如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如: 1) 无法获得(提纯分离)人源蛋白; 2) 需要在体内考察蛋白的功能,但无法直接进行人体临床试验; 3) 使用动物蛋白更方便、更便宜; 4) 其他限制因素。 而计算模拟则便利很多。如果我们真正的研究对象是人体,则一般情况下应当使用人源蛋白。但是,如果需要根据对接计算的结果去指导实验或解释实验现象,或者开展后续实验(如定点突变)对计算结果进行验证,那么,原则上应当让计算用的蛋白种属与实验一致,否则氨基酸序列可能对应不上。 比如,在UniprotKB数据库(https://www.uni......阅读全文
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许
如何选择蛋白晶体结构?
在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无
如何选择蛋白质裂解液?
蛋白质裂解液的选择,除了要根据其“产量”,还要看所选择的一抗是否能识别经变性的蛋白质样品。一般来说对于不能识别变性的蛋白质样品的一抗,其蛋白质裂解液都会是不含去污剂或含有较温和的非离子去污剂的(如:NP-40,Triton X-100)。 蛋白质裂解液的配方有很多种,如何选择合
如何选择蛋白质裂解液
蛋白质裂解液的选择,除了要根据其“产量”,还要看所选择的一抗是否能识别经变性的蛋白质样品。一般来说对于不能识别变性的蛋白质样品的一抗,其蛋白质裂解液都会是不含去污剂或含有较温和的非离子去污剂的(如:NP-40,Triton X-100)。 蛋白质裂解液的配方有很多种,如何选择合适的蛋白质
如何用衍射仪判断晶体结构
一种物质会有可能会有多种晶型,因此就有多个pdf卡片,如不同的αfe或γfe。有了pdf卡片,这种晶型的该物质的结构就已经确定了,卡上有该晶体的空间群晶格常数等信息。对于未知物质或其晶体类型,需要用透射电子衍射或者会聚束方法
如何选择荧光蛋白的激发波长?
表一:波长组指定激发发射适用于UV - 紫外线360 - 380nm415nm长波通DapiVI - 紫罗兰400 - 415nm450nm长波通蓝色荧光蛋白青色荧光蛋白RB - 皇家蓝440-460nm500nm长波通绿色荧光蛋白RB - 皇家蓝440-460nm500 - 560nm带通
如何选择合适的蛋白含量测定方法
选择一种蛋白测定方法时,需要考虑两个重要因素:缓冲液的化学组成和检测的蛋白量。基于dford方法的Quick Start Bradford和Bio–Rad 蛋白测定灵敏度高,可以兼容糖、巯基乙醇、DTT等。而对于去污剂和NaOH这两种干扰Bradford测定的物质,DC蛋白测定却可以兼容。如果蛋白是
如何选择合适的牛血清白蛋白?
牛血清白蛋白(BSA)又称第五组分(需要注意的是,第五组分并不是BSA的一种组份,而是EdwinJ.Cohn教授早期从血液中通过特定的分离技术得到5种组份,其中第五种就是白蛋白),英文名称为BovineSerumAlbumin,简称BSA。由于牛血清白蛋白(BSA)具有多种产品样式,可满足不同种的
如何选择蛋白印迹实验中的印迹膜?
硝酸纤维素膜(NC膜)是蛋白和核酸杂交最常用的印迹膜,是蛋白印迹实验的标准固相支持物。在低离子转移缓冲液的环境下,大多数带负电荷的蛋白质会与硝酸纤维素膜发生疏水作用而高亲和力的结合在一起,虽然这其中的机制还不是十分清楚,但由于硝酸纤维素膜的这个特性,而且易于封闭非特异性结合,从而得到了广泛的应用。目
如何选择牛血清白蛋白种类?
