Antpedia LOGO WIKI资讯

基因组研究的“98K”——人工智能算法

每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。 如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个细胞中几乎都一样。如果将基因组比作生命之书,那么我对旁注则更感兴趣。”这些“旁注”是指附着在DNA分子上的小化学标记,它们不会改变遗传信息本身,但会影响相应位点上DNA发生的变化。换句话说,这些标记具有表观遗传作用。它们充当负责启动子和增强子等基因激活和失活的基因组区域的调节剂。 在许多复杂的疾病中,基因的表观遗传控制无法正常工作,这对科学家非常感兴趣。然而,在实验室中对这些区域的分析通常是麻烦,费时且复杂的。这就是为什么Vingron和他的团队决定开发一个新的程序包的过程。 该程序包称为条件特定的调节单元预测(CRUP),它可以......阅读全文

Nature:华大基因前CEO王俊创办的碳云智能引发广泛关注

  生物通报道:中国一家最有趣的生物科技公司,已经实现了早期看似不切实际的诺言,利用人工智能(AI)来彻底改变卫生保健。  1月5日,深圳iCarbonX公司创始人、华大基因前CEO王俊在数字生活峰会(Digital Life Summit)上表示,他们已经与来自世界各地、专门收集不同类型卫生保健数

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

大数据分析预测常见致命疾病风险 基因检测时代来临!

图片来源: Lauren Solomon这些测试利用基因组中数百万个地方的信息来确定五种疾病的风险,可以在症状出现之前就预示更有可能发展成潜在的致命疾病。虽然这项研究数据源自英国,但它表明,仅根据基因变异,美国就有高达2500万人患冠状动脉疾病的风险可能比正常人高出3倍以上。此外,还有数百万人患其他

Cell:干细胞指数 未来有望开发出抑制癌症进展的新疗法

  日前,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中,来自圣保罗大学等机构的研究人员通过研究开发出了一种新型的索引模式,其能为癌症患者的预后提供相关信息,同时也能帮助指导癌症患者采用更加合适的疗法进行治疗,并且鉴别出开发新药的靶点。文章中,研究人员利用人工智能算法对来自33种不同类型肿瘤的1.2万份样

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

中国髓母细胞瘤基因表达图谱研究新成果发布

  中华医学会第七届全国小儿神经外科学术大会暨第十一届中国小儿神经外科论坛(CPNF)于2019年6月21至23日在广州隆重召开。本次会议由中华医学会、中华医学会神经外科学分会小儿神经外科学组主办,广东三九脑科医院、上海交通大学医学院附属新华医院承办。  复旦大学附属华山医院神经外科姚瑜教授课题组、

第三代测序技术:PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长

PacBio单分子测序最新科研动态

DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度

一口唾液就能测出孩子天赋?专家 检测尚处于“忽悠”阶段

  “一口唾液,就能测出孩子的天赋。家长可以有的放矢地开发孩子的天赋和潜能,不用尝试那么多的兴趣班来挖掘特长”“准确预测癌症肿瘤,准确率近100%”……  打开搜索引擎,键入“基因检测”,类似的广告语不时可见。基因检测成了可以预测未来发展以及旦夕福祸的利器,然而事实真的如此吗?  天赋基因检测尚处于

英国推进十万人基因组计划 Illumina等企业踊跃参加

  英国计划在2017年完成10万人的基因测序工作,但筛选疾病基因需要创新的软件。  一对加利福利亚双胞胎出生后,他们的父母日益忧心:宝宝们发育缓慢,而且肌张力低。脑部扫描发现,男宝宝可能有大脑麻痹,但女宝宝却有癫痫和震颤。医生们百思不解。多种测试结果都无法确诊两个宝宝究竟出了什么问题。等到孩子们5

基于影像学的多种人工智能算法在肿瘤研究中的应用进展

  人工智能(artificial intelligence,AI)即为研究、探索如何模拟人类智能并对人类智能进行扩展延伸的一门学科。现如今人工智能已成为人们广泛关注的焦点,其今后的发展将对各行各业产生深远的影响。机器学习(machine learning,ML)是实现人工智能的方法之一,是使计算机

基于影像学的多种人工智能算法在肿瘤研究中的应用进展

  人工智能(artificial intelligence,AI)即为研究、探索如何模拟人类智能并对人类智能进行扩展延伸的一门学科。现如今人工智能已成为人们广泛关注的焦点,其今后的发展将对各行各业产生深远的影响。机器学习(machine learning,ML)是实现人工智能的方法之一,是使计算机

