2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集公布
近日,国家微生物科学数据中心发布了由中国科学院微生物研究所、中国人民解放军军事科学院军事医学研究院、中国科学院海洋研究所等单位牵头的2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集,所有公开数据通过国家微生物科学数据中心门户对国内外科学家共享(www.nmdc.cn)。此次共开放数据集107个,来自于2019年结题的7个项目、20个数据提交单位,数据集涵盖2012-2019年23个省份的微生物菌种资源数据、标本数据、DNA条形码数据,还包括专项形成的志书、报告、标准规范等文档数据。其中,菌种数据865个属39 757条,标本数据858个科,2108个属,58 555条,图片96 600张,序列文件538 300条,2015-2019《西藏地区极端特色微生物菌种名录》、《中国大小兴安岭真菌名录》等志书25本,《青藏高原及新疆地区特色微生物资源与多样性调查报告》等调研报告6份,标准规范5份。图1. 2019微生物领域科技基础性工......阅读全文
2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集公布
近日,国家微生物科学数据中心发布了由中国科学院微生物研究所、中国人民解放军军事科学院军事医学研究院、中国科学院海洋研究所等单位牵头的2019年科技基础性工作专项微生物领域项目数据集,所有公开数据通过国家微生物科学数据中心门户对国内外科学家共享(www.nmdc.cn)。此次共开放数据集107个,
“微生物领域云”项目启动
4月25日,“十二五”科研信息化科技领域云项目“微生物领域云”项目启动会在中科院微生物研究所举行。 启动会由中科院微生物所科技处处长杨怀义主持,李彦副所长致欢迎辞。项目负责人微生物所信息中心马俊才研究员对项目总体情况进行了汇报。随后,四个子课题组分别就其研究内容依次进行了汇报
人类肠道微生物基因集-为研究提供精准数据支持
7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。 据介绍,人
全国水库数据集、湖泊型流域自然人文综合数据集发布
近期,在国家重点研发计划、中科院战略性先导科技专项等资助下,中国科学院南京地理与湖泊研究所研究员宋春桥课题组联合美国堪萨斯州立大学、加州大学洛杉矶分校等,利用地理空间大数据技术,整理汇编现有众源资料,采用空间分析和数理统计等方法,编目全国精细化水库数据集(CRD: China Reservoir D
共享激光雷达数据集
3D 激光雷达数据可公开共享给众多用户和同事。共享激光雷达数据的两个主要方法是通过 Web 共享或通过文件系统共享。通过文件系统共享任何文件都可通过文件系统或 ArcCatalog 进行共享。只需记住,移动文件会使引用的数据源的链接断开。例如,复制、重命名或删除 LAS 数据集或汇总数据会导致 LA
免疫学领域中常用的单细胞测序基准数据集有哪些?
在免疫学领域,一些常用的单细胞测序基准数据集包括:Immune Cell Atlas (免疫细胞图谱):涵盖了多种免疫细胞类型和组织来源的数据。COVID-19 相关的免疫细胞单细胞测序数据集:用于研究免疫系统对新冠病毒感染的反应。特定疾病(如自身免疫性疾病、癌症等)中免疫细胞的单细胞测序数据集,例
单细胞测序基准数据集的标注方法在不同领域的应用有哪些?
以下是单细胞测序基准数据集的标注方法在不同领域的一些应用: 1. 免疫学领域 - 基于已知的免疫细胞标志物(如 CD4、CD8 用于区分 T 细胞亚型)进行标注,研究免疫细胞在健康和疾病状态下的组成和功能变化。 - 结合免疫组化验证免疫细胞在组织中的分布和状态。 2. 神经科
数据标注优秀案例集之四十六-|-AI数据标注助力中医药领域高质量发展
AI数据标注助力中医药领域高质量发展 申报单位:成都中医药大学 推荐单位:四川省发展和改革委员会(四川省数据局) 一、案例简介 为解决中医药领域转型面临的数据标注效率低、标注标准不统一、跨模态数据融合难等问题。案例通过自研中医古籍机器标注系统、构建多模态数据治理工具链、引入联邦计算保障隐私安
Immune-Cell-Atlas-数据集的简介
Immune Cell Atlas 数据集是一个重要的资源,用于深入研究免疫系统中细胞的特征和功能。 要获取这个数据集,您可以通过以下途径: 1.相关科研机构的网站:一些专门从事免疫学研究的机构可能会提供访问或下载该数据集的渠道。2. 公共数据存储库:如欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)的
癌症学研究公布最新数据集
据英国《自然》杂志10月17日在线发表的一项癌症研究,美国俄勒冈健康与科学大学公布了一个数据集,揭示了此前未发现的、急性髓性白血病(AML)患者的特定突变与药物敏感性之间的关联。这些发现将增进对急性髓性白血病的生物学和临床方面的理解。 急性髓性白血病是一种非常多样化的疾病,目前已在患者中观察到
Immune-Cell-Atlas-基准数据集是否存在数据偏差?
