一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列组装、变异进化分析等流程提供一体化解决方案,并已协助全国多地疾控中心成功组装新型冠状病毒全长序列。结果显示,它们与公布的参考基因组序列高度一致。 新冠病毒序列组装过程中的难点及要求 如大家所知,高通量测序在新冠病毒鉴定及诊断中可与RT-PCR法形成互补,不仅能提高阳性检出率,还能进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。更为重要的是,它还可以对病毒序列进行组装,获得病毒全长基因组信息,为追溯病毒来源、监测病毒变异趋势、探究致病机理提供研究基础。 为获取完整的病毒基因组序列,目前广泛应用的高通量测......阅读全文

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

一文读懂新冠病毒抗原/抗体检测试剂试验方法

  2020年1月份以来,国家药品监督管理局根据《医疗器械应急审批程序》,已批准7家企业的新型冠状病毒核酸检测试剂盒上市。近日多家企业设计开发了新型冠状病毒抗原/抗体检测试剂,这类试剂与之前批准的核酸检测试剂在检验原理、试验方法、预期用途等方面均存在差异,下面对此进行简单介绍。一、什么是抗原检测试剂

新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展

  2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。  通过对从患者收集的

一文解读新冠病毒和流感病毒的异同!

  最近几周,新型冠状病毒的爆发成为了新闻头条,但还有另一种病毒在世界各国肆虐:流感病毒。但是这些病毒差异大么,哪一种更令人担忧呢?  到目前为止,这种新型冠状病毒已经导致全球超过89000人患病,3000人死亡。但这和流感比起来就不值一提了。根据美国疾病控制与预防中心(CDC)的数据,仅在美国,这

如何开发新冠病毒检测方法?

  2019新型冠状病毒(2019-nCoV),因2019年武汉病毒性肺炎病例而被发现,2020年1月12日被世界卫生组织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族,已知可引起感冒以及中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS)等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株。 

新研究揭示新冠病毒如何影响心脏

 新华社悉尼10月5日电(记者郝亚琳)澳大利亚昆士兰大学日前发布消息说,一项新研究揭示了新冠病毒如何对心脏产生影响,以及其与流感病毒对心脏影响的差异,这为治疗新冠病毒感染所引起的心脏损伤提供了思路。  这项由昆士兰大学领衔的研究已发表在《免疫学》月刊上。研究报告作者之一、昆士兰大学的库拉辛哈博士说:

一文了解如何拉平新冠肺炎病例曲线

  前往澳大利亚的旅客现在必须自我隔离14天--这是澳大利亚总理Scott Morrison上周末宣布的一系列措施之一,目的是减缓冠状病毒的传播,缓解医院病床上的压力。  流行病学家--研究疾病在不同人群中发生频率及原因的专家--将这种减缓病毒传播的普遍概念称为"曲线变平"。这个词在社交媒体上被广泛

面对新冠病毒-我们应当如何运动

  锻炼对于保持健康的身心至关重要,但是是否可以运动需要考虑环境等各方面的因素。梅奥诊所的运动医学医师Daniel Montero博士就何时运动提供了一些建议。  Montero博士说:“运动是一个医学问题。如果出现例如流鼻涕,打喷嚏,感冒等常见症状,以及鼻塞或流鼻涕或咽喉痛等,那么运动是一种非常有

一文读懂如何测量面粉的质量

  面条制品是目前实现了工业化生产的传统食品之一,并随着食品工业的发展逐渐成为我国及亚洲其他一些国家和地区城乡居民的主要食品之一。品质优良的面条要求结构细密光滑,耐煮,不易混汤和断条,色泽白亮,硬度适中,富有弹性和韧性,有咬劲,滑爽适口。  面粉质量好坏、净含量的准确与否,除了水分对它的影响外,还受

酵母还能快速“重建”新冠病毒基因组?

