Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(一)
1前言在蛋白质药物产品的质控要求中,肽图分析是其中重要的一环。肽图分析包括对蛋白氨基酸序列进行确证及相关修饰的鉴定和定量。根据蛋白药物质谱分析特点和生物制药应用的特殊需求,Thermo Fisher与Amgen联合开发了PepFinderTM 软件。 PepFinder不仅具有最基本的肽段序列确证、覆盖率分析、修饰位点鉴定与定量、二硫键分析、图谱对比和肽段CID/HCD/ETD谱图解析等功能,还具有其独特功能,如未知修饰搜索功能和氨基酸突变搜索功能[1-5]。这两项功能可以帮助分析人员快速发现可能出现的序列突变,从而大大降低出现质量风险的几率。同时,PepFinder还有更多实用的功能设计,如内置CHO细胞系糖型、具有肽段鉴定可信度评价功能,还可根据碎裂方式和能量智能预测多肽的理论碎裂谱图,并用于与实验图谱直观对比,以辅助分析。这些功能不但减少工作强度,也降低了对分析员理解质谱数据深度的要求。对于氨基酸固定修饰设置,不......阅读全文
Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(一)
1前言在蛋白质药物产品的质控要求中,肽图分析是其中重要的一环。肽图分析包括对蛋白氨基酸序列进行确证及相关修饰的鉴定和定量。根据蛋白药物质谱分析特点和生物制药应用的特殊需求,Thermo Fisher与Amgen联合开发了PepFinderTM 软件。 PepFinder不仅具有最基本的肽段序列确证、
Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(二)
图3 肽段SNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEK的脱酰胺鉴定及定量 图4 在PepFinder2.0中对所有肽段进行De Novo Sequencing 图5 对一张MS/MS谱图进行De Novo Sequencing 图6 在PepFinder软件中计算单克隆抗体各种常用分
运用ACQUITY-Arc可靠地对肽图分析方法进行转换(一)
简介ACQUITY Arc系统能够在同一个平台上运行HPLC和UHPLC分离,是一款可以填补HPLC与UPLC®之间的性能差距的LC平台。利用Arc Multi-flow path™技术,用户可在流路1与流路2之间轻松切换,从而实现无缝的方法转换或改善现有方法。此前的研究表明,ACQUITY
BiopharmaLynx软件在蛋白质肽图分析中的应用(一)
在新药研发中,蛋白质药物正在占据越来越大的比重,而蛋白质分子结构的复杂性又要求对蛋白质药物必须进行全面的表征,以满足新药报批、工艺改进和ZL保护的要求。目前蛋白质药物的研发和表征还面临很多挑战,尤其是在重组蛋白的序列确证、微量杂质蛋白的检测和定量、不同批次间产品的比较和质量控制等方面。质谱在蛋白质的
运用ACQUITY-Arc可靠地对肽图分析方法进行转换(二)
结果与讨论从Agilent 1100系列HPLC系统到ACQUITY Arc系统的HPLC肽图方法转换实现了方法等效性 为了评估肽图方法从Agilent 1100系列HPLC系统转换到ACQUITY Arc系统时的方法等效性,我们采用如上所述的方法参数建立了英夫利昔单抗的肽图。根据以前的评估结果,我
运用ACQUITY-Arc可靠地对肽图分析方法进行转换(三)
比较两个系统时,ACQUITY Arc系统表现出了良好的系统间重复性 在整个实验室或其它分析场所中部署新的仪器平台时,确保分析结果的一致性是非常重要的。为了比较不同ACQUITY Arc系统的分析结果,我们采用具有相同核心配置的两套不同的ACQUITY Arc系统,在如上所述的方法条件下执行分析
运用ACQUITY-Arc可靠地对肽图分析方法进行转换(四)
图3A展示了使用3.5 μm色谱柱在Agilent 1100系列HPLC系统上获得的色谱图,以便进行比较(另见:图1A)。图3B展示了使用2.5 μm色谱柱在ACQUITY Arc系统上获得的结果,图3C展示了相应的质谱响应。将色谱柱粒径由3.5 μm降至2.5 μm,可以观察到微小的分
赛默飞新型PepFinder软件能够深度表征分析生物治疗蛋白
