plosbiology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS Biology》上发表文章，指出RNA-seq技术产生的数据经常出现技术偏差，进而导致错误的结论。 通过分析数十个可公开获得的，针对细胞对多种不同压力的反应的RNA-seq数据集合， Mandelbaum及其同事注意到，长度过短或过长的基因集合反复显示出表达水平的变化。(图片来源：Www.pixabay.com) 作者对此感到困惑，然后试图搞清楚这一现象背后究竟是真实的生物学反应，还是实验过程引入的人为误差。为了解决这个问题，他们比较了相同生物学条件下的重复批次的样本。重复样品之间基因表达的差异可以反映与生物学因素无关的技术性影响......阅读全文
胀泡与基因表达
在个体发育的某个阶段或某些化学物质的诱发下，多线染色体的某些带纹变得疏松膨大而形成胀泡。最大的胀泡叫做巴尔比安尼氏环。胀泡是基因转录和翻译的形态学标志，在这里DNA解旋呈开放环，RNA的合成很活跃；核糖体排列成多聚核糖体长链，多肽链的长度有一个梯度，甚至还可观察到从巴尔比安尼环上新合成的蛋白质分泌颗
基因表达调控的概念
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制，使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态，并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行，包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。
基因表达调控主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面：①转录水平上的调控；②mRNA加工、成熟水平上的调控；③翻译水平上的调控；
基因表达的系列分析
中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
基因超表达的概念
超表达是指目的基因的全长序列与高活性组成型启动子或组织特异性启动子融合，通过转化，获得该基因产物大量积累的植株。
科学家通过改变精子速度选择后代的性别！
如果你想要一个女婴，那就不要在离排卵太近的时候做爱。因为有一个这样的故事：带有Y染色体的精子--携带这些染色体的婴儿为男性--游动得更快，所以如果精子要经过很长的一段路才能到达卵子，那么你就有更高的机会生男孩。这个想法没有科学价值，但研究人员现在发现了一种方法，可以在老鼠身上实现这个想法。图片来
欧洲学者：基因表达尚“表达”不了死者死亡时间
最近，英国《自然·通讯》杂志发表文章称，欧洲科学家根据生物库的数据分析表明，死亡引起的不同组织的基因表达变化，将可用于估计死者的死亡时间。该消息引发公众广泛关注。图片来源于网络 在刑侦领域，死亡时间的确定是破案最重要的线索之一，围绕它展开的相关研究一直没有停止。但是，现实没有我们想得那么乐观。
PLoS－Biol：父亲的基因竟会影响母爱行为
父亲的基因或许并不再仅仅被认为能为后代提供生长和发育的“蓝图”了，近日，一项刊登在国际杂志PLoS Biology上的研究报告中，来自卡迪夫大学的科学家们通过研究发现，父亲的基因或许还能影响后代出生前后被照顾的类型。图片来源：dailymail.co.uk 研究人员一直在调查女性怀孕期间胎盘所
PLoS－Genet：天然基因差异如何影响心脏健康
心血管疾病的最大风险是吸烟和不良的饮食习惯。然而，不同的人更容易受到心脏病的影响，这是基于他们基因的微小差异，即变异。虽然已经有许多研究将变异与心血管特征联系起来，但目前还不清楚这些变异是否具有功能后果，比如基因或蛋白质表达的改变。在托马斯杰斐逊大学(Thomas Jefferson Unive
Cell：基因表达分析的反思
在最新一期（10月26日）的《细胞》（Cell）杂志上，来自怀特黑德研究所的研究人员报告称在生成和注释来自全基因表达（global gene expression）分析的数据时所采用的一种常用假设可以造成当前广泛的生物学研究中关于基因活性与细胞行为的结论出现严重错误。 怀特黑德研究所成员Richa
Nature揭开基因表达的秘密
你的DNA不止控制了你的眼睛是什么颜色，是否可以卷起你的舌头。你的基因中包含了生成所有蛋白质的指令，细胞时时需要蛋白质来维持你的生存。然而直到现在，这一过程在分子水平上运作的一些关键方面仍然是难解的谜。 利用低温电子显微镜(cryo-EM)，劳伦斯伯克利国家实验室的科学家Eva Nogales
为什么有些基因高表达？
在我们的细胞中，DNA被折叠成数百万个小数据包，就像一根线上的珠子，使我们2米长的线性基因基因组，能够纳入一个直径只有约0.01毫米的细胞核中。然而，这些分子珠子，称为核小体，使DNA变得“不可读”。 因此，它们需要暂时无家可归，让基因被复制（转录）到用来制造蛋白质的信息中。细胞如何确保适当的接
PNAS：昼夜节律基因表达
一项研究发现，昼夜节律钟对基因转录的节奏影响可能比此前认为的更加广泛。昼夜节律钟驱动着包括睡眠、体温和激素水平在内的生物过程，研究提示这些过程可能是受到昼夜节律控制的基因转录的调控。 John B. Hogenesch及其同事使用RNA测序以及DNA微阵列确定这种昼夜节律钟调控着小鼠器官的有节
研究称环境影响基因表达
随环境改变“脾气”的小蜜蜂 几年前，美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授，请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨，但后者却在领地防御上厉害很多。 鲁滨逊
