脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

研究背景:大脑创伤(TBI)具有极高的发病率和致死率,会不同程度地危害身体健康,目前对其致病机理,尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。已知外泌体中富含环状RNA,这是一种新发现的环状非编码RNA,大多以miRNA海绵发挥调控下游功能基因的表达。而本研究作者正是集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,利用高通量测序揭示大脑创伤外泌体中环状RNA的变化及其潜在的生物学功能。研究思路:作者首先分离了小鼠脑组织,提取脑周质外泌体,通过外泌体全转录组测序检测TBI脑周组织外泌体中环状RNA的表达变化。结果发现231个差异表达的环状RNA,其中155个上调,76个下调。接下来通过生信分析如GO及KEGG分析对外泌体差异表达的环状RNA进行了功能预测。GO分析表明这些RNA分子主要参与神经损伤修复,神经系统发育及神经信号传导相关,这些分子同时主要富集在cGMP-PKG信号通路。CircRNA-miRNA互作网络图揭示了环状RNA作用靶m......阅读全文

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

  近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

  近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)

脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测

研究背景:大脑创伤(TBI)具有极高的发病率和致死率,会不同程度地危害身体健康,目前对其致病机理,尤其是对神经系统造成伤害的分子机理尚不知晓。已知外泌体中富含环状RNA,这是一种新发现的环状非编码RNA,大多以miRNA海绵发挥调控下游功能基因的表达。而本研究作者正是集合了外泌体和环状RNA两大科研

当外泌体遇上环状RNA(一)

文章导读外泌体是细胞分泌的大小为30-200nm的盘状囊泡,它在人体体液中分布广 泛。2013年,科学家通过研究外泌体细胞囊泡调控机制获得诺贝尔奖,这使外泌体开始被广 泛关注,随着研究的深入,人们发现外泌体可作为细胞间信息交流的桥梁,在细胞间往来穿梭进行信息传递。另外,外泌体与疾病的发生尤其

当外泌体遇上环状RNA(三)

2. 外泌体circSHKBP1通过调控miR-582-3p/HUR/VEGF过程以及抑 制HSP90降解来促进胃ai发展发表期刊:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.6.29文章链接:Exosomal circSHKBP1 promotes gastric

当外泌体遇上环状RNA(六)

3. 外泌体circPACRGL通过miR-142-3p/miR-506-3p- TGF- cm1过程驱动大肠ai的恶化发表期刊:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.7.27文章链接:Exosomal circPACRGL promotes progressio

当外泌体遇上环状RNA(四)

(3)GC来源的外泌体circSHKBP1在体外能促进GC细胞的增殖、迁移和侵袭为了探索circSHKBP1是否影响GC细胞的生物学过程,分析了circSHKBP1在4种人GC细胞系(BGC823、HGC27、AGS和MGC803)和正常胃上皮细胞系GES1中的表达水平。结果表明,circSHKBP

当外泌体遇上环状RNA(七)

(3)circPACRGL作为海绵分子结合miR-142-3p和miR-506-3p作者使用生物信息学数据库预测发现circPACRGL同时具有miR-142-3p和miR-506-3p的结合位点,双荧光素酶报告实验检测也证实miR-142-3p和miR-506-3p可与circPACRGL直接结合

当外泌体遇上环状RNA(二)

(4)circUHRF1通过miR-449c-5p相关途径来抑 制NK细胞功能作者利用生物信息学预测了14个miRNA,在NK-92细胞中进行circUHRF1-RIP以及qPCR,结果表明miR-449c-5p是NK-92细胞中一个与circUHRF1相互作用的miRNA。在NK-92细胞中进行抗

当外泌体遇上环状RNA(五)

(6)circSHKBP1直接HSP90相互作用并抑 制其降解在HGC27细胞中用circSHKBP1探针的RNA pull-down和蛋白质谱结果显示两个差异表达蛋白HSP90β和HSP90α(HSP90的异构体)在过表达circSHKBP1的GC细胞中富集。RIP实验显示,circSHKBP1能

外泌体环状RNA作为结肠ai分子标志物的实例应用

文章导读如今想要短平快靠单纯测序+验证发表一篇5分左右文章,光靠一个热点环状RNA还不够,环状RNA+外泌体,环状RNA+m6A,环状RNA+环状DNA等方向都是可以去尝试的。小编今 天以云序用户以环状RNA+外泌体作为研究方向的案例进行解析。2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers

外泌体研究深度剖析(二)

案例2:外泌体lncRNA促进肾癌肿瘤细胞耐药性肿瘤学顶级期刊Cancer Cell(IF:27.409)发表文章,阐述了疾病相关lncRNA参与肾癌耐药性及通过外泌体传播的生理机制,将外泌体lncRNA的研究又一次带到了大众视野中。首先作者通过高通量手段检测了野生型细胞和耐药型细胞中差异表达的

环状RNA研究文章汇总(一)

环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20

2018国自然研究热点三:外泌体研究深度剖析

  一申请国自然没保障,外泌体来助攻   2018年国自然申请马上就要展开,科研界一年一度的压轴大戏又要上演。中了国自然,新的一年安安心心搞科研,舒舒服服过大年;没有中,那可能意味着接下来又是紧衣缩食的一年。在这里云序小编先衷心的祝福各位老师2018新年快乐,开春申请的基金都能中,所有的实验都成功

2020年自然研究热点——外泌体研究(二)

 2.外泌体获批项目中的热点分子由于外泌体的主要功能被认为是细胞之间的信息传递,了解它带有的蛋白质和多种RNA上的信息就变得尤其重要。2019年外泌体中标项目中带有热门话题miRNA、lncRNA和环状RNA的项目数量如下图(图4)所示。我们可以看到,外泌体中的miRNA和lncRNA过去研究的是比