牛血清白蛋白(BSA)产品种类繁多,可满足不同种的应用。但是该怎么选择呢,下面让爱必信带您一起解决这个难题吧!目前BSA大致分为标准级BSA、BSA第五组分、无IgG试剂级BSA、无蛋白酶BSA、无脂肪酸BSA、低内毒素BSA、无蛋白酶/IgG BSA、诊断级BSA。我们一起来看一下他们的区别:BS
蛋白合成之如何选择平台分析实验数据?
Autodock、Autodock Vina与Dock6A:有没有关于分子对接结果解读之类的文章呢,有些时候结果出来了不会分析不会看。答:《【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究》的最后就有分析,解读无非就是看图说话,再结合一些实验数据、相关文献进行拓展。A:dock6也是
如何选择蛋白印迹实验中的印迹膜
硝酸纤维素膜(NC膜)是蛋白和核酸杂交zui常用的印迹膜,是蛋白印迹实验的标准固相支持物。在低离子转移缓冲液的环境下,大多数带负电荷的蛋白质会与硝酸纤维素膜发生疏水作用而高亲和力的结合在一起,虽然这其中的机制还不是十分清楚,但由于硝酸纤维素膜的这个特性,而且易于封闭非特异性结合,从而得到了广泛的
蛋白质的荧光激发波长如何选择?
荧光蛋白的波长组指定激发发射适用于UV - 紫外线360 - 380nm415nm长波通DapiVI - 紫罗兰400 - 415nm450nm长波通蓝色荧光蛋白青色荧光蛋白RB - 皇家蓝440-460nm500nm长波通绿色荧光蛋白RB - 皇家蓝440-460nm500 - 560nm
如何选择合适的牛血清白蛋白(BSA)?
由于牛血清白蛋白(BSA)具有多种产品样式,可满足不同种的应用。目前网上的信息大多模棱两可,有牛血清白蛋白,也有牛血清白蛋白v组分等,很多 供货商对其区别也是不清楚的;另外,市场上还提供无蛋白酶、无DNase及无RNase、无脂肪酸、微生物级、试剂级、诊断分析级等不同等BSA粉末,因 此如何选择合适
如何选择蛋白酶抑制剂以提高蛋白纯化率
当细胞破碎的时候,蛋白水解酶就会被释放出来或被激活,使电泳结果复杂化,影响zui终结果分析。为了避免这些情况的出现,建议在样品制备时尽可能在低 温下进行。此外,许多蛋白酶在PH9以上就失活了,因此Tris碱,碳酸钠或碱性载体两性电解质往往能抑制蛋白水解。但是有些蛋白酶在上述条件下仍然保持 着活性,此
如何选择蛋白印迹成像与定量分析技术
——western blot技术在蛋白定量分析中的选择应用 蛋白质印迹(western blot),它是根据抗原抗体的特异性结合检测复杂样品中的某种蛋白的方法。western blot 是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的一种新的免疫生化技术。由于免疫印迹(western blo
中科院发现寨卡病毒关键蛋白晶体结构
近日,中科院微生物研究所院士高福和中科院北京生命科学研究院副研究员施一带领的科研团队针对寨卡病毒(ZIKV)进行分析,发现非结构蛋白1(NS1)的分子结构。该研究成果提供了非结构蛋白1的原子层面图像,在这之前非结构蛋白1同样参与了登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制,相关研究成果在线发表于4月1
微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构
中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses(《寨卡病
中国科学家解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病毒
如何选择冻干机?
选购冷冻干燥机,要注重看以下几个参数,双嘉在此做个简单介绍,希望能帮助您更好地选择合适机型。1、冻干面积用户应根据自己的需要,通过计算来确定需用多大冻干面积的冷冻干燥机。以水为例,每批需冻干1.2公斤(升),用物料盘装载物料,每盘装载10㎜厚,则可计算出冻干板层的负荷面积:A(面积,㎡)=V(体积,
如何选择酶标仪?
