SMAD2/3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6ARNA甲基化调...

SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读:胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一篇英国剑桥大学研究团队于2018年8月发表在Nature(影响因子:40.14)文章,聊一聊RNA甲基化在调控胚胎干细胞分化过程中的作用机制。这篇文章的开头很直接,首先通过阅读文献确定了感兴趣的基因SMAD2/3,对其进行Co-IP和质谱后,结果显示其能够与甲基化转移酶METTL3,METTL14和WTAP直接互作。他们是明星,和他们结合的分子也是明星分子,这不,在胚胎干细胞当中有研究者就发现SMAD2/3就和METTL3,METTL14结合,不出所料,这一结......阅读全文

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2

2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能  发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.147发表日期:2018.06.01实验方法: m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供)  上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发

动物所等在Factin调控TGFβ受体内吞研究中取得进展

  TGF-β超家族包括四十多种序列相似性的分泌型蛋白,根据其功能的差异分为TGF-β/Activin/Nodal和BMP/GDF/MIS两个亚家族。Nodal是TGF-β超家族成员之一,在脊椎动物胚胎中内胚层诱导、神经图式形成、原肠运动、内脏器官左右不对称等发育过程中具有广泛而重要的作用。在胚胎早

广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展

  9月8日,中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2

(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258

与-TGFβ信号通路相关因子介绍PIK3C2B

该基因编码的蛋白属于磷酸肌醇3激酶(pi3k)家族。pi3激酶在参与细胞增殖、癌基因转化、细胞存活、细胞迁移和细胞内蛋白质转运的信号传导途径中发挥作用。该蛋白包含一个脂质激酶催化结构域和一个C末端C2结构域,这是II类PI3激酶的特征。C2结构域作为钙依赖性磷脂结合基序,介导蛋白质向膜的转运,也可能

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义,该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1

一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所

动物所揭示细胞核内Net1调控TGFβ信号转导机制

  Nodal是TGF-β超家族成员之一,在脊椎动物胚胎中内胚层诱导、神经图式形成、原肠运动、内脏器官左右不对称等发育过程中具有广泛而重要的作用。中国科学院动物研究所研究员王强领导的研究组主要从事TGF-β家族跨膜信号转导通路在胚胎早期发育及组织器官形成中的调控机制研究。他们在原肠期斑马鱼胚胎中系统

m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇

一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学

动物所揭示细胞核内Net1调控TGFβ信号转导机制

  Nodal是TGF-β超家族成员之一,在脊椎动物胚胎中内胚层诱导、神经图式形成、原肠运动、内脏器官左右不对称等发育过程中具有广泛而重要的作用。中国科学院动物研究所研究员王强领导的研究组主要从事TGF-β家族跨膜信号转导通路在胚胎早期发育及组织器官形成中的调控机制研究。他们在原肠期斑马鱼胚胎中系统

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  文章导读   m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院

与血管生成信号通路相关因子介绍SMAD2

由该基因编码的蛋白质属于smad,一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’(mad)和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子(tgf)-β的信号,从而调节多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular

不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究

  lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。   RNA甲基化,作为最新的国

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(二)

2.4  m6A参与肿瘤免疫过程最初的文献报道,m6A甲基化通过靶向IL-7/STAT5/SOCS轴参与调控T细胞稳态。Toll样受体(TLRs)是内源性免疫系统中最保守的分子,是针对病原体的第一道防线。带有m6A甲基化修饰的RNA分子不能活化部分TLR分子,这一过程导致TLR受体不能识别包含病毒核

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

Nature-Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制

m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  文章导读   表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

核酸研究揭秘m6A调控胃癌细胞EMT过程

1.METTL3的临床相关性TCGA数据库中胃癌数据的搜索结果显示METTL3在胃癌组织中高表达且与较差的临床预后相关,这一趋势在对60例病人的qPCR验证结果中保持一致,且METTL3的表达量与分期分级呈一定相关性。重要的是,METTL3在弥散型胃癌(diffuse-type GC)样本中的表

“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇

关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育

SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:R

lncRNA甲基化如何研究?

lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到

SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能

  RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。   近三个月高分文章部分列表:   2月28日

解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)

  云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测

m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在