plosbiology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS Biology》上发表文章，指出RNA-seq技术产生的数据经常出现技术偏差，进而导致错误的结论。 通过分析数十个可公开获得的，针对细胞对多种不同压力的反应的RNA-seq数据集合， Mandelbaum及其同事注意到，长度过短或过长的基因集合反复显示出表达水平的变化。(图片来源：Www.pixabay.com) 作者对此感到困惑，然后试图搞清楚这一现象背后究竟是真实的生物学反应，还是实验过程引入的人为误差。为了解决这个问题，他们比较了相同生物学条件下的重复批次的样本。重复样品之间基因表达的差异可以反映与生物学因素无关的技术性影响......阅读全文
差异基因表达的定义
中文名称差异基因表达英文名称differential gene express定 义在细胞分化过程中某些奢侈基因表达的结果生成一种类型的分化细胞，另一组奢侈基因表达的结果导致出现另一类型的分化细胞的现象。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞分化与发育（二级学科）
为什么有些基因高表达？
在我们的细胞中，DNA被折叠成数百万个小数据包，就像一根线上的珠子，使我们2米长的线性基因基因组，能够纳入一个直径只有约0.01毫米的细胞核中。然而，这些分子珠子，称为核小体，使DNA变得“不可读”。 因此，它们需要暂时无家可归，让基因被复制（转录）到用来制造蛋白质的信息中。细胞如何确保适当的接
基因表达的调控模式介绍
转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调
痘苗病毒系统基因表达实验
实验方法原理 本方案从构建外源基因位于 PT7 和 T7 终止子之间的质粒载体开始，然后用重组质粒通过脂质体介导转染已经被vTF7-3（可以持续表达T7 RNA聚合酶的痘苗病毒）感染的细胞。收获后，基因产物在细胞内的表达可以用脉冲标记的方法或用「重组痘苗病毒及其产物的鉴定实验」中叙述的方法分
关于基因表达的概念简介
基因表达（gene expression）是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质，所有已知的生命，都利用基因表达来合成生命的大分子。 基因表达产物通常是蛋白质，但是非蛋白质编码基因如转移RNA（tRNA）或小核RNA（snRNA）基因的表达产物是功能性RNA
基因表达快速分析新技术
实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16～20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分
基因表达的转录机制介绍
转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转录本序列的
表达谱基因芯片实验
表达谱基因芯片可应用于：（1）疾病诊断；（2）新药开发；（3）环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下，载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号
研究称环境影响基因表达
随环境改变“脾气”的小蜜蜂 几年前，美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授，请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨，但后者却在领地防御上厉害很多。 鲁滨逊
基因表达调控定义是什么
基因表达调控的意义一方面是使生物体适应环境的不断变化，维持其生存的需要。从低等生物到人体各种生物在处于环境变化，如营养、温度、渗透压改变时，能够对环境信号作出反应，改变各种自身基因表达速率，调整体内参与相应功能的蛋白质的种类、数量，改变代谢状况／-以适应环境需要。另一方面是保证多细胞生物进行正常地分
基因表达过程中哪些因素与基因表达组织特异性有关
基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中，把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译，转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中，奢侈基因按一定顺序表
基因组中表达基因的类型介绍
基因组中表达的基因分为两类：⑴一类是维持细胞基本生命活动所必须的，称管家基因（house keeping gene），如各种组蛋白基因；⑵另一类是指导合成组织特异性蛋白的基因，对分化有重要影响，称奢侈基因（luxury gene），即组织特异性(tissue-specific gene)表达的基因，
PLoS推出新期刊《PLoS趋势—灾害》
3月27日，美国公共科学图书馆(PLoS)在官方博客发布公告，宣布推出了一份新的学术类开放获取期刊——《PLoS趋势—灾害》(PLoS Currents: Disasters)。 PLoS在公告中表示，及时、方便地获取最新研究信息非常重要，尤其是在灾害研究领域;因为这些信息传播的速度事
科学家整合多种遗传操作技术构建新型家蚕性别调控体系
8月13日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所谭安江研究组等在《美国国家科学院院刊》上发表了题为Silkworm genetic sexing through W chromosome-linked, targeted gene integration的研究论文，报道了整合多
PLoS质疑“食物基因可进入血液”的研究发现
