生科院提出环形RNA内部序列结构可视化新方法

1月18日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队于Bioinformatics 杂志上在线刊发了题为Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。该研究主要开发了环形RNA的可视化工具——CIRI-vis软件,具有将CIRI-AS或CIRI-Full的输出结果可视化,且可以批量展示环形RNA上的读段信息与内部结构的优势。 环形RNA是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA分子,其独特的5’-3’反向剪接特征成为绝大多数环形RNA识别工具的靶点。随着算法的进步,对环形RNA的识别从反向剪接位点的识别发展到内部序列的识别,研究者们发现可变剪接现象在环形RNA中普遍存在。这个情况表明,环形RNA的分析应与线性RNA一样,需要将其内部的所有剪接产物的结构与相对丰度考虑在内。过去的研究只验......阅读全文

北大生科院最新PNAS文章

  来自北京大学生命科学学院的研究人员独立完成了一项最新研究成果:Self-assembly and sorting of acentrosomal microtubules by TACC3 facilitate kinetochore capture during the mitotic s

北京生科院最新《自然》文章

来自北京生命科学研究所,中科院生物物理研究所,遗传与发育研究院,清华大学生命科学与生物技术系,美国康奈尔大学的研究人员报道了第一个细菌效应蛋白和植物中对应的抗性蛋白的复合物AvrPto-Pto的晶体结构,基于该结构和相关实验结果,提出了AvrPto通过解除Pto对防御响应的抑制引发疾病抗性的机制。这

北大生科院全球公选院长

  7月2日,北京大学发布,面向海内外公开招聘生命科学学院院长。新一届院长应为愿致力于北京大学生命科学高等教育和科学研究的国际知名科学家,并将在北大、北大生命科学委员会、北大—清华生命科学联合中心和国家蛋白质研究中心北大部分的大力支持下,发挥重要作用。  据悉,北大生科院现任院长饶毅于20

白春礼视察上海生科院

  8月12日,中科院常务副院长白春礼视察上海生科院。  白春礼先后视察了营养科学研究所林旭、刘勇实验室,神经科学研究所王伟实验室,生物化学与细胞生物学研究所裴钢实验室,听取了上海生科院院长陈晓亚、药物所所长丁健关于本单位推进科技创新工作、发展态势与竞争力分析、组织谋划“创新2020

饶毅卸任北大生科院院长

  9月3日上午10点,北大宣布饶毅卸任生科院院长,加州大学洛杉矶分校吴虹教授将出任新一任院长。   吴虹简历:   美国加州大学洛杉矶分校分子和医学药理学系教授。美国加州大学洛杉矶分校分子遗传技术中心主任。JCCC癌症干细胞研究项目联合副主任。JCCC泌尿生殖系统肿瘤项目成员,信号转导研究及治

上海生科院最新PNAS文章

  4月19日,《美国科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究组题为Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification

北京生科院最新研究进展

4月12日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长转录

张亚平调研上海生科院

  9月4日,中国科学院副院长、党组成员张亚平到中科院上海生命科学研究院调研,分别听取四个实体科研机构贯彻落实深化上海生科院改革各项任务推进情况工作报告,并与相关机构领导班子成员进行了座谈交流。  张亚平指出,在中科院党组领导下,在院机关和上海分院指导支持下,四个实体科研机构坚决贯彻落实决策部署,深

张亚平调研上海生科院

  9月4日,中国科学院副院长、党组成员张亚平到中科院上海生命科学研究院调研,分别听取四个实体科研机构贯彻落实深化上海生科院改革各项任务推进情况工作报告,并与相关机构领导班子成员进行了座谈交流。  张亚平指出,在中科院党组领导下,在院机关和上海分院指导支持下,四个实体科研机构坚决贯彻落实决策部署,深

上海生科院JNeurosci解析神经调控

  来自中科院上海生命科学研究院神经所,新乡医学院的研究人员第一次通过直接的电生理证据,证明了顶叶皮层的神经元在急速快速眼动过程中的活性不同,介绍了后顶叶皮层神经活动对快速眼动过程的影响,相关成果公布在神经学重要期刊Journal of Neuroscience杂志上。   领导这一研究的是中

北大生科院连发Cell,Nature子刊文章

  近期北京大学生命科学学院接连在Cell,Nature structural and molecular biology上发表文章,介绍了关于先天免疫信号转导通路中的重要接头及感应蛋白STING结构生物学研究成果,以及基因组稳定性方面的研究成果。   在“The structura

上海生科院Science解析重要分子机制

  来自中国科学院上海生命科学研究院的研究人员,在对多年生草本植物弯曲碎米荠(Cardamine flexuosa)的研究中揭示了年龄相关性春化作用的分子基础。相关论文“Molecular Basis of Age-Dependent Vernalization in Cardamine f

清华大学生科院PNAS文章

  来自清华大学生命科学学院,中科院上海药物研究所等处的研究人员首次报道了一种具有阴离子选择性的机械敏感性离子通道的晶体结构,对其功能特性和离子选择机制进行了研究。   文章的通讯作者是清华大学生科院杨茂君研究员,以及上海药物研究所李扬研究员。其中杨茂君研究员早年毕业于吉林大学生命科学院,2001