酶标仪(MicroplateReader)是对酶联免疫检测(EIA)实验结果进行读取和分析的专业仪器。酶联免疫反应通过偶联在抗原或抗体上的酶催化显色底物进行的,反应结果以颜色显示,通过显色的深浅即吸光度值的大小就可以判断标本中待测抗体或抗原的浓度。酶标仪广泛地应用在临床检验、生物学研究、农业科学、食
如何选择酶标仪
酶标仪即酶联免疫检测仪,是酶联免疫吸附试验的专用仪器,酶联免疫技术(ELISA)是在免疫学和细胞工程学基础上发展的一种微量检测技术,具有操作简便、灵敏性高等优点,已在食品农药残留、重金属污染、食品添加剂检测等诸多方面表现出了独特的优势,在食品安全检测领域有着广阔的应用前景。 对于全自动酶标
如何选择测厚仪?
大家在选购测厚仪之前,先了解一下市面上几种测厚仪的类型,才能提高效率,满足自身对产品的实际需求。 1.磁性测厚仪 精度尚可,适用于用磁性材料上的非导磁层厚度测量,导磁材料一般为:钢、铁、铜等。 2.涡流测厚仪 适用导电金属上的非导电层厚度测量,但此相对于磁性测厚法精度低。 3
如何选择凝胶
生物分子下游纯化的对象一般包括蛋白、酶、重组蛋白、单抗、抗体及抗原、肽类、病毒、核酸等。纯化前首先需要测定生物分子的各物理和化学特性,然后通过实验选择出最有效的纯化流程。 1.测定------分子量、PI 当目标蛋白的物理特性如分子量、PI等都不清楚时,可用PAGE电泳方法
如何选择冻干机?
选购冷冻干燥机,要注重看以下几个参数,双嘉在此做个简单介绍,希望能帮助您更好地选择合适机型。1、冻干面积用户应根据自己的需要,通过计算来确定需用多大冻干面积的冷冻干燥机。以水为例,每批需冻干1.2公斤(升),用物料盘装载物料,每盘装载10㎜厚,则可计算出冻干板层的负荷面积:A(面积,㎡)=V(体积,
如何选择酶标仪
2020年,新冠肺炎全球爆发,常规的核酸检测判别是否感染新冠病毒,血清抗体检测则可以揭示中国人群新冠病毒的感染情况,随着疫情防控常态化,大规模血清检测对于监控人群免疫情况十分必要。如此看来,作为酶联免疫检测的核心仪器,酶标仪的采购情况被业内看好。酶标仪作为一个常用的仪器,其基本功能不外乎一个比色测定
如何选择测厚仪
测厚仪是用来测量材料及物体厚度的仪表。在工业生产中常用来连续或抽样测量产品的厚度(如钢板、钢带、薄膜、纸张、金属箔片等材料)。如何选择测厚仪:1、塑料上的铜、铬层:建议用库仑法测厚仪(会破坏镀层)或X射线测厚仪(无损测量),如铜层在10m~200m可考虑电涡流法测厚仪(无损测量)。2、金属件上镀锌层
如何选择酶标仪
2020年,新冠肺炎全球爆发,常规的核酸检测判别是否感染新冠病毒,血清抗体检测则可以揭示中国人群新冠病毒的感染情况,随着疫情防控常态化,大规模血清检测对于监控人群免疫情况十分必要。如此看来,作为酶联免疫检测的核心仪器,酶标仪的采购情况被业内看好。酶标仪作为一个常用的仪器,其基本功能不外乎一个比色测定
如何选择酶标仪
选型指南首先,酶标仪体积不宜太大。检验室空间有限,仪器体积太大会占据很多空间,给其他工作带来不便。这也是小巧玲珑、外形美观的机型受人青睐的原因。此外,在检验过程中,经常会有样品液体外溅,所以酶标仪外壳要易于消毒、清洁。第二,仪器操作要简便,菜单应该用中文来显示。尽管目前检验人员的素质有限大幅度提高,
如何选择内标
内标的选择:1,与被测物质的性质相近2,化学性质稳定3,不与样品中的物质发生反应4,保留时间与被测物质相近