PCR污染的处理(三)

(二)反应液污染 可采用下列方法之一处理:1. DNase I法:PCR混合液(未加模板和Taq聚合酶)加入0.5U DNase I,室温反应30 min后加热灭活,然后加入模板和Taq聚合酶进行正常PCR扩增。该方法的优点是不需要知道污染DNA的序列;2. 内切酶法:选择识别4个碱基的内切酶(如Msp I和Taq I等),可同时选择几种,以克服用一种酶只能识别特定序列的缺陷,室温作用1h 后加热灭活进行PCR;3. 紫外照射法:未加模板和Taq聚合酶的PCR混合液进行紫外照射,注意事项与方法同上述UV照射法;4. g射线辐射法:1.5kGy的辐射可完全破坏0.1ng基因组DNA,2.0 kGy可破坏104拷贝的质粒分子,4.0 kGy仍不影响PCR,但高于此限度会使PCR扩增效率下降。引物......阅读全文

PCR实验技术(三)

【注意事项】1. PCR引物设计:引物设计可能是PCR扩增成功最关键的因素。如引物设计欠佳,可能导致扩增产物不足,甚至扩增失败,其原因是设计欠佳的引物可导致非特异扩增和/或形成引物二聚体,此又成为PCR反应的竞争性产物,从而进一步抑制PCR产物形成。在引物设计时必须考虑以下几个因素,其中最重要的是引

PCR-Primer-Design(三)

  References   Albert, J., and Fenyo, E.M. 1990. Simple, sensitive and specific detection of human immunodeficiency virus type 1 in clinical speci

数字PCR应用(三)

Fluidigm公司于2006年底推出了基于集成流体通路(IFC)芯片的Bio-Mark™ 高通量基因剖析系统。 其创新在于集成液体通路技术:应用集成电路制造工艺(光刻)在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体,经过不同的控制阀门控制溶液在其中的活动来完成生物样品的分液、混合、PCR扩增。图8. Bi

PCR反应污染源的排查

PCR反应污染源的排查如果PCR反应不慎发生污染,应逐一分析排查污染源。一、设立对照组:每次扩增均应设立PCR体系中各试剂的随机对照组,即除模板DNA外应包含PCR反应所需的全部组分。若扩增结果中对照组为阳性,则表明有一种或数种试剂被污染。排查方法:将PCR反应所需各组分试剂分别置于不同的扩增反应管

PCR实验室的污染来源

1、样本间交叉污染:收集样本的容器被污染或样本密封不严外溢;不同样本移液时忘记更换枪尖或未使用带滤芯枪尖;移液器等实验器具及耗材未及时消毒灭菌;不同样本同时开盖或样本剧烈震荡、反复吹吸导致气溶胶形成扩散,相互交叉污染。2、实验试剂污染:主要是在 PCR 组分试剂加样过程中,由于移液器、容器、阴性对照

PCR实验室污染的原因

污染原因:1)标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。2) PCR试剂的污染:主要是

细胞支原体污染的PCR检测

支原体菌株来源:M.Arginini ATCC23838 精氨酸支原体M.FermentaneATCC19989 发酵支原体M.SalivariumATCC23064唾液支原体M.HominisATCC23114人型支原体M.OraleATCC23714口腔支原体M.HyorhinisATCC290

细胞支原体污染的PCR检测

支原体菌株来源:       M.Arginini ATCC23838 精氨酸支原体       M.FermentaneATCC19989发酵支原体       M.SalivariumATCC23064唾液支原体       M.HominisATCC23114人型支原体       M.Ora

『PCR实验污染』的解决办法!

PCR污染是每个实验室都多多少少会遇到的问题。原因在于,PCR是非常灵敏的一项检测,100个拷贝之内的靶序列就足以产生阳性扩增,从而容易出现DNA污染导致的假阳性。那么,怎样远离PCR的污染呢?   图 PCR污染之一瞥   首先,要辨别PCR污染的来源。设立阴阳性对照,有利于检测反应体系各成分的污

表面污染样品的处理

对于表面有油等有机物污染的样品,在进入真空系统前,必须用油溶性溶剂,如环己烷,丙酮等清洗样品表面的油污,最后再用乙醇洗去有机溶剂。为了保证样品表面不被氧化,一般采用自然干燥。有些样品可以进行表面打磨等处理。

核酸污染处理的难点

1.移液器移液器内部被污染很难去除,可以通过清洗或者另换一套移液器。2.生物安全柜移除内部所有物品,用DNA去除剂擦拭表面后,打开柜门连续运行。3.核酸提取仪内部用DNA去除剂擦拭内表面后,打开提取仪门或外罩,静置。如果能及时发现污染,通常情况不会太严重,采取上述措施实验室空置几天污染会消除。但是如

船舶污染的处理装置

对船舶生活污水来说,主要的处理方法有在船上直接安装生活污水处理装置、安装生活污水收集装置,第一种是达标处理后,直接排入江河,第二种是收集到岸上处理。目前,国际上船舶生活污水处理装置主要有英国HAMWORTHY公司、WelBen公司、美国Red—Pox公司、日本SASAKURA公司等的生化法处理装置。

污染的色谱柱处理

柱头处理:对于柱头堵塞污染严重的情况而且用溶剂冲洗无效的色谱柱,只有打开柱子去除柱顶的填料重装:先拆下不锈钢烧结过滤器,检查柱床,常见凹陷或受污染的带色填料,剔去不规则床层和带色填料,使柱床显白色并完全水平,再用甲醇作糊状填料匀浆液,将糊状填料匀浆液滴在柱上靠重力从匀浆液中排出甲醇液,重复直到填料水

