大肠杆菌芯片在研究蛋白质去乙酰化酶YcgC的应用

上海交通大学和美国约翰霍普金斯大学的研究人员利用广州博翀生物科技有限公司生产的大肠杆菌蛋白质组芯片,发现了一种全新的蛋白质 去乙酰化酶 YcgC ,这一研究成果2015年12月30日在eLIFE杂志在线发表。 蛋白质是生命活动的体现者,在生命周期中往往会被打上不同类型的修饰。乙酰化作为一种重要且广泛存在的蛋白质翻译后修饰类型,与一系列重要疾病密切相关,影响众多关键的生物学过程。随着蛋白质组技术的进步,目前已经从低等的大肠杆菌到高等的人等众多生物的细胞中发现了成千上万的乙酰化修饰。蛋白质的乙酰化由乙酰转移酶和去乙酰化酶所调控。对应海量的蛋白质乙酰化修饰,目前已知的乙酰化酶和去乙酰化酶数目非常有限,仍有相当数目的新酶有待发现,一个关键问题是“如何实现高效乙酰化相关酶的发现?”。针对这一问题,研究者发展了一套称之为“Clip-chip”的技术,在大肠杆菌蛋白质组芯片的基础上,进行了全局性蛋白质去乙酰化酶的......阅读全文

白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性的机制

  6月15日,美国Genes & Development 杂志发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组关于白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性作用机制的最新研究进展,标题为Structural basis for allosteric, substrate-dependent stimulat

重要次生代谢产物合成调控与植物抗逆研究取得系列进展

近日,中国科学院东北地理与农业生态研究所,在蛋白翻译后修饰调控植物次生代谢产物合成,以及植物逆境胁迫适应方面取得系列进展。研究团队在药用植物丹参次生代谢调控研究中取得成果。科研人员通过整合代谢组、蛋白质组与磷酸化蛋白质组学分析,解析了丹参不同器官中丹参酮类成分积累与蛋白质表达谱的关联,鉴定出丝裂原活

上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰通路研究中取得进展

  蛋白翻译后修饰对蛋白质的结构和功能起着关键作用,是细胞精细调节生理活动的关键之一。因而,蛋白翻译后修饰通路研究是目前新药研发的重要热点之一。   中科院上海药物研究所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密西根大学合作研究,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了

中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰

  来自密西根大学,中科院上海药物研究所,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底

什么是乙酰化?常见的乙酰化剂

乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应,最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因

HDAC4基因的结构特点和生理作用

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白属于组蛋白去乙酰化酶/acuc/apha家族的Ⅱ类。它具有组蛋白脱乙酰酶活性,当与启动子结合时抑制转录。这种蛋白质不直接与dna结合,而是通过转录因子mef2c和

植物去氢酶的简易鉴定实验

实验方法原理去氢酶是呼吸链中参加电子和氢传递的重要酶之一,包括烟酰胺脱氢酶和黄素脱氢酶。还原型的黄素脱氢酶可被某些试剂氧化,例如甲烯兰与黄素酶作用可发生下列变化:实验材料马铃薯块茎仪器、耗材温箱试管刀片刻度试管电炉实验步骤一、材料与设备材料:马铃薯块茎设备:温箱、试管、刀片、20ml刻度试管2支、电

植物去氢酶的简易鉴定实验

实验方法原理 去氢酶是呼吸链中参加电子和氢传递的重要酶之一,包括烟酰胺脱氢酶和黄素脱氢酶。还原型的黄素脱氢酶可被某些试剂氧化,例如甲烯兰与黄素酶作用可发生下列变化:实验材料 马铃薯块茎仪器、耗材 温箱试管刀片刻度试管电炉实验步骤 一、材料与设备材料:马铃薯块茎设备:温箱、试管、刀片、20ml刻度试管

植物去氢酶的简易鉴定实验

实验方法原理:去氢酶是呼吸链中参加电子和氢传递的重要酶之一,包括烟酰胺脱氢酶和黄素脱氢酶。还原型的黄素脱氢酶可被某些试剂氧化,例如甲烯兰与黄素酶作用可发生下列变化: 实验材料马铃薯块茎                                                          

乙酰化的概念及常见的乙酰化剂

乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应,最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。

深大特聘教授陈雪梅院士PNAS发表植物表观遗传学成果

  生物通报道:在植物中,组蛋白去乙酰化酶(HDACs)属于一个大的蛋白质家族,但是很少有人知道每个HDAC的靶标特异性是如何实现的。12月5日在《PNAS》发表的一项研究中,来自深圳大学、加州大学河滨分校、韩国基础科学研究院和湖南农业大学等处的研究人员指出,一对含有SANT (SWI3/DAD2/

Protein-Cell:病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控

   天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线,在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰(non-hi

HDAC8基因的结构特点和生理作用

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰酶家族的Ⅰ类。它催化组蛋白n末端末端末端末端赖氨酸残基的脱乙酰化,并抑制具有转录共抑制因子的大型多蛋白复合物中的转录。已发现该基因编码不同亚型的

科学家发现合成酶调控新机理

  复旦大学生命科学学院余巍课题组研究发现乙酰化修饰对氨酰tRNA合成酶的调控及抑制超氧应激的分子机理。相关研究成果近日发表于美国《国家科学院院报》。  氨酰tRNA合成酶是一个进化上非常保守的酶家族,其经典的功能是作为蛋白质翻译的一部分,催化氨基酸与其对应的tRNA之间的氨酰化反应。许多氨酰tRN

