ETDtriggeredCID方法应用于融合蛋白的二硫键分析(二)
2.3 数据分析方法使用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索,具体参数如下,流程图如图 2 所示:数据库:融合蛋白对应的氨基酸序列;一级质量偏差:20 ppm;二级质量偏差:0.02 Da;三级质量偏差:0.8 Da;酶:trypsin+Chymotryspin;酶漏切位点:2; 图 2. Proteome Discoverer 1.3 软件对 ETD-triggered CID 原始数据进行二硫键定位分析的流程示意图 3. 结果与讨论3.1 以肽段 P1:SKQEGCRL-肽段P2:CRPGF为例:a. 色谱质谱提取流图如下所示: 由上图可以看出,该肽段对应的一级母离子在 13.96 min 洗脱出来,相应的质量偏差在 5.4 ppm。b. ETD 二级碎裂匹配图 由上图可以看到,二硫键连接的两条肽段在经过 ETD 碎裂后......阅读全文
融合蛋白的定义
融合蛋白(fusion protein)有两种不同的含义,一种是通过DNA重组技术得到的两个基因重组后的表达产物,另一种是介导两个细胞质膜融合的一组蛋白,如在仙台病毒脂双层外侧小叶中含有的两种糖蛋白之一,介导病毒被膜与宿主细胞质膜的融合作用。另一种糖蛋白是血细胞凝集素神经酰胺酶。 两个不同的蛋白质既
二硫键的基本功能
二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸
二硫键与钛键的关系
二硫键和肽键都是维持蛋白质结构的重要连接,其中,肽键是氨基酸之间的基本连接,维持蛋白质一级结构。它由氨基酸的氨基和羧基脱水缩合连成,化学式是以下:R-C=O |R-N-HR代表不同的氨基酸残基。二硫键在蛋白质中一般只由半胱氨酸形成,可以维持蛋白质更高级的结构,化学式是-S-S-左边和右边连着不同的两
细胞化学基础二硫键的功能
二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸
细胞化学基础二硫键简介
二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。
PNAS-杨弋等-二硫键蛋白质组学研究
人物简介: 杨弋 博士生导师 ,药学院、生物反应器工程国家重点实验室特聘教授。1973年4月出生。1990年由湖北省黄冈中学考入清华大学生物科学与技术系。1995年7月获得学士学位。同时被推荐为本系直硕生。1997年9月因成绩优异及论文工作突出,免试提前攻博。曾任校学生红十字会会长,生物系研究
GSP融合蛋白的准备
GST Fusion Protein PrepItalics indicate optional steps especially useful for the analysis of untested proteins.GROWTH AND HARVESTING OF BACTERIAAdd 10
抗体融合蛋白的应用
抗体融合蛋白的应用如下:1.肿瘤的体内显像诊断2.病毒的诊断和抗病毒感染3.血液疾病的诊断
抗体融合蛋白的应用
抗体融合蛋白的应用如下:1.肿瘤的体内显像诊断2.病毒的诊断和抗病毒感染3.血液疾病的诊断
融合蛋白的技术特点
融合基因可在原核细胞(如大肠杆菌) 也可在真核细胞中进行表达。原核表达系统的特点是时程短,费用低,是科研中的主要工具。其缺点是真核蛋白表达没有得到确切修饰;大量蛋 白常常沉淀成不溶性包涵体聚合物,需要复杂的变性和复性过程;大量蛋白的分泌较困难。
融合蛋白的设计类型
融合蛋白的设计大致分为基于重复结构、基于生长因子以及基于细胞粘附分子3类。第1类融合蛋白中最典型的是来源于弹性蛋白( Elastin-Like Polymers,ELPs) 及丝素蛋白( Silk-Like Polymers,SLPs) 的融合蛋白。ELPs 是一种由数个重复的氨基酸序列组成的细胞外
GST融合蛋白的准备
Preparation of Glutathione-S-Transferase (GST) Fusion ProteinsMargret B. Einarson and Elena N. Pugacheva Foxx Chase Cancer Center, Philadelphia, PA 19
融合蛋白的操作要点
在构建融合蛋白中,一个关键的问题是两蛋白间的接头序列( Linker ),即连接肽。它的长度对蛋白质的折叠和稳定性非常重要。如果接头序列太短,可能影响两蛋白高级结构的折叠,从而相互干扰;如果接头序列太长,又涉及免疫原性的问题,因为接头序列本身就是新的抗原。一般来说, 3-5个氨基酸的Linker可满
融合蛋白的临床应用
1、DNA疫苗目前,疫苗已经经历了三代:第一代疫苗是用减毒或杀死的病原体来激活机体免疫系统;第二代疫苗是用生物技术和重组DNA技术研制的组分疫苗注射机体诱导免疫应答; 第三代疫苗是直接注射基因重组的抗原基因来激活人体免疫系统,即DNA疫苗。DNA疫苗与传统疫苗相比有着明显的优势,如易于生产,稳定性强
融合蛋白的操作要点
