一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列组装、变异进化分析等流程提供一体化解决方案,并已协助全国多地疾控中心成功组装新型冠状病毒全长序列。结果显示,它们与公布的参考基因组序列高度一致。 新冠病毒序列组装过程中的难点及要求 如大家所知,高通量测序在新冠病毒鉴定及诊断中可与RT-PCR法形成互补,不仅能提高阳性检出率,还能进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。更为重要的是,它还可以对病毒序列进行组装,获得病毒全长基因组信息,为追溯病毒来源、监测病毒变异趋势、探究致病机理提供研究基础。 为获取完整的病毒基因组序列,目前广泛应用的高通量测......阅读全文
新软件按需组装无缝基因组序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰
一文读懂|如何快速消除结核病细菌?
据印度媒体报道,印度一个研究小组新发现了结核病细菌产生耐药性的机制,并成功通过一种药物组合阻止这种耐药机制被激活,通过两个月治疗就几乎完全清除了小鼠肺部的细菌,且可有效降低复发感染概率。 结核病是由结核杆菌引起的慢性传染病,在印度的发病率和死亡率都较高。据《印度教徒报》近日报道,印度科学研究所
中国新型冠状病毒的基因组序列
《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示,该病毒与此前在
新冠病毒治疗进展如何?院士来为你解惑!
美国约翰斯·霍普金斯大学数据显示,截至北京时间8月6日12时35分,全球新冠确诊病例已突破1881万例,死亡病例超过70万例。 持续数月的疫情远未看到终点,而新冠治疗产生的“副作用”“后遗症”研究让人们再生担忧。 近日,一项发表于《美国医学会杂志》(JAMA)的意大利研究表明,有一半以上的新
如何选择体检项目快速准确筛查新冠病毒?
庚子年初,荆楚大疫,新冠肆虐,封城建院,闭户隔离。父母停工,孩子滞学。白衣执甲,万众一心。举国之力,救治研发。历经磨难,疫情初步可控,百业待兴,复序有望。 随着新型冠状病毒的疫情逐渐得到控制,武汉这座英雄的城市苏醒,全国多地也陆续解封。在加强新冠病毒防控的前提下,各地正积极有序地推进企业单位的复工
新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?
新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。
新冠病毒重男轻女?数据揭秘新冠易感人群
新冠疫情暴发已有大半年的时间,全球疫情新增确诊整体仍然呈上升趋势。截至7月17日19时,全球累计确诊逾1380万,累计死亡人数超59万。 在海外疫情形势严峻的背景下,北京和香港疫情反弹、哈萨克斯坦出现不明肺炎,这些都让大家对新冠疫情蒙上一层阴影,有关疫情的二次爆发以及新冠病毒变异的猜测不断蔓延
辉瑞BioNTech新冠疫苗可中和新冠变异病毒
《自然》发表的一篇论文报道,接种辉瑞 -BioNTech 新冠疫苗的血清中和了新的新冠变异病毒。接种两剂疫苗的人的血清中和了B.1.617.2(又称delta)变异株(首次于印度发现)和一些其他变异株,包括B.1.525(首次发现于尼日利亚)。 随着新冠病毒新变异株的出现,亟需评估现有疫苗产生
抵御病毒需要哪些营养素?感染新冠病毒后如何吃?
奥密克戎病毒致病力下降,但传播速度快、传染性强。合理膳食能有效改善人体的营养状况,良好营养是保障机体免疫功能的物质基础,可以增强抵御病毒感染能力。那么,抵御病毒需要哪些营养素?感染新冠病毒后该如何饮食?近日,人民网记者采访了中国农业大学食品科学与营养工程学院教授范志红。“目前,尚未发现补充某种营养素
新冠治疗新希望?2天新冠病毒减少5000倍!
