利用荧光光镊系统对Cas9脱靶效应进行实时可视化评估
CRISPR-Cas9作为一种有效的基因编辑方法,在疾病预防与治疗中具有巨大的潜能,但是在临床转化中必须要考虑到它的脱靶效应。传统的生物学手段如电泳或测序等,虽然也可以用来研究Cas9的靶向性,但是其结果大多数为静态的、平均的。2019年3月发表在Nature Structural and Molecular Biology期刊上的最新文章 ,采用最新的荧光光镊技术,利用光镊操纵DNA模板,结合共聚焦荧光显微成像系统,实现了在单分子水平动态的观察Cas9对目的基因的靶向编辑。结果表明,当DNA松弛时,CRISPR的编辑具有特异性,但是当DNA被拉伸时,CRISPR编辑准确性降低,并出现脱靶编辑,其脱靶的概率随着受力的增加而增加。这项研究将有助于设计具有更高准确度的CRISPR系统。Hold the molecule & Look at it! 深入了解单分子的相互作用有助于科学家更好地回答最基本的生命科学......阅读全文
利用荧光光镊系统对Cas9脱靶效应进行实时可视化评估
CRISPR-Cas9作为一种有效的基因编辑方法,在疾病预防与治疗中具有巨大的潜能,但是在临床转化中必须要考虑到它的脱靶效应。传统的生物学手段如电泳或测序等,虽然也可以用来研究Cas9的靶向性,但是其结果大多数为静态的、平均的。2019年3月发表在Nature Structural and Mo
哈佛大学实验室发现CRISPR/Cas9存在严重脱靶效应
哈佛大学David R Liu实验室利用体外筛选和高通量测序检测CRISPR/Cas9的脱靶,针对CLTA基因的四个不同靶位点共设计了八条不同序列的gRNA,即每个靶位点有两条gRNA,结果发现,四个靶位点均存在脱靶现象,脱靶效率最高可达 84%,同时CRISPR/Cas9的特异性仅与g
全基因组测序揭示CRISPR-/-Cas9在葡萄上的脱靶效应
近日,Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的
Sci-Rep:科学家利用全息光镊技术对细胞微环境进行研究
近日,刊登在国际杂志Scientific Reports上的一篇研究论文中,来自诺丁汉大学的研究人员通过研究构建了一种新型微观细胞,其可以帮助开发治疗疾病的新型疗法,这种微观细胞可以被操作,并且可以利用高强度的红外线来进行3D模式的研究。 文章中研究者发现如何利用全息光镊技术(Holograp
CRISPRCas9基因编辑系统在灵长类中不会导致明显脱靶效应
CRISPR-Cas9基因编辑系统已被广泛应用于生物和医学研究,研究人员正在尝试利用这一系统进行人类疾病的基因治疗。然而,CRISPR-Cas9系统在临床前的安全性却缺少全面的评估。之前有研究表明,CRISPR-Cas9系统在小鼠中会造成大量脱靶突变。此外,对细胞系的研究发现,Cas9编辑细胞的
利用CRISPR/CAS9对人类干细胞系进行可诱导基因敲除
近日,来自美国威斯康星大学的华人科学家Su-Chun Zhang在国际学术期刊Cell Stem Cell发表了一项最新研究进展,他们利用CRISPR/CAS9技术实现了对人类干细胞系进行可诱导基因敲除,这一方法的成功对于研究基因在干细胞及分化不同阶段中的作用具有重要推动作用。 对基因表达进行
利用纳米磁铁对体内CRISPR/Cas9基因组编辑进行空间控制
在自然界中,CRISPR/Cas9通过记录入侵者的DNA来增强细菌的免疫防御。这让细菌能够识别和攻击再次到来的相同入侵者,但是科学家们一直在竞相改进基因组编辑工具CRISPR/Cas9来修复导致遗传疾病的突变并在实验室实验中操纵DNA。 如果科学家们能够将这种基因组编辑工具运送到体内正确的细胞
成都学者利用双核素失踪技术对防风固沙效益进行评估
风沙灾害是我国北方干旱和半干旱区主要的生态环境问题之一,对该区社会和经济的可持续发展造成影响。我国实施的“三北”防护林工程,减少了“三北”地区的荒漠化和沙尘暴。但由于地面监测资料欠缺,单纯依靠遥感手段难以科学评估“三北”防护林效益。中国科学院成都山地灾害与环境研究所副研究员苏正安利用137Cs和