在构建融合蛋白中,一个关键的问题是两蛋白间的接头序列( Linker ),即连接肽。它的长度对蛋白质的折叠和稳定性非常重要。如果接头序列太短,可能影响两蛋白高级结构的折叠,从而相互干扰;如果接头序列太长,又涉及免疫原性的问题,因为接头序列本身就是新的抗原。一般来说, 3-5个氨基酸的Linker可满
融合蛋白的操作要点
在构建融合蛋白中,一个关键的问题是两蛋白间的接头序列( Linker ),即连接肽。它的长度对蛋白质的折叠和稳定性非常重要。如果接头序列太短,可能影响两蛋白高级结构的折叠,从而相互干扰;如果接头序列太长,又涉及免疫原性的问题,因为接头序列本身就是新的抗原。一般来说, 3-5个氨基酸的Linker可满
融合蛋白的制备步骤
具体步骤为:1、进行目的基因的克隆:根据基因序列互补原则,设计合适的引物序列,以cDNA为模板,利用PCR技术扩增不同的目的DNA片段。2、在载体中进行重组:通过限制内切酶将两个DNA片段进行酶切并回收,然后通过连接酶将两个具有相同末端酶切位点的基因片段进行体外连接,并克隆到高表达质粒载体中,构建重
融合蛋白的基本介绍
融合蛋白(fusion protein)有两种不同的含义,一种是通过DNA重组技术得到的两个基因重组后的表达产物,另一种是介导两个细胞质膜融合的一组蛋白,如在仙台病毒脂双层外侧小叶中含有的两种糖蛋白之一,介导病毒被膜与宿主细胞质膜的融合作用。另一种糖蛋白是血细胞凝集素神经酰胺酶。 两个不同的蛋白
关于二硫键的基本内容介绍
二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。 在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。
胞化学基础二硫键的还原反应
二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-car
融合蛋白技术简介
在基因操作中,对一些分子数小的多肽基因常采用融合的方法与某一基因(如lac)相连,二者之间接上某一酶(如凝血酶)的切口,以增加在体内表达后产物的稳定性,也有的故意使两个分子串连融合以提高疗效,如IL-3与GM-CSF。也有与分泌性蛋白的信号肽基因组成融合基因,以使表达产物分泌到膜外或胞外。融合蛋白技
二硫键被氧化后变成什么
二硫键又称S-S键。是2个-SH基被氧化而形成的—S—S—形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。 二硫键被氧化后的产物要以氧化物的氧化能力而定。如果是强氧化剂,硫会变成最高价正六价。
二硫键被氧化后变成什么
二硫键又称S-S键。是2个-SH基被氧化而形成的—S—S—形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。 二硫键被氧化后的产物要以氧化物的氧化能力而定。如果是强氧化剂,硫会变成最高价正六价。
二硫键的还原反应的基本内容
二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-c
融合蛋白的临床的应用
1、DNA疫苗目前,疫苗已经经历了三代:第一代疫苗是用减毒或杀死的病原体来激活机体免疫系统;第二代疫苗是用生物技术和重组DNA技术研制的组分疫苗注射机体诱导免疫应答; 第三代疫苗是直接注射基因重组的抗原基因来激活人体免疫系统,即DNA疫苗。DNA疫苗与传统疫苗相比有着明显的优势,如易于生产,稳定性强
赛默飞ETD技术发明人参加第十届乌普萨拉国际会议
2013年2月17日,第十届乌普萨拉电子捕获与电子转移裂解国际会议(UPPCON 2013)在北京友谊宾馆召开。UPPCON 2013是一个偏重质谱基础研究的国际会议,围绕离子-离子和离子-电子的气相反应的理论、实验、仪器开发和应用,数位最著名的资深的学者介绍他
细胞化学基础二硫键的结构性质
二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右,在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外,S-S键反映了二价硫的极化特性,容易被极性试剂(包括亲电试剂和亲核试剂,特别是亲核试剂)切断 。二硫键的长度约为2.05 A
GST融合蛋白纯化的原理
GST纯化系统其实就是凝胶亲和层析系统。该纯化柱中,凝胶手臂上通过硫键结合一个谷胱甘肽。然后利用谷胱甘肽与谷胱甘肽巯基转移酶(即GST)之间酶和底物的特异性作用力,使得带GST标签的融合蛋白能够与凝胶上的手臂谷胱甘肽结合,从而将带标签的蛋白与其他蛋白分离开。
关于融合蛋白的特点介绍
融合基因可在原核细胞(如大肠杆菌) 也可在真核细胞中进行表达。 原核表达系统的特点是时程短,费用低,是科研中的主要工具。其缺点是真核蛋白表达没有得到确切修饰;大量蛋 白常常沉淀成不溶性包涵体聚合物,需要复杂的变性和复性过程;大量蛋白的分泌较困难。真核表达系统的特点是蛋白翻译后加工机会多,甚至可
融合蛋白的酶解实验
实验材料 融合蛋白试剂、试剂盒 SDS仪器、耗材 水浴锅培养箱离心机实验步骤 1. 准备两个小量预试验反应以确定最佳温育时间: (1)反应1:20 μl 含有1 μl 200 μg/ml Xa因子的1 mg/ml 融合蛋白,室温下反应(2)反应2:5 μl 不含因子Xa的1 mg/ml 融合蛋白(