大数据时代的疾病生物样本库建设与管理(一)

李建忠,冯凯,解放军306医院,特种医学实验研究中心品牌质量管理办公室 左天宇 整理大数据时代,研究者更关注样本的生物信息数据与疾病临床信息的相关性,通过大样本的关联分析,来预测疾病的发生、发展与转归。疾病生物样品库便是关联疾病临床信息与样本生物信息的桥梁与核心,是生命科学基础与临床研究的关键源头,是进行大样本验证、快速实现生物医药转化医学的核心环节。近几年,我国疾病生物样本库与转化医学得到政府与科学家们的高度关注、医院领导与专家们的高度重视、企业与技术部门大力支持,广大科研、医务工作者的积极响应,呈现良好发展势头。从样本资源来说,中国最大的特点是样本资源量大,资源种类多样化。在中国一个月的就诊数量,在国外达到同样的病例数可能要几个月,如胸腺肿瘤类,据说整个欧洲的例数甚至少于中国的一家三甲专科医院。目前,我国生物样本库有专家库、科室库、多学科库、重大项目库、医院库、区域库等,不少医院(尤其三甲医院)纷纷着手建立自己的样本库,其中......阅读全文

生物样本蛋白质的提取

由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02~0.05mol/L磷酸缓冲溶

活体肿瘤样本库与常规肿瘤生物样本库有什么区别?

  一、常规生物样本库  肿瘤在临床上有实体瘤和非实体瘤之分。来源于临床活检或外科手术的固体肿瘤组织,由病理医生决定切割组织的关键部份用于常规病理诊断,且在不影响常规病理诊断的情况下,组织的剩余部份被生物样本库切割收集,将肿瘤蜡块存储到样本库中。但是这种方式保存的样本,不能够保证保存下来的肿瘤块是否

生物样本的基本类型有几种

描述有两种种类型,分人物描述和景物描述。描述要有明确的目的,鲜明生动具体形象,抓住特点突出特点,少而精有特色,使人犹如身临其境经久不忘。人物描述,通过对人物的外貌特征即容貌衣饰神情姿态等描述,反映其内心世界和性格特征;通过对人物的心理活动描述把任务的内心世界展现给读者;通过对人物的行动描述显示其精神

生物样本的主要检测技术有哪些?

这些待测组分大多数都可以用色谱方法进行分析测定,其中用得最多的是HPLC、GPC、电泳和毛细管电泳分析,一些小分子化合物也可直接或衍生化后用GC分析。当待测组分存在于体液或细胞外时,可采用各种萃取方法将待测组分提取后制备成适合于色谱分析的样品;也可将干扰组分(如蛋白质、DNA、多糖等)沉淀除去,然后

几种典型扫描电镜生物样本制备

隨着科学技术的发展,扫描电子显微镜技术已成为检测物质性能和表征微观结构的重要手段,被广泛应用于食品学、生物学、医学、高分子材料等领域[1]。扫描电子显微镜在科学研究中有广泛应用,如观察不同淀粉颗粒的超微形貌[2]、蛋白复合膜的微观结构[3]、淀粉纳米颗粒的研究[4]及不同储藏过程中肉食类微结构的变化

病原微生物样本的采集

传染病实验室诊断、传染源调查、自然疫源地监测、流行病学调查研究,都以检出特定的病原微生物或其相关物质为目的。这类样本来源主要是人和宿主动物、媒介昆虫,也包括水、土壤、食品等样本供调查传染源。1、病原微生物样本采集的一般注意事项1)针对性:不要求样品代表性,强调针对性,尽可能采集病原微生物含量最多的部

生物芯片实验样本选择和设计

 基因芯片对样本的选择非常重要,选用有效的样本可以使实验结果可靠。但是基因芯片对样本要求非常高,理想的样本往往得不到。因此,在可选择的范围内,样本的选择和设计非常重要。     (1)待测样本的选择:基因芯片需要的样本来源非常广泛,可以是组织来源的或血液来源的,也可以是培养的细胞或病人的体外分泌物等

粪便样本库立功,多种疾病可获得免疫

人类生活和饮食方式的改变导致了肠道微生物群的巨大变化,尤其是在过去几十年里。这些变化与哮喘、过敏、消化系统疾病、2型糖尿病和其他疾病的发病率增加有关。美国哈佛医学院和布莱根妇女医院研究团队在近日发表于《分子医学发展趋势》的研究中提出,可以让个人在年轻和健康时保存自己的肠道菌群样本,以便在以后的生活中

中国生物样本库:不能仅“存起来再说”