  据《自然》杂志6日发表的一项合成生物学研究,瑞士一个研究团队开发出一种可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗,同时,拥有合成能力也被认为是未来防治相关疫情的重要一环。  在实验室重建病毒,是一种有效的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时,将病毒样本送至研究机构可

一文详解新冠病毒检测中的咽拭子

  正常人咽峡部培养应有口腔正常菌群,而无致病菌生长。咽部的细菌均来自外界,正常情况下不致病,但在机体全身或局部抵抗力下降和其他外部因素下可以出现感染等而导致疾病。因此,咽部拭子细菌培养能分离出致病菌,有助于白喉、化脓性扁桃体炎、急性咽喉炎等的诊断。  由于呼吸和食物都通过口腔,因此口腔中会有形形色

一文告诉你新冠病毒检测方法是什么?

  在卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第六版)》中,诊断标准描述为:确诊病例需有病原学证据阳性结果(实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性;或病毒基因测序,与已知的新型冠状病毒高度同源)。  问题来了,核酸检测是怎么做到的呢?  首先医护人员要先采集患者的咽拭子样本,样本采集完成后

一文读懂老药新用研究新成果!

  时至岁末,转眼间2019年已经接近尾声,迎接我们的将是崭新的2020年,在即将过去的2019年里,科学家们在老药新用研究领域上取得了多项研究成果,本文中,小编就对本年度相关重要研究进行整理,分享给大家!  图片来源:http://cn.bing.com  【1】Cell Rep:老药新用!一类乳

新发地的新冠病毒基因组序列是什么样的?中疾控公布了

   据中国疾病预防控制中心网站消息,6月18日晚,中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”正式发布2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据。三条数据来自北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)以及环境样本基因组序

一文读懂新型冠状病毒的核酸检测

2019年12月以来,武汉市部分医疗机构陆续出现不明原因肺炎病例。国家药品监督管理局随即启动《医疗器械应急审批程序》。目前,已批准7家企业的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒上市。为进一步合理使用上述产品,有效满足疫情防控需求,现将使用情况做如下说明:1、新型冠状病毒的核酸检测原理所有生物

一文读懂|西湖大学郭天南:多组学对新冠的研究与挑战

  编译 | 陆恬,钱丽琴  作者 | 陆恬,王瑛睿 ,郭天南  COVID-19 仍在全球肆虐,且似乎不会从地球消失。近日,西湖大学郭天南团队在 Cell Reports Medicine 发表评述,在这篇评述中,郭天南等人讨论了多组学技术在揭示 COVID-19 发病、进展和传播背后的分子机制中

一文读懂如何提高色谱柱柱效

  色谱柱的柱效能是评价色谱性能的一项重要指标,混合物能否在色谱柱中得到分离,除取决于选择合适的固定相外,还与色谱操作条件及色谱柱的装填状况等因素有关。那么,如何有效地提高色谱柱的柱效呢?  在一定的色谱操作条件下,色谱柱的柱效可用理论塔板数或理论塔板高度来衡量。一般说来塔板数愈多,或塔板高度愈小,

新冠病毒“物传人”风险多大?如何防范?

北京市和广东省深圳市、珠海市在1月17日分别举行的疫情防控工作新闻发布会上,各自通报了当地本土确诊病例的情况,均研判不排除经境外物品而感染病毒的可能。 为何做出这一判断?新冠病毒通过境外邮件及其他物品“物传人”的风险有多大?个人如何更好地防护?记者依托权威信息来源

如何猜到新冠病毒“喜欢”感染哪些细胞?

  自2019年12月开始,关于新型冠状病毒感染的肺炎疫情就牢牢占据了我们的视线,在一线奋战的医护人员、科研人员,受到疫情影响的同胞们,都触动着我们的神经。  知己知彼,百战不殆。为了对付新型冠状病毒,特别是寻找药物救治被感染的患者,当疫情出现后,我们急需了解它究竟是如何感染人的,特别是它究竟在攻击

新冠病毒“物传人”风险多大?如何防范?