HDAC4基因编码功能及结构描述

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白属于组蛋白去乙酰化酶/acuc/apha家族的Ⅱ类。它具有组蛋白脱乙酰酶活性,当与启动子结合时抑制转录。这种蛋白质不直接与dna结合,而是通过转录因子mef2c和

HDAC4基因编码功能及结构描述

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白属于组蛋白去乙酰化酶/acuc/apha家族的Ⅱ类。它具有组蛋白脱乙酰酶活性,当与启动子结合时抑制转录。这种蛋白质不直接与dna结合,而是通过转录因子mef2c和

HDAC4基因突变与药物因子介绍

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白属于组蛋白去乙酰化酶/acuc/apha家族的Ⅱ类。它具有组蛋白脱乙酰酶活性,当与启动子结合时抑制转录。这种蛋白质不直接与dna结合,而是通过转录因子mef2c和

乙酰化的作用

乙酰化作用是生物体内经常进行的反应之一。例如:胆碱乙酰化形成生成乙酰胆碱,葡萄胺乙酰化生成乙酰葡萄胺。又如脂肪酸的合成,萜类化合物、胡萝卜素、类固醇的合成,都必须通过一系列的乙酰化反应。一般通过形成活性乙酰基即乙酰辅酶A而实现。

我学者发现DNA守护者及表观遗传载体更新机制

  记者23日从北京师范大学生命科学学院获悉,该院邱小波教授领导的研究团队发现乙酰化,而不是泛素化,介导了组蛋白通过特异的蛋白酶体降解。相关论文发表在最新一期国际著名期刊《细胞》上。该发现修正了科学界关于体细胞组蛋白不降解的论点,将开辟关于乙酰化介导蛋白质降解研究的新领域。   科学界一直认为,作

关于组蛋白的医学应用介绍

  1、预测  最新研究结果显示:组蛋白修饰的整体模式可预测低分级前列腺癌的复发风险。该研究第一作者加利福尼亚大学的Siavash K. Kurdistani表示:这种修饰模式最终可作为前列腺或其他类型癌症的预后或诊断指标,也可作为预测何种患者、患者会对一类o组蛋白去乙酰酶抑制剂新药产生反应的指标。

生物物理所揭示白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性机制

  6月15日,美国Genes & Development 杂志发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组关于白藜芦醇促进去乙酰化酶SIRT1酶活性作用机制的最新研究进展,标题为Structural basis for allosteric, substrate-dependent stimulat

中科院在乙酰化酶SIRT1酶活性作用机制取得新进展

  2015年6月15日,美国Genes & Development杂志发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组题为"Structural basis for allosteric, substrate-dependent stimulation of SIRT1 activity by resv

HDAC7基因的结构特点及主要作用

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与小鼠hdac7基因同源,其蛋白通过转录辅压子smrt介导抑制作用。另外,已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体

代谢物和细胞周期信号调控组蛋白乙酰化

  足够的营养是细胞增殖和组织发育的必要条件。细胞增殖和组织发育需要上调组蛋白乙酰化来激活基因转录。二者之间的联系,也就是:“营养物信号如何被传递到组蛋白乙酰化?”这个基础生物医学问题,长期未能得到阐明。  2021年6月17日,复旦大学赵世民团队/徐薇团队合作在Nature Metabolism杂

复旦学者找到清除胰腺癌发生恶化的“微环境”新机制

  乙酰“武装”蛋白质可抑制肿瘤。   复旦大学学者找到了肿瘤发生和恶化的“微环境”新机制,这一研究有望为胰腺癌等早期诊断提供可能。国际权威杂志《癌细胞》今天以《乳酸脱氢酶A去乙酰化导致胰腺癌发生》为题,刊发了这一引人关注的重要成果。   “乳酸脱氢酶A”是人体内的蛋白质,也是一种能够产生乳酸的

知识分享:去泛素化酶(DUBs)家族专题介绍

  去泛素化酶(DUBs),是一类数量很大的蛋白酶类家族。它主要通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来。人类基因组编码近100种去泛素酶,使得它们成为泛素系统酶中最大家族。在人类中的去泛素化酶基因,可分为两大类:半胱氨酸蛋白酶家族和金属蛋

新抑制剂有助研发抗肿瘤药物

  近日,中科院广州生物医药与健康研究院的研究人员利用计算机辅助药物设计原理和合理药物设计的方法,成功设计合成了新型组蛋白去乙酰化酶I型选择性抑制剂。这为进一步研究具有选择性的组蛋白去乙酰化酶抑制剂提供了非常好的模型,对肿瘤表观遗传及个体化治疗提供了有益的方向。相关研究成果日前在《美国化学会药物化学

关于羟肟酸在医药方面的应用介绍

  随着癌症发病率的升高,抗癌活性药物的设计合成在世界范围内备受关注。经有关研究证实,恶性肿瘤的发生发展与组蛋白去乙酰化状态的失衡密切相关,而组蛋白去乙酰化酶抑制剂通过增加细胞内组蛋白的乙酰化程度,能选择性地抑制肿瘤细胞的增殖,诱导细胞分化和凋亡。羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶抑制剂是组蛋白去乙酰化酶抑制

蛋白质印迹法非特异性条带多或位置不准确的原因

①目的蛋白质被乙酰化、磷酸化、甲基化、烷基化、糖基化,应选择去修饰剂以恢复原有目的蛋白质大小;②目的蛋白质降解,制备样品时应使用蛋白酶抑制剂,并使用新鲜标本;③抗体浓度过高,应适当稀释抗体;④目的蛋白质存在二聚体或多聚体,样品应充分煮沸10min,使蛋白质彻底变性再上样。