基因表达－RTPCR之我见
本文讨论的范围包括RNA酶保护分析，northernblot，原位杂交，半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不谈具体protocol，是因为各种书籍和kit说明书上都有，主要说一些原则，而且大部分是失败和成功的经验，还有小组讨论结果以及各种书里七零八落看的内容，希望对大家有用。基因表达的定义
基因表达快速分析新技术
实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16～20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分
TLP基因的表达模式分析
实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析，为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析 1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后，用液氮速冻，以保证RNA不被降解，然后冻存于-70
表达谱基因芯片实验
表达谱基因芯片可应用于：（1）疾病诊断；（2）新药开发；（3）环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下，载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号
基因表达系列分析实验（SAGE）
实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心
基因表达的系列分析实验
实验材料 玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 一、一般原则若用于 SAGE 的 RNA 有足够的量，最好用 2.5~5 ug polyA+RNA, 可按实验方案 A 进行。这里我们还提供了实验方案 B，它在多
痘苗病毒系统基因表达实验
实验方法原理 本方案从构建外源基因位于 PT7 和 T7 终止子之间的质粒载体开始，然后用重组质粒通过脂质体介导转染已经被vTF7-3（可以持续表达T7 RNA聚合酶的痘苗病毒）感染的细胞。收获后，基因产物在细胞内的表达可以用脉冲标记的方法或用「重组痘苗病毒及其产物的鉴定实验」中叙述的方法分
痘苗病毒系统基因表达实验
重组痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂质体转染 两种重组痘苗病毒共感染细胞 实验方法原理 本方案从构建外源基因位于 PT7 和 T7 终止子之间的质
基因表达的系列分析实验
实验材料 玻璃及塑料器皿 试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物
基因表达的系列分析实验
SAGE(Velculescuetal.1995) 是基于 PCR 技术的一种高灵敏度研究基因表达的方法，可得到 mRNA 文库的定性及定量信息。自 1995 年此技术产生以来，发表了大量的相关文章，表明 SAGE 可同时检测大量基因的表达水平的变化。实验材料玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒溶液与缓冲液引
基因表达差异分析方法进展
高等真核生物的基因组一般具有80 000～100 000个基因，而每一个细胞大约只表达其中的15%［1］。基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性表达决定了生命活动的多样性，如发育与分化、衰老与死亡、内环境稳定、细胞周期调控等。比较细胞间基因表达的差异为我们揭示生命活动的规律提供了依据。
调节基因表达与否的开关
研究学者发现一种特殊的分子结构，这种分子结构起着开关的作用，可以调节基因的表达和关闭。这一发现发表在10月份第21期“Cell”杂志上。 近年来，分子生物学中的一个重要发现，即基因表达的开放或激活、关闭或抑制是如何被调节的。这一机制与人类的疾病（如调节细胞生长基因的不适当激活或抑制是癌症
外源基因的诱导表达
1．目的了解外源基因在原核细胞中表达的特点和方法。2．原理外源基因克隆在含有lac启动子的表达系统中。先让宿主菌生长，lac I产生的阻遏蛋白与lac操纵基因结合抑制下游的外源基因转录。向培养基中加入诱导物IPTG（异丙基硫代-b-D-半乳糖），解除抑制使外源基因大量表达。表达的蛋白可经SDS-
基因表达调控定义是什么
基因表达调控的意义一方面是使生物体适应环境的不断变化，维持其生存的需要。从低等生物到人体各种生物在处于环境变化，如营养、温度、渗透压改变时，能够对环境信号作出反应，改变各种自身基因表达速率，调整体内参与相应功能的蛋白质的种类、数量，改变代谢状况／-以适应环境需要。另一方面是保证多细胞生物进行正常地分
基因表达调控的主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面：①转录水平上的调控；②mRNA加工、成熟水平上的调控；③翻译水平上的调控；
个体基因表达度的概念
中文名称表达度英文名称expressivity定 义个体基因表达的变化程度。同一基因型的不同个体在性状或疾病的表现程度上的差异。可以因环境因子的差异、其他基因的影响或者个体遗传背景的不同等引起。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）