NatureMethods:单细胞TCR研究进展
引言:今年三月份,来自英国的科学家Michael Stubbington博士和TapioLönnberg博士一起,基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据,开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具---TraCeR,同时结合T细胞亚群的转录组数据分析,从而进一步揭示在不同免疫反应中蕴含的更深层次的T细胞功能特异性。该研究成果发表在著名的《nature methods》杂志上。原文链接:http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n4/full/nmeth.3800.html 研究背景及成果当机体受到外源性入侵时,免疫系统会召集所有免疫细胞亚群通过产生免疫反应与病原体进行对抗。由于病原体存在着多种多样的差异,因而相应产生的免疫反应和和每个阶段内涉及的细胞类型也有所不同。T细胞受体中V(D)J基因区域的随机重排,导致了T细胞种类的复杂多样化;这种多样化使T细胞在识别和杀......阅读全文
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同?
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同:空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
2篇Cancer-Discovery|复旦高强/樊嘉等团队肝内胆管癌新突破
2022年7月19日,复旦大学高强,樊嘉及华大基因吴奎共同通讯在Cancer Discovery (IF=38)在线发表题为“Geospatial immune heterogeneity reflects the diverse tumor-immune interactions in int
癌症免疫细胞治疗知识:CART与TCRT的区别在哪里?
肿瘤免疫治疗,实际上分为两大类。一种把肿瘤的特征“告诉”免疫细胞,让它们去定位,并造成杀伤;另一种是解除肿瘤对免疫的耐受/屏蔽作用,让免疫细胞重新认识肿瘤细胞,对肿瘤产生攻击(一般来说,肿瘤细胞会巧妙伪装,逃脱免疫的监视)。 第一种情况,因为要利用机体自身的免疫细胞,因此,目前多为免疫细胞治疗
划时代的抗癌黑科技CART/TCRT:简明实用全攻略
1. 什么是肿瘤免疫细胞治疗? 利用患者本人的肿瘤组织、外周血等标本(当然也可以利用其他健康志愿者的外周血标本),分离和提取免疫细胞,在体外经过适当的改造(比如基因改造)和扩增,重新回输给患者。这种利用活的免疫细胞进行抗癌的技术,就是肿瘤免疫细胞治疗。图片来源于网络 肿瘤免疫细胞治疗,主要包
单细胞蛋白的营养特性
单细胞蛋白质饲料由于原料及生产工艺不同,其营养成分组成变化较大,一般风干制品含粗蛋白质在50%以上。因为这类蛋白质是由多个独立生存的单细胞构成,所以富含多种酶系。动物对其消化率高。例如,猪对啤酒酵母的消化率可达92%,对木糖酵母的消化率可达88%。必需氨基酸组成和利用率与优质豆饼相似。单细胞生物
单细胞研究指南:细胞分离
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。 那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这
单细胞mRNA差异显示实验
目前有几种方法可以显示生理刺激下组织样本中未知基因的表达水平变化。然而, 很多组织内的细胞又存在形态和功能上的异质性,因此常常需要从单个细胞水平研究基因表达的差异。现在,我们介绍一种新方法,它常规用来在单细胞水平考察未知基因的差异性表达。现代神经科学研究技术作者:U.Windhorst & H. J
单细胞生物的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快,世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克,1天即可获得2500千克酵母,其生长繁殖速度约为大豆的1300倍,为动物生长的2000倍。所以,这类饲料生长速度快,世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图 试剂、试剂盒 溶液和缓冲液 仪器、耗材
单细胞凝胶电泳介绍
单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用
单细胞分选效率的分析
引言在单克隆细胞培养时,手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞,每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率,无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法,是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图试剂、试剂盒 溶液和缓冲液仪器、耗材 水浴槽PCR热循环仪微量离心机塑料制品和滤器实验步骤 一、RNA 的分离收集对照组和实验组细胞,放入含 45ul2 mmol/L DTT 的 1.5 ml 微量离心管中。95℃ 水浴热解 2 min。每管加入以下物质:37℃ 温育 30
单细胞分离仪最新应用
随着人们对环境研究的不断深入,研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面:有些需要对藻类进行单细胞级别的分析(如藻类单细胞测序等),也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题,那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式,是在显微镜下用毛细管吸取。这种方式比较直观,对哪个细胞感兴趣就挑哪
单细胞铺板的原理介绍
单细胞铺板是将一个孔加入少量无血清培养基,晃动浸润整个孔底,然后用移液枪吸至第二孔,同样方法浸润孔底,其它孔依此类推,这样整个孔底都是湿润的,细胞悬液会平铺在整个孔底。 加细胞悬液的时候可以避免加在中间中间细胞多,而加在周边晃匀后周边细胞多中间少的现象,细胞分散较均匀,注意加完细胞悬液后要放工作台
单细胞生物的主要影响
