基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种
芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物,如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样,芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害,造成巨大经济损失。 近日,《园艺学研究》在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝课题组方智远院士团队的综述文章。该文针对芸薹属作物主要病害芜菁花叶病毒病、黑腐病、黑胫病、菌核病、枯萎病、霜霉病和根肿病等,详细介绍了近年来国内外在芸薹属抗性基因挖掘及育种应用等方面取得的进展。 论文通讯作者、中国农业科学院蔬菜花卉研究所副研究员吕红豪介绍,传统的物理、化学防治手段往往操作复杂、成本高、易对环境造成危害。相比之下,利用作物的自然抗性是最理想的策略。因此,挖掘抗性种质和抗病基因,培育抗病、优良的新品种成为芸薹属育种工作者的重要任务。近年来,基因组学、分子遗传学和生物技术的快速发展使得抗性基因的高效挖掘和应用成为可能。 这些成果既缓解了上述病害对芸薹属作物生产的危害,也加深了人们对R基因抗......阅读全文
基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种
芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物,如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样,芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害,造成巨大经济损失。 近日,《园艺学研究》在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝课题组方智远院士团队的综述文章。该文针对芸薹属作物主要病害芜菁花叶病毒病
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
原文: Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities 原文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
2019年5月2日,Cell杂志报道了美国休斯敦贝勒医学院研究人员利用基因、转录、蛋白及翻译后修饰等多组学技术,对结肠癌/癌旁组织进行了系统、全面的分析,整合多组学结果为后续癌症治疗方案提供了新思路,同时也为生物标志物筛选、药物靶点、分子分型等研究工作奠定理论基础。实验背景结肠癌是世界上死亡率排名第
挖掘玉米“高产基因”
玉米的单株产量由玉米的每穗籽粒数目和穗粒重共同决定,挖掘控制玉米产量的“高产基因”,解析穗行数调控网络,可使玉米单产得到大幅度提高,对保障国家粮食安全有重大价值和现实意义。在国家自然科学基金重大研究计划“主要农作物产量性状的遗传调控网络解析”支持下,在山东农业大学教授张宪省等责任专家指导下,研究人员
华大基因:挖掘基因测序的“超级金矿”
日前公布的2012年度深圳市科学技术奖拟奖名单上,奖金高达100万元的“市长奖”拟颁给一个37岁的年轻人;去年底,英国《自然》杂志评选出2012年科学界年度十大人物,他又是唯一入选的中国人。这个年轻人,就是华大基因研究院院长王俊。 他所在的深圳华大基因,没有享受到任何财政拨款,却坐上了《自
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示,来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先,和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示,尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示,大约在10万年前,现代人和尼安德特人之间
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
图片来源:基因解码公司 因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日,《科学》杂志报道称,冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录,以估算28万名并未同意参与该公司的研究,
美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化
美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率 美国药物基因组学检测商业化 Companiondx实验
天赋基因检测,挖掘的不是天才是暴利
“一口唾沫,就能测出您的孩子有什么天赋;如果他有运动基因,可能成为下一个菲尔普斯;如果有音乐基因,可能培养成李云迪……”近期,一项名为“天赋基因检测”的服务在国内兴起,吸引了不少父母,福州也有家长不惜重金购买该服务。记者调查发现,网上有不少商家提供该服务,收费数千至上万元不等。虽然确实存在这项检
科学家开发出基因挖掘新策略
得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学研究,植物发育生物学在过去40年取得了长足发展。植物分生组织(干细胞)的建立与维持机制、重要组织和器官的分化轨迹及其核心调控网络已初步建立。这些基础知识为作物农艺性状的分子调控解析与设计改造奠定了基础。然而,随着正向遗传学筛选的日趋饱和,基因
基因大数据深度挖掘,我们将面临挑战
在日前于北京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,众多与会专家就基因技术发展方向及面临的机遇与挑战进行了深入交流。作为一种新型基因检测技术,基因测序能从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性、个体的行为特征及行为合理性。基因测序技术能锁定个人病变基因,予以提前预防和治疗。
从基因标签挖掘癌变诱因,实现癌症预防
2015年,世界最大的癌症慈善机构英国癌症研究中心投资超1亿英镑,以期在5年内实现对抗癌症的“七大挑战”。其中,“挖掘癌症突变下的基因标签”作为挑战之一入列其中。这一挑战主要是通过研究DNA突变信号,挖掘预防癌症的方法。 导致癌症的原因:外因?内因? 2015年1月,Science发表一篇文
表型组学技术:精准挖掘玉米抗旱基因
随着测序技术普及和待测材料的规模化,传统的干旱表型性状获取手段已经不能满足植物抗逆基因组学研究的需求,严重阻碍玉米抗旱资源的挖掘。 近年来,以智能化、高通量、动态无损测量为主要特征的表型组学技术迅猛发展,使得多时空多尺度表型检测成为可能,可实现作物全生育期表型动态精准鉴定。 近日,《基因组生
Science专题:癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以
药物基因组学的定义
药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。
毒理基因组学的定义
毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。
全面解读药物基因组学基因检测技术
全面解读药物基因组学基因检测技术FDA和CFDA分别于2010和2012年将CYP2C19基因检测的重要性说明纳入氯吡格雷的药物说明书。在国内,阜外医院已完成氯吡格雷用药基因检测超过20000例,居全国单中心检测量之首。以下列出了药物基因组学涉及的主要基因及对应的个体化用药:(4) 以下为上述三大
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从
PNAS:挖掘神秘基因簇的药用价值
加州大学的科学家们开发了新型基因操作平台,直接克隆、重构和异源表达了一个沉默的生物合成通路,获得了新型抗生素taromycin A。这一技术发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,为开发天然药用化合物开辟了新的途径。 领导这项研究的Bradley S. Moore博士指出,这
基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多专
基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多
拿下灵长类基因组“矿藏”挖掘主导权
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502057.shtm6月2日凌晨,《科学》以研究专刊形式在线发表8篇论文、《科学进展》在线发表2篇论文,集中报道了我国科学家发起并主导的灵长类基因组计划取得的阶段性突破。该计划由中国科学院昆明动物研究所(
华大基因携手爱丁堡大学,共促基因组学研究
2012年7月24日,深圳华大基因研究院与英国爱丁堡大学签署合作协议,宣布双方将在基因组领域展开广泛的科研合作,通过汇聚中英两国研究专长,加速基因组学在人类健康和农业及其他相关领域的创新和发展。 在签署的合作备忘录中,双方将着眼于对人类和其他生物的科学认识,通过共同努力,对遗传信息进行深入
表观基因组学研究指南(一)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi
-Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
基因组学:-跨越癌症研究国界
1982年11月,在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官,突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时,当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡,这让我感到震惊,从那时开始我意识到,我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol
作物基因组学研究进展
摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组
表观基因组学研究指南(三)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal
英国|基因组学和基因编辑:未来的研究方向
英国下议院(House of Commons)的科学技术委员会(Science and Technology Committee)发起对基因组学(Genomics)和基因编辑(Genome editing)的调查,呼吁这些新兴的科学领域的研究能提供其影响人类健康、植物、动物和生态系统的证据。20