101篇1980年前后发表于《细胞》《自然》等杂志的重大发现,20年后仅1项有临床价值。”中国科学院院士、复旦大学附属中山医院院长樊嘉在近日召开的中国整合生物样本学大会上说,美国的这组统计数字显示从实验室到临床的传统转化模式效率低、时间长。 高质量论文仅有不足百分之一临床转化,这样的窘境有

生物大分子样本的贮存方法

生物大分子的稳定性与保存方法的很大关系。干燥的制品一般比较稳定,在低温情况下其活性可在数日甚至数年无明显变化,贮藏要求简单,只要将干燥的样品置于干燥器内(内装有干燥剂)密封,保持0-4度冰箱即可,液态贮藏时应注意以下几点。1、样品不能太稀,必须浓缩到一定浓度才能封装贮藏,样品太稀易使生物大分子变性。

中国生物样本库向标准化迈进

  1 癌症研究现状与精准医学  过去一百多年,各国对肿瘤浩浩荡荡的研究并没有取得突破性进展,就如 Clifton Leaf 在 2004年 Fortune 所提到:“Why We’re Losing the War on Cancer —— and How to Win it?”。近 10 多年来

生物样本库保存时间影响血检结果

  用于医疗研究的血液样品被存储在生物库的时间可影响测试结果, 其程度和血液样品提供者的年龄相当。这是来自乌普萨拉大学的一项新研究,发表在科学杂志EBioMedicine。到现在为止,医学研究已发现提供所述样品人的年龄,性别和健康是影响因素,但事实证明贮存时间也同样重要。  “这一发现将改变整个世界

单细胞分选可应对各种复杂生物样本

单细胞分选与传统的流式细胞分选技术相比,该技术不对细胞进行任何“修饰”即可实现精准分选,可保持细胞本来的状态,对不同类型和尺寸的细胞具有良好的普适性,可应对各种复杂生物样本,特别适用于微生物单细胞分选。  细胞分选可从血液、尿液等成分复杂的临床样本中,快速定位并分离病原微生物,从而指导用药,为患者特

英国生物样本库发布大规模遗传数据

  近日在线发表于《自然》的两篇论文集中介绍了英国生物样本库的遗传数据。两篇论文对整个数据集进行了详细描述,并对大脑遗传结构进行了深入研究。该数据集涵盖了约50万个个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录。  英国生物样本库包含50万年龄(招募时)在40~69岁之间英国人的遗传和临床数据,这些资

WHO欲建埃博拉病毒生物样本库

  随着西非埃博拉疫情的逐渐好转,为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本,一项计划正在酝酿。日前,世界卫生组织(WHO)在塞拉利昂首都弗里敦召开会议,讨论建造生物样本库,储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等,共计约10万份样本。   WHO理事会顾

生物样本库建设、管理及相关产品建议

建样本库的基本原则是安全、准确、便捷。其中安全包括样本生物安全、样本信息安全、设备运行安全;准确包括样本信息准确、样本存放取出位置准确;便捷包括工作流程便捷、软件系统操作便捷、信息交流便捷、硬件软件耗材供应及技术支持便捷。    样本库通常由基础设施、冻存设备、冻存耗材、编码及读码设备、监控设备、管

-美实验室暂停转移生物样本

Thomas Frieden  美国疾病控制和预防中心(CDC)已经关闭了两个实验室,并暂停转移一些生物实验样本。最近美国联邦实验室爆出一系列安全问题,例如没有妥当处理高致病性微生物样本。相关安全事故包括,安全防护级别较高的一个实验室在未确认炭疽杆菌是否妥善灭活的情况下,就将样本提供给了安全防护低一

浅析溶血对生物样本分析的影响

溶血指的是红细胞破裂,血红蛋白逸出释放到血浆或血清中,可发生在体内和体外,影响溶血的因素也十分复杂。血浆血清发生溶血后,许多生理成分如血红蛋白、胆红素、磷脂等明显增加,这些成分可能会影响溶血样品中药物的检测。生物药物分析的样品一般为血浆或血清样品,存在被测样品少,样品复杂及干扰物质多等问题,而且在实

北京脑科学中心生物样本库获批

  日前,国内首个由新型研发机构申请的、专注于脑科学研究的生物样本库——北京脑科学与类脑研究中心(简称北京脑科学中心)生物样本库顺利通过中国人类遗传资源行政许可事项审批。据悉,该样本库集人类遗传资源样本保藏和数据保藏于一体,具备高通量测序和高性能计算等完整闭环工作流程。  人类遗传资源是开展生命科学

