NatureMethods：单细胞TCR研究进展
引言：今年三月份，来自英国的科学家Michael Stubbington博士和TapioLönnberg博士一起，基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据，开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具---TraCeR，同时结合T细胞亚群的转录组数据分析，从而进一步揭示在不同免疫反应中蕴含的更深层次的T细胞功能特异性。该研究成果发表在著名的《nature methods》杂志上。原文链接：http://www.nature.com/nmeth/journal/v13/n4/full/nmeth.3800.html 研究背景及成果当机体受到外源性入侵时，免疫系统会召集所有免疫细胞亚群通过产生免疫反应与病原体进行对抗。由于病原体存在着多种多样的差异，因而相应产生的免疫反应和和每个阶段内涉及的细胞类型也有所不同。T细胞受体中V(D)J基因区域的随机重排，导致了T细胞种类的复杂多样化；这种多样化使T细胞在识别和杀......阅读全文
德国企业Medigene－AG宣布TCRT疗法进入I/II临床研究
近日，德国生物技术公司Medigene AG宣布，其TCR-T细胞候选疗法MDG1011在针对血液肿瘤的I/II临床研究中第一位患者已接受治疗，包括急性髓性白血病（AML）、骨髓增生异常综合征（MDS）和多发性骨髓瘤（MM）。 MDG1011使用患者来源的T细胞受体（TCR）修饰T细胞靶向肿瘤
继CART之后，TCR技术或成为第3代免疫疗法明星
美国时间7月3日，全球领先的TCR公司Immunocore宣布其合作伙伴葛兰素史克（GSK）又开展了一项计划作为他们正在进行的肿瘤免疫疗法合作的一部分，该合作于2013年首次推出，是基于Immunocore公司的T细胞受体（TCR）平台ImmTAC，该平台承诺创造更小的生物分子，从而达到常规单克
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择：手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然，除了成熟的方法，巧妙的新方法也在不断涌现，能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中，会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境，就需要用到激光捕获显微切割技术，这种技术通过扫描组织切片来
单细胞分离仪在单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离仪可以实现从微孔芯片转移单细胞到细胞收集管中。单细胞转移分离系统集单细胞成像，单细胞隔离，单细胞选择功能于一体，自动聚焦成像。 转移单细胞到微管，PCR微孔板或其它反应微管中，在隔离单细胞后，它可以对选定收集的细胞进行扫描并成像，采用倒置荧光显微镜，配备自动扫描显微镜载物台，自
有哪些具体的单细胞分析技术可用于疾病诊断？
具体的单细胞分析技术可用于疾病诊断： 1. **单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）**： - 可以揭示单个细胞中基因的表达情况。例如，在肿瘤诊断中，通过分析肿瘤细胞和周围免疫细胞的基因表达模式，能够区分不同亚型的肿瘤，评估肿瘤的恶性程度和预后。 - 对于神经系统疾病，如
Cell：科学家利用新方法鉴定肿瘤免疫治疗新靶点
2017年5月，《Cell》杂志连续刊登了美国西奈山伊坎医学院研究人员的工作，他们分离了来自肺癌病人肿瘤组织、正常肺组织以及外周血的免疫细胞，利用TCR测序和质谱流式（CyTOF）等技术对细胞特定转录本和表面30多个蛋白Marker进行检测分析，绘制了早期肺腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的详细图谱。根
Nature子刊：新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞
近年来，随着精准医疗的发展，癌症治疗已经取得了长足的进步，其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功，但大多数只对部分患者有效，并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此，了解免疫系统在癌症治疗中的表现，准确筛选最有可能获益
哈佛大学尹鹏Nature－Biotechnology：高灵敏度单细胞质谱流式
利用质谱仪计数单细胞 质谱仪使用金属同位素标记的抗体标记感兴趣的靶点，这使得能够同时测量数百万个单细胞中的约50种蛋白质或蛋白质修饰，从而能够分析高度异质性样品中复杂的细胞行为。然而，目前的质谱分析灵敏度有限，通常需要将数百种金属标记抗体结合到每种细胞表位上，才能达到仪器的检测阈值。这阻碍了用
单细胞动物的简介
没有神经系统,没有反射,只有“应激性” 草履虫等单细胞动物也是自然界中降解水体中有机物的主要动力。 草履虫是研究单细胞动物最好的标本，因为它具有这类动物的全部属性。单细胞动物就是只有由一个细胞构成的生物个体，这种动物往往比较低级，如很多细菌就是单细胞生物．其他生物就比单细胞生物要高级的多，而且身
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
Nature：单细胞测序（下）
随着技术的飞速发展，成本大大降低，使得基因组测序成为常规技术。然而，大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序，它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序，研究小
Nature：单细胞测序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年，冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织，一并将这些DNA进行测序，生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。