上海生科院举办第一作者讲坛

    会议现场  10月26日下午,由中科院上海生命科学研究院研究生部主办的“第一作者讲坛”第68期报告在中科大厦举行,上海生科院健康科学研究所戈宝学研究员指导的严大鹏博士作了以“细菌安插‘内应’,假传体内‘太平’”为题的精彩报告。  报告是以严大鹏所在课题组最近的研究成果为切入口

张亚平到上海生科院调研

  11月9日至10日,中国科学院副院长张亚平率队赴中科院上海生命科学研究院调研指导工作。期间,他出席了中国科学院战略性先导科技专项(B类)《脑功能联结图谱》实施工作会议,并听取了生科院关于上海植物逆境生物学研究中心筹建情况等方面的汇报。   在中国科学院战略性先导科技专项(B类)《

上海生科院揭示等位遗传调控机制

  5月14日,国际学术期刊Cell Reports在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

上海生科院揭示根系发生的新通路

  种子植物的根系由主根、侧根和不定根共同组成。主根起始于胚胎发育时期,侧根和不定根则不断补充胚后发育的根系系统。传统教科书中对侧根的描述为“根上发生的根”,而不定根是“非根器官上发生的根”。8月29日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐麟研究组题为Non-canonical WOX1

上海生科院揭示大脑编码情绪的模式

    生活中充满了七情六欲,喜乐哀愁。为什么人们高兴时心花怒放,如步云端,痛苦时又五内俱焚,似坠深渊?在这些情绪的背后,大脑中发生了些什么样的变化?大脑如何使人表现欢喜或悲伤,又怎样让人心弦微动或被情绪的风暴席卷而无法自拔?情绪使生活多姿多彩,帮助人们趋利避害,对生存和生活至关重要。然而,长久以来

上海生科院CancerRes癌症研究新发现

  来自中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员在新研究中证实,TRAF6上调了HIF-1α表达,促进了肿瘤血管生成。相关论文发表在5月30日的《癌症研究》(Cancer Research)杂志上。   论文的通讯作者是中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的方靖(Jing Fan

武汉大学生科院最新Nature-Immunology文章

  来自武汉大学生科院,中科院的研究人员揭示了内质网应激感应蛋白IRE1α通过调控巨噬细胞的极性活化影响机体的能量平衡,在肥胖与相关代谢疾病的发生发展中发挥重要的功能。这一研究成果公布在Nature Immunology杂志上。  巨噬细胞介导的慢性炎症是肥胖诱发胰岛素抵抗与2型糖尿病的关键环节。在

上海生科院揭示根系发生的新通路

  种子植物的根系由主根、侧根和不定根共同组成。主根起始于胚胎发育时期,侧根和不定根则不断补充胚后发育的根系系统。传统教科书中对侧根的描述为“根上发生的根”,而不定根是“非根器官上发生的根”。8月29日,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐麟研究组题为Non-canonical WOX1

上海生科院举办食品安全风暴论坛

  11月30日下午,求索讲坛年终特辑“食品安全风暴论坛”在中科院上海生命科学研究院举行。本次讲坛邀请了第一财经“头脑风暴”节目主持人、零点研究咨询集团董事长袁岳担任嘉宾主持。上海交通大学生命科学技术学院副院长张大兵教授、家乐福中国食品安全总监柏韦亚(Xavier Bodenes)、江南大学食品

北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术

   2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存

北京生科院免疫与健康联合研究中心成立

  12月24日,中科院北京生命科学研究院免疫与健康联合研究中心成立大会召开。北京生科院院长康乐宣读了成立免疫与健康联合研究中心的决定。中科院院士王大成、中科院生命科学与生物技术局局长张知彬、中国免疫学会副理事长田志刚、北京免疫学会理事长张毓等出席了成立大会。中科院院士田波、方荣祥发来贺信。   

北京生科院提出环形RNA识别的新方法

  环形RNA是一类新报道的结构特殊的非编码RNA。近两年的研究发现,环形RNA在动物细胞内广泛存在,且大多位于基因的外显子区域。另有研究表明,少数环形RNA分子可以充当microRNA“海绵”,在转录后水平对基因表达进行调控。然而,目前绝大多数的环形RNA功能仍不明确,科学家们推测其可能与蛋白质及

上海生科院Cell-Res发表癌症研究新文章

  来自中科院上海生命科学研究院、复旦大学的研究人员证实,VGLL4通过负向调控Hippo信号通路下游转录因子复合物YAP-TEAD,在肺癌中发挥肿瘤抑制因子作用。这一研究发现在线发表在1月24日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。   中科院上海生命科学研究院的季红斌(Hon

中科院广州生科院:让药物创新多点“洋气”

广州生物院院长裴端卿  黄皮肤、白皮肤、棕皮肤,走进中科院广州生物医药与健康研究院(以下简称广州生物院)的任何一间实验室,你很可能会看到肤色各异的科研人员穿着同样的白大褂,用英文交流着。  从2003年广州生物院筹备时开始,这个坐落于岭南古城的研究机构就注定要走上“洋气”的发展道路。10多年来,广州

北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术

  4月12日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长