BiopharmaLynx软件在蛋白质肽图分析中的应用(一)

在新药研发中,蛋白质药物正在占据越来越大的比重,而蛋白质分子结构的复杂性又要求对蛋白质药物必须进行全面的表征,以满足新药报批、工艺改进和ZL保护的要求。目前蛋白质药物的研发和表征还面临很多挑战,尤其是在重组蛋白的序列确证、微量杂质蛋白的检测和定量、不同批次间产品的比较和质量控制等方面。质谱在蛋白质的表征方面发挥着至关重要的作用,它不仅可以测定蛋白质药物的分子量和产品的异质性,还可以通过肽图分析确证蛋白质分子的一级结构,包括氨基酸序列、突变和修饰、二硫键定位等信息。 但如果没有功能强大的软件帮助,质谱数据的分析、比较、注释、有效信息的提取和分析报告的产生将是一个十分费时耗力的复杂过程。如果进行人工分析,即使是经验丰富的分析人员也会感到很头疼,而且在如此复杂的分析过程中很难保证不出差错,而一旦出现差错,不仅会严重影响研发的进程,有些错误的判断还有可能导致整个项目的失败。因此,分析软件是必不可少的。理想的软件不仅可以按照标准......阅读全文

BiopharmaLynx软件在蛋白质肽图分析中的应用(一)

在新药研发中,蛋白质药物正在占据越来越大的比重,而蛋白质分子结构的复杂性又要求对蛋白质药物必须进行全面的表征,以满足新药报批、工艺改进和ZL保护的要求。目前蛋白质药物的研发和表征还面临很多挑战,尤其是在重组蛋白的序列确证、微量杂质蛋白的检测和定量、不同批次间产品的比较和质量控制等方面。质谱在蛋白质的

BiopharmaLynx软件在蛋白质肽图分析中的应用(二)

四、修饰的肽段在不同样品间含量对比BiopharmaLynx软件可以比较不同样品间某种肽段(包括突变肽段和特定修饰肽段)的含量差异,发现样品间的细微差别,并用直观的方式显示出来。五、BiopharmaLynx的样品间肽图对比BiopharmaLynx软件这可以自动地将各个批次样品的肽图与参照样品的肽

Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(一)

1前言在蛋白质药物产品的质控要求中,肽图分析是其中重要的一环。肽图分析包括对蛋白氨基酸序列进行确证及相关修饰的鉴定和定量。根据蛋白药物质谱分析特点和生物制药应用的特殊需求,Thermo Fisher与Amgen联合开发了PepFinderTM 软件。 PepFinder不仅具有最基本的肽段序列确证、

使用BiopharmaLynx软件分析蛋白完整分子量

对蛋白药的分子量进行测定,可以在完整蛋白水平,对其进行宏观表征,以初步确定蛋白的表达是否正确。BiopharmaLynxTM软件中,专门设计了对蛋白整体分子量测定及表征的多种功能,它具有以下特点。 ■ 通过原始质谱数据,计算出蛋白分子量。■ 自动标注蛋白的各种不同修饰形态。■ 以直观方式,比较样品与

Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(二)

 图3 肽段SNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEK的脱酰胺鉴定及定量  图4 在PepFinder2.0中对所有肽段进行De Novo Sequencing  图5 对一张MS/MS谱图进行De Novo Sequencing   图6 在PepFinder软件中计算单克隆抗体各种常用分

基于UNIFI的沃特世生物制药系统解决方案的一项基本功能

  目的   展示UNIFI™ 科学信息系统的强大功能如何帮助用户查看和审核UPLC®/MS或UPLC/MSE肽图分析实验获得的LC/MS原始数据。   背景   肽图分析是药物蛋白鉴定的基本工具,可监测蛋白药物结构新变体,并对已知变体的变化程度进行监测。利用高分辨质谱检测进行肽图分析可得到非

最轻松的糖肽鉴定——PLGS、BiopharmaLynx糖肽分析

糖基化蛋白质参与了几乎所有重要的生命过程,糖链的组成和结构对糖基化蛋白质的构象、功能以及与其它分子的相互作用都具有巨大的影响。许多蛋白类药物都是糖基化蛋白质,如免疫球蛋白IgG等。蛋白糖基化一级结构的研究内容包括:糖链的糖型结构、糖基化修饰的氨基酸位点、以及两者间的对应关系。这些信息都集中于糖肽结构

简化肽图分析结果的确证过程

简化肽图分析结果的确证过程:基于 UNIFI 的沃特世生物制药系统解决方案的一项基本功能目的     展示 UNIFI ™ 科学信息系统的强大功能如何帮助用户查看和审核 UPLC®/MS 或 UPLC/MSE 肽图分析实验获得的 LC/MS 原始数据。     背景     肽图分析是药物蛋白鉴定的