研究发现CRISPRCas9在非人灵长类中不会导致明显脱靶效应
CRISPR-Cas9基因编辑系统已被广泛应用于生物和医学研究,研究人员正在尝试利用它进行人类疾病的基因治疗,然而,它在临床前的安全性方面还缺少全面评估。记者从中科院昆明动物研究所了解到,近期该所多个课题组合作,发现这一基因编辑系统在非人灵长类中不会导致明显脱靶效应,因而有较高安全性。研究成果发
利用循环水浴系统对电子烟油粘度进行测定
电子烟广泛用来作为戒烟产品或传统香烟替代品使用。烟油是电子烟中最重要的组成部分,决定了电子烟的口感,风味及消费者的吸食感受。由于烟油和吸食设备的多样性和可玩性,电子烟也因此迅速发展成为了一种青年亚文化,不少人从“使用者”变成了“爱好者”。粘度是影响电子烟油流动性及电子烟雾化器导油性的重要因素。
利用CRISPR/Cas9系统可拯救失明小鼠
英国《自然·通讯》杂志发表一项遗传学重要研究成果,一种基因组编辑方法能够阻止小鼠视网膜退化,进而拯救失明小鼠。其所述方法利用了CRISPR/Cas9基因治疗系统,可适用于导致色素性视网膜炎(失明的主要原因)的各种潜在遗传缺陷。 色素性视网膜炎无法医治、不易觉察,对患者眼睛造成极大危害而且具有遗
Nature子刊:基因组编辑新技术
许多的实验室都在利用近期发现的一种细菌和古细菌天然防御机制作为基因组编辑工具。与真核生物的RNA干扰过程相似,这一CRISPR-Cas系统通过序列特异性切割外源核酸,保护了原核生物免受病毒攻击。而CRISPR-Cas系统有可能发生非特异性靶向,导致基因组别处突变,也引起了人们越来越多的关注。
遗传发育所-个体水平发现单碱基编辑系统存在脱靶效应
人类遗传疾病和农作物农艺性状很多情况下是由基因组中的单个或少数核苷酸的突变引起的。因此,基因组中关键核苷酸变异的鉴定与定向修正是人类遗传疾病治疗及动植物育种的重要方向。基因组编辑工具单碱基编辑器的开发,为定向编辑和修正基因组中的关键核苷酸变异提供了重要工具,展现了其在遗传疾病治疗与动植物新品种培
基因编辑新进展:-关键酶消除CRISPRCas技术脱靶效应
近来全球兴起的CRISPR-Cas编辑技术是基于细菌和古细菌天然防御机制的一项技术。与真核生物体内的RNA干扰过程极为相似,CRISPR-Cas 技术能够特异性切割核酸片段,不过该技术也有可能发生非特异性切割,引起基因组非靶向位点的突变,这一问题越来越受到科研人员的关注。 CRISPR
LUMICKS-CTrap-G2荧光光镊系统
仪器名称:LUMICKS C-Trap G2荧光光镊系统仪器编号:21004752产地:荷兰生产厂家:Lumicks型号:C-Trap G2出厂日期:购置日期:2021-03-26所属单位:医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机组放置地点:医学楼C129固定电话:固定手机:固定em
先进科学:基因编辑如何摆脱“脱靶”困扰
基因组编辑技术是当前生命科学研究的前沿领域。在多种不同的基因组编辑方法,以CRISPR/Cas9系统最为便捷、高效,应用也最广泛。 但CRISPR技术存在的脱靶效应依旧是影响其能否广泛应用的主要限制因素,如何正确评估、检测脱靶效应,并提出相应的策略降低脱靶效应,是当前基因编辑研究领域的重要研究
基因测序技术升级检测CRISPR脱靶效应
政府主导致效率低 2014年末,习近平总书记前往镇江视察时发表过如下言论:“一些大医院始终处于‘战时状态’的状况需要改观。”新医改启动至今已是第七年,但因患者在大医院高度拥堵造成的看病难、看病贵却丝毫不见缓解,反而有所加剧,习总书记所指出的,正是这一轮医疗卫生体制改革最亟需解决的问题。 相关
清华大学Cell子刊发表CRISPR新文章
来自清华大学、哈佛医学院和斯坦福大学等机构的研究人员,通过优化sgRNA的参数提高了CRISPR/Cas9系统在果蝇中的特异性和效率。研究结果发布在10月23日的《Cell Reports》杂志上。 清华大学医学院的倪建泉(Jian-Quan Ni)博士和斯坦福大学的Jin Billy Li教
Editas创始人再破“脱靶效应”,向精准CRISPR时代迈进!