随着近期印度疫情再次加剧,当地大面积应用伊维菌素的消息引发关注,还有研究显示,伊维菌素能在 48 小时内将新冠病毒 RNA 减少 5000 倍。 一个不少人关心的问题:伊维菌素要成为新冠治疗的新希望吗? 伊维菌素能治新冠吗? 伊维菌素(Ivermectin)是上世纪七十年代发现的一种抗生素
Science一文:有没有疫苗,新冠病毒都可能持续到2025年。
前些天,哈佛大学公共卫生学院发了一篇Science: 我下载了预印版,读完后脑子里产生了比较吓人的想法: 新冠病毒可能要陪伴人类很久,很久了…… 根据论文中的描述,无论是否能研发出疫苗,新冠病毒都可能会陪伴人类到2025年。 那么,2025年以后人类能摆脱新冠病毒吗? 不,只是到时我们
一文读懂range()函数
range()函数在其他语言中,如果想要循环一个变量从1到100,要怎么写呢?python怎么实现这个功能呢?python设计了range()函数,直接实现了上面的功能。range是内置函数,无须导入。在任何地方都可以直接使用它。
一文读懂JCR分区
目前,根据JCR分区表对SCI论文进行评价的模式已被国内部分高校和科研机构采纳,因为它有利于鼓励科研工作者向本学科的高级区域投稿。国内主流参考的SCI分区依据主要有中科院JCR分区表以及汤森路透JCR的Journal Ranking分区两种。其中,中科院期刊分区表则被更多的机构采纳以作为科研评价
一文读懂JCR分区
目前,根据JCR分区表对SCI论文进行评价的模式已被国内部分高校和科研机构采纳,因为它有利于鼓励科研工作者向本学科的高级区域投稿。国内主流参考的SCI分区依据主要有中科院JCR分区表以及汤森路透JCR的Journal Ranking分区两种。其中,中科院期刊分区表则被更多的机构采纳以作为科研评价
一文读懂凝血机理
凝血过程通常分为:①内源性凝血途径;②外源性凝血途径;③共同凝血途径。现已日益清楚,所谓内源性或外源性凝血并非绝对独立的,而是互有联系,这就是进一步说明凝血机制的复杂性。在生量条件下,凝血因子一般处于无活性的状态;当这些凝血因子被激活后,就了生了至今仍公认为的“瀑布学说“的一系列酶促反应。1.内源性
新冠病毒“自然起源”说新佐证?
据法国《世界报》报道,法国巴斯德研究所报告称,在老挝北部发现迄今为止和新冠病毒最为接近的蝙蝠冠状病毒,与新冠病毒具有共同关键特征,可能与新冠病毒存在进化关系。这项研究为新冠病毒溯源提供了线索,也让科学家们更接近于确定新冠病毒的起源。相关研究于9月18日发表在《自然》杂志的预印本平台“研究广场”。
美国新冠病毒复制特性
3月3日,美国疾控中心等机构的研究人员在bioRxiv上发表论文,描述了从第一个美国新冠肺炎患者体内分离出的病毒,并描述了其基因组序列和复制特性。(bioRxiv论文未经同行评议。) 研究人员表示,此次疫情传播速度之快前所未有,迫切需要为进一步研究新冠病毒提供参考试剂。公共卫生界也需要病毒裂解
新冠病毒详细科普指南
还有几天就是春节了,亲朋好友的扎心三连问又如约而至:脱单了吗?生几个?年终奖多少……想要年过得愉快舒心,就得先发制人。那就是发挥生物医药科研人的优势,给七大姑八大姨科普目前备受关注的新冠病毒,拿出来的瞬间就能让人惊艳闭嘴、妈见夸。话不多说,小赛已经为大家准备好了,从初一到初七,从七大姑八大姨到熊孩子
新冠病毒溯源深陷迷雾
2月27日,国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示,疫情首先出现在中国,不一定是发源在中国。 同时,最新研究表明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。 有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而,它从哪里来?如何到达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,
新抗新冠病毒药物潜在作用靶点—新冠病毒包膜蛋白
新冠病毒已经感染超过1.5亿人次,并导致300多万人死亡,然而迄今尚无用于新冠肺炎的特效药物。新靶点的发现和确证对于抗新冠病毒药物研发具有重要意义。 2021年6月10日,中科院上海药物所高召兵、李佳、沈敬山,以及武汉病毒所张磊砢、昆明动物所郑永唐联合研究团队在Cell Research 发表
一文告诉你如何读懂梅毒TRUST和TPPA
余云娥 福建省连江县妇幼保健院 梅毒是由苍白螺旋体所引起的一种慢性、系统性的传播性疾病,是我国三大性传播疾病之一,人体受感染后,螺旋体很快播散到全身,几乎可侵犯全身各组织与器官,临床表现复杂,病程较长,且时隐时显,因此,采用简单、快速、敏感性好和特异性强的诊断方法对梅毒及时诊断、治疗和控制传
如何做到远离新冠病毒一身轻松
Durland Fish是耶鲁大学公共卫生学院的一名退休传染病流行病学家,他对缺乏个人如何预防冠状病毒感染的信息感到担忧。 75岁时,他感染流感病毒的风险很高,他的伴侣也是70多岁,她患有慢性肺部疾病,如果感染,她的生命将受到威胁。所以他花了很多时间思考怎样才能最大限度地减少感染流感病毒的几率
如何防范新冠病毒-世卫给出10项基本建议
世界卫生组织总干事谭德塞28日在例行记者会上介绍了当前针对新冠病毒的10项个人预防措施基本建议,包括定期清洁双手和物品表面、在发烧或咳嗽期间避免旅行等。 谭德塞当天在记者会上表示,“遏制疫情从你开始”。世卫组织给出10项针对新冠病毒的个人预防措施基本建议。 首先,定期用含酒精成分的免洗洗手液
免疫系统如同虚设,看看新冠病毒如何漫步全身?
