特征选择在生物信息学中的应用

随着生物信息学的发展,许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求,因此特征选择技术(FS techniques)在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里,应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点:(1)避免过度适应和提高模型的性能;(2)提供更快的和更有效的模型;(3)对生成数据的潜在的过程获得更深入的了解。当然,特征选择技术在搜索相关特征的子集时也会为建立模型引入额外的复杂度。下面将简要介绍特征选择技术在生物信息学中的应用。1、序列分析中的特征选择 序列分析是生物信息学中常见的工作,对邻近序列的特征选择可以分为两类:内容分析(content analysis)和信号分析(signal analysis)。内容分析着眼于序列主要的特征,例如序列编码蛋白的倾向性或者实现的某种生物学的功能。而信号分析则着眼于序列中重要基序的识别......阅读全文

特征选择在生物信息学中的应用

随着生物信息学的发展,许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求,因此特征选择技术(FS techniques)在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里,应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点:(1)避免过

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

   随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,

生物信息学在人类基因组计划中的应用

生物信息学是当前生物学领域的研究热点,预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加,近期生物信息学将在以下几方面迅速发展:大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前

背景场特征在电磁波模拟中的应用

COMSOL Multiphysics 5.0 版本新增了一个背景场特征,可以帮助用户模拟线偏振平面波。这里,我们将使用案例集锦中一个依赖极化的散射示例来探讨这一特征的用法。“看穿”墙体假设一个对象不在您的视线内,比如藏在墙后,但您需要确定它的取向。这也是救援人员特别关注的一个领域。进入建筑后,工作

共轭酸碱对在缓冲对选择中的应用

  实际工作中需要制备某一pH值的缓冲溶液时,可按下列步骤进行:  按照电离理论,选择一种缓冲对,使其中弱酸(或弱碱)的pKa(或pKb)与所需要的pH(或pOH)相等或相近,如pKa或(pKb)与所需要的pH(或pOH)值不完全相等时,则按所要求的pH(或pOH)值,利用缓冲方程式,计算出所需的弱

共轭酸碱对在缓冲对选择中的应用

实际工作中需要制备某一pH值的缓冲溶液时,可按下列步骤进行:按照电离理论,选择一种缓冲对,使其中弱酸(或弱碱)的pKa(或pKb)与所需要的pH(或pOH)相等或相近,如pKa或(pKb)与所需要的pH(或pOH)值不完全相等时,则按所要求的pH(或pOH)值,利用缓冲方程式,计算出所需的弱酸(或弱

特征离子定性及定量方法在农药残留分析中的应用

天津科技大学  采用特征离子对蔬菜、水果中残留农药进行了定性及定量分析方法的研究。结果表明,采用保留时间与特征离子双重定性,特征离子定量比单纯的色谱保留时间定性、峰面积定量有更高的准确度与精确性。 特征离子定性及定量方法在农药残留分析中的应用

化学组成和理化特征在乳品检验分析中的应用

第一条 为了加强乳品质量安全监督管理,保证乳品质量安全,保障公众身体健康和生命安全,促进奶业健康发展,制定本条例。第二条 本条例所称乳品,是指生鲜乳和乳制品。乳品质量安全监督管理适用本条例;法律对乳品质量安全监督管理另有规定的,从其规定。第三条 奶畜养殖者、生鲜乳收购者、乳制品生产企业和销售者对其生

力传感器在汽车测试中的选择与应用分析

随着电子技术的发展,汽车电子化程度不断提高,传统的机械系统已经难以解决某些与汽车功能要求有关的问题,因而将逐步被电子控制系统代替。传感器作为汽车电控系统的关键部件,其优劣直接影响到系统的性能。目前,普通汽车上大约装有几十到近百只传感器。其中,力传感器对于整个汽车设计和制造过程都是至关重要的;

T细胞在胸腺中的选择

成熟的、有功能的T细胞必须经过在胸腺中阳性选择和阴性选择。主要组织兼容性复合体(MHC)抗原在这两种选择中起着关键的作用。1.假如一个双阳性细胞表面能与胸腺皮质上皮细胞表面MHCI类或Ⅱ类分子发生有效结合,就可能被选择而继续发育,否则会发生程序性的细胞死亡(apoptosis)。MHCI类分子选择C

露点仪在压缩空气应用中应该如何选择?