酶制剂在活性肽制备中的应用

鸡蛋卵清的主要成分是蛋白质,约占卵清总量的12%,其中糖蛋白的含量在80%以上,这些糖蛋白在选择性蛋白酶(如链霉蛋白酶)的作用下,能够释放出具有重要生理活性的糖肽,称之为卵清糖肽。研究表明,来自鸡蛋卵黏蛋白的糖肽具有抗肿瘤的活性;而吕志良等人的研究则揭示了卵清糖肽具有抑制绒毛膜促性腺激素(hCG)受

酶制剂在活性肽制备中的应用

 鸡蛋卵清的主要成分是蛋白质,约占卵清总量的12%,其中糖蛋白的含量在80%以上,这些糖蛋白在选择性蛋白酶(如链霉蛋白酶)的作用下,能够释放出具有重要生理活性的糖肽,称之为卵清糖肽。研究表明,来自鸡蛋卵黏蛋白的糖肽具有抗肿瘤的活性;而吕志良等人的研究则揭示了卵清糖肽具有抑制绒毛膜促性腺激素(hCG)

酶应用酶制剂在活性肽制备中的应用

 鸡蛋卵清的主要成分是蛋白质,约占卵清总量的12%,其中糖蛋白的含量在80%以上,这些糖蛋白在选择性蛋白酶(如链霉蛋白酶)的作用下,能够释放出具有重要生理活性的糖肽,称之为卵清糖肽。研究表明,来自鸡蛋卵黏蛋白的糖肽具有抗肿瘤的活性;而吕志良等人的研究则揭示了卵清糖肽具有抑制绒毛膜促性腺激素(hCG)

Gradiflow-技术在蛋白质分离研究中的应用(一)

电泳是现代蛋白质研究常用和有效的工具,但是电泳过程中所产生的热量对蛋白质结构的破坏,以及目的蛋白从蛋白胶或其他介质中低的回收效率等等问题,常常让蛋白质更深入的研究戛然而止,而Gradiflow 技术的应用解决了研究者头疼的难题 ! Gradiflow 技术要点可以简单概括为如下几点:1. 应用不同孔

Celigo成像分析技术在细胞杀伤中的应用(一)

2018年的诺贝尔生理学或医学奖授予了两位免疫学家,分别是美国的James P Allison和日本的本庶佑教授,以表彰他们的原创发现推动了免疫学研究的进程,促使了癌症治疗领域革命性新药物的面世。如今炙手可热的PD-1, CAR-T,TCR-T技术等都要归功于这一伟大发现及其临床应用。如果你的工作也

简述蛋白质结构在蛋白质设计中的应用

  蛋白质设计的目标是通过计算机辅助的算法以生成符合目标蛋白质三维结构的氨基酸序列,经过漫长的进化,自然界已经筛选出了数量众多的蛋白质,但天然蛋白质只有在自然条件下才发挥最佳功能,这使得人们利用这些蛋白质受到了限制,因此需要对蛋白质进行改造使其能适应特定条件发挥特定的功能。蛋白质分子的设计分为3类:

什么是肽图

肽图分析(Peptide Mapping):肽图分析是根据蛋白质、多肽的分子量大小以及氨基酸组成特点,使用专一性较强的蛋白水解酶[一般未肽链内切酶(endopeptidase)]作用于特殊的肽链位点将多肽裂解成小片断,通过一定的分离检测手段形成特征性指纹图谱,肽图分析对多肽结构研究合特性鉴别具有重要

Waters征服质谱应用的挑战-推出8项MassLynx解决方案

  新的软件可以利用自动数据系统和简化的工作流程扩展质谱的应用领域   即时发布   费城 ASMS 2009年6月1日   沃特斯公司( NYSE :WAT)在第57届质谱大会上,推出八款新型的MassLynx™工作流程方案,所有的设计旨在增强实验室的生产力和扩大实验室质谱的应用。

分泌肽能系统干扰中的蛋白质组学分析实验

实验步骤 一、材料 1 细胞培养和裂解 (1)小鼠脑垂体 AtT20 和 AtT20 (proSAAS) 细胞系。 AtT20 .(proSAAS) 细胞系通过用包含一个新霉素抗性基因的 proSAAS 表达载体转染 A

运用ACQUITY-Arc可靠地对肽图分析方法进行转换(一)

简介ACQUITY Arc系统能够在同一个平台上运行HPLC和UHPLC分离,是一款可以填补HPLC与UPLC®之间的性能差距的LC平台。利用Arc Multi-flow path™技术,用户可在流路1与流路2之间轻松切换,从而实现无缝的方法转换或改善现有方法。此前的研究表明,ACQUITY

自动拼图软件(AIM)在SEM大景深样品拍摄中的应用

自动拼图(Automated Image Mapping)软件(图1)选件是飞纳电镜的又一功能强大的实用软件。其主要优势总结如下:大范围内自动收集多张图片生成大面积视野的图片自动生成高分辨率、高清晰度大图操作简单,“选择区域”然后“扫描”即完成 以下举例说明其各个优势及其应用场合:大范围多张图片的收

