Raf蛋白Ras结合结构域的简并进化库合成以及利...(一)

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆实验实验材料 寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要,它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向(图 15.1 示意了在连接设计中对空间位置的考虑)。因此,在设计蛋白一PCA 片段融合体时,以何种方式将蛋白质片段连接在一起使其能够折叠形成天然结构是非常重要的。融合蛋白能否正确折叠受融合蛋白的末端朝向和片段间接头(linker) 长度两个因素的影响。我们将片段 GGGGS 应用于多种不同蛋白质,证明这个序列在大肠杆菌、酵母和哺乳动物细胞表达系统中效果都比较好。我们认为这个序列可以改善融合蛋白的弹性和可溶性,......阅读全文

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及利...(一)

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆实验实验材料 寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及利...(二)

3.3 文库的克隆和回收( 1 ) 插入片段和载体的理想比例是(2 : 1 ) ~(3 : 1 )。我们将用于连接的 DNA 浓度限制在 10 ng/μl,使用 1 mmol/L 的 ATP,16°C 连接过夜(见注 8 )。( 2 ) 连接反应体系于 65°C 处理,使酶失活,用氯仿抽提,然后用乙

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆             实验材料 寡核苷酸引物

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成

实验材料寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材琼脂糖凝胶实验步骤3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要,它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向(图 15.1

Ras2MAPK信号转导途径

Ras2MAPK信号转导途径Ras上游通路Ras能被复杂的网络激活.首先,被磷酸化激活的受体如PDGFR,EGFR直接结合生长因子受体结合蛋白(Grb2),这些受体也可以间接结合并磷酸化含有src同源区2(SH2)结构域的蛋白质(例如Shc,Syp)后,再激活Grb2.第二,Grb2的src同源区3

Ras2MAPK信号转导途径Ras/Raf通路的介绍

  至今,Ras/Raf通路是最明确的信号转导通路.当GTP取代GDP与Ras结合,Ras被激活后,再激活丝苏氨酸激酶级联放大效应,招集细胞浆内Raf1丝苏氨酸激酶至细胞膜上,Raf激酶磷酸化MAPK激(MAPKK),MAPKK激活MAPK.MAPK被激活后,转至细胞核内,直接激活转录因子.另外,M

常见信号通路介绍

1. NF-κB信号NF-kB(nuclear factor-kappa B)是1986年从B淋巴细胞的细胞核抽提物中找到的转录因子,它能与免疫球蛋白kappa轻链基因的增强子B序列GGGACTTTCC特异性结合,促进κ轻链基因表达,故而得名。它是真核细胞转录因子Rel家族成员之一,广泛存在于各种哺

常见信号通路介绍

1. NF-κB信号NF-kB(nuclear factor-kappa B)是1986年从B淋巴细胞的细胞核抽提物中找到的转录因子,它能与免疫球蛋白kappa轻链基因的增强子B序列GGGACTTTCC特异性结合,促进κ轻链基因表达,故而得名。它是真核细胞转录因子Rel家族成员之一,广泛存在于各种哺

G蛋白偶联受体信号通路激活的MAPK/Erk信号通路图

研究证实,受体酪氨酸激酶、G蛋白偶联的受体和部分细胞因子受体均可激活ERK信号转导途径。如:生长因子与细胞膜上的特异受体结合,可使受体形成二聚体,二聚化的受体使其自身酪氨酸激酶被激活;受体上磷酸化的酪氨酸又与位于胞膜上的生长因子受体结合蛋白2(Grb2)的SH2结构域相结合,而Grb2的SH3结构域

G蛋白偶联受体信号通路激活的MAPK/Erk信号通路图

研究证实,受体酪氨酸激酶、G蛋白偶联的受体和部分细胞因子受体均可激活ERK信号转导途径。如:生长因子与细胞膜上的特异受体结合,可使受体形成二聚体,二聚化的受体使其自身酪氨酸激酶被激活;受体上磷酸化的酪氨酸又与位于胞膜上的生长因子受体结合蛋白2(Grb2)的SH2结构域相结合,而Grb2的SH3结构域

MAPK/Erk信号通路图

MAPK,丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPKs)是细胞内的一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。研究证实,MAPKs信号转导通路存在于大多数细胞内,在将细胞外刺激信号转导至细胞及其核内,并引起细胞生物学反应(如细胞增殖、分化、转化及凋亡等)的过程中

受体酪氨酸激酶的概念特点

受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinase,RTK) :又称酪氨酸蛋白激酶受体,是细胞表面的一大类重要受体家族,迄今已鉴定有50余种,包括7个亚族。所有RTK的N端位于细胞外,为配体结合域,C端位于胞内,具有酪氨酸激酶结构域和自磷酸化位点。它的细胞外配体是可溶性或膜结合的多肽或

Ras蛋白的活性介绍

Ras蛋白的活性状态对细胞的生长、分化、细胞骨架、蛋白质运输和分泌等都具有影响,其活性则是通过与GTP或GDP的结合进行调节。

Ras蛋白的结构特点

Ras是大鼠肉瘤(rat sarcoma,Ras)的英文缩写。Ras蛋白是原癌基因 c—ras的表达产物,相对分子质量为21kDa。

Ras蛋白的结构特点

Ras蛋白为膜结合型的GTP/GDP结合蛋白,相对分子质量为2.1万,定位于细胞膜内侧.它由188或189个氨基酸组成,它的第一个结构域为含有85个氨基酸残基的高度保守序列,接下来含有80个氨基酸残基的结构域中,Ras蛋白结构轻微不同,除了K2Ras末端25个氨基酸由于不同的外显子而分为A型和B型外

