产。为了研究酵母的品质和安全性,实验人员也会开展各种检测实验,但在此之前,实验人员会对酵母进行研磨,以便提取其中的DNA/RNA,以条形酵母为例,它是将酵母通过小孔注入到装有液体氮的气罐中压缩制成的,其研磨过
运用高通量种子研磨仪水稻叶片方法
水稻叶片研磨方法如下: 1)将离心管编号,对应编号将相应的水稻叶片截成1cm左右的小段,每个离心管中放3段,用镊子夹住中间位置,放入管底。 2)分装珠子:内侧两排装2颗5mm珠子和5颗3mm珠子;外侧两排装1颗5毫米珠子和6颗3mm珠子。 3)冷冻:将摆好的夹具(确定好内外
高通量微波消解仪的操作程序
高通量微波消解仪利用微波的穿透性和激活反应能力加热密闭容器内的试剂和样品可使制样容器内压力增加,反应温度提高。从而大大提高了反应速率,缩短样品制备的时间。并且可控制反应条件,使制样精度更高。减少对环境的污染和改善实验人员的工作环境。 高通量微波消解仪的操作程序 准备 检查所
多产学者Nature高通量技术解析RNA功能
来自斯坦福大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员研发出了一种具有某种配体亲和性,能识别RNA结构和序列作用的整体策略,这种技术的全称为RNA分子互作机械诱导捕获技术,是一种微流体系统平台,能对程序性RNA文库进行整体分析,以及功能解读。 文章的通讯作者之
用高通量免疫测序诊断病毒感染
药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上发表创新型研究论文,结果证明可提供一种潜在的新颖方法诊断慢性病毒感染。▲药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 在《Nature Genetics》上
高通量智能微波消解仪的安全分析
智能微波消解仪并非人们想象的那样轻易发生危险。智能微波消解仪的安全主要来自微波应用安全和微波辐射两个方面。微波应用安全是由仪器对反应参数的控制方式和正确性,操纵职员的操纵规范性,消解罐的材质和结构,以及发生异常时仪器所采取的主被动安全措施(包括罐体泄压,炉门缓冲,炉腔材质及厚度,炉门防护等)等综合因
让高通量的蛋白分析成为可能
抗体药物研发是目前药物研究的热点之一。在疫苗工程,治疗性抗体筛选以及糖基化研究中都会有大量的蛋白样品需要被分析。目前许多实验室仍依赖于SDS- PAGE技术,这一方法耗时耗力不说,且通量有限,而诸如CE和HPLC等方法则无法进行高通量分析,这导致了整个研究进程无法高效运行。 为了推动这
液相序列捕获系统与高通量测序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷伦寡核苷酸序列合成技术的液相序列捕获系统 – 高通量平行靶向测序的最佳解决方案来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员,利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成
高通量测序技术技术的应用及前景
高通量测序技术技术的应用及前景 (作者:生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜) 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划
高通量毛细管电泳的概念
中文名称高通量毛细管电泳英文名称high throughput capillary electrophoresis定 义可同时进行多个通道(如96通道)的毛细管电泳,并配以自动上样、激光检测和数据处理等系统。可用于DNA自动测序等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
高通量芯片式分析仪相关叙述
技术指标 1. 离子源是是密闭的,与外界环境隔离,与传统的敞开式Nano离子源相比,可有效避免环境带来的背景离子; 2. 质量范围: 2-2,000 amu; 3. 分辨率: 2.5M (半峰宽≤0.4Da); 4. ESI正离子1pg利血平柱上进样,m/z609-195,信噪比≥300
高通量组织研磨仪研磨玉米叶片实验
现在可能还有很多人对高通量组织研磨仪并不是很了解,为了方便的大家的操作,托普云农的技术人员也专门对玉米叶片进行了研磨实验,其中的操作步骤和试验结果都说的非常详细,相信大家在看了以后,一定会有所提升的。 我们都知道,批量研磨玉米叶片,能为后续提取核酸,进行遗传或生理生化指标分析实验带去很大便
高通量组织研磨仪的使用方说明
高通量组织研磨仪是通过碳化钨小球或不锈钢小珠在样品管内来回震荡实现样本的粉碎、混合、均化以及细胞破碎等,可以对硬性、软性、弹性等样品进行快速的粉碎和均相化处理,符合理化分析实验室的要求,配置不同体积、不同材料的研磨罐,可以进行干磨、湿磨及冷冻研磨,也可以进行细胞破碎和DNA/RNA提取,在农业、生物
如何用FFPE组织样品进行高通量检测?
福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的样品代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,如何从这些样品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技术有限公司针对FFPE样品的高通量分析,建立了整套的SOP 标准解决方案,帮助广
高通量研磨破碎古植物岩石样本
古植物学研究中很关键的一环,便是通过对古植物样本,即植物分类学的研究及植物系统分类的建立。因为地质历史时期有不少已绝灭的类别,必须把它们与现存的植物统一考虑,才能建立科学的分类体系,反映各类植物间的系统关系。最早曾被分为菌藻植物、苔藓植物、蕨类植物、种子植物四个门,以后随着植物学、古植物学研究的深入