大肠杆菌芯片在研究蛋白质去乙酰化酶YcgC的应用

上海交通大学和美国约翰霍普金斯大学的研究人员利用广州博翀生物科技有限公司生产的大肠杆菌蛋白质组芯片,发现了一种全新的蛋白质 去乙酰化酶 YcgC ,这一研究成果2015年12月30日在eLIFE杂志在线发表。 蛋白质是生命活动的体现者,在生命周期中往往会被打上不同类型的修饰。乙酰化作为一种重要且广泛存在的蛋白质翻译后修饰类型,与一系列重要疾病密切相关,影响众多关键的生物学过程。随着蛋白质组技术的进步,目前已经从低等的大肠杆菌到高等的人等众多生物的细胞中发现了成千上万的乙酰化修饰。蛋白质的乙酰化由乙酰转移酶和去乙酰化酶所调控。对应海量的蛋白质乙酰化修饰,目前已知的乙酰化酶和去乙酰化酶数目非常有限,仍有相当数目的新酶有待发现,一个关键问题是“如何实现高效乙酰化相关酶的发现?”。针对这一问题,研究者发展了一套称之为“Clip-chip”的技术,在大肠杆菌蛋白质组芯片的基础上,进行了全局性蛋白质去乙酰化酶的......阅读全文

表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化

大家好,我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢,组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程,今天呢,我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体,它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成,其中组蛋白八聚体包含 2 (H2

复旦大学雷群英教授Cell子刊癌症研究新文章

  来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员在新研究中证实,ATP-柠檬酸裂解酶(ATP-Citrate Lyase,ACLY)乙酰化促进了脂类生物合成及肿瘤生长。这一研究发现在线发表在8月8日的《分子细胞》(Molecular Cell)杂志上。   论文的通讯作者是复旦大学上海医学院的雷

华南植物园在植物叶片发育表观遗传调控研究中获进展

  组蛋白去乙酰化酶(HDAC)在染色体的结构修饰和基因表达调控中发挥着重要的作用。HDAC通过去乙酰化作用移除核心组蛋白N-末端的乙酰基,增加 DNA与组蛋白之间的引力,使松弛的核小体变得十分紧密,从而抑制基因转录的起始与表达。研究表明,HDAC在植物生长发育过程中发挥重要调控作用。 AS

乙酰化剂的特点

(1)产物转化率高,达到95%以上;(2)催化剂活性高,用量小;(3)反应条件温和,反应时间短;(4)催化剂可以重复使用数次仍保持高活性;(5)环保。

乙酰化剂的简介

  乙酰化剂又称为乙酰化试剂。将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应称为乙酰化反应,相应的试剂称为乙酰化试剂。   常用的乙酰化试剂有乙酰氯、乙酸酐和冰醋酸等,其中以冰醋酸最为价廉易得,乙酰氯反应最快。

乙酰化的特征过程

这种催化乙酰化反应的方法,其特征在于:在醇或酚与乙酸酐所进行的乙酰化反应过程中,以[MORBSA][HSO4]离子液体作催化剂,催化剂用量占反应原料总摩尔数的0.5~1.0%,反应结束后,分离催化剂,测定反应转化率;其具体步骤如下: 第1步[MORBSA][HSO4]离子液体的制备将摩尔比为1.1∶

乙酰化的作用介绍

乙酰化作用是生物体内经常进行的反应之一。例如:胆碱乙酰化形成生成乙酰胆碱,葡萄胺乙酰化生成乙酰葡萄胺。又如脂肪酸的合成,萜类化合物、胡萝卜素、类固醇的合成,都必须通过一系列的乙酰化反应。一般通过形成活性乙酰基即乙酰辅酶A而实现。

简述乙酰化的作用

  乙酰化作用是生物体内经常进行的反应之一。例如:胆碱乙酰化形成生成乙酰胆碱,葡萄胺乙酰化生成乙酰葡萄胺。又如脂肪酸的合成,萜类化合物、胡萝卜素、类固醇的合成,都必须通过一系列的乙酰化反应。一般通过形成活性乙酰基即乙酰辅酶A而实现。

乙酰化反应的方法

这种催化乙酰化反应的方法,其特征在于:在醇或酚与乙酸酐所进行的乙酰化反应过程中,以[MORBSA][HSO4]离子液体作催化剂,催化剂用量占反应原料总摩尔数的0.5~1.0%,反应结束后,分离催化剂,测定反应转化率;其具体步骤如下: 第1步[MORBSA][HSO4]离子液体的制备将摩尔比为1.1∶

乙酰化值的性状

性质:又称乙酰化值。。油脂中含羟基的脂肪酸可与乙酸酐或其他酰化剂作用生成相应的酯。乙酰化值指1g乙酰化的油脂所分解出的乙酰用氢氧化钾中和时所需的氢氧化钾mg数。

HDAC8基因编码功能及结构描述

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰酶家族的Ⅰ类。它催化组蛋白n末端末端末端末端赖氨酸残基的脱乙酰化,并抑制具有转录共抑制因子的大型多蛋白复合物中的转录。已发现该基因编码不同亚型的

HDAC8基因编码功能及结构描述

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰酶家族的Ⅰ类。它催化组蛋白n末端末端末端末端赖氨酸残基的脱乙酰化,并抑制具有转录共抑制因子的大型多蛋白复合物中的转录。已发现该基因编码不同亚型的