巴尔的摩—ASMS 2014—2014年6月16日—在治疗重大疾病时,基于蛋白质的药物变得越来越重要,针对这些复杂蛋白分子的深度表征分析,分析人员面临的最大挑战在于既能安全有效,同时也能满足质量需求。Thermo Scientific PepFinder软件可提高广泛生物治疗蛋白表征分
BiopharmaLynx软件在蛋白质肽图分析中的应用(二)
四、修饰的肽段在不同样品间含量对比BiopharmaLynx软件可以比较不同样品间某种肽段(包括突变肽段和特定修饰肽段)的含量差异,发现样品间的细微差别,并用直观的方式显示出来。五、BiopharmaLynx的样品间肽图对比BiopharmaLynx软件这可以自动地将各个批次样品的肽图与参照样品的肽
简化肽图分析结果的确证过程
简化肽图分析结果的确证过程:基于 UNIFI 的沃特世生物制药系统解决方案的一项基本功能目的 展示 UNIFI ™ 科学信息系统的强大功能如何帮助用户查看和审核 UPLC®/MS 或 UPLC/MSE 肽图分析实验获得的 LC/MS 原始数据。 背景 肽图分析是药物蛋白鉴定的
什么是肽图
肽图分析(Peptide Mapping):肽图分析是根据蛋白质、多肽的分子量大小以及氨基酸组成特点,使用专一性较强的蛋白水解酶[一般未肽链内切酶(endopeptidase)]作用于特殊的肽链位点将多肽裂解成小片断,通过一定的分离检测手段形成特征性指纹图谱,肽图分析对多肽结构研究合特性鉴别具有重要
用新型自动细胞成像系统和细胞分析软件进行基...(一)
用新型自动细胞成像系统和细胞分析软件进行基于细胞实验的表型分析简介当需要持续获得高质量、高精确的数据时,那么迫切需要一台全自动基于细胞检测实验的多参数分析系统。一台紧凑的,全自动微孔板图像分析系统可用于多参数实验,如利用诱导多功能干细胞 (iPSC) 分化为心肌细胞,神经细胞和肝细胞研究中。
使用Skyline创建单克隆抗体的MRM方法
在抗体药物的血药浓度定量分析中,使用配体结合的传统方法进行测定时,必须针对目标药物制备具有高度特异性和亲和性的检测抗体,并且确立分析方法也需要耗费大量的时间和费用。而使用LC/MS/MS进行分析,由于不需要制备抗体,不仅大幅度缩短了分析方法的创建时间,还可以降低成本。本文向您介绍使用Skylin
使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(一)
使用MD SoftMax Pro 7软件进行平行线分析和相对活性评价介绍在生物实验中要经常要使用到的平行线分析(PLA)方法,当无法直接检测一个生物制品的活性而只能通过检测其产生的效果时,PLA方法通常会被用来进行效应曲线的比较来获得此制品的效果(Figure1)。如果对于两种物质其生物响应相似或者
肽图的概念和作用
中文名称肽图英文名称peptide map定 义单一蛋白质或不太复杂的蛋白质混合物经降解(通常利用专一性较强的蛋白酶)得到的产物,通过层析和电泳,以及质谱等手段分离鉴定后,得到的表征蛋白质和混合物特征性的图谱或模式。可作为对蛋白质比较和分析的依据。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技
赛默飞在ASMS-2014上推出多款升级质谱新品
赛默飞科技在ASMS 2014壮大其行业领先的质谱产品阵营 巴尔的摩—2014年6月16日—科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)今天宣布推出了最新仪器、软件和耗材,旨在使客户在研发和应用市场获得更高水平的分析性能和生产效率。赛默飞的最新款产品会在 6月1
双压线性离子阱质谱用于单克隆抗体分子量测定(二)
图2. 对图1 谱图进行去卷积 由图1 及图2 可以看出:首先,使用Velos pro 双压线性离子阱质谱对完整单克隆抗体(150kD)进行分子量测定,得到的谱图中可见不同电荷态的峰均匀分布(图1);对其使用ProMass 软件进行去卷积分析,可知所测单克隆抗体分子量为147491Da,
一种对颈动脉斑块进行量化分析的方法
现:3DT1加权梯度回波(3DT1GRE)序列有助CAS相关脑栓塞的预测 预防脑栓塞是颈动脉支架(CAS)的一个重要问题。为此,日本Mie医学研究生院神经外科的HiroshiTanemura博士等人进行了一项研究,研究结果于2012年11月20日在线发表在Stroke杂志上。研究结果发
PNAS:机体免疫系统如何有效识别病毒肽并对进行攻击?
