SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略
大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(或已知BAC序列)进行系统分析,设计标记开发方案,后期根据前期的方案,构建SLAF-seq文库,筛选特异性长度片段进行高通量测序,将获得测序深度和质量满足要求的SLAF片段来代表目标物种的全基因组信息。它具有以下优势: 1. 高深度测序保证分型准确; 2. 简化的策略降低测序成本; 3. 前期简化方案预测保障标记数量最优; 4. 采用double index技术能适用于大群体。 在文章中,我们用水稻和大豆数据验证了SLAF-seq技术的有效性,2个结果都显示预测的和实际的结果一致性非......阅读全文
高通量组织gDNA提取实践手册
Part 1 —— 前 言 | 组织gDNA提取和纯化是分子生物学的基本实验技术,其原理和操作绝大数生物学相关的研究人员都有接触。困扰实验人员的是当样本量过大时,以1.5ml离心管为基本体系的组织核苷酸提取模式,同时操作20个以上的样品有非常繁琐的实验过程和样品间有错乱或者交叉污染的风险,此篇笔者介
关于高通量测序的基本介绍
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),或大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)。区别于传统Sanger(双脱氧法)测
waters高通量药物开发_英文
用Quattro Micro做,OpenAccess QuanOptimise allows rapid and easy optimisation and method development. From the initial stages of tuning solutions to the
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
高通量细胞分析产品推荐
生化药物筛选虽然十多年前就已经规范化了,但药物疗效并不是总能实现预期效果的。在试管中看起来效果不错的靶标,在动物或者人类试验中却结果不佳,这一部分是由于毒性的问题,另外一部分则是由于药物在体内被处理的过程,与在单纯化学相互作用环境中的不同。科学家们希望能通过以细胞为基础的分析方法,来进行药物研发
简述高通量筛选的性能特点
高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测,工作枯燥,步骤单一,操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势,它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程,编程过程简洁明了。
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
高通量测序(NGS)的原理简介
高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch
高通量的转录因子活性检测
转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不
高通量微波消解仪怎么选?
微波消解大不同:高通量微波消解仪怎么选当前,环境安全检测和食品安全检测中应用广的就是高通量微波消解仪。所谓“高通量”,是指批处理量≥40个,其所用消解罐的罐体结构及客户做样情况和对设备安全性的要求,都与只有十几个或者几个消解罐的“超高压微波消解仪”存在差异!简单来说,至少有以下几点:1、“高通量微波
高通量核酸提取组合方案(二)
标准组件已经可以完成核酸分离纯化过程,可进行全血,血清的核酸提取以及PCR产物纯化。各种选用组件主要用于各种不同来源材料的前处理过程。以全血DNA提取为例,介绍提取过程以及过程中每个组件的功能: 1. 血样从采血管手动转移到96孔盘:这步操作最为复杂,一方面采血管的规格不同于96孔盘,另
现代高通量筛选,更快……更小?更弱?
