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基因组研究的“98K”——人工智能算法

每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。 如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个细胞中几乎都一样。如果将基因组比作生命之书,那么我对旁注则更感兴趣。”这些“旁注”是指附着在DNA分子上的小化学标记,它们不会改变遗传信息本身,但会影响相应位点上DNA发生的变化。换句话说,这些标记具有表观遗传作用。它们充当负责启动子和增强子等基因激活和失活的基因组区域的调节剂。 在许多复杂的疾病中,基因的表观遗传控制无法正常工作,这对科学家非常感兴趣。然而,在实验室中对这些区域的分析通常是麻烦,费时且复杂的。这就是为什么Vingron和他的团队决定开发一个新的程序包的过程。 该程序包称为条件特定的调节单元预测(CRUP),它可以......阅读全文

基因组研究的“98K”——人工智能算法

  每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。  如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个

人工智能加速期:"算法为王"还是"场景落地"优先 ?

  人脸识别、语音识别是人工智能应用最为人熟知的两个领域。智能音箱、人脸门禁也已经走进不少人的生活。去年大火的无人货柜,则用到了“物品识别”技术。接下来,人工智能推广应用会怎么走?靠算法的不断提升吗?  海康威视高级副总裁徐习明说:“今天的人工智能还是一种弱人工智能。基于深度学习的算法精度会无限逼近

人工智能算法打开月球永久阴影区的神秘大门

以瑞士苏黎世理工大学为首的一个国际研究小组利用人工智能算法观察到月球上的永久阴影区。该人工智能有望“照亮”永久的阴影区,尤其是那些尽管旋转但自然阳光仍无法到达的区域。这项近期刊载于《地球物理研究快报》上的研究也包含在美国国家航空航天局(NASA)“阿尔忒弥斯1号”任务计划中,有助于为其将来的登月计划

人工智能算法超越化学家,精确预测科学试验

  科学研究领域中,追求真理经常意味着穿着白大褂在实验室做实验,其中免不了做一些失败的试验。没关系,因为失败的试验有时候也能带来很多新发现。现在,哈佛大学正努力帮助科学家加速试验研究的速度,通过一个可以预测化学反应成功率的机器学习算法,算法成功率超过了人类科学家。   算法分析了失败实验的数据。通

人工智能算法似乎在检测皮肤癌方面效果更好

  分析测试百科网 研究人员首次发现人工智能或机器学习的形式被称为深度学习卷积神经网络(CNN),它比经验丰富的皮肤科医生在检测皮肤癌方面更好。  在今日(星期二)发表在主要癌症杂志Annals of Oncology上的一项研究中,德国,美国和法国的研究人员通过向CNN展示100,000多幅恶性黑

人工智能算法准确描绘海洋浮游生物图像真实色彩

你一定听说过“蓝眼泪”海滩。实际上,“蓝眼泪”是海洋甲藻等多种海洋浮游生物发光产生的自然现象。 海洋浮游生物作为一类悬浮在水层常随水流移动的海洋生物,是海洋生态系统的基本组成部分,对浮游生物的观测不仅是海洋生态科学研究的基础,也是现代海洋生态环境管理不可或缺的手段。 近期,来自中国科学院深圳

新算法提升基因融合检测效率

  近日,华大基因公开一种基因融合检测算法SOAPfuse。模拟数据和真实验证数据的综合测评表明,该算法具有准确率高、敏感性强、精度高、资源消耗少等优点。该算法主要采用局部穷举算法和一系列精细的过滤策略,从而对基因融合进行快速、精确的检测。相关研究成果在《基因组生物学》(Genome

人工智能算法魅力:判断癌症患者能否从免疫治疗获益

  免疫治疗在癌症统治的世界里不断攻城略地。  癌症患者看到了生的希望,但遗憾的是患者很难知道自己究竟是不是免疫治疗泽被的那些人。  目前的临床统计显示,PD-1抑制剂只能在20%-50%的晚期实体瘤病人中发挥作用[1]。受益的患者究竟是谁?目前找到这些患者的手段有限。  因此,找到一种可靠的生物标

人工智能算法有助于快速分析蛋白质折叠结构

近日,英国《自然》杂志报道,美国哈佛大学医学院生物学家AlQuraishi开发出新型人工智能算法,能够快速分析预测蛋白质三维结构,大大提高蛋白质三维结构预测的效率,将预测时间从若干小时或几天缩短至几毫秒。  报道称,蛋白质三维结构与蛋白质功能密切相关,当前生物学界一大挑战在于如何基于氨基酸序列预测蛋

人工智能解锁新领域 深度学习算法助力发现古人类遗迹

  近年来,深度学习作为机器学习的一个分支,在考古学中迅速普及应用,使得考古工作的效率得到提升。除了用于发现考古遗迹,预测、翻译古文字,人工智能还参与了部分文物的修复过程。  人工智能继续探索新领域,这次是考古。  近日,来自美国宾夕法尼亚州立大学、澳大利大悉尼大学等4所研究机构的研究人员,在著名考