任何数据集都可能存在一定程度的数据偏差,Immune Cell Atlas 基准数据集也不例外。 可能存在的潜在数据偏差包括: 1. 样本偏差:数据集所包含的样本可能来自特定的人群、地区或研究机构,不能完全代表整个人群的免疫细胞特征。 2. 技术偏差:不同的实验技术、测序平台和操作流程可能
如何评估-Immune-Cell-Atlas-基准数据集的数据偏差?
评估 Immune Cell Atlas 基准数据集的数据偏差可以考虑以下几个方面: 1. 样本特征分析 - 检查样本的来源,包括种族、年龄、性别、地理位置等分布情况,判断是否存在不均衡或过度集中的现象。 2. 实验方法和技术一致性 - 了解样本采集、细胞分离、测序平台和实验
英惠康基金会与施普林格自然开展数据集试验项目
英国惠康基金会与施普林格·自然近日将合作开展一个试验项目,以推动科研人员的研究数据集在科研共同体能被更多人发现和使用。 该试验项目预计运行6至12个月,参与项目的科研人员将使用施普林格·自然的数据支持服务,最初涉及的使用费将由惠康基金会支付。该试验项目将面向惠康基金会资助的研究项目及研究机构所
将激光雷达用作-terrain-数据集
terrain 数据集是一种将地理数据库要素类用作数据源的基于 TIN 的数据集。不规则三角网 (TIN) 是以多个三角形相连的网络进行表面建模(例如高程)的数据结构。要将激光雷达(LAS 文件)添加到 terrain 数据集,则需要将其导入地理数据库要素数据集中的多点要素类。terrain 数据集
大气所发布CERN紫外辐射数据集
科学数据如果孤立存在就毫无用途,因此,中国科学院大气物理研究所主办的国际期刊《大气科学进展》(Advances in Atmospheric Sciences, AAS)正积极推动与协助充分发挥数据集应用的作用,于5月15日预出版发布了第一篇数据描述文章。该文描述了两个关于中国紫外辐射的数据集。
将激光雷达用作-LAS-数据集
LAS 数据集提供一种快速访问大量的 激光雷达和表面数据而无需进行数据转换和导入的方法。这样可以轻松地处理覆盖整个管理区域的数千个 LAS 文件,或者可能只是关于特定研究区域的几个 LAS 文件。LAS 数据集允许您快捷地检查 LAS 文件,并在 LAS 文件中提供了激光雷达数据的详细统计数据和区域
LAMOST-DR6数据集正式发布
2018年6月,在中国科学院国家天文台LAMOST运行和发展中心及相关单位的共同努力下,LAMOST第六年光谱观测任务圆满结束。经过9个月的数据处理及质量分析,2019年3月27日,包含先导巡天及前六年正式巡天的LAMOST DR6数据集正式对国内天文学家和国际合作者发布。 2017年6月,L
单细胞测序基准数据集如何选择?