Citius -Altius – Fortius! 更快、更高、更强,这是现代奥林匹克运动的追求和理想 ,而现代高通量筛选(High Throughput Screening,简称HTS)所追求的是:更快、但却更小、甚至更弱。 先前我讲到,1990年代末的组合化学没能给新药研发带来足够的多
OilPrep-8实现高通量样品制备
润滑油中磨损金属的分析,能够延长更换液体的寿命,最大限度地减少意外操作时间,确定零件损坏或即将发生的故障,并减少环境废物的产生。应用高通量 OilPrepTM8油稀释装置制备的样品,ICP-AES分析的结果与手动制备的结果相同,且经石油样品和认证双盲的参考标样进行了确定。方法可靠且重复
高通量测序技术核酸片段分选
近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量
高通量测序技术及原理介绍
高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成
药物高通量筛选技术的研究
药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。 ■发展中的高通量筛选技术 高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、
高通量测序的技术应用的介绍
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测
关于高通量测序的内容简介
高通量测序已经成为一种常规的实验技术,不过最近新一代测序技术的显著优势,比如大规模平行信号(MPSS, Brenner et al.2000)和焦磷酸测序法(也称454测序; Margulies et al.2005, Langaee and ronaghi2005)已经使测序技术发生了彻底的变
高通量测序--锁定病原体“命门”
《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。“对埃博拉病毒的研究和控制是高通量测序技术(二代测序技术)全面应用的首次‘实战’。”日前,在由中国医学科学院、北京协和医学院主办的第
高通量智能微波消解仪的特点
功能特点仪器采用微波非脉冲连续自动变频控制,延长了仪器的使用寿命和电磁波的均匀性,腔体采用66L大容积316L不锈钢腔体材料特制而成,自锁式缓冲防爆炉门,当反应异常时,缓冲结构确保操作人员人身安全和炉门结构完整无损,炉门和腔体结合紧密,微波泄漏符合国家标准。仪器采用温、压双控系统对消解实验的压力和温
感染病原高通量基因检测意义
高通量基因测序检查技术优点,能对临床上未知病原体筛查,避免临床上对许多疾病的未知因素检查效果,以及未知...
高通量平行合成仪的相关介绍
简介 高通量平行合成仪是专为精细化工等行业研发设计的组合化学和多产品合成设备。该产品按反应板温度区域数量不同分为单区反应和多区反应;按多区反应板功能不同可分为加热型、加热/冷却型、回流型;按试管容量不同及试管的装载数量不同又可分成多个品种规格。 产品特点 1.多温度区反应模块各带独立的循环
关于高通量测序的技术应用介绍
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重
高通量基因分析仪相关介绍
高通量基因分析仪是一种用于预防医学与公共卫生学领域的仪器,于2013年01月04日启用。 技术指标 1、通量:有三种通量的测序芯片灵活可选,分别是50M、500M、1.5-2G,可供不同通量需求的项目灵活选择. 2、半导体测序芯片,125万个反应微孔。 3、运行速度:每轮反应2小时内可以
高通量农药残留检测仪介绍
农药残留现在已经造成比较严重的社会影响,不光对人的身体健康有比较大的伤害,还对农产品的出口也造成严重的影响和掣肘,因为国际社会对农药残留的检查和标准非常严格,我们有不少农产品因为农药残留超标的问题已经被阻拦,对农业生产的经济影响是很大的,所以需要对农药残留的问题重视起来,加强对农药残留的检测,保
关于高通量筛选的基本-应用介绍
1、充分利用药用资源 由于高通量筛选依赖数量庞大的样品库,实现了药物筛选的规模化,较大限度地利用了药用物质资源,提高了药物发现的几率,同时提高了发现新药的质量。 2、微量筛选系统 由于高通量筛选采用的是细胞、分子水平的筛选模型. 样品用量一般在微克级(μg),节省了样品资源,奠定了“一药多
如何提取土壤中的高通量核酸?
土壤是指地球表面的一层疏松的物质,由各种颗粒状矿物质、有机物质、水分、空气、微生物等组成,能生长植物。土壤微生物的数量很大,1克土壤中就含有4000~7000种近10亿个细菌。1亩地耕层土壤中,微生物的重量能达到300-3000公斤。而其中90%以上的微生物都是无法直接培养的。因此,提取土壤中的微生
llumina高通量测序平台的应用(二)
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描
高通量测序-锁定病原体“命门”
病原体能使人类群体性致病甚至致死,为追本溯源,找到变异基因作为有效靶点,科学家们在迎战埃博拉病毒的过程中取得突破。 《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。 “对埃博拉病毒
使用高通量组织研磨仪的原因
样品前处理在实验分析过程中是一个既耗时又非常容易产生误差的步骤,样品处理的效果将直接影响后续分析的最终结果,因此,为了提高分析测定效率,提高测定结果的准确性及代表性,在样品研磨过程中一定要借助高通量组织研磨仪这类专业的设备才行。 因为食品样品属于复合基质体系,多含有蛋白、油脂,碳水化合物、