中国生物样本库向标准化迈进

  1 癌症研究现状与精准医学  过去一百多年,各国对肿瘤浩浩荡荡的研究并没有取得突破性进展,就如 Clifton Leaf 在 2004年 Fortune 所提到:“Why We’re Losing the War on Cancer —— and How to Win it?”。近 10 多年来

卫生指标微生物样本的采集

1、卫生指标微生物样本采集的一般注意事项1)代表性:采样量、采样部位应依据检样归属类别的标准要求执行,注意采用随机抽样法,并按批号抽样。2)均匀性:固体粉末样品应边取边混合;液体样品应振荡混匀;涂抹取样的棉拭子应将棉拭子尾部剪断,投入稀释液内充分振荡后,作为原液检样。3)及时性:为避免样品变质和样品

低温保存对生物样本及其生物大分子的影响

引言生物样本库主要是指收集和应用健康及疾病生物体的生物分子、细胞、组织和器官等,包括人体器官、组织、体液或处理过的样本(DNA、RNA、蛋白等),以及与这些样本相关的临床资料、质控、管理等生物应用系统。在医学研究中,生物样本是联系分子信息与疾病的桥梁。根据使用目的的区别,样本的保存要求也会有所差别。

研发人员开发AI工具可通过血液样本诊断多种疾病

科研人员开发出一款人工智能(AI)工具,能够通过分析血液样本中免疫细胞的基因序列,一次性诊断多种病毒感染及确定健康状况。在2月20日发表于《科学》的一项涉及近600人的研究中,该工具成功识别出受试者的健康状态,以及是否感染新冠病毒、艾滋病毒或是否患有1型糖尿病、系统性红斑狼疮,还能判断出受试者近期是

建立埃博拉病毒生物样本库有助非洲科学

  随着西非埃博拉疫情的逐渐好转,为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本,一项计划正在酝酿。8月6日~7日,世界卫生组织(WHO)在塞拉利昂首都弗里敦召开会议,讨论建造生物样本库,储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等,共计约10万份样本。  西非和

2014生物样本库与临床研究论坛

  随着高通量生物技术、各类组学与生物信息学的快速发展,个体化医疗与转化医学成为国际医学健康领域的重要概念。   转化医学是沟通基础医学与临床医学之间的桥梁,使实验室研究成果能够快速转化为临床的诊疗方案(Bench to Bedside),让患者受益。   生物样本作为生命科学基础研究与转化医学

建立埃博拉病毒生物样本库有助非洲科学

   随着西非埃博拉疫情的逐渐好转,为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本,一项计划正在酝酿。8月6日~7日,世界卫生组织(WHO)在塞拉利昂首都弗里敦召开会议,讨论建造生物样本库,储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等,共计约10万份样本。  西非

生物样本库申请单位应具备相应资源

  生物样本库应有专职人员、基础设施和专用场地、设备、信息系统和生物样本库活动所需要的支持性服务。生物样本库应做好战略规划并形成文件,战略规划应定期更新。确保有持续的资金支持各项活动。  1-人员要求  所有可能影响生物样本库活动的内部或外部人员,都应公正行事。所有能访问生物样本库机密数据的人员都应

EcoBioBank生物样本库整体解决方案

整体集成特点:样本库前期整体设计+样本库资源信息化管理+样本库安全管理+样本库存储方案;为生物样本库专业用户提供高效、便捷的一站式服务 图(从左至右):样本库布局、通风、散热、供电设计;样本库资源管理信息系统 ;样本安全监控系统 图:组织生物样本低温储存设备 1】样本库前期整体设计  为用户提供整体

毛细管电泳技术应用生物样本

生物体内药物及其代谢物的随时间与位置分布研究,即药物动力学分析,在临床医学中有重要意义。在非水溶剂中可降低被分析物与管壁的作用,降低由于吸附所引起的峰拓宽并改善拖尾,同时可显著提高被分析物的回收率,降低用管壁面积较大的毛细管进行分析时被分析物的损失。近年来,用毛细管电泳法进行生物样本中的药物及其代谢

临床试验生物样本的处理与保存规范

  临床试验是新药人体试验的起始阶段,即评价人体对于新药的耐受性和安全性[1]。2003年国家食品药品监督管理总局(CFDA)现更名为国家药品监督管理局(NMPA)颁布了《药物临床试验质量管理规范》(GCP),其中规定研究者应获得所在医疗机构或主管单位的同意,保证有充分的时间在方案规定的期限内负责和