Ras蛋白的物质介绍

Ras蛋白是小型GTP结合蛋白大家族中的一员,是由190个氨基酸残基组成的小型GTP结合蛋白,具有GTP水解酶活性,分布于质膜胞质一侧。通常将“小型GTP结合蛋白”称为“单体GTP水解酶”,以区别于结构是三聚体的G蛋白。Ras蛋白的结构类似于G蛋白的α亚基,起到分子开关的功能。Ras蛋白的构象在两个

Ras蛋白的功能介绍

Ras(P21)蛋白位于细胞膜内侧,它在传递细胞生长分化信号方面起重要作用.它属于三磷酸鸟苷(GTP)结合蛋白(一种细胞信息传递的耦联因子),通过GTP与二磷酸鸟苷(GDP)的相互转化来调节信息的传递.P21与GTP和GDP有很强的亲和性,而且有较弱的GTP酶活性.正常情况下P21和GDP结合处于失

RAS靶点的药物的研发进程的梳理盘点

  RAS是肿瘤患者中最常见的致癌基因之一,目前包括KRAS、NRAS以及HRAS三种亚型。其中,NRAS突变多见于黑色素瘤和急性骨髓性白血病,HRAS突变多见于膀胱癌和头颈癌,而KRAS突变比其他两种更常见,最常发生在肺癌、胰腺癌以及结直肠癌中,也成为了科学家们着力攻克的热点。RAS曾被医学界称为

简述丝裂原活化蛋白激酶的信号级联

  MAPK通常形成多层通路,接收比实际MAP激酶高几层的输入。与MAPKs和MAP2Ks相对简单、磷酸化依赖的激活机制相比,MAP3Ks具有惊人的复杂调控。许多了解得更多的MAP3K,如c-Raf、MEKK4或MLK3,需要多个步骤来激活它们。这些酶通常是受变构效应控制的酶,通过多种机制紧密地锁定

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧实验(六)

3.2.5.1 简并密码子使用简并密码子,可在希望改变的位点上编码若干氨基酸的混合密码。同样,在仔细选择要随机化的对应位点引入简并密码子,不仅可以引入期望的碱基,而且可以引人期望的氨基酸。如已经讨论过的,盘绕螺旋在不同位置对氨基酸类型有偏好。例如,e 和 g 残基常是极性且互补的(表 3. 4)

关于Ras蛋白的物质介绍

  Ras蛋白是小型GTP结合蛋白大家族中的一员,是由190个氨基酸残基组成的小型GTP结合蛋白,具有GTP水解酶活性,分布于质膜胞质一侧。通常将“小型GTP结合蛋白”称为“单体GTP水解酶”,以区别于结构是三聚体的G蛋白。Ras蛋白的结构类似于G蛋白的α亚基,起到分子开关的功能。Ras蛋白的构象在

Ras蛋白的物质调节介绍

Ras的活性受两个蛋白的控制,一个是鸟苷交换因子(guanine nucleotide exchange factor, GEF),它的作用是促使GDP从Ras蛋白上释放出来,取而代之的是GTP,从而将Ras激活,GEF的活性受生长因子及其受体的影响。另一个控制Ras蛋白活性的是GTP酶激活蛋白(G

关于Ras蛋白的结构介绍

  Ras蛋白为膜结合型的GTP/GDP结合蛋白,相对分子质量为2.1万,定位于细胞膜内侧.它由188或189个氨基酸组成,它的第一个结构域为含有85个氨基酸残基的高度保守序列,接下来含有80个氨基酸残基的结构域中,Ras蛋白结构轻微不同,除了K2Ras末端25个氨基酸由于不同的外显子而分为A型和B

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能

原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达时,才有可能

要说Ras2MAPK信号途径与肿瘤的关系

  肿瘤发生与调控细胞增殖的信号发生异常有关.一些肿瘤病人生长因子或其受体的表达或功能出现异常,如卵巢癌病人血清中EGF和胰岛素样生长因子含量升高;EGF增高影响细胞间连接,促进细胞转移和浸润.临床资料表明,酪氨酸蛋白激酶受体过表达与肿瘤相关,ErbB22在乳癌病人中30%过表达;起源于上皮的肺癌,

Ras2MAPK信号途径与肿瘤的关系

肿瘤发生与调控细胞增殖的信号发生异常有关.一些肿瘤病人生长因子或其受体的表达或功能出现异常,如卵巢癌病人血清中EGF和胰岛素样生长因子含量升高;EGF增高影响细胞间连接,促进细胞转移和浸润.临床资料表明,酪氨酸蛋白激酶受体过表达与肿瘤相关,ErbB22在乳癌病人中30%过表达;起源于上皮的肺癌,乳癌

PNAS-陈雁小组-ERK信号通路调控研究

近日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所陈雁研究组关于ERK信号通路调控的最新研究成果。该研究发现了一个新的Raf-1调控蛋白,第一次揭示了Raf-1的空间调控方式,并提出了一种在高尔基体上遏制ERK信号通路的新机制,为未来研究肿瘤细胞过度增生的分子机理进