选择单细胞测序基准数据集时,可以考虑以下几个关键因素: 1. 研究目的和问题 - 明确您的具体研究目标,例如是关注特定细胞类型的分类、细胞发育轨迹分析还是差异表达基因检测等,选择与研究问题相关的数据集。 2. 细胞类型和组织 - 确保数据集包含您感兴趣的细胞类型和组织来源。如果您
国家数据集管理服务平台正式发布
2026年4月29日,国家数据集管理服务平台在数字中国建设峰会上正式发布并启动试运行(访问地址:https://www.ndsms.cn),标志着我国高质量数据集建设工作迈入集约化管理新阶段。 国家数据集管理服务平台由国家数据局指导、国家数据发展研究院建设和运营,以数据集目录汇聚为基础,构建“
单细胞测序基准数据集的概念
单细胞测序基准数据集是一组经过精心挑选和整理、具有高质量和代表性的单细胞测序数据集合。这些基准数据集通常具有以下特点和作用:特点:高质量:数据经过严格的质量控制和处理,具有低噪声、高准确性和完整性。多样性:涵盖多种细胞类型、组织、疾病状态、实验条件等,以全面反映单细胞测序的各种情况。详细标注:对细胞
237个科学数据集揭开人口与健康大数据“面纱”
2017年1月4日,国家人口与健康科学数据共享平台科技资源发布会暨2016健康医疗大数据创新应用与发展峰会在京举行,本次会议主题为“医学科学数据共享,推进健康中国建设”。王陇德院士、陈可冀院士、刘德培院士、曹雪涛院士、金力院士等40余名权威专家以及国家科技部和卫生计生委有关领导出席发布会,会议
2.7万份样本采集分析-首份地球微生物多样性数据集出炉
英国《自然》杂志10月31日发表了一篇微生物学重要论文:科学家通过分析2.7万份来自全球范围内不同环境所得的微生物样本,对细菌和古菌的多样性进行了前所未有的深入解读。该元分析属于地球微生物组计划(EMP)第一期的一部分,该计划的最终目标是表征地球上所有的微生物。 微生物生态研究的一个重要目标,
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等,在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展,提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法,可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架(RDF),并构建了基于语义网框
Immune-Cell-Atlas-数据集包含哪些细胞类型
Immune Cell Atlas 数据集通常包含多种免疫细胞类型,常见的有: 1.T 细胞:如 CD4+ T 细胞(包括 Th1、Th2、Th17 等亚型)、CD8+ T 细胞、调节性 T 细胞等。 2. B 细胞:包括初始 B 细胞、记忆 B 细胞、浆细胞等。 3. 自然杀伤(NK)细胞。 4.
单细胞测序基准数据集有哪些特点?
单细胞测序基准数据集通常具有以下特点:高质量和准确性:数据经过严格的质量控制和处理,具有较低的噪声和错误率,以确保分析结果的可靠性。多样性:涵盖多种细胞类型、组织来源和实验条件,能够全面评估分析方法在不同情况下的性能。标注详细:包括已知的细胞类型、标记基因、细胞状态等信息,为评估分析结果的准确性提供
中国最新最完整蛇类特征数据集出炉
截至2023年1月,中国共记录312种蛇类,是世界上蛇类多样性最丰富的国家之一。物种特征决定其在环境中的生存能力,在进化生物学、生态学和保护生物学研究中具有重要作用。但是,目前还没有关于我国蛇类形态学、生活史和生态学等特征的完整数据库。日前,《生物多样性》杂志发表了目前中国最新、最完整的蛇类特征
最大活跃DNA转座子数据集构建
科技日报讯 (记者陆成宽)DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。记者6月24日获悉,中国科学院动物研究所研究员张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模DNA转座子活性筛选,构建了目前最大活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果日前在线发表于《细胞》杂
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
多模态同步语言神经影像数据集发布
大脑在加工语言时,需要实时调动多个脑区的神经元进行协同工作。构建高时空分辨率的神经影像数据可以帮助我们更好地了解各个脑区以及脑区之间的协同合作,对于探索大脑的语言加工机制至关重要。当前已有的开源数据主要针对英文采集,只包括单一模态的神经影像数据,如高空间分辨率的功能核磁共振(fMRI)或高时间分
最大活跃DNA转座子数据集构建
DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。记者6月24日获悉,中国科学院动物研究所研究员张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模DNA转座子活性筛选,构建了目前最大活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果日前在线发表于《细胞》杂志。DNA转座子约占人类基