在CRISPR系列的基因编辑系统中,Cas9酶是一个非常关键的组成部分,更是“元老级”的成员,但是CRISPR/Cas9的脱靶效应是一直急需攻克的难题。在CRISPR技术向医学临床不断转化的过程中,科学家们正想法设法的解决这一重大技术难题,希望形成更精准的基因编辑系统。 1月6日,发表在《自然
LUMICKS荧光光镊系统在相分离研究领域的应用
相分离 (Phase separation)是目前发展非常迅速的一个研究领域,大量研究表明相分离在细胞中普遍存在,与基因组的组装、转录调控等生物学过程密切相关;相分离的失衡可能会导致一些疾病(如神经退行性疾病)的发生,通过干扰异常“相分离”也有希望会成为治疗相关疾病的新手段。由于技术的限制,研究
西北农大张涌团队利用CRISPR技术培育出抵抗结核病的奶牛
在一项新的研究中,来自中国西北农林科技大学动物医学院的研究人员首次利用CRISPR/Cas9基因编辑技术成功地培育出具有增加抵抗牛结核病能力的奶牛。相关研究结果于2017年2月1日发表在Genome Biology期刊上,论文标题为“Single Cas9 nickase induced gen
利用I型CRISPR/Cas系统对人细胞进行靶向转录调节
在一项新的研究中,美国杜克大学生物医学工程副教授Charles Gersbach、Gersbach实验室博士后研究员Adrian Oliver及其团队首次描述了他们如何成功地利用I型CRISPR系统开启和关闭基因,并对人细胞中的表观基因组进行编辑。他们希望这能够极大地扩展生物医学工程师可用的基于
Nature Methods:两种新型 CRISPR 脱靶效应的分析方法
昨日,在 Nature Methods 同时刊登的两篇研究中,发表了两种分析 CRISPR/Cas -9 基因组编辑脱靶效应的新方法。其中一种方法可以鉴定细胞类型特异性 SNP 相关的脱靶突变,另一种则可以检测潜在脱靶切割位点。 第一项研究中,来自麻省综合医院(MGH)和哈弗大学的研究人员开发
CRISPR好不好用,还要看基因?
来自哈佛医学院、波士顿儿童医院和蒙特利尔大学的研究团队发现“一刀切”的基因编辑疗法可能并不会对所有患者产生有相同的疗效,基因编辑技术或许也需要根据每位患者的基因序列加以调整,以实现最大化的功效和防止潜在有害的脱靶效应。 “人类的基因序列各有不同,而将“标准化”的基因序列作为参考并不能顾及所有差
杨辉组/高彩霞组发现单碱基编辑系统存在严重脱靶效应
2016年,David Liu团队在 Nature 期刊上首次报道了基于胞嘧啶脱氨酶APOBEC1(能催化C脱氨基变成U,而U在DNA复制过程中会被识别成T)和尿嘧啶糖基化酶抑制剂UGI(能防止尿嘧啶糖基化酶将U糖基化引起碱基切除修复)的单碱基编辑工具(BE3)首次实现可以在不引入DNA双链断裂
在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术(二)
四.CRISPR/Cas9技术与新一代测序技术的联用 革命性技术总是发展迅速、应用广泛的。作为另一项革命性的生命科学研究技术,DNA新一代测序技术在近五、六年得到快速发展和推广。它已经用于生命科学相关领域的许多方面。同样地,也可以用在CRISPR/Cas9相关的研究中。两者之间的应用领域有许多交叉或
实时荧定量PCR仪在医学诊断中的应用
基因扩增仪俗称PCR仪,是进行基因研究过程中必不可少的一种仪器。正是因为其特殊的工作原理,在很多的方面都有一定的应用。只要我们能想想到的与基因有关的研究都用得到PCR仪,因为有些时候我们收集到的样品是很少的,如果不通过基因扩增手段根本满足不了实验的要求。 基因扩增仪又叫PCR仪或者热梯度循环仪
实时荧定量PCR仪在医学诊断中的应用
基因扩增仪俗称PCR仪,是进行基因研究过程中必不可少的一种仪器。正是因为其特殊的工作原理,在很多的方面都有一定的应用。只要我们能想想到的与基因有关的研究都用得到PCR仪,因为有些时候我们收集到的样品是很少的,如果不通过基因扩增手段根本满足不了实验的要求。 基因扩增仪又叫PCR仪或者热
完美基因编辑:-新方法可消除CRISPRCas的脱靶效应
前段时间,麻省理工的研究人员发现基因编辑工具CRISPR-Cas系统具有脱靶效应。近日,这个研究小组的负责人张峰教授表示,他们已经找到了影响CRISPR-Cas系统精确度的关键因素,这一发现将使该系统在人类细胞中的应用更安全。目前,这一研究发表在Nature Biotechnology上。
杨力课题组等开发出变形式碱基编辑新系统
5月10日,Nature Cell Biology在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所研究员杨力课题组与合作者在碱基编辑研究领域发布的最新进展——Eliminating base-editor-induced genome-wide and transcriptome-wide off-ta