大肠杆菌芯片在研究蛋白质去乙酰化酶YcgC的应用
上海交通大学和美国约翰霍普金斯大学的研究人员利用广州博翀生物科技有限公司生产的大肠杆菌蛋白质组芯片，发现了一种全新的蛋白质 去乙酰化酶 YcgC ，这一研究成果2015年12月30日在eLIFE杂志在线发表。 蛋白质是生命活动的体现者，在生命周期中往往会被打上不同类型的修饰。乙酰化作为一种重要且广泛存在的蛋白质翻译后修饰类型，与一系列重要疾病密切相关，影响众多关键的生物学过程。随着蛋白质组技术的进步，目前已经从低等的大肠杆菌到高等的人等众多生物的细胞中发现了成千上万的乙酰化修饰。蛋白质的乙酰化由乙酰转移酶和去乙酰化酶所调控。对应海量的蛋白质乙酰化修饰，目前已知的乙酰化酶和去乙酰化酶数目非常有限，仍有相当数目的新酶有待发现，一个关键问题是“如何实现高效乙酰化相关酶的发现？”。针对这一问题，研究者发展了一套称之为“Clip-chip”的技术，在大肠杆菌蛋白质组芯片的基础上，进行了全局性蛋白质去乙酰化酶的......阅读全文
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
关于基因沉寂的作用介绍
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲基化
以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息
以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息 进行杂合反应时所使用的探针若为放射性物质所标定者，杂合讯息可经由放射显影术 (autoradiography) 侦测出來；若为DIG所标定者，则需借助anti-DIG抗体与碱性去磷酸酶 (alkaline phosphatase, AP) 的
以酶联免疫反应与碱性去磷酸酶呈色反应侦测杂合讯息
进行杂合反应时所使用的探针若为放射性物质所标定者，杂合讯息可经由放射显影术 （autoradiography） 侦测出来；若为DIG所标定者，则需借助anti-DIG抗体与碱性去磷酸酶 （alkaline phosphatase, AP） 的conjugate,并利用碱性去磷酸酶的酵素活性转
HDAC7基因编码功能及结构描述
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与小鼠hdac7基因同源，其蛋白通过转录辅压子smrt介导抑制作用。另外，已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体
HDAC7基因编码功能及结构描述
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与小鼠hdac7基因同源，其蛋白通过转录辅压子smrt介导抑制作用。另外，已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体
HDAC7基因突变与药物因子介绍
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与小鼠hdac7基因同源，其蛋白通过转录辅压子smrt介导抑制作用。另外，已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体
关于组蛋白修饰的方式—乙酰化的基本信息介绍
组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上，是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。组蛋白乙酰化呈多样性，核小体上有多个位点可提供乙酰化位点，但特定基因部位的组蛋白乙酰化和去乙酰化是以一种非随机的、位置特异的方式进行。乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋白的影响，来
乙酰化剂的特点介绍
一、乙酰化剂 常用的乙酰化试剂有乙酰氯、乙酸酐和冰醋酸等，其中以冰醋酸最为价廉易得，乙酰氯反应最快。 二乙酰胺[ArN(COCH3)2]副产物的生成 二、优点 (1)产物转化率高，达到95%以上； (2)催化剂活性高，用量小； (3)反应条件温和，反应时间短； (4)催化剂可以重复
乙酰化的特征过程介绍
这种催化乙酰化反应的方法，其特征在于：在醇或酚与乙酸酐所进行的乙酰化反应过程中，以[MORBSA][HSO4]离子液体作催化剂，催化剂用量占反应原料总摩尔数的0．5～1．0%，反应结束后，分离催化剂，测定反应转化率；其具体步骤如下： 第1步[MORBSA][HSO4]离子液体的制备将摩尔比为1．
乙酰化剂的制备方法
乙酰氯的主要工业方法是冰醋酸-三氯化磷法：由冰醋酸与三氯化磷在冷的情况下混合后加热，去氯化氢蒸馏而制得。常压下，过量三氯化磷缓慢加入冰醋酸中，加热升温，精馏得98%乙酰氯、副产物亚磷酸和盐酸。其反应机理较为复杂，副反应较多。主要反应：PCl3+ 3CH3COOH→H3PO3+ 3CH3COCl主要副
Cell：揭示SIRT3在调节线粒体健康中的关键作用
2016年11月6日/生物谷BIOON/--就蛋白而言，去乙酰化酶（sirtuin）是令人喜欢的，而且因它们与衰老和年龄相关疾病相关联而受到人们的广泛关注。作为去乙酰化酶的来源，线粒体，也因在健康和疾病中的作用而闻名于世。 来自美国哈佛医学院的Marcia Haigis和她的团队从事基础研究，
何谓化学修饰调节
凡通过化学基因的引入或除去，而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰（chemical modification）调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的，是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
化学性调节具有哪些特点
凡通过化学基因的引入或除去，而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰（chemical modification）调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的，是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
韩国揭示效应蛋白通过乙酰化RIN4激活植物免疫的新机制
病原菌效应蛋白和植物的互作机理长期是植物领域的研究热点和前沿。这些效应蛋白通常具有某种活性，例如蛋白酶活性、蛋白激酶活性、E3泛素连接酶活性和转录因子活性等。它们通过这些功能来抑制植物的免疫反应或者使植物感病。然而，病原细菌含有数量众多且功能多样的效应蛋白，它们如何激活植物免疫的机制仍有待研究。
Cell子刊：报道poly(A)化修饰对能量稳态调控的关键作用
任职于上交大医学院附属一院临床转化研究院的单佩佩、范广建和孙莲慧三位博士为论文第一作者，王传贵教授和张胜萍副研究员是这篇论文的通讯作者。 该论文不仅首次论证了poly(A)化可作为一个标签，实现真核细胞蛋白质合成的整体把控，而且首次把RNA转运引入到能量代谢稳态调控领域，为能量代谢紊乱相关疾病
天津工生所等开发出基于蛋白质乙酰化位点的生物信息工具
乙酰化(Acetylation)又称乙酰基化或乙酰化作用，是指将一个乙酰官能基团加入到一个有机化合物中的化学反应。在生命体中，蛋白质乙酰化作为一种非常重要的蛋白质翻译后修饰存在，它调控着细胞凋亡、DNA-蛋白质相互作用、DNA复制和修复、DNA转录活性及蛋白质稳定性等多种重要的生命过程。 中国
如何进行蛋白质的泛素化和去泛素化鉴别
主要有四步： 1.泛素的活化：泛素甘氨酸端的羧基连接到泛素活化酶E1的巯基，这个步骤需要以ATP作为能量，最终形成一个泛素和泛素活化酶E1之间的硫酯键。 2.E1将活化后的泛素通过交酯化过程交给泛素结合酶E2。 3.泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到目标蛋白质上并释放E2，形成特定的泛素化的蛋白质
如何进行蛋白质的泛素化和去泛素化鉴别
主要有四步： 1.泛素的活化：泛素甘氨酸端的羧基连接到泛素活化酶E1的巯基，这个步骤需要以ATP作为能量，最终形成一个泛素和泛素活化酶E1之间的硫酯键。 2.E1将活化后的泛素通过交酯化过程交给泛素结合酶E2。 3.泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到目标蛋白质上并释放E2，形成特定的泛素化的蛋白质
基因沉寂的定义和原理
定义RNAi与转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing and transgene silencing)在分子层次上被证实是同一种现象。原理基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现，包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰（由甲基转移酶
HDAC9基因突变与药物因子介绍
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与非洲爪蟾和小鼠二尖瓣基因同源。mitr蛋白缺乏组蛋白脱乙酰酶催化结构域。它通过招募包括ctbp和hdac的多组分
HDAC9基因编码功能及结构描述
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与非洲爪蟾和小鼠二尖瓣基因同源。mitr蛋白缺乏组蛋白脱乙酰酶催化结构域。它通过招募包括ctbp和hdac的多组分
HDAC9基因编码功能及结构描述
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与非洲爪蟾和小鼠二尖瓣基因同源。mitr蛋白缺乏组蛋白脱乙酰酶催化结构域。它通过招募包括ctbp和hdac的多组分
蛋白质分解酶的相关介绍
胃蛋白酶，除存在于高等动物的胃液中外，在无脊椎动物中也具有同样性质的蛋白酶。但其性状许多还不明了。胰蛋白酶，存在于高等动物的胰液中。在低等动物（甲壳类、复足类等）的胃液中，也以活性状态存在。但是否与高等动物的相同还不清楚。糜蛋白酶，含于高等动物的胰液中，氨肽酶存在于高等动物的肠液中，除作用于蛋白
消化酶是蛋白质吗
可以说人体中绝大部门的酶都是蛋白质，只有很少一部分不是，在高中的第三本书中会提到这些！一般消化酶的作用是水解，有的消化酶由消化腺分泌，有的参与细胞内消化。细胞外消化酶中，有以胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、羧肽酶原等一些不活化酶原的形式分泌然后再被活化的。消化酶的特点总结消化酶是人体消化器官分泌的消化液中所
研究发现激活Sirt3和调控线粒体代谢的关键信号通路
Sirt3是线粒体中的一个重要的去乙酰化修饰酶，能够调控线粒体中许多代谢酶的活性，进而调控细胞线粒体的代谢。经过多年的研究，发现Sirt3的活化与抗衰老、抗肿瘤和提高免疫力等密切相关，因此， Sirt3一直是世界上许多实验室和制药公司研究的重要药物靶标。但至今为止，尚未找到激活Sirt3的有效途
蛋白磷酸酯酶的去磷酸化过程
蛋白磷酸酯酶(PP)-2A和PP-2B可使AD神经原纤维缠结中的II型双螺旋丝（PHFII-tau）在Ser-199/Ser-202去磷酸化，Ser-396/Ser-404部分去磷酸化;此外，PP-2A和PP-2B可分别使PHFII-tau的Ser-46和Ser-235去磷酸化;去磷酸化后PHFII
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应，等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外，甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
组蛋白HDAC6的结构特点及生理功能
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白属于组蛋白去乙酰化酶/acuc/apha家族的Ⅱ类。它包含两个催化结构域的内部复制，这两个催化结构域看起来相互独立。该蛋白具有组蛋白脱乙酰酶活性并抑制转录。