一项研究指出食物中的基因能完整通过饮食传入到我们身体血液中，这一发现引发了众多争议，近期来自密歇根大学的一位分子生物学家重新审核了这一有争议的研究论文的数据，发现实验室中存在的污染物可能可以解释这一备受关注的研究发现。 Richard Lusk表示，他的这项发现强调了实验室样品污染这一此前被低
PLoS－ONE：AMPK基因突变导致肌肉糖原增加
可能用于II型糖尿病治疗 一个由Mary-Ellen Harper、Robert Dent和Ruth McPherson博士领导的渥太华研究组联合来自美国加州伯克力的研究人员对AMPK（腺苷单磷酸活化蛋白激酶）基因进行了深入研究。这种酶控制着我们细胞中的能量数量。在两个没有亲缘关系的家族中的成员细
PLoS－Genet：关键基因突变导致猛犸象灭绝
在4000多年前，地球上仅存的最后一群猛犸象在西伯利亚背部的小岛上备受寒冷的折磨，这也许就是这一物种在地球上的最后一段时光了。看上去似乎大自然对这一曾经辉煌的物种十分的残忍。 最近一项研究发现，随着猛犸象种群数量的减少，它们的基因组也发生了螺旋式的“溶解”，越来越多的关键基因的突变加速了这一物
PLoS－Pathog：基因编辑的干细胞有望消除HIV！
使用基因编辑的骨髓干细胞可以显著降低感染猴/人免疫缺陷病毒（SHIV）的猪尾猕猴休眠的“病毒水库”的大小，来自福瑞德哈金森肿瘤研究中心的Christopher Peterson及其同事在《PLOS Pathogens》上发表了这项最新研究。图片来源：Grace Choi 2007年，HIV阳性
Chemical－Genomics－Approaches－in－Plant－Biology
Chemical genomics (i.e., genomics-scale chemical genetics) approaches are based on the ability of low-molecular-mass molecules to modify biologica
基因表达量变化差值是什么
差值是△CT，即是相对于某个内参基因的相对表达量，而不是绝对表达量；在此基础上再进行比值，即△△CT，是（某两个处理之间的）差异表达倍数。
多药抗药基因的表达实验
实验方法原理 大多MDR细胞膜上出现MDR-1基因及其基因产物P-糖蛋白过度表达。实验材料 RNA试剂、试剂盒 PBS氯仿异丙醇萘酸异硫氰酸肽十二烷基肌酸钠构橼酸钠乙酸钠二疏基乙醇乙醇Taq酶仪器、耗材 离心机紫外分光光度计琼脂糖凝胶电泳PCR仪实验步骤 一、细胞总RNA提取1. 收集约5×107
转基因动物表达系统组成
转基因动物表达系统，包括外源基因、表达载体和受体细胞等，基因组的转移则是细胞核移植和动物克隆技术，人工合成与设计基因、全基因乃至基因组的转基因技术是合成生物学。
真核基因表达载体的构建
提高目的基因在哺乳动物细胞中表达的策略：1、DNA水平：增加基因拷贝数(1)高拷贝载体；（2）基因共扩增；2、转录水平：利用强启动子、增强子，可诱导启动子，如CMV、Tet；3、翻译水平：优化翻译起始序列和非编码区序列。本篇文章来源于网络，如有异议请联系我们，我们将在3个工作日内作出处理。
测定线粒体基因表达怎么做
亲缘鉴定是否可以用线粒体？首先你要知道什么是线粒体，其次你要了解线粒体是怎么遗传的，应该初中就会讲。那么结论是线粒体用于母系。。。就是外孙女－妈妈－外婆－外婆的妈妈。只要来自同一个母亲就可以用。但是线粒体的检测目前没有一个标准，就是所选取的检测区域存在者争议，所以可以做为一个参考。
基因表达系列分析的原理简介
第一、一个9～10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息，能够唯一确认一种转录物。例如，一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物（49），而人类基因组估计仅能编码80000种转录物，所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。 第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行
小鼠βactin基因的克隆表达（2）
实验步骤： （1）目的基因与表达载体的连接反应： ①表达载体和目的片段的酶切 管号 ① ② pGEX 4T-1
RSV感染的基因表达谱分析
发表在11月12日的PLOS Medicine杂志上的一项研究，采用全血基因表达谱分析估测了儿童RSV感染的发病机制和疾病严重程度，揭示了在儿童中由RSV感染引起的免疫反应的系统学调节异常，表明分子标记能够用来预测疾病的严重程度。 呼吸道合胞体病毒(RSV，Respiratory sy
基因表达RNA加工的机制介绍
原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA（mRNA）,但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本（pre-mRNA）,必须经过一系列加工才能成为成熟RNA（mRNA）。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中
单个脑细胞的基因表达谱
科研人员报告了一种根据基因表达谱为人类大脑的单个细胞分类的方法。人类大脑含有许多种类的细胞，它们的基因表达模式有差别。此前为这些细胞类型分类的方法一直限于使用几个基因或蛋白质标记物以及分析整个细胞群。Stephen Quake及其同事使用单细胞RNA测序分析了来自人类大脑组织的466个个体细胞的
单纯物理力就能激活基因表达
美国伊利诺伊大学的一项新研究发现，生物学相关力——相当于通过呼吸、运动或发声施加在人体细胞上的力就能激活基因表达蛋白质。 “力可以激活基因，不需要中间产物，也不需要细胞质中的酶或信号分子，”领导这项研究的机械科学与工程教授Ning Wang说。“我们还发现了为什么有些基因可以被‘武力’激活，而