ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（一）
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。最新的报道表明：ctDNA（羟）甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物，还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下，ctDNA（羟）甲基化检测既具有极高的科研价值，又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能，为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA（羟）甲基化测序，仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA（羟）甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA（羟）甲基化图2. ctDNA（羟）甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器：ct......阅读全文
一代测序，二代测序，三代测序的优点缺点
一代测序，二代测序，三代测序的优点缺点分别介绍如下：一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低，使得de novo测序、转录组测序等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本，保持了较高准确性，并且大幅降低了测序时间，将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面
焦磷酸测序技术原理及应用
焦磷酸测序（Pyrosequencing）技术 焦磷酸测序技术(pyrosequencing)是由Nyren等人于1987年发展起来的一种新型的酶联级联测序技术，焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析，其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美，而速度却大大的提高。焦磷酸测
Genome－research：不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
数字PCR在精准医学领域的十大应用
数字PCR是一种新的核酸检测和定量方法，借助微液滴或微坑，通过单个模板分子的PCR扩增，可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、绝对定量。数字PCR使得反应更灵敏、结果更可靠、展示更直观，尤其适用于微量或痕量DNA检测与定量。下面我们就目前已经比较明确的数字PCR应用方向做个介绍。基因表达差异研究数
Illumina将发布全新液体活检与大样本量肿瘤检测方案
Illumina宣布即将推出其第一款用于检测癌症生物标志物的液体活检解决方案——TruSight™ Oncology 500 ctDNA（TSO 500 ctDNA）。TSO 500 ctDNA是Illumina的肿瘤全景变异分析产品系列TruSight Oncology 500（TSO 500
全新一代测序技术：没有光的测序
至今，新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心 ――明斯特大学Dag Harmsen 在去年召开的美国微生物学会上，来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言，这场疫情首先在德国北部地区爆发，感染了至少4000人，夺去了超过
一代测序和二代测序的区别
一、含义不同：第一代测序：指双脱氧末端终止法，扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。第二代测序：为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二、作用不同：San
车用流量计故障分析案例（一）
毛病一：奥迪A6，APS型发动机怠速不稳，局部负荷冒黑烟，且有时换档熄火。 检测进程：电脑内毛病存储为空气流量计毛病，但详细检测空气流量计电路时状况正常，且用VAG1552执行功用01—08读取数据快，怠速时进气量为2.5g/s，契合规范。但照样改换空气流量计毛病照旧，改换电脑后冷车正常，热车
LED灯具谐波抗扰度测试案例（一）
LED具有光照质量佳、能耗低、寿命长、体积小等优点，正在逐步取代传统日光灯、荧光灯等，广泛应用各个领域。在实际应用中，电网谐波对LED灯具工作产生不可忽视的影响。如某新工厂安装一批LED灯具，调试阶段发现LED灯具发光闪烁，严重影响照明质量。现场对电网电能质量分析，结果显示3／5／11次谐波含量均
ATS声波移液原理及应用案例（一）
ATS诞生于专注技术研发，低调的美国公司EDC，并很快地被GSK，Novartis，Merck，Pfizer 等公司采用。Broad Institute和美国伯克利国家重点实验室也在文章中标注采用ATS进行基于定量PCR 的高通量药物筛选和高通量质谱分析实验。 ATS到底是怎样一个技术？ 让我们
重结晶的原理和经典问题案例（一）
在有机合成实验和药物生产的过程中，我们最常用的纯化方式当属重结晶了，所以如何进行正确的重结晶操作很重要，但了解重结晶原理和与之相关案例同样不容忽视。 重结晶(recrystallization)(chóngjiéjīng)是将晶体溶于溶剂或熔融以后，又重新从溶液或熔体中结晶的过程。重结晶可以使不
航天器用低频电缆网设计案例（一）
航天器的低频电缆网是航天器总体电路分系统的重要组成部分，其主要功能包括：① 实现航天器各电子设备间供电与信号的传输。② 为电子设备和“地”之间建立低阻抗电传导通路。③ 提供航天器与运载火箭及与地面测试设备的电气接口。④ 实施对航天器火工品、太阳电池阵驱动机构、蓄电池组等的安全保护。本篇对某航