HDAC8基因突变与药物因子介绍

组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰酶家族的Ⅰ类。它催化组蛋白n末端末端末端末端赖氨酸残基的脱乙酰化,并抑制具有转录共抑制因子的大型多蛋白复合物中的转录。已发现该基因编码不同亚型的

南大附属鼓楼医院发文解析黄连素降糖的机制

  南京大学医学院附属鼓楼医院领导的研究团队对小檗碱的降糖机制进行了深入研究。他们发现,小檗碱通过抑制去乙酰化酶SIRT3而促进葡萄糖摄取并抑制糖异生作用。  黄连素(学名小檗碱,berberine)是一种家喻户晓的中药。它能够对抗微生物病原体,对痢疾杆菌等细菌有抑制作用,因此常被用来治疗腹泻。不过

第八届中国蛋白质组学大会圆满闭幕

  以“人类蛋白组计划:让人类更健康”为主题,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办,军事医学科学院放射与辐射医学研究所、重庆医科大学、蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心共同承办的第八届中国蛋白质组学大会于2013.9.8-10日在重庆市国际会展中心成功召开

去泛素化酶(DUB)的5大分类详解

        泛素一蛋白酶体途径(ubiquitin-proteasome pathway)是细胞内一个重要的蛋白质降解调节系统。通过对底物蛋白的多聚泛素化并经蛋白酶体降解,可以影响或调节多种细胞活动,包括:基因转录、细胞周期调节、免疫反应、细胞受体功能及肿瘤生长、炎症过程等。该途径也是一种动

揭示癌细胞代谢的新型控制靶点乙酰化作用

  癌细胞并不总是喜欢保持持续性发展,它们通常会阻断糖分向正常细胞的运输,甚至会阻断线粒体向健康细胞提供能量;近日,来自美国埃默里大学温希普癌症研究所的研究人员通过研究发现了癌细胞使用的一种重要的控制开关,其可以帮助癌细胞在氧气受限条件下调节线粒体的功能并且维持癌细胞生长。   研究者Jing

连接骨骼肌干细胞代谢与表观遗传的新纽带

  NAD+依赖性去乙酰化酶Sirt1已经被发现在许多生物学过程中都发挥重要作用,近日,来自美国NIH的Vittorio Sartorelli研究小组发现,在骨骼肌干细胞中,Sirt1能够感受代谢变化信号并通过其去乙酰化酶活性影响H4K16乙酰化修饰,启动肌肉基因表达转录。这一研究成果发表在干细胞领

以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息

以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息       进行杂合反应时所使用的探针若为放射性物质所标定者,杂合讯息可经由放射显影术 (autoradiography) 侦测出來;若为DIG所标定者,则需借助anti-DIG抗体与碱性去磷酸酶 (alkaline phosphatase,

以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息

进行杂合反应时所使用的探针若为放射性物质所标定者,杂合讯息可经由放射显影术 (autoradiography) 侦测出来;若为DIG所标定者,则需借助anti-DIG抗体与碱性去磷酸酶 (alkaline phosphatase, AP) 的conjugate,并利用碱性去磷酸酶的酵素活性转

细胞分化与肿瘤(二)

二、肿瘤的诱导分化肿瘤的诱导分化就是应用某些化学物质使不成熟的恶性细胞逆转,向正常细胞分化。这些物质称为分化诱导剂。在分化诱导剂的作用下,肿瘤细胞的形态特征、生长方式、生长速度和基因表达等表型均向正常细胞接近,甚至完全转变为正常细胞,这种现象称为诱导分化(induced differentiat

简述基因沉寂的原理介绍

  基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染

基因沉寂的基本原理

基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染色质

基因沉寂的原理

基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染色质

NKAP基因的结构特点和主要作用

该基因编码一种参与普遍存在的转录因子nf-kappab激活的蛋白质。该蛋白和组蛋白去乙酰化酶HDAC3和Notch共加压因子复合物相关,从而充当Notch靶基因的转录抑制因子它也是αβT细胞发育所必需的在x染色体上发现了一个相关的假基因,而在6号染色体上发现了一个相关的无内含子的逆转录酶,该逆转录酶

复旦大学研究揭示氨基酸感知和信号传导机制

  复旦大学赵世民、徐薇、徐彦辉团队通过近5年的持续研究发现,tRNA合成酶除了识别氨基酸和激活tRNA在蛋白质合成中扮演功能外,还具有修饰蛋白质赖氨酸的功能。相关研究成果日前在线发表于《细胞代谢》。  氨基酸除参与蛋白质合成外,众多氨基酸还参与不同的重要信号通路调控。但氨基酸如何被感知、tRNA合

CCDC84的周期性乙酰化修饰以及对中心粒数量的控制

  中心体是动物细胞主要的微管组织中心,该细胞结构由一对中心粒以及包围在其周围的中心粒外周物质组成。在细胞周期运行过程中,中心粒的复制(或组装)只在S期与DNA的复制同步进行,而且在每个已经存在的中心粒的近端只能组装一个子中心粒,但机制尚不明确【1】。中心体的数目或结构异常会影响有丝分裂纺锤体的组装

关于基因沉寂的作用介绍

  这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲

基因沉寂的作用

这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化

基因沉寂的作用

这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化