杰出女科学家再发Cell解析调控机制

  来自美国麻省大学医学院,英国牛津大学等处的研究人员发现DEAD-box家族蛋白中两个成员:UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使过程中扮演了重要角色,并指出了一种新型核周转录沉默机制。相关成果公布在Cell杂志上。   文章的通讯作者分别是麻省大学医学院生物信息学和整合生物学部的翁志萍

2018年全球十大新兴技术大盘点

  在不久的将来,技术革新将如何改变我们的生活?  人工智能将大幅提升新药物和新材料的开发速度;新型诊断工具将打造更先进的个性化医疗;从日常任务到工业生产,增强现实将走进生活的方方面面,将大量信息和动画覆盖于真实世界之上;如果你生病了,医生将可以在你体内植入活细胞,用这些“药物工厂”为你治病;你将会

2018 MedAI 世界人工智能卓医创新挑战赛

——寻找医学的无限可能,人工智能落地多点开花  去年7月,国务院印发《新一代人工智能发展规划》,提出了面向2030年我国新一代人工智能发展三步走战略目标,同年10月,上海市政府出台《关于本市推动新一代人工智能发展的实施意见》,对标第一步2020年的国家战略目标,部署并全面实施“AI@SH”行动,人工

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

国家基金委八大学部公布“优先发展领域及主要研究方向”

  “十三五”期间,通过支持我国优势学科和交叉学科的重要前沿方向,以及从国家重大需求中凝练可望取得重大原始创新的研究方向,进一步提升我国主要学科的国际地位,提高科学技术满足国家重大需求的能力。各科学部遴选优先发展领域及其主要研究方向的原则是:  (1)在重大前沿领域突出学科交叉,注重多学科协同攻关,

Nature子刊“大发现”:CRISPR可引发数百种“意外突变”!

  问世短短几年的CRISPR俨然已成为生命科学领域最耀眼的“明星”之一。除了作为常规的科研工具,这一被称为“魔剪”的基因编辑工具还被寄予了用于疾病治疗的厚望。目前,来自全球各国的科学家们正在开展CRISPR用于多种疾病治疗的研究,包括癌症、艾滋病、失明、免疫缺陷病症、杜氏肌营养不良症、镰状细胞病等

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

实质等同性(转录组学)实验

实验材料:小麦  试剂、试剂盒:β-巯基乙醇                                   &nb

ctDNA甲基化,液体活检助力癌症早筛的核心武器

  北京莱盟君泰国际医疗技术开发有限公司是LAM®总部在中国设立的分支,更是促成癌症早期筛查与临床干预前沿技术在中国“落地生花”的重要根据地。2018年,公司进入发展的关键期:与美国同步,推出针对多癌种的早期筛查技术,即基于ctDNA甲基化的液体活检产品。  “我们以‘未癌先知、健康先行’为创新理念

气候变化究竟会对森林造成怎样的影响呢?

   气候变化深刻影响着森林、草原等生态系统。森林作为陆地生态系统的主体,成为研究界的重点关注对象。气候变化究竟会对森林造成怎样的影响呢?  北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心副教授毛建丰告诉《中国科学报》,气候变化对森林的潜在影响是巨大的,森林可能在数年间由于不适合气候变化带来的病虫害而被

2019年中国学者86篇Cell,Nature及Science文章汇总

  2019年上半年很快就结束了,iNature盘点了中国学者在Cell,Nature及Science发表的成果,我们发现总共有86篇(截至2019年6月24日),具体介绍如下:  4-6月发表的文章  【1】2019年6月21日,西北工业大学王文,中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

华大发布最大规模中国人基因组学大数据研究成果

  北京时间2018年10月4日,正当全国各族人民都在以各种形式庆祝祖国母亲69岁生日之际,华大也献上一份“厚礼”。  刚刚,华大在国际顶级学术期刊《细胞》上发表了迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果。这是由中国科学家主导,历时两年,对14余万中国人无创产前基因检测数据进行深入研究的成果。

再次飞跃 | 短短2天,中国学者连续发表11篇CNS

3.杨辉/李亦学/Lars M. Steinmetz等团队建立新型脱靶检测技术,基因编辑工具安全性评估或迎来新突破  CRISPR/Cas9是广泛关注的新一代基因编辑工具,自从2012年被发明以来,它一直以其高效性和特异性备受世人的期待,然而值得注意的是,CRISPR/Cas9从问世以来,其脱靶风险

蛋白质组技术的研究进展

大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信息仅

逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...

逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起,全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前,主要有两种获得研究物种参考基因组的策略:de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正,mapping是指将所有测序读段通过序列比对定