体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Northern 和 Southern 杂交,但当分析哺乳动物基因的转录时,放射性标记的 RNA 目前是首选探针。由于 RNA 酶 A 既耐用又容易控制,可用 RNA 酶 A 来消化 RNA-RNA 杂合体,而不必用特异性 S1 核酸酶来消化 DNA-RNA 杂合分子,RNA 酶 A 可在较宽的浓度范围内使用而不影响实验结果(Zirmetal. 1983; Mehonetal. 1984)。实验材料 限制性内切核酸酶RNA 聚合酶胰腺 DNA 酶Ⅰ模板 DNA试剂、试剂盒 乙酸铵牛血清白蛋白DTT乙醇酚氯仿胎盘......阅读全文
RNA逆转录(RT)过程
一,准备工作 1, 实验器具与材料: (1)移液枪:200ul、10ul (2)吸头:200ul、20ul (3)EP 管 1.5ml、100ul (4)水浴箱 2,实验器具的处理与准备 逆转录(RT) 塑料制品:(包括吸头、EP 管等) 将塑料制品逐个浸泡于 1‰DEPC
常见RNA探针的技术特点
cRNA探针:是以cDNA为模板,通过体外转录而获得的。因为它是一种单链探针,因此也避免了应用双链cDNA探针做杂交反应时存在的两条之间的复性问题。cRNA与RNA之间形成的杂交体要比cDNA-RNA杂交体稳定。cRNA-RNA之间形成的杂交体不受RNA酶的影响。因此杂交反应后可用RNA酶处理,以除
研究发展RNA“缓冲荧光探针”
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研究发展RNA“缓冲荧光探针”
近日,中国科学院大连化学物理研究所副研究员乔庆龙和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合,在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN,实现了对核仁动态轮廓的成像,并通过活细胞内药物诱导下核仁特定形态的可视化,为核仁应激试剂的筛选提供可视化的工具。相关成果发表在《先进科学》。
RNA探针的概念和分类
RNA探针是指带有标记的能与组织内相对应的核苷酸序列互补结合的一段单链cDNA或cRNA分子。根据在RNA杂交中所使用的探针依其来源可分为三种:即特异性cDNA、cRNA探针和人工合成寡核苷酸探针。
RNA探针技术的应用介绍
这类RNA探针主要用于研究目的,而不是用于检测。例如,在筛选逆转录病毒人类免疫缺陷病毒(HIV)的基因组DNA克隆时,因无DNA探针可利用,就利用HIV的全套标记mRNA作为探针,成功地筛选到多株HIV基因组DNA克隆。又如进行中的转录分析(nuclear run on transcrip-tion
分子杂交技术的核酸探针标记法
核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。下面将介绍各种类型的探针及标记方法。 分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程差异
⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现,线粒体和叶绿体中除有DNA外,还有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖体、氨基酸活化酶等。说明
新生链转录分析的方法特点
中文名称新生链转录分析英文名称nascent chain transcription analysis定 义用于对基因转录调控研究的一种方法。即分离细胞核的过程中,所有基因转录都暂时终止,当把细胞核转入核苷三磷酸和辅助因子齐全的缓冲体系中时,它就会恢复转录功能。缓冲体系中加入标记核苷三磷酸,在转录
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,用
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA
双链DNA探针标记法介绍
分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。1. 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的
RNA复制的转录与逆转录的过程介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
信使RNA的反转录酶与反转录过程
定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录 1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。 2.反转录酶与反转录过程 反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合
体外膜肺氧合ECMO的应急预案
体外膜肺氧合(ECMO)突发事件与应急预案: (一)ECMO治疗时突发事件如下一、ECMO运行开始时:1. 准备物品不到位;2. 置管不顺利;3. 预充不熟练;4. 无菌操作不到位;二、ECMO运行过程中:1. 管路问题:深度变动、打折、脱出、破损;2. 流量探测器报警:耦合剂干燥、破损;3
体外膜肺氧合ECMO的应急预案
(一)ECMO治疗时突发事件如下一、ECMO运行开始时:1. 准备物品不到位;2. 置管不顺利;3. 预充不熟练;4. 无菌操作不到位;二、ECMO运行过程中:1. 管路问题:深度变动、打折、脱出、破损;2. 流量探测器报警:耦合剂干燥、破损;3. 氧合器问题:血栓形成、破损、渗血;4. 主
体外膜肺氧合ECMO的应急预案
(一)ECMO治疗时突发事件如下一、ECMO运行开始时:1. 准备物品不到位;2. 置管不顺利;3. 预充不熟练;4. 无菌操作不到位;二、ECMO运行过程中:1. 管路问题:深度变动、打折、脱出、破损;2. 流量探测器报警:耦合剂干燥、破损;3. 氧合器问题:血栓形成、破损、渗血;4.
4.5-体外转录与体外翻译耦联的快速反应系统
TNT 耦联网织红细胞裂解物系统乂可以分为:TNTT7 系统、TNTSP6 系统和 TN 下 PCR 系统。其屮,TNTT7 系统可以从线状和环状 DNA 中翻译蛋白质,SP6 系统只能使用环状 DNA 进行翻译,而 PCR 模板可使用 TNTPCR 系统迸行翻译实验材料质粒 DNA 模板试剂、试剂
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程的区别
⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现,线粒体和叶绿体中除有DNA外,还有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖体、氨基酸活化酶等。说明
双链RNA抑癌原理
双链RNA抑癌原理是通过构建对癌症细胞特异蛋白转录后得到的mRNA的反义RNA,从而通过碱基结合使得该蛋白表达被阻断而最终导致癌细胞正常代谢通路受阻等,绝非所谓的食用后能够起到抑癌作用;
单链RNA的结构特点
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
双链RNA病毒的特点
双链RNA病毒有两个特点:一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RNA进
双链RNA病毒的特点
双链RNA病毒有两个特点:一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RNA进
细胞化学词汇单链RNA
中文名称:单链RNA英文名称:single-stranded RNA;ssRNA定 义:只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)
双链RNA病毒的复制
虽然同为双链核酸分子,但双链RNA的复制方式和双链DNA不同,双链RNA不是半保留复制,而是全保留复制,复制需要经过mRNA中间体。双链RNA病毒有两个特点,一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有多层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒双链
分子杂交技术--1
互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。 杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方
转录组的重编写:RNA编辑
基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了
转录组的重编写:RNA编辑
前 言 基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA
简述信使RNA的转录过程
分为起始、延长和终止三个阶段。起始包括对双链DNA特定部位的识别、局部(17bp)解链以及在最初两个核苷酸间形成磷酸二酯键。第一个核苷酸掺入的位置称为转录起点。 起始后起始因子离开,核心酶构象改变,沿模板移动,转录生成杂交双链(12bp)。随后DNA互补链取代RNA链,恢复DNA双螺旋结构。延