单细胞分离技术介绍
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲，我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术，并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1：目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员，都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞测序方法汇总
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题，而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了（scRNA-seq）。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序，并给出平均差异，但并没有两个细胞是完全一样的，而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变，甚至这种技术还能够阐明完整
单细胞藻类的简介
单细胞藻类无胚，自养型生活，进行孢子繁殖，作为一种低等植物广泛存在于活性污泥中。藻体为单细胞、群体或多细胞体，微小者需借助显微镜才能看见，大者如马尾藻、巨藻等可长达几米、几十米到上百米。内部构造初具细胞上的分化，而不具有真正的根、茎、叶。整个藻体结构简单，富含叶绿素，能进行光合作用。藻类的生殖基
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
什么是单细胞生物？
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物（Protozoa）和多细胞生物（Metazoa）。单细胞生物只由单个细胞组成，个体微小，用肉眼很难看的见，大多数单细胞生物生活在水域环境中，有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖（酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖）单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
什么是单细胞测序？
单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序，可以：揭示细胞的异质性：了解即使是看似相同的细胞群体中，每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态：识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊
单细胞测序方法介绍
单细胞RNA测序（scRNA-seq）作为一种全基因组测序的方式，在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料，来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况，对比静息记忆B细胞，可以从单细胞层面研究基因表达
单细胞生物的概述
单细胞生物主要分有核和无核的单细胞。 有核的如草履虫就是典型的有核单细胞生物。有核单细胞生物主要由细胞核、细胞质、还有细胞器。 它包括：线粒体、高尔基体、核糖体、细胞膜、这是动物型单细胞。如果是植物型单细胞比如 红藻，就是细胞壁、细胞核、细胞质，它的细胞器就包括线粒体、高尔基体、核糖体、叶绿
单细胞生物的种类
概括 单细胞生物主要分有核和无核的单细胞。 有核的如草履虫就是典型的有核单细胞生物。有核单细胞生物主要由细胞核、细胞质、还有细胞器。 它包括：线粒体、高尔基体、核糖体、细胞膜、这是动物型单细胞。如果是植物型单细胞比如 红藻，就是细胞壁、细胞核、细胞质，它的细胞器就包括线粒体、高尔基体、核糖体
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
利用cryoEM在3.7A的分辨率下解析了人类TCR的结构
T细胞在细胞膜上有着特殊的T细胞受体（TCRs），其能帮助识别表达异常蛋白片段的功能异常细胞，如果发生癌症或感染，这类异常就会发生；当TCRs识别到这些异常肽类时，受体就会被激活同时也会几乎T细胞来破坏或抑制异常细胞的进展，这类T细胞反应常常会被抗癌临床疗法所调节，TCRs就是研究人员非常感兴趣
学者开发出MIST模型解析T细胞功能
暨南大学基础医学与公共卫生学院教授罗钧洪团队基于变分自编码器深度学习框架开发了人工智能模型Multi-Insight for T cell（MIST），针对scRNA-seq与scTCR-seq数据的联合分析，创新性地构建了跨组学数据深度融合、可解释性和适配性强的分析框架。近日，相关成果发表于《
黄超兰Cell发文－绝对定量质谱揭示CD3ε的多重信号转导功能
2020年7月29日，北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队，中科院上海生化与细胞所许琛琦团队、美国加州大学圣地亚哥分校惠恩夫团队，联手在Cell上发表了题为“Multiple signaling roles of CD3ε and its application in CAR-T cell
狙击肿瘤，PD1与GITR抗体联用事半功倍（一）
【科学前沿】Science Immunology：狙击肿瘤，PD-1与GITR抗体联用竟有事半功倍之妙！ 前言近年来，靶向PD-1/PD-L1抗体的效果无疑戏剧性地引导我们对癌症治疗总体方法和对宿主-肿瘤生物学理解的改变。由于癌症治疗过程中，T细胞会发生功能性障碍，大多数癌症病人单独接受PD-1或者
单细胞表观组学：单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