菱形改良皮瓣在治疗褥疮中的应用(手术图)

  褥疮治疗的方法有很多:有中药换药,手术清创缝合,手术皮瓣治疗。    而我们做皮瓣讲究的是宁简勿繁,这里褥疮清创后坏死达到了关节囊可以看见股骨粗隆的骨膜外肌肉,这其实已经到达褥疮的第四期,因此经过菱形改良皮瓣关闭创面,放引流膜引流,还算幸运患者营养不好也长好了,以前一直担心创面长不好。还有手

NIR在工业分析中的应用

化工、食品工业在线监控 近红外技术在我国石油化工中的应用开始于1997年,由中国石油化工科学研究院开始进行近红外技术在石油炼制方面的应用研究。1998年,布鲁克光谱仪器公司开始与中国石油化工科学研究院合作,进行傅里叶变换近红外在该行业的应用研究。借助石化产品中有机物的C-H、

NIR在工业分析中的应用

化工、食品工业在线监控 近红外技术在我国石油化工中的应用开始于1997年,由中国石油化工科学研究院开始进行近红外技术在石油炼制方面的应用研究。1998年,布鲁克光谱仪器公司开始与中国石油化工科学研究院合作,进行傅里叶变换近红外在该行业的应用研究。借助石化产品中有机物的C-H、N-H、O-H

DSC在药物分析中的应用

近年来,热分析技术在制药工业中的应用越来越广泛,本文以案例的形式介绍了热分析中的差示扫描量热仪,在药物纯度、药品多晶型分析、冷冻干燥工艺的优化、蛋白质变性的检测等几个方面的应用。 药品研发与生产中,必须监控其物化性质,如纯度、晶型、稳定性和安全性,以确保药物具有预期的药性。众所周知,有机化

简述蛋白质结构在药物设计中的应用

  从基因组数据到新药物的过程分为2个部分:一是选择目标蛋白,二是选择合适的药物,药物分子必需与目标蛋白质分子紧密结合、容易合成且没有毒副作用。传统的药物设计通过筛选大量的天然化合物、已知的底物或配基的类似物(anaIogs)以及生物化学研究来确定前导物(Iead compounds),较少依赖目标

蛋白质芯片技术在肿瘤检测中的应用

【关键词】  蛋白质芯片;卵巢癌;前列腺癌;肿瘤;临床检验 蛋白质芯片技术在肿瘤研究领域中进展最快。随着肿瘤细胞的发生,肿瘤患者体内某些蛋白质会发生上调或下调,或产生新的与肿瘤关联的异常蛋白,而蛋白质芯片技术可以描绘出患者体液中所有蛋白质表达情况。根据正常与异常的蛋白质表达谱的差异,从而建立肿瘤的指

波谱分析在药物分析中的应用

药物分析中的应用波谱分析的发展趋势 药物波谱分析是当今发展最为迅速的前沿科学之一。波谱分析在药物分析中的重要应用可见一斑。中药的化学成分复杂,有效成分难以确定。仅单方制剂亦为一多种成分的混合物,因此要求更严格和更先进的分离、分析手段进行鉴别和含量测定。而波谱分析便是中药研究中最为广泛应用的一项技术。

PCR在临床检验中的应用(一)

医学检验大致可分为形态学、生物化学、血清免疫学和分子生物学几大类,其分别代表几代实验诊断技术。60年代DNA双螺旋结构及半保留复制模式的出现,70年代基因重组及体外基因克隆技术、分子杂交技术的应用使分子生物学在疾病诊断中得到了长足的发展。特别是1985年Mullis发明了聚合酶链式反应(PCR)技术

肽图的概念和作用

中文名称肽图英文名称peptide map定  义单一蛋白质或不太复杂的蛋白质混合物经降解(通常利用专一性较强的蛋白酶)得到的产物,通过层析和电泳,以及质谱等手段分离鉴定后,得到的表征蛋白质和混合物特征性的图谱或模式。可作为对蛋白质比较和分析的依据。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技

蛋白质测定仪在牛奶蛋白质测定中的应用

蛋白质测定仪可以对牛奶(包括纯奶、核桃、燕麦、红枣牛奶、牛初乳)、奶粉(包括牛初乳粉)、豆粉、豆奶粉和鸡蛋等样品中蛋白质含量的测定。适用于乳制品质监站、产品质 量监督检验所、农产品检测中心、畜牧水产品检测站、出入境检验检疫局、工商、卫生等部门对牛奶、奶粉、豆粉、豆奶粉及鸡蛋等样品中蛋白质的快速定量检

沃特世在第55届美国质谱年会推出的新品

沃特世公司在2007年美国质谱年会上重新定义分子描述方法  创新技术推动生物学和化学分子科学的前沿,改进研发和定量手段 第55届美国质谱年会于6月3日至7日在印第安纳州,印第阿波利斯市举行。沃特世公司(Waters Corporation)(股票代码NYSE:WAT)在会上推出新型质谱,蛋白组学和