1、选择何种测量方式-你需要的是固定式仪表还是便携式仪表?固定在线式露点仪:此类仪表通常需要配置外接电源才能工作,从仅具备基本模拟输出功能到具有显示、报警继电器、数据记录、以太网连接等丰富功能,各种型号不一而足。便携手持式设备:此类设备为电池供电的移动式设备,尺寸和功能各有不同,并针对不同应用进行了

露点仪在压缩空气应用中应该如何选择?

1、选择何种测量方式-你需要的是固定式仪表还是便携式仪表?固定在线式露点仪:  此类仪表通常需要配置外接电源才能工作,从仅具备基本模拟输出功能到具有显示、报警继电器、数据记录、以太网连接等丰富功能,各种型号不一而足。便携手持式设备:  此类设备为电池供电的移动式设备,尺寸和功能各有不同,并针对不同应

生物信息学中的HSP的含义

热休克蛋白(英文:heat shock protein )又称应激蛋白,是机体细胞在一些理化因素刺激后高效表达的一组蛋白质,因最先发现于果蝇唾液腺的热应激反应中而得名,此后的研究表明,热休克蛋白广泛存在于人、动物、微生物和植物的细胞中,是一类在遗传上高度保守的分子,能保护细胞并促进细胞对各种刺激所造

荧光标记基团的选择及其在荧光定量PCR中的应用

PCR实验室产品选择指南 荧光  基团是吸收一定波长的光子后发射特定波长的光波,可以作为抗体等分子的标记物,实时荧光定量PCR中的Taqman探针常用荧光基团FAM标记荧光基团和TAMRA标记。 荧光基团 吸收特定波长的光子后荧光染料(通常称为“荧光基团”或简称为“荧光素”)的化

果汁中应用酶制剂的选择

1.存在问题  果汁生产中,果汁的澄清处理是关键工序。制造果汁的果实中含有一定量的果 胶质、纤维质和淀粉,这些物质使汁液黏稠、混浊,失之清亮,各种杂质以其为依托,难以在短时间内沉淀去除。  (1)皂土加冷冻的方法或自然澄清法澄清果汁,存在的问题:  ①澄清效果不佳,经澄清的果汁未达到要求的清亮程度;

正交试验法在微生物培养条件优化选择中的应用

一、目的要求 对于一个生物作用过程,其结果或产物的得到受到多种因素的影响。如发酵中,菌种的生物活性、酶的浓度、底物浓度、温度、pH 值、菌种生长环境中的氧气、二氧化碳浓度、各种营养成分的比例等。对于这种多因素的实验,如何合理地设计实验,提高效率,以达到所预期的目的是需要进行认真考虑和周

选择性根管再治疗在磨牙中的应用病例报告

根管治疗术是目前治疗牙髓病根尖周病最有效的方法,取得了满意的临床效果,由于根管系统复杂性、器械操作局限性及一些医源性因素,初次根管治疗术后总成功率为68%~85%,根管治疗仍有失败的可能。对于失败病例,非手术性根管再治疗术是首选治疗方法,在磨牙根管治疗后疾病中,通过CBCT对病灶精准定位以及根管显微

臭氧发生器在仓储保鲜行业中的选择和应用原则

  一般在仓储保鲜行业,消毒保鲜空间较大,应选择较大型的强制扩散型"开式"臭氧发生器,安装在库房上方以便臭氧的扩散。仓储保鲜消毒浓度要求较高,臭氧消耗量大,一般1000立方米空间可按10~15克/小时规格选择。臭氧对仓库内微生物的杀灭效果,取决于臭氧的浓度,微生物种类,处理时间,库房温湿度,墙、顶棚

正交试验法在微生物培养条件优化选择中的应用

一.目的要求对于一个生物作用过程,其结果或产物的得到受到多种因素的影响。如发酵中,菌种的生物活性、酶的浓度、底物浓度、温度、pH 值、菌种生长环境中的氧气、二氧化碳浓度、各种营养成分的比例等。对于这种多因素的实验,如何合理地设计实验,提高效率,以达到所预期的目的是需要进行认真考虑和周密准备的。本

