当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进入单细胞时代，由于细胞异质性的存在，比起在组织水平上的研究，单细胞水平的变化研究能更好的探究细胞水平上的分子差异。单细胞基因组、转录组、蛋白组已有较成熟技术，目前代谢组学还相对停留在体液和组织水平，通过对体外培养的同一类细胞样品进行代谢组学检测，与单细胞研究较为接近。尽管如此，代谢组学的结果通过与其他单细胞组学结果的联合，仍然能为整个研究提供更深层次的相互印证解读，从而更好地解决探索相关科学问题。文献案例一：代谢组学结合蛋白组学助力新冠诊疗研究背景：该案例为迪安凯莱谱代谢组学实验室2020新冠病毒肺炎研究科研成果。项目由迪安凯莱谱代谢......阅读全文
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
当宏基因组遇上单细胞测序
日前，科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性，但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上，研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
告别平均！单细胞代谢组学技术“精准签发”每个细胞的代谢履历
在生命科学研究领域，代谢组学致力于剖析生物体代谢物的奥秘。传统代谢组学研究聚焦群体细胞，忽略了细胞间的代谢异质性，使得单个细胞的独特特征被群体平均属性掩盖，难以满足精准研究需求。单细胞代谢组学应运而生，它能深入细胞亚群精准分析，挖掘被忽视的关键信息。单细胞代谢物浓度极低且代谢物无法扩增，导致对检
机器学习遇到单细胞组学：Perturbation－Modeling
细胞生物学的相关研究一直受限于数据的完整性和表型的完整性，对应激状态和稳态下的细胞区别观察不够充分。过去五年中，计算机视觉和语音识别领域通过对大量的无标签数据进行学习、建模，很好的解决了数据不足的问题。同样在最近的研究中，机器学习方法使用单细胞数据进行扰动建模也推动了细胞生物领域前进。
当免疫治疗遇到基因组学
近来一种能够激活人体自身免疫系统对付肿瘤的新药大获成功，然而，只有部分癌症患者得以受益。科学家们近来发现编码肺部肿瘤的基因序列有可能能够帮助我们预测免疫药物能够让哪些人受益最多。 肿瘤细胞之所以能否逃脱人体免疫系统的监视，是通过激活了免疫T细胞表面一个叫做PD-1的受体。该受体被激活以后，T细
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
单细胞测序技术的技术特点
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。 它具有以下几个重要特点和优势： 1. 揭示细胞异质性：能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异，识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化：追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹，揭
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
华大基因再出手－单细胞转录组学测序技术的系统分析
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-seq)是在单细胞水平对转录组（mRNA）进行测序的一项新技术，可发现细胞群体中真正起作用的细胞，特别适合对高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体进行研究，认识细胞分子机制和基因调控网络。单细胞RNA-seq技术需要在测序前制备文库
Nat－Methods：当免疫学与单细胞测序结合－完美！
近日，来自威康基因组校园单细胞基因组学中心的研究者通过研究改变了我们观察基因表达和免疫反应的方式，相关研究刊登于杂志Nature Methods上，文章中研究者开发了一种名为TraCeR的方法，该方法可以作为一种强有力的工具帮助深入进行免疫反应、疫苗、癌症及自身免疫疾病等研究。 是什么机制促进
单细胞测序技术的技术优势
单细胞测序技术具有许多优势：揭示细胞异质性：能够发现不同细胞之间基因表达和遗传变异的差异。研究细胞发育和分化：追踪细胞在发育过程中的动态变化和谱系关系。解析复杂组织：剖析组织中各种细胞类型的组成和功能。助力疾病研究：在肿瘤学中，有助于了解肿瘤细胞的进化、异质性和耐药机制。
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同？
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同：空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
－Science：宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
测序技术再现新进展，已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术
单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面（例如基因组、表观基因组和转录组）的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系，有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年，Nature Me
单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用
近期，中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》（Journal of Hepatology）上，发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞，随着增殖不断地改变形状和功能，最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
单细胞脂质组学技术的机制及意义
5月17日，清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术，实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析，解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量，该团队实现了野生型非小细胞肺癌（HCC827）细胞群体中耐药细胞的
北大团队发展最新单细胞多重组学测序技术
单细胞三重组学测序技术（scTrio-seq）单细胞中三种组学之间的对应关系癌症中两个细胞亚群的DNA拷贝数差异 2016年2月23日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组、黄岩谊研究组和首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大
单细胞测序新技术：同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
科学家开发单细胞全转录组测序新技术
北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备，全面提高了单细胞全
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学（SSCM）能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征； * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像； * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict
单细胞和空间组学技术在肝脏领域的应用
近期，中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》（Journal of Hepatology）上，发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
2015－年代谢组学技术高级培训班通知
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统 生物学的重要组成部分。已在疾病诊断、医药研发、精准医学、营养食品科学、 毒理学、环境学，植物学等领域得到广泛应用。 中国的代谢组学与国际在同步发展，到目前为止，中国人发表的代谢组学相 关的文章数量已在国际上排第
代谢组学技术在临床医学中的应用
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科，它通过对人体内小分子代谢物（50~1,500 Da）进行精准定性定量，分析代谢物与人体生理病理变化的关系，研究疾病发生发展、寻找疾病生物标记物、预测疾病预后等。代谢组学在临床诊断上将有广阔的发展前景，主要应用方向有四个方面：在临床诊断（B
时空分辨单细胞测序技术的原理
时空分辨单细胞测序技术的原理通常包括以下几个关键步骤：单细胞分离和捕获利用微流控技术、激光捕获切割或荧光激活细胞分选等方法，从组织样本中分离并捕获单个细胞，同时尽量保持细胞的完整性和生物活性。空间定位标记通过特定的标记方法，如给组织切片进行区域划分、使用特定的条码标记或成像技术，记录每个细胞在原始组