临床案例——不一样的紫癜
临床工作三十年，总有些案例没齿难忘，漏诊误诊防不胜防，这是一个本院家属的孩子。 患者女，7岁，因腹痛3天门诊就诊，3天前无明显诱因出现腹痛，以脐周为主，时轻时重，在家以肠痉挛对症治疗，效果欠佳，腹痛加重，伴有呕吐，呕吐所进食物，无发热，排大便不缓解，大小便肉眼下正常。既往健康。
不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEA
生物实验室实战经验分享（一）
平时在实验室最常听到的一句话就是“今天某某试验没做好是为什么?今天某某试验没出结果是什么原因?今天某某试验为什么会是这样的呢?” 等等。然后仔细一查找原因，往往是由于操作上面的不认真，或是一些小小的细节没有注意到。以下是集各路朋网友的一些实战经验，在此与大家分享。 1. 跑pa
分享一下早期热导率测试的方法
早的热导率测试使用静态方法，它的普遍特点是操作人员在已知样品的壁厚上建立温度梯度，并控制从一边传递到另一边的热量。常用的热流是一维的，但有时也会使用其它的形式。在测量中常用的变量是Guarded Hot Plate(GHP)。 GHP是指防止热量通过边界从系统散发出去的一种设置，例如在样品周围设
从全球精准医疗进展看未来投资机会
01 全球精准医疗进展 自2015年美国前总统奥巴马提出“精准医学计划”后，精准医疗概念迅速席卷全球，近年来更呈逐年加速趋势，各种新技术、新产品不断出现。 基因测序的成本进一步降低至100美元，解读效率进一步提升。 2017年1月，基因测序行业巨头美国Illumina公司推出全新测序仪，将
九大测序平台对比（一）
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流
九大测序平台对比（一）
1.sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流型号：3730XL样品要求：PCR产物：浓度≥50ng/ul 体积≥10ul；质粒：含量≥5ug；菌液：体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法：Sanger法测序的原理就是，每个反应含有所有
一代测序及其应用
一代测序及其应用
LightBench全自动核酸电泳分析回收系统助力ccfDNA检测研究
循环游离DNA（circulating cell-free DNA，ccfDNA）是人及动植物体液中、在细胞外，处于游离状态的DNA 分子。作为一种非入侵性的疾病诊断标志物，ccfDNA的检测有望替代目前的侵入性方法，在早期实现疾病的诊断和监控。因此ccfDNA在在液体活检领域掀起一阵新风暴。
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
肝脏再生与类器官形成中表观遗传重塑过程
在成体肝脏中，生理条件下细胞迭代的速率较低。而肝脏遇到组织损伤的情况下，细胞则能够高效地发挥再生能力【1-4】。最近有研究发现，胆管细胞能够发展成为具有自我更新能力的肝脏类器官，并且具有分化成为肝细胞和导管细胞的能力【5】。但是胆管细胞获得细胞可塑性、起始类器官发育以及应对组织损伤的再生能力是如
CTC何时带来检验医学的春天
“如果CTC开到检验科，将来医生可能会照检验人员要精准的、个体化的诊断结果；CTC做下去，未来检验科可能就能向患者提供精准的药物筛选结果，这对于检验人员来说，真是意味着春天的到来。”在近日在京召开的第一届长城检验医学会议循环肿瘤细胞（Circulating Tumor Cell ，简称CTC）前
关于第三代测序技术的应用—甲基化研究的介绍
SMRT技术采用的是对DNA聚合酶的工作状态进行实时监测的方法，聚合酶合成每一个碱基，都有一个时间段，而当模板碱基带有修饰时，聚合酶会慢下来，使带有修饰的碱基两个相邻的脉冲峰之间的距离和参考序列的距离之间的比值结果大于1，由此就可以推断这个位置有修饰。甲基化研究中关于5mC和5hmC（5m
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一：非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序：又称Sanger测序(多分子，单克隆) 历史：第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174)，全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
一代测序、二代测序和三代测序各有什么优势
一代测序、二代测序和三代测序的优势如下：第一代测序：指双脱氧末端终止法，（Sanger法）扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。优势：由于ddNTP的2’和3’都不含羟基，其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例带
一代测序、二代测序和三代测序各有什么优势
一代测序、二代测序和三代测序的优势如下：第一代测序：指双脱氧末端终止法，（Sanger法）扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。优势：由于ddNTP的2’和3’都不含羟基，其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例带
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序：又称Sanger测序(多分子，单克隆) 历史：第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174)，全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用