近日,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自澳大利亚国立大学和澳洲莫纳斯大学的科学家们通过研究解开了长期以来困扰研究者的一个问题,即机体免疫系统如何有效识别来自病毒的蛋白并抵御病毒入侵机体,相关研究或为
UiECorr腐蚀分析软件用户手册(一)
UiECorr™软件配套腐蚀测试技术包括: (1).腐蚀电位-时间. (2).恒电位极化. (3).恒电流极化. (4).动电位极化. (5).线性极化电阻(LPR). (6).零电阻电流计(ZRA). (7).Tafel. 下载手册全文适用于PG580RM多通道电化学分析仪,BiSt
用什么软件可以处理质谱图
每一个品牌的质谱仪软件都不一样,出来的数据也就不一样,但是所有的质谱仪一定都是可以导出一个文本文件,里面包含数据的。我们实验室要求用Igor pro,用matlab, origin, python甚至excel都可以迅速的导入数据然后出图。因为我们仪器是自己定制的,所以的到的就是原始数据,有些质谱仪
如何对元素分析仪进行维护?
1、在长期不使用时,化学元素分析仪应定期进行通电检查。例如氢离子激光器必须经常启动激发出光,保持氢离子谐振腔的气压,确保仪器运转正常。 2、为了防止化学标样受潮漏电,应将化学标样放在带有干燥剂的玻璃器皿中。如果在雨天出外检定,为了方便可携带干燥剂来代替干燥器,钢铁标准样品用纱布包好后放入装有干燥剂的
感官分析软件时代为什么企业需要一套量身定制的感官分析软件?
【关键词】感官分析软件感官实验室建设专业感官分析室感官分析系统主流的感官品评软件感官分析系统在线感官分析系统感官分析好工具感官品评感官分析感官分析系统感官感官分析方法感官分析样品制备的要求感官分析数据分析感官分析数据统计感官分析方法的培训主要包括感官分析方法喜好感官分析方法总论干酪感官分析使用标度评
基于-QExactive-平台和-BioPharma-Finder-软件的简单快速抗体...
基于 Q-Exactive 平台和 BioPharma Finder 软件的简单快速抗体药物二硫键解析1. 前言目前,在全球范围内,单克隆抗体药物已经成为生物医药领域中最耀眼的一颗明珠。该类抗体药物具有靶向性专一、特异性高和毒副作用低等特点,代表了药物治疗领域的最新发展方向,并且在抗肿瘤和自身免疫系
用新型自动细胞成像系统和细胞分析软件进行基...(二)
评价化合物对心机细胞毒性的作用评价心肌细胞毒性影响,使用各种不同的心肌细胞毒性化合物处理 24 小时,然后活细胞通过 Hoechst 核染料分子标记后,MitoTracker Orange 染料标记和 AF-488 连接的鬼笔环肽染料来检测细胞骨架的完整性。利用 ImageXpress Pi
Maxwell如何对磁滞材料进行建模(一)
问题描述磁滞现象是铁磁材料的固有属性,电机、变压器使用的硅钢片属于软磁材料,剩磁与矫顽力都比较小,所以在电机设计过程中一般使用其平均磁化曲线,磁滞损耗包含在铁耗中,根据斯坦梅茨方程拟合计算其铁耗,这对电机、变压器稳态运行影响较小,但是在特殊工况下,磁滞现象会产生不良影响或者利用其特性开发新的产品。针
使用在线二维色谱对血清中治疗性单克隆抗体进行MRM-...
使用在线二维色谱对血清中治疗性单克隆抗体进行MRM 定量的优势简介在定量血清中的治疗性蛋白时,不进行分析物预分组分在降低检测成本和简化样品制备流程方面具有一定优势。分析物的分离(通常利用免疫亲和性)需增加额外的纯化步骤并使用昂贵的同位素标记的蛋白质标准品来计算分析物回收率。 另一种方法是采用具有较高
赛默飞亮相2014美国质谱大会,彰显全新质谱分析能力
近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)亮相2014年第62届美国质谱大会。期间,赛默飞发布并展示了全新仪器、软件和耗材,进一步为客户在研发和应用市场方面带来更高性能。 “新产品的推出,让我们不断突破和拓展,在质谱分析方面取得长远发展。我们致力于此,也凭借这样的创新能
MassARRAY®-分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序,用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例,该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理,通过表格和图形格式进行数据的可视化,
对在线浊度分析仪的测量原理进行分析
在线浊度分析仪测量原理: 从传感器光源组件发出的白炽光,向下进入浊度仪内,遇到样品中的悬浮颗粒产生散射光。传感器浸在水样中的光电检测器能够检测到与入射光束呈90°角的散射光。 连续流动的水样流经获得砖利的气泡脱除系统,该系统能脱除样品流中夹带的空气泡,从而消除低浊度测量中显著的干扰;