质构仪在糖果硬度分析中的应用以及探头的选择

橡皮糖、棉花糖、凝胶糖果等因其可爱的外形、Q 弹适度的口感深受人们的喜爱,那么这就涉及到胶弹性达到多少才适合人们咀嚼呢?货架期间的硬度的变化如何?延展性、挤压破裂情况等等都是需要生产商在产品 开发、生产、销售等方面注意的。 典型案例:橡皮糖的硬度分析实验(烘干时间与硬度的关系) 橡皮糖在烘干过程中硬

选择性微电极在植物生理学研究中的应用(二)

1.1  依据Fick定律推导离子移动速率  离子选择性微电极在待测离子浓度梯度中对已知的两点的距离(dx)进行测定,分别获得电压V1和V2(图2)。两点间的浓度差(dc)从V1、V2及已知的该电极的电压/浓度校正曲线计算就可以获得。D是离子或分子特异的扩散系数(单位:cm-2s-1),将它们代入F

选择性微电极在植物生理学研究中的应用(三)

3        在植物生长发育研究中的应用光通过光周期和非光周期过程影响着叶片的展开。选择性微电极能探测到光诱导引起的与叶片生长有关的离子或分子信息。Zivanovic等(2005)利用选择性微电极比较了白光(2600 μmol·m-2·s-1)下及结合使用DCMU后的玉米叶片不同区域(叶基部和叶

选择性微电极在植物生理学研究中的应用(五)

7  展望选择性微电极技术能用于直接并灵敏地观察植物体对矿质元素的需求,研究者可利用选择性微电极技术进行对植物某种离子或高或低的吸收的品种的筛选,还可制定出与植物需求相适应的环境的营养水平;能及时准确地探测到的光、温、水涝、盐分引起的植物体离子或分子信息的微小变化,能成为预测植物受到逆境胁迫最直观、

选择性微电极在植物生理学研究中的应用(一)

朱俊英1,高荣孚1,许越2,3*1北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083;2旭月(北京)科技有限公司,北京100080;3Vibrating Probe Facility,Biology Department,University of Massachusetts at Amherst,M

气相色谱仪速率理论方程在分离条件选择中的应用

气相色谱仪速率理论方程为:H = A + B/u + Cu式中:A = 2λdpB = 2rDgC = Cm + Cs = 0.01k2/[(1+k)2]×dp2/Dm + q×[k/(1+k)2]×df2/Ds气相色谱仪色谱柱的填充均匀度、载体粒度、载气种类及流速、固定液液膜厚度和柱温等因素对柱效

选择性微电极在植物生理学研究中的应用(四)

5   在植物逆境生理研究中的应用随着选择性微电极技术的日益成熟,近年来,许多学者开始用选择性微电极探讨植物适应逆境的离子或分子流的瞬间变化(我们称之为原初响应机制)。Shabala(2000)考察了蚕豆叶片叶肉细胞在盐胁迫和渗透胁迫下离子流的响应机制,观察到90mM NaCl会导致K+出现明显的外

AFM在化学中的应用

       许多化学反应是在电极表面进行的,了解这些反应过程,研究反应的动力学问题是化学家们长期研究的题目。吸附物质将于表面形成吸附层,吸附层的原子分子结构,分子间相互作用是研究表面化学反应的前提与基础。在超高真空环境下,科学家们使用蒸发或升华的方法将气态分子或原子吸附在基底(一般为金属或半导体)

均质机在豆奶中的应用

  均质时豆乳在高压下从均质阀的狭缝压出。脂肪球,蛋白质等颗粒在剪切力,冲击力与空穴效应的共同作用下,进行微细化。形成均一的分散液。防止脂肪上浮,蛋白质沉淀,增加豆乳光泽度,提高了豆乳的稳定性。豆乳的均质效果受均质压力。均质温度和均质次数三个因素影响。均质压力受到设备的限制。豆乳生产中可用20~30

TGA在锂电中的应用

TGA在锂电中的应用隔膜的热重曲线(图片来源:郭鑫,锂离子电池PVDF-HFP基凝胶聚合物电解质的制备及性能研究)如上图所示,为几种不同隔膜的热重曲线。可以观察到隔膜在420℃之前质量变化比较稳定,在420℃之后,继续升高温度,隔膜开始分解。550℃时,隔膜基本完全分解。锂离子电池的正常工作温度在8