SMAD2/3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6ARNA甲基化调...
SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读:胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一篇英国剑桥大学研究团队于2018年8月发表在Nature(影响因子:40.14)文章,聊一聊RNA甲基化在调控胚胎干细胞分化过程中的作用机制。这篇文章的开头很直接,首先通过阅读文献确定了感兴趣的基因SMAD2/3,对其进行Co-IP和质谱后,结果显示其能够与甲基化转移酶METTL3,METTL14和WTAP直接互作。他们是明星,和他们结合的分子也是明星分子,这不,在胚胎干细胞当中有研究者就发现SMAD2/3就和METTL3,METTL14结合,不出所料,这一结......阅读全文
SMAD2/3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6A-RNA甲基化调...
SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读:胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚
SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育
文章导读: 胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一
与-TGFβ信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物,HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA,circRNA作为一种新型环状RNA,具有共价闭合环状结构,在组织和血液中具有
揭示Y染色体上LncRNA-TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你! 2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell
与-TGFβ信号通路相关因子介绍SMAD3
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白作为一种转录调节剂,被转化生长因子β激活,并被认为在致癌过程中发挥调节作用。[由RefSeq提供,2009年4
揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)
近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)
近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D
与-TGFβ信号通路相关因子介绍PIK3CA
PIK3CA基因编码的蛋白是PI3Ks的催化亚单位,PI3Ks是一种脂激酶家族,能特异性磷酸化磷脂酰肌醇的3位羟基,产生第二信使肌醇类物质。PI3Ks家族分I型、II型和III型,其中IA型又分为IA和IB两个亚型,PIK3CA则是IA型的催化亚单位。PIK3CA基因的突变可以导致PI3Ks的催化活
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
文章导读 2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表
云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用
导读 RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。 近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2
2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能 发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.147发表日期:2018.06.01实验方法: m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供) 上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发
m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化研究
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化
与Hippo信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
与-Wnt信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
与Hippo信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
与-Wnt信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258
m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个
动物所等在Factin调控TGFβ受体内吞研究中取得进展
TGF-β超家族包括四十多种序列相似性的分泌型蛋白,根据其功能的差异分为TGF-β/Activin/Nodal和BMP/GDF/MIS两个亚家族。Nodal是TGF-β超家族成员之一,在脊椎动物胚胎中内胚层诱导、神经图式形成、原肠运动、内脏器官左右不对称等发育过程中具有广泛而重要的作用。在胚胎早
与-TGFβ信号通路相关因子介绍CBFB
该基因编码的蛋白质是属于pebp2/cbf转录因子家族的异二聚体核心结合转录因子的β亚单位,该转录因子家族主要调控造血(例如runx1)和成骨(例如runx2)特异性基因的宿主。β亚单位是一种非DNA结合调节亚单位;当复合物与各种增强子和启动子(包括小鼠白血病病毒、多瘤病毒增强子、T细胞受体增强子和
与-TGFβ信号通路相关因子介绍AR
雄激素受体(AR),也称为NR3C4(核受体亚家族3,C组,成员4),是一种核受体,通过结合任何雄激素激活,包括睾酮和二氢睾酮在细胞质中,然后易位到细胞核。 雄激素受体与孕酮受体的关系最为密切,较高剂量的孕激素可以阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调节基因表达的DNA结合转录因子; 然而,
与-TGFβ信号通路相关因子介绍TNF
该基因编码一种多功能促炎细胞因子,属于肿瘤坏死因子(TNF)超家族。这种细胞因子主要由巨噬细胞分泌。它能与受体TNFRSF1A/TNFR1和TNFRSF1B/TNFBR结合并通过其发挥作用。这种细胞因子参与调节广泛的生物学过程,包括细胞增殖、分化、凋亡、脂质代谢和凝血。这种细胞因子与多种疾病有关,包