如何寻找转录起始位点

一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的长度为引物的标记的核苷酸到RNA-5`末端间的碱基数,所得cDNA的量和目的RNA的起始量成正比。理想的引物是ssDNA,长度为20-40个核苷酸,与要分析的转录产物的5`末端区域互补。延伸产物小于150个核苷酸,可得到最佳分离效果。引物延伸实验非常灵敏,可检测2 pg的转录产物,这相当于1个细胞中的1个RNA。引物延伸实验非常适合于对单个基因作定量和定性分析。 1. 引物延伸分析所用试剂:引物延伸实验需要模板RNA,可用总RNA或poly(A)+RNA。一个特异的末端标......阅读全文

起始复合体

中文名起始复合体外文名pre-replicative complex 2(PRC2)定义DNA复制起点的引发体,亦称为起始复合体。在DNA复制起点(简写为ori)形成。作用即为启动DNA复制。

什么是起始因子?

起始因子(英语:Initiation factors)是指翻译起始阶段端结合到核糖体小亚基上的一些蛋白质,翻译是蛋白质生物合成中的一部分。

第六篇Science,复旦上医团队系统描绘转录起始连续动态全过程

  2023年12月22日,复旦上医徐彦辉团队在《科学》(Science)杂志上在线发表题为“Structural visualization of transcription initiation in action”的研究长文(Research Article)。该项研究首次用结构重现出了转录从

徐彦辉组揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装机制

   4月1日,《科学》在线发表了复旦大学生物医学研究院研究员徐彦辉课题组的一篇研究长文,首次报道了包含TFIID的完整转录前起始复合物(PIC)结构,揭示了PIC如何识别不同类型启动子并完成多步组装的完整动态过程。  “徐彦辉团队在《科学》发表的论文中,解析了25种复合物冷冻电镜结构,涵盖了不同P

中和热的起始温度

关于量HCl和NaOH溶液的起始温度“t1/℃”①不能以空气的温度去代替酸碱溶液的温度;也不能以水的温度去代替酸碱溶液的温度,因为空气、水和溶液(这里是酸碱)的温度是有差别的,会明显影响实验结果。②为了使NaOH和HCl溶液的温度稳定,最好是把配成的溶液过夜后使用。③最好不求HCl和NaOH两种溶液

真核生物起始因子

中文名称真核生物起始因子英文名称eukaryotic initiation factor定  义参与真核生物的蛋白质合成起始作用的蛋白质因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

起始因子的功能介绍

起始因子(英语:Initiation factors)是指翻译起始阶段端结合到核糖体小亚基上的一些蛋白质,翻译是蛋白质生物合成中的一部分。

细胞化学词汇起始tRNA

起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使

“起始密码子”的功能

“起始密码子”的功能并不是“使翻译开始”,而是“定位翻译开始位置的信号标记”。“起始密码子”编码氨基酸,而“终止密码子”不编码氨基酸。

前后引物的起始位置要求

你用扩增的引物测序的话,最好是双向测序,或者,重新合成引物进行测序会比较好.测序引物的纯化要求较高,而且引物片段不能大于20多个bp.因为在引物下游几十个bp左右,测序的结果是不稳定的,往往测不出,需要几十个bp之后才稳定.你再看看你送的是质粒还是pcr产物,如果是质粒,就可以看看外源片段的上游有什

真核起始因子的介绍

  真核起始因子(英文:eukaryotic initiation factor,简称为eIF),又称为真核翻译起始因子,是指参与真核翻译起始这一过程的蛋白质。与原核起始因子只有三种(IF1、IF2、IF3)相比,真核起始因子种类多且复杂,已鉴定的真核起始因子共有12种。通过这些真核起始因子之间以及

起始tRNA-的基本信息

起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使

简述真核细胞翻译起始过程

  A. 核糖体的前期准备  (1)eIF1,3,5围绕E位点结合至小亚基,eIF1A围绕A位点结合至小亚基;  (2)eIF2·GTP在胞质中结合Met-tRNA形成三原复合物;  (3)三原复合物进一步结合到小亚基复合物(小亚基以及eIF1,1A,3,5)中小亚基P位点上形成43S复合物;  B