PCR扩增仪的选择三

梯度PCR对于一个PCR反应,虽然有各种各样的PCR引物设计软件或者经验公式计算zui适的退火温度,可是由于模版中碱基的组合千变万化,对于特殊片断,经验公式得到的数据不一定能"P"出来结果,细微的变化对结果都可能产生决定性的影响,因而“摸条件”一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问

PCR实验如实预防实验污染

进行PCR操作时,操作人员应该严格遵守一些操作规程,最大程度地降低可能出现的PCR污染或杜绝污染的出现。划分操作区:目前,普通PCR尚不能做到单人单管,实现完全闭管操作,但无论是否能够达到单人单管,均要求实验操作在三个不同的区域内进行,PCR的前处理和后处理要在不同的隔离区内进行:(1)标本处理区,

PCR实验如实预防实验污染

进行PCR操作时,操作人员应该严格遵守一些操作规程,zui大程度地降低可能出现的PCR污染或杜绝污染的出现。1.划分操作区:目前,普通PCR尚不能做到单人单管,实现完全闭管操作,但无论是否能够达到单人单管,均要求实验操作在三个不同的区域内进行,PCR的前处理和后处理要在不同的隔离区内进行:(1)标本

PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(三)

2.2 PCR-SSCP并测序分析发现X连锁遗传性铁幼粒细胞贫血家系ALAS2基因第5外显子基因异常 分析两兄弟及其父母、外祖父母的ALAS2基因,两兄弟ALAS2基因第5外显子的PCR扩增产物有与正常脐血不同的单链电泳条带,他们的父亲和外祖父有与正常脐血相同的单链电泳条带,而他们的母亲和外祖母同时

潜在的-PCR-污染源有哪些?

主要包括3个方面:①仪器设备的污染,样品收集器、微量加样器、点杂交器、离心管、离心机、切片机、pH计、水浴锅、高压锅及 PCR 仪等的污染;②试剂污染,乙醇、液氮、氯仿、酶及其他生物制品(如明胶等)的污染;③操作者的污染,操作者的皮肤、头发等均可引起 PCR 污染。

导致PCR假阳性的污染源

 PCR反应的特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。一、标本交叉污染源:收集标本的容器:标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;吸样枪:标本核酸模板在提取过程中,由于污染导致标本间污染;气溶胶:zui可能

简述PCR技术测试污染原因的内容

  一、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。  二、PCR试剂的污染:主要是由于

解决PCR实验室污染的方法

(1)开窗通风:如在短时间内要消除实验室污染,开窗通风促进实验室内空气流通,使停留在室内的核酸排放到室外。    (2)紫外灯照射:将实验室内好生物安全柜内物品平铺,打开离心机内盖,然后将紫外等打开照射12-24小时,通风12小时以上。    (3)消毒液降解核酸:及时用1%-2%的次氯酸钠擦拭操作

PCR注意事项(三)

⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量: 每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。酶及其浓度 目前有两种Taq DNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生

核酸污染的处理措施介绍

   发现污染第一步就是要暂停实验,评估假阳性对以往检测结果的影响。对实验进行彻底打扫和清理,尽可能更换相关的试剂耗材,对仪器设备进行清洁和去核酸处理。所有人员回家洗澡换衣服。    1.化学处理法    使用商品化的DNA去除剂,有好用的DNA去除剂大家可以推荐给我    1 mol/l的 盐酸和

PCR应用中的问题与处理方法

开展 PCR 应具有一定的条件。需要一个正规的 pCR 实验室,采集标本、核酸提取、扩增及产物分析应在不同的房间进行;需有严密的防污染措施、假阳性和假阴性结果的质控等。实验者应具有一定的分子生物学理论知识及实验技能,能够及时发现和纠正实验中的问题。目前,我国在PCR 应用中尤其是在临床诊断中

利用PCR技术对污染的监测的内容

  一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。  对照试验  一、阳性对照:在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照,它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。阳性对照要选择扩增度中

已污染的色谱柱的处理

已污染的色谱柱的处理:因保留强的物质污染,流动相或样品中不溶物沉积于柱头,可用下列方法洗涤:去除脂类可用四氢呋喃、乙腈或甲醇洗涤;去除蛋白质可用乙腈、丙醇和1%三氯乙酸进行梯度洗脱;一些高疏水性化合物可用乙腈或甲醇洗脱,同时反复注入100-200ml的四氢呋喃。

怎么防止PCR实验室污染

PCR实验室污染标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。PCR试剂的污染:主要是由于

PCR实验室如何避免污染?

PCR实验室污染    标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。     P

PCR污染问题怎么监测和预防

这两天正好看到一个“2012年全国公安司法及血液中心标准DNA实验室装备展览会”的宣传文章说这个问题,复制来给你看看吧。PCR室污染监测及防御2012年全国司法及血液中心国际标准DNA实验室观摩会将在明年6月于青岛国际会展中心举行,这次观摩会秉着打造全球顶尖展会的理念,将展示具有世界一流水平,符合国

PCR基因扩增中污染来源及污染防治措施介绍

1、测定分析前的污染源测定分析前实验材料的污染主要来自非病人标本来源的核酸。2、测定分析阶段的污染源通常,测定分析阶段的每一步都可能发生对样本的污染。反应混合液的任何成分及核酸的制备和反应建立阶段所涉及到的实验设备的任何部位都是可能的污染源。如受污染的试剂(例如牛血清白蛋白,明胶或矿物油)、商品酶制