外泌体研究深度剖析

  一申请国自然没保障,外泌体来助攻   2018年国自然申请马上就要展开,科研界一年一度的压轴大戏又要上演。中了国自然,新的一年安安心心搞科研,舒舒服服过大年;没有中,那可能意味着接下来又是紧衣缩食的一年。在这里云序小编先衷心的祝福各位老师2018新年快乐,开春申请的基金都能中,所有的实验都成功

神秘的外泌体

随着测序技术的不断发展,癌症的体液活检技术逐渐壮大。体液活检,顾名思义,是通过人体的体液(血液、尿液等)检测诊断疾病的一种技术。由于体液活检便捷而不失精准,被《麻省理工大学科技评论》评选为"2015十大突破"之一。摩根大通甚至认为癌症的体液活检是一个千亿美元级的大市场。 体液活检目前检测的

云序生物环状RNA研究文章汇总

  环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达

唾液DNA/RNA/外泌体等收集保存工具汇总

为什么有人吃东西总是那么“津津有味”,说话总能“津津乐道”?那是因为他们的唾液质量好,产生唾液的能力也好。您有仔细观察过自己舌头上的味蕾是什么样子吗?味蕾就像小触角在舌头上面飘着,如果没有唾液的滋润,舌头是干的,味蕾的功能就会退化,那么你吃什么东西都会是一个味儿:味同嚼蜡。我们吃东西觉得好吃,靠的是

外泌体是什么

外泌体于1983年首次被发现,是由于细胞膜内吞形成内体,内体限制膜发生多处凹陷,向内出芽形成微囊泡,从而形成的具有动态亚细胞结构的多囊泡体。大多数类型的细胞均可分泌外泌体。构成外泌体的主要成分为蛋白质、核酸和脂质。外泌体有多种分泌途径,对细胞间通信、疾病的传播及组织修复具有重要的调节作用。外泌体与受

外泌体来自哪里

外泌体是指包含了复杂 RNA 和蛋白质的小膜泡 (30-150nm),现今,其特指直径在40-100nm的盘状囊泡。1983年,外泌体首次于绵羊网织红细胞中被发现, 1987年Johnstone将其命名为“exosome”。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形

什么是外泌体

什么是外泌体人到中年,最难以启齿的矛盾便是脸上越来越多的皱纹和内心与日俱增的“抗老需求”之间的矛盾。为了今天的容颜不被明天改变,什么玻尿酸、水光针甚至是干细胞美容,我都勇于“尝鲜”。而作为美容界的后起之秀——“外泌体”,我更是不愿错过。毕竟它虽然是近两年兴起的美容模式,但其发展历史也已经有40多年了

什么是外泌体?

什么是外泌体人到中年,最难以启齿的矛盾便是脸上越来越多的皱纹和内心与日俱增的“抗老需求”之间的矛盾。为了今天的容颜不被明天改变,什么玻尿酸、水光针甚至是干细胞美容,我都勇于“尝鲜”。而作为美容界的后起之秀——“外泌体”,我更是不愿错过。毕竟它虽然是近两年兴起的美容模式,但其发展历史也已经有40多年了

什么是外泌体

什么是外泌体人到中年,最难以启齿的矛盾便是脸上越来越多的皱纹和内心与日俱增的“抗老需求”之间的矛盾。为了今天的容颜不被明天改变,什么玻尿酸、水光针甚至是干细胞美容,我都勇于“尝鲜”。而作为美容界的后起之秀——“外泌体”,我更是不愿错过。毕竟它虽然是近两年兴起的美容模式,但其发展历史也已经有40多年了

小鼠CD4+T细胞外泌体分离及鉴定

目的:探讨CD4+T细胞是否具有分泌外泌体的能力,以及CD4+T细胞外泌体参与炎症及肿瘤免疫过程的可能。 方法:应用断颈处死的方法取出小鼠的脾脏,用磁珠分选的方法从小鼠脾脏细胞中分选出CD4+T细胞,并尝试从培养基上清液中提取CD4+T细胞的外泌体,在透射电镜下观察,后用PCR技术分

小鼠CD4+T细胞外泌体分离及鉴定

目的:探讨CD4+T细胞是否具有分泌外泌体的能力,以及CD4+T细胞外泌体参与炎症及肿瘤免疫过程的可能。方法:应用断颈处死的方法取出小鼠的脾脏,用磁珠分选的方法从小鼠脾脏细胞中分选出CD4+T细胞,并尝试从培养基上清液中提取CD4+T细胞的外泌体,在透射电镜下观察,后用PCR技术分析miR-23a、

cpe外泌体和普通细胞中外泌体的区别

众所周知,所有的细胞中都含有外泌体,外泌体是一种小分子成分,应用于护肤品中可以直接进到皮肤内部进行作用,像对皮肤进行修护、将携带的营养物质输送到每一个细胞处、提升内源细胞的huo力等。而cpe外泌体与普通的外泌体区别在于它具有准确发现受损细胞的能力,大大增快了救援细胞的速度,提高解决皮肤衰老问题的效

外泌体是什么?外泌体(Exosome)研究正确打开方式

外泌体曾经被认为是细胞卸载废物的一种方式,在过去的十年中,我们对外泌体的看法发生了巨大变化。我们已经开始认识到,外泌体是从细胞中释放出来的,通过其RNA,蛋白质,脂质和DNA的载体充当信号载体和组织重塑者。参与癌症,炎症,免疫,中枢神经系统功能,心脏细胞功能。外泌体在这些基本生物过程中的作用,它们作

空间转录组测序样本准备指南

  一、外泌体研究热度持续攀升   外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,

2020年自然研究热点外泌体研究

  一、外泌体研究热度持续攀升   外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,