酸式滴定管起始读数怎么读起始读数在0刻度以下

因为酸式滴定管和碱式滴定管的零刻度线在上方,越往下走读数越大。所以要从上至下开始读数。而其它仪器零刻度线一般在下方,越往上走,读数越大,所以要从下至上开始读数。常量分析用的滴定管有50mL及25mL等几种规格,它们的最小分度值为0.1mL,读数可估计到0.01mL。此外,还有容积为10mL,5mL,

起始密码子的运作原理

AUG是起始密码子,也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上.也就是说,甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码.但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。根

类器官培养的起始细胞来源

类器官培养的起始细胞群一般从成人或胎儿组织活检样本中获得,肿瘤组织也可类似处理以分离肿瘤细胞来培养类器官。此外,从外周血、腹水和胸腔积液等液体样本中分离的肿瘤细胞也可作为起始材料。对于肿瘤衍生类器官,需要解决癌细胞和正常细胞共存的问题,可利用培养条件,通过使用选择性培养基来实现。

真核起始因子的相关疾病

  已知的真核起始因子中,eIF2B与人类遗传病的关系最为密切。eIF2B的五个亚基基因的常染色体遗传性隐性突变会导致白质异常,在临床上表现为一系列严重的连续症状,称为“eIF2B相关紊乱”。典型的如脑白质病,即白质消失(vanishing white matter,VWM)和卵巢衰竭(ovaria

起始复合物的结构功能

由一个mRNA、一个接合子mRNA的特定位点(RBS;核糖体结合位点)的30s核糖体亚基和一个与起始密码子相互作用的N-甲酰甲硫氨酸tRNA相结合而成。某些蛋白质(起始因子)也为起始复合物贡献信息,然后被快速释放。

起始tRNA-的结构和功能特点

起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使

脂肪酸合成的起始原料

脂肪酸合成的起始原料是乙酰coa,它主要来自糖酵解产物丙酮酸,脂肪酸的合成是在胞液中。先说说饱和脂肪酸的合成:1.乙酰辅酶a的转运:脂肪酸的合成是在胞液中,而乙酰coa是在线粒体内,它们不能穿过线粒体内膜,需通过转运机制进入胞液。三羧酸循环中的柠檬酸可穿过线粒体膜进入胞液,然后在柠檬酸裂解酶的作用下

什么是上游起始密码子?

约50%的智人(Homo Sapiens)基因带有上游起始密码子(上游AUG)。尽管真核细胞每条mRNA只表达一个蛋白,但其依然可以带有多个上游可读框和上游AUG,只是其并不翻译产生具有生物学意义的蛋白。理论上,真核细胞会翻译其mRNA上游到下游扫描遇到的第一个AUG,并且在翻译完成后解离。这意味着

原核细胞的翻译起始过程介绍

  (1)翻译起始因子IF3结合到小亚基的E位点,同时也横跨至P位点;(这一过程在起始之初就已经完成)起始因子IF1结合至A位点;  (2)起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位点;  (3)起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密码子AUG招募,另一方面被已经结合到P位点的IF2·G

RNA复制、转录与逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA的转录和逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

转录图谱的转录图谱的意义

在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D

关于基因转录的转录因子介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

起始点识别复合体的定义

中文名称起始点识别复合体英文名称origin recognition complex;ORC定  义在真核细胞染色体复制起点上与DNA结合,为DNA复制起始所必需的多亚基的蛋白质复合体。为蛋白质相互间作用提供了位点。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

cDNA文库注意获得起始RNA的介绍

  构建cDNA文库要求的RNA量比做RACE和Northern blot的要多,在材料允许的情况下一般的试剂盒均推荐采用纯化总mRNA后进行反转录,这比直接采用总RNA进行反转录而构建的cDNA文库好,虽然后者也并不是不能做。老版本CLONTECH的SMART 4的中级柱子要求纯化后的总mRNA量

简述起始密码子的动作原理

  AUG是起始密码子,也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上.也就是说,甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码.但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多

起始密码子的概念和特点

起始密码子,信使RNA(mRNA)的开放阅读框架区中,每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸,这种存在于mRNA开放阅读框架区的三联体形式的核苷酸序列称为密码子(codon)。由A、U、C、G四种核苷酸可组成64个密码子,其中有61个密码子可编码氨基酸。AUG既编码甲硫氨酸,又作为多肽链合成的起始