揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献

DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息,DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发,也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异,这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日,华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中的DNA甲基化变异,揭示了DNA甲基化变异的遗传基础以及DNA甲基化变异与基因表达和表型的关联。该成果发表在开放获取期刊Genome Biology 上。 近年来,高通量测序技术和基因型检测技术的发展极大促进了作物遗传改良,育种家可以根据大量的SNP数据建立模型,预测表型和进行基因组选择,这一做法的前提是性状变异由DNA序列变异(SNP)决定。但是,对于很多性状,DNA序列变异通常只能解释部分的遗传力,仍有相当一部分遗传力无法被解释,许多学者将这种现象称为“消失的遗传力”,如何寻找并利用这部分遗传力是遗传学家和育种学家面临的一个重大......阅读全文

哺乳类动物的DNA甲基化特点

哺乳类动物一生中DNA甲基化水平有着显著变化:在受精卵最初几次卵裂中,去甲基化酶清除DNA分子上几乎所有从亲代遗传下来的甲基化标记;在胚胎植入子宫时,一种新的甲基化遍布整个基因组,构建性甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式,一旦细胞内新的甲基化模式建成,将通过维持甲基化酶以“甲基化维持”的形式

植物DNA甲基化的调控研究获重要进展

  近日,中国科学院华南植物园农业与生物技术中心研究员陈琛、副研究员王昌虎团队与合作者,在国家自然科学基金面上项目和青年项目、广州市科技计划项目的资助下,对植物DNA甲基化的调控研究取得重要进展。相关成果发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。  DNA甲基化是表观遗传修

Cell发布革命性DNA甲基化分析技术

  Whitehead研究所的研究人员开发出了一种方法,监测单个细胞中随着时间推移发生的DNA甲基化改变。这一突破性的研究成果发布在顶级科学期刊《细胞》(Cell)杂志上。  DNA甲基化对正确控制基因表达及细胞身份——使得细胞具有相同遗传物质的细胞变为神经细胞、肌肉细胞或皮肤细胞,起至关重要的作用

组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系

在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—

DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲

汪海林:维生素C调控DNA甲基化

  2014年8月26日,第十三届全国青年分析测试学术报告会在陕西西安南洋大酒店隆重开幕。本届全国青年分析测试学术报告会由中国分析测试协会青年学术委员会举办,西安交通大学电子材料研究所承办,来自全国各地的分析测试学界代表近200人参加了此次报告会。来自中科院生态环境中心的汪海林教授为大家带来题为《维

揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献

  DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息,DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发,也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异,这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日,华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中

研究揭示肠癌DNA甲基化调控新机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508004.shtm

DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便

Nature:10000人最大研究!“超重”改变DNA甲基化

  12月21日,发表在Nature杂志上题为“Epigenome-wide association study of body mass index, and the adverse outcomes of adiposity”的研究证实,节假日养出的“肉”(biao)除了会让你看起来更bigge

Alpha助力DNA甲基化表型调控新发现

  NA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式

Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息

中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定  义编号:EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一,包括内切酶和甲基化酶两种成分,作用在识别位点(回文结构)内或其附近,反应不需要ATP;而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶,在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化,又能

关于DNA甲基化检测的操作方法介绍

  1、DNA甲基化检测— 基因组DNA的提取及浓度测定,设计引物时要求所扩增的片段中必须含有一个或一个以上的CpG岛,以保证检测可以正常进行。  2、DNA甲基化检测— 基因组DNA进行化学修饰,主要采用亚硫酸氢钠修饰,注意温度和时间的掌握,修饰后的DNA单链比较脆弱,操作应轻柔,避免剧烈振荡。适

检测DNA甲基化识别四种常见癌

  中美研究人员26日说,DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式,只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析,且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌4种常见恶性肿瘤。   这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成,相

DNA甲基化酶的类型和作用介绍

基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C

DNA甲基化在肿瘤发生中的作用

越来越多的研究表明,在肿瘤形成过程中包含两大类机制。一个是通过DNA核苷酸序列改变而形成突变,即遗传学机制。肿瘤作为一种遗传学疾病在分子生物学领域已经得到证实。另外一个就是表观遗传学(epigenetics)机制,即不依赖DNA序列改变导致基因表达水平的变化,它在肿瘤形成过程中的作用越来越受到重视。

昆明动物所揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用

  3月21日,EMBO Reports在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。昆明动物所助理研究员蒋德伟为文章第一作者,研究员李家立为通讯作者。  准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重

研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制

  近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。  该研究由中科院上海生

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应

科学家探明DNA甲基化如何调控猪肉性状

   近日,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队在猪产肉性状形成的表观遗传研究方面取得重要新进展,相关研究成果在线发表于国际期刊《核酸研究》(Nucleic Acid Research)。 生猪是我国农业支柱产业,我国的生猪养殖和猪肉消费量均占全球50%以上,但优良种猪

Cell子刊:DNA甲基化的不完全重置

  Babraham研究所的科学家们揭示了生殖细胞(卵子和精子)发育时DNA重置的机制。众所周知,表观遗传学修饰是指不改变DNA序列的DNA修饰,DNA上添加这样的小基团会改变基因的活性。在人们的一生中(包括在子宫内的发育),表观遗传学修饰都在不断积累和变化,环境也能够对表观遗传学修饰发生影响。

老年痴呆症新解释:DNA甲基化

  2014年8月17日发表在《自然·神经科学》杂志上的一项研究发现,脑部早期DNA甲基化(DNA methylation)参与阿尔茨海默症(AD)的形成。  DNA甲基化能化学修饰DNA,是DNA特定区域生物活性的标记物。该研究是迄今为止第一例大型的全表观基因组学关联分析(Epigenome-wi

陈柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化动态

  精子和卵子融合是动物个体发育的起点,不过这一过程并不仅仅是简单的融合。人们发现,在哺乳动物胚胎的早期发育中,全基因组的甲基化模式会发生明显的变化。在小鼠胚胎受精之前,雌雄生殖细胞具有较高的甲基化水平,受精后父源基因组迅速的发生主动去甲基化,而母源基因组发生被动的去甲基化。  为了了解人类生殖细胞

dna甲基化抑制剂-aza和dec的区别

DNA甲基化在诸如胚胎发育、基因转录、染色质的结构和稳定性、X染色体的失活、基因组印记、细胞的癌变和衰老等生物过程中起到关键作用。DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用。DNA去甲基化包括DNA主动去甲基化和被动去甲基化。其中,DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化中起关键作用

科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛,联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海,在《基因组研究》(Genome Research)上,在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preim

Pyrosequencing-DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便与结肠癌患

华人科学家发现DNA甲基化关键调节因子

  《科学》基因表达调控新突破:  DNA甲基化对哺乳动物发育至关重要。本研究利用DNA甲基化报告子敲入技术,对人类胚胎干细胞进行全基因组CRISPR-Cas9筛选。发现QSER1基因是发育相关基因二价启动子和准备状态增强子的关键保护因子,尤其是位于DNA甲基化峡谷内的基因。研究确定了QSER1和T

DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发

  发表在今天《临床实验胚胎学》杂志上的新研究表明有一种简单的血液测试方法可以确定癌症侵犯其他器官如肺、骨头或大脑等疾病复发的风险。这样的测试对改善所有类型的女性乳腺癌会产生深远影响,这种疾病会影响八分之一的女性。  在研究中,翻译基因组学研究院(TGen)的研究人员确定了21 DNA甲基化热点——

DNA去甲基化酶催化作用介绍

DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应,等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外,甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。

研究发现植物DNA主动去甲基化新机制

  近期《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i