北京市和广东省深圳市、珠海市在1月17日分别举行的疫情防控工作新闻发布会上,各自通报了当地本土确诊病例的情况,均研判不排除经境外物品而感染病毒的可能。 为何做出这一判断?新冠病毒通过境外邮件及其他物品“物传人”的风险有多大?个人如何更好地防护?记者依托权威信息来源

无需PCR,这项技术半小时就能获得新冠病毒基因序列

   当前,针对新型冠状病毒的主要检测技术有免疫、PCR和高通量测序(NGS)三类,其中免疫和PCR方法是一种定向检测,可以对病毒进行筛查,适合对患者标本中是否存在病毒进行诊断。图片来源于网络  高通量测序作为一种全面的基因组检测技术,虽然它可以有效防止病毒变异产生的漏检,但因实验流程耗时长,操作繁

新冠病毒源自哪里?基因组分析解读秒懂

  研究小组分析了2019年12月至2020年3月间测定的各国患者感染的新冠病毒基因组。结果发现全球新冠病毒分为三个有密切“血缘关系”的不同“变体”,分别标记为“A”、“B”和“C”。  美国和澳大利亚的患者主要感染的是A型病毒,在武汉居住的美国人中也发现了A的变异版本。  武汉甚至整个东亚地区主要

新冠病毒胶体金试剂:快速检测新冠病毒

   23日下午,中国工程院院士钟南山在广州医科大学附属第一医院首次与广东对口支援湖北荆州医疗队进行远程会诊。会上,他带来了一个“好消息”:国家批准了两个抗体试剂盒。  “这两种试剂盒都是采用胶体金法,能够测出患者体内的lgM抗体,在患者感染的第7天或发病的第3天就能够检测出lgM抗体,对患者进一步

一文读懂全球新冠疫苗进展-20种疫苗正在进行人体试验!

  《纽约时报》网站载文称,今年1月,SARS-CoV-2基因组的破译工作开始进行,目前世界各地的研究人员正在开发超过145种新冠病毒疫苗,其中20种疫苗正在进行人体试验。文章梳理了已经进行人体试验以及一些仍在进行细胞或动物试验但有望成功的疫苗的进展情况。图片来源于网络  首先,文章将疫苗的测试过程

一文读懂|如何快速消除结核病细菌?

  据印度媒体报道,印度一个研究小组新发现了结核病细菌产生耐药性的机制,并成功通过一种药物组合阻止这种耐药机制被激活,通过两个月治疗就几乎完全清除了小鼠肺部的细菌,且可有效降低复发感染概率。  结核病是由结核杆菌引起的慢性传染病,在印度的发病率和死亡率都较高。据《印度教徒报》近日报道,印度科学研究所

新冠病毒核酸检测结果如何解读

病毒核酸检测具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点,使用最广泛的是实时荧光定量RT-PCR技术。一般检测位于病毒ORF1ab和N基因上的两个靶标,同一份标本需满足双靶标阳性或重复检测为单靶标阳性或两种标本同时满足单靶标才能确认SARS-CoV-2病毒核酸阳性。新型冠状病毒肺炎发病3~5天后,血清特异性

一文读懂range()函数

range()函数在其他语言中,如果想要循环一个变量从1到100,要怎么写呢?python怎么实现这个功能呢?python设计了range()函数,直接实现了上面的功能。range是内置函数,无须导入。在任何地方都可以直接使用它。              

一文读懂JCR分区

  目前,根据JCR分区表对SCI论文进行评价的模式已被国内部分高校和科研机构采纳,因为它有利于鼓励科研工作者向本学科的高级区域投稿。国内主流参考的SCI分区依据主要有中科院JCR分区表以及汤森路透JCR的Journal Ranking分区两种。其中,中科院期刊分区表则被更多的机构采纳以作为科研评价