单细胞生物虽然个体微小,但是与人类的生活有着密切的关系。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分,是鱼类的天然饵料。草履虫对污水净化有一定的作用,据统计,一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡,每个食物泡中大约含有30个细菌,因此,一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌。但是单细胞生物也有对人类有害
单细胞生物也具有“智慧”
虽然"智慧"是一种十分复杂难以定义的概念,我们却都明白具备一个大脑是生物具有智慧的生理前提。但是对于单细胞生物来讲,它们是否也存在智慧呢? 如果我们坚信智慧来源于大脑,那么答案就是否定的。不过,最近一项研究表明情况比我们想象的要复杂,研究者们发现"无脑"的单细胞生物也具有学习的能力。 正如科
单细胞生物的相关介绍
单细胞生物指的是身体只有一个细胞,在生物圈中还有肉眼很难看见的生物。 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,而且经常会聚集成为细胞集落。单细胞生物个体微小,全部生命活动在一个细胞内完成,一般生活在水中。 第一个
单细胞动物的进化过程
当生命进化到真核细胞以后,便有了动物和植物之分。最早的动物叫原生动物,是最低等的一类动物,它的个体是由一个细胞构成的。仅管如此,“麻雀虽小却五脏俱全”,这是一个完整的生命活动体,拥有作为一个动物应具备的主要生活机能,如新陈代谢、刺激感应、运动和繁殖等,它的体内有了原始的分化,各具一定功能,形成了
单细胞测序的临床应用
近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息,并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法,或者在无细胞DNA的情况下,来自许多细胞的基因组材料。因此,这些基因
单细胞分析重大突破
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,
单细胞蛋白的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快,世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克,1天即可获得2500千克酵母,其生长繁殖速度约为大豆的1300倍,为动物生长的2000倍。所以,这类饲料生长速度快,世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
新型单细胞活性分析技术
近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中,来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术,鉴别出了人类大脑脑细胞的特性,该研究揭示,如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效,而且廉价。 研究者Arnold
单细胞生物的科技应用
单细胞分析 单细胞分析是分析化学、生物学和医学多学科相互渗透发展形成的跨学科前沿领域。单细胞分析的各种方法,包括毛细管电泳、微流控芯片、多种光学显微镜(荧光显微镜、聚焦荧光显微镜、全内反射荧光显微镜、多光子荧光显微镜、荧光相关显微镜、近场扫描光学显微镜等)、扫描电化学显微镜、质谱成像、原子力显
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响?
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响:促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台,使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能,从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时,能够促使开发者反思和改进算法,以提高准确性和可靠
多功能单细胞显微操作系统FluidFM-BOT在单细胞力学实验...
多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT在单细胞力学实验中的创新应用瑞士Cytosurge公司的多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT,是将原子力系统、微流控系统、纳米位移台系统合为一体的单细胞操作系统,能够在单细胞水平上为研究者提供很大的便利,可应用于单细胞力谱、单细胞质谱、单细
程超等揭示VISTA在调控T细胞稳态中的重要作用
根据克隆选择理论的中心宗旨,T细胞作为机体应对外界病原威胁的关键组成部分之一,需要被抗原激活从而发挥作用,然而,机体内绝大多数T细胞在整个生命过程中并非处于激活状态而是由保持静默的初始T细胞组成【1】。无论是是克隆选择理论还是近年基于克隆选择理论的研究都未指出负调节信号在维持初始T细胞静默状态中
免疫调控机制研究为癌症治疗,可以从这方面入手
5月25日,《科学进展》在线发表上海交通大学医学院附属第九人民医院教授陈福祥团队与美国路易斯维尔大学教授Jun Yan合作的研究论文。该论文揭示了特殊免疫细胞γδ T的免疫代谢调控机制,为γδ T细胞生物学基础研究及定向分化机制提供了新线索,同时为临床疾病(如癌症)免疫治疗提供了新思路。免疫细胞γδ
Cell-Res:TCR激活过程中CD3依赖磷脂膜的动态变化机制
获得性免疫反应(adaptive immunity)的关键特征之一是抗原的特异性。不同的病原微生物能够引发各自特异的后天免疫反应,然而,其中的分子机制目前了解的并不清楚。获得性免疫反应的起始是由T细胞表面的TCR复合体与抗原呈递细胞表面的MHC-抗原复合物结合而引发的,之后,一系列的信号传递最终
中科院,南京大学Cell-Res发文-解析TCR复合物新调控机制
来自中科院生物化学与细胞生物学研究所的研究人员发表了题为“Lipid-dependent conformational dynamics underlie the functional versatility of T-cell receptor”的文章,揭示了TCR复合物胞内段的结构动态性,为
Cell:首次在单细胞水平描绘肝癌微环境中的免疫图谱
2017年6月16日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape o