高通量的转录因子活性检测

转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不同的表型,这正是转录因子让人着迷的地方。 过去,对于转录因子的活性检测,人们常常采用电泳迁移率改变分析(EMSA)。这是一种经典技术,过去通常采用32P放射性同位素标记的DNA显现实验结果,需要数天。当然,现在也采用化学发光检测来取代同位素。不过,EMSA 操作相当繁琐,整个过程包括了核蛋白的抽提、定量,探针的标记与纯化,探针与蛋白质的结合,电泳与显影等若干步,且每次只能检测一个转录因子。 然而,一种特定的细胞信号通道通常可同时激活多种转录因子,一个特定基因的表达在多种转录因子的控制之下,因此同时检测多种转录因子的活性......阅读全文

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

高通量的转录因子活性检测

  转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不

信使RNA的启动子和转录因子

  一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。  二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。  三真核

基因表达的转录机制介绍

  转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的

启动子—基因表达的发动机

  众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。

启动子—基因表达的发动机

众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。     

基因表达转录调控的主要途径

基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

基因表达的转录调控的介绍

  可分为三种主要途径:  1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);  2)调控转录因子与转录机制相互作用;  3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合

Cell-reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能

  近日,来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展,他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ,也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性,促进肿瘤进展。  YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下

FoxD3调控结果由基因环境可以决定

Nanog主要在胚泡的内细胞团(inner cell mass, ICM)中表达。相关研究表明,Nanog基因表达与细胞的分裂、分化情况以及细胞的干细胞特性密切相关。在分裂旺盛的细胞中,Nanog基因高表达,而随着细胞分化程度的加深Nanog基因的表达量逐渐降低,直至在完全分化的细胞中不表达

微孔板振荡器

  微孔板振荡器采用直流无刷电机驱动振荡,主要应用于酶标板(96孔/384孔板)、细胞培养板(24孔板、48孔板、96孔板等)等溶液的混匀振荡。可应用于免疫测定和染色等实验,可在室温低的环境或培养箱中使用,产品外观紧凑,操作简洁方便,安全稳定无噪音。   微孔板振荡器广泛应用于各种电泳凝胶的固定,

基因转录因子的相关介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

基因表达的转录后调控的介绍

  真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。  携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在

T细胞基因的转录激活及其表达

  TCR/CD3复合物与配体结合后,经多种信号转导途径传递信号,最终导致T细胞活化和增殖。信号转导中所涉及的基因根据其活化时间可以分为早早期、早期、晚期基因三种类型(表8-5)。早早期基因的转录不需蛋白的合成,而早期及晚期基因的转录则需蛋白的合成。早早期及早期基因转录在有丝分裂期之前,而晚期基因转

Science:端粒酶的调控

  对于所有多次分裂的细胞来说,维持染色体两端端粒(telomere)的长度是至关重要的。一种称作端粒酶(telomerase)的酶可使两端得以延长,以抵消每次染色体拷贝所发生染色体缩短。端粒酶是细胞生存的必要条件,端粒酶功能丧失可导致干细胞自我更新障碍,从而引起诸如先天性角化不良、再生障碍性贫血和

广州生物院揭示人多能干细胞神经分化的分子调控机制

  中国科学院广州生物医药与健康研究院潘光锦研究组在对神经细胞命运决定的分子调控机制的研究中,发现在人多能干细胞中miRNA簇miR -379-656的一个成员——miR-376c可以促进神经干细胞分化进程,而抑制miR-376c则有相反作用。相关研究成果于8月11日在线发表在The FASEB J

研究发现影响血液干细胞中特殊基因表达的关键元件

  基因转录通常会被启动子和调节元件(比如增强子和沉默子)之间的染色质环来进行调节,不同的转录因子(TFs,transcription factors)能够与这些调节元件结合,并以一种细胞类型特异性的方式来调节启动子-增强子环。尽管其在控制基因表达方面发挥着重要作用,但转录因子如何促进启动子-增强子

最新研究发现植物干细胞命运决定新机制

  固着生长的高等植物能够不断调整器官发生和发育进程,从而适应复杂多变的环境条件。与动物相比,植物的生长发育表现超强的可塑性,这主要取决于其干细胞组织结构。以模式植物拟南芥根尖分生组织为例,干细胞组织中心(静止中心,Quiescent center,QC)与其周围干细胞共同构成根尖干细胞微环境,为根

双向启动子的转录机制

双向启动子的双向转录机制可能是两个RNA聚合酶同时聚集在无核小体区的边界,然后在两个方向上起始转录.双向启动子在真核生物基因组中广泛分布 ,大多数的双向启动子缺少TATA盒,而具有较高的GC含量和丰富的CpG岛。

细胞成像微孔板检测系统

  细胞成像微孔板检测系统是一种用于生物学、农学、畜牧、兽医科学、基础医学领域的分析仪器,于2016年10月27日启用。  技术指标  孵育温度范围:室温以上5℃-65℃;CO2和O2控制范围:0-20%(CO2);1-19%(O2)控制分辨率:+0.1%(CO2和O2)稳定性:+0.2%at5%C

多功能微孔板读数仪

  多功能微孔板读数仪是一种用于农学、食品科学技术领域的分析仪器,于2018年6月1日启用。  技术指标  1 光吸收、荧光、发光三种模式均采用独立的光源、光路及检测器; 2 分光系统:四光栅光路及滤光片光路,激发和发射分别为双光栅; 3 适用板型:1-384孔板、微量检测板、Cellchip、比色

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激...(一)

CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞重编程题目:CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus EnablesReprogramming to Pluripotency期刊:C

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

北京大学发现调控植物分枝形成基因

  植物分枝的多少,是植物在形态上适应环境的一种非常重要的方式,还可以影响粮食产量。那么植物的分枝是如何形成的呢?分枝形成的过程又是如何调控的呢?北京大学秦跟基课题组发现了一个重要的调控植物分枝的基因。相关成果日前发布于《植物细胞》。   一些名为“腋芽分生组织调控因子”(RAX)的MYB类转录因子

荧光素酶报告基因的技术流程

启动子的预测转录因子的预测报告基因质粒的构建实验方法及结果分析 用生物信息学方法分析并预测启动子区可能的转录因子结合位点。设计引物用PCR法从基因组DNA中克隆所需的靶启动子片段,将此片段插入到荧光素酶报告基因质粒(pGL3-basic)中。筛选阳性克隆,测序。扩增克隆并提纯质粒备用。扩增转录因子质

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启动子的预测转录因子的预测报告基因质粒的构建实验方法及结果分析 用生物信息学方法分析并预测启动子区可能的转录因子结合位点。设计引物用PCR法从基因组DNA中克隆所需的靶启动子片段,将此片段插入到荧光素酶报告基因质粒(pGL3-basic)中。筛选阳性克隆,测序。扩增克隆并提纯质粒备用。扩增转录因子质

长链非编码RNA:-从科研到临床(一)

概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结

如何证明基因需要转录调控元件调控表达

如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3)

tDEG(转录组差异表达基因深度分析)

 本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化;对两个以上生物学样本之间的差异表达基因进行可信分析;对差异表达所揭示出的重要科学问题进行中肯分析;让您快速“发现”所关注生物学问题,医学问题和农业问题

胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现

  在胚胎干细胞的自我更新中,转录因子Nanog 具有关键性的作用,这一因子也一直是近年来研究的热点。最近,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的科学家们发现,NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂,分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分,或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