众说周知,SARS-CoV-2是感染2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体。患者感染SARS-CoV-2后,主要表现为呼吸道和肺部感染,进而导致严重和致命性的多器官衰竭、休克。呼吸系统以外的器官是否会感染SARS-CoV-2呢?SARS-CoV-2是否能够在呼吸系统以外的器官中复
新冠病毒“变异”了?科学研究如何避免过度解读
最近几天,关于新型冠状病毒变异成两个“亚型”的传言惹人注目。其来源是3月3日发表于《国家科学评论》的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》。 但是,中国—世卫组织联合考察组刚刚给出了新冠病毒未发生明显变异的结论。《自然—微生物学》也发表了耶鲁大学流行病学专家Nathan D. Gru
一文了解新冠igg抗体阳性意义
IgG抗体阳性,一般提示是既往感染的,对于临床诊断的意义不是很大。如果IgG抗体的滴度为进行性上升,其临床意义是比较大的,这种情况考虑是近期感染了该种病毒。一般来说,相关抗体的检查分为IgM和IgG两种,IgM是近期感染的标志,一般作为诊断疾病的检测方法。如果IgM是阳性的,并且有相关的临床症状
新冠病毒咽拭子阳性等于确诊新冠肺炎吗?
近些天北京疫情的新闻,让大家刚平复没多久的心情又紧张了起来。而新发地市场成了这次疫情的『中心』。 新冠病毒核酸检测作为找出病毒的有效手段之一,又开始被大家重视了起来。 关于核酸检测,大家肯定有很多疑问,下面小编就简单梳理一下大家比较关心的几个问题。 普通人需要核酸检测吗? 1、5月30日
一文读懂血尿那点事
正常人的尿中一般没有红细胞,如果尿中每高倍视野有3个以上的红细胞,就叫血尿,是泌尿系统疾病的信号。 血尿分两种情况:肉眼血尿,指可看到尿的颜色是红色,洗肉水样色,镜下血尿:尿的颜色正常,外观无异常,但显微镜下尿中发现有红细胞或隐血,一般无何症状,多于体检时发现。引起血尿的原因1.尿路感染患者有尿频
一文读懂拉曼光谱
分子振动也可能引起分子极化率的变化,产生拉曼光谱。拉曼光谱不是观察光的吸收, 而是观察光的非弹性散射。非弹性散射光很弱,过去较难观测。激光拉曼光谱的出现使灵敏度和分辨力大大提高,应用日益广泛。 拉曼散射效应的进展 1928年,印度物理学家拉曼(C.V.Raman)
一文读懂拉曼光谱
分子振动也可能引起分子极化率的变化,产生拉曼光谱。拉曼光谱不是观察光的吸收, 而是观察光的非弹性散射。非弹性散射光很弱,过去较难观测。激光拉曼光谱的出现使灵敏度和分辨力大大提高,应用日益广泛。 拉曼散射效应的进展 1928年,印度物理学家拉曼(C.V.Raman)首次发现曼散射效应,荣获