如何选择蛋白晶体结构

在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如: 1) 无法获得(提纯分离)人源蛋白; 2) 需要在体内考察蛋白的功能,但无法直接进行人体临床试验; 3) 使用动物蛋白更方便、更便宜; 4) 其他限制因素。 而计算模拟则便利很多。如果我们真正的研究对象是人体,则一般情况下应当使用人源蛋白。但是,如果需要根据对接计算的结果去指导实验或解释实验现象,或者开展后续实验(如定点突变)对计算结果进行验证,那么,原则上应当让计算用的蛋白种属与实验一致,否则氨基酸序列可能对应不上。 比如,在UniprotKB数据库(https://www.uni......阅读全文

如何选择酶标仪

2020年,新冠肺炎全球爆发,常规的核酸检测判别是否感染新冠病毒,血清抗体检测则可以揭示中国人群新冠病毒的感染情况,随着疫情防控常态化,大规模血清检测对于监控人群免疫情况十分必要。如此看来,作为酶联免疫检测的核心仪器,酶标仪的采购情况被业内看好。酶标仪作为一个常用的仪器,其基本功能不外乎一个比色测定

蛋白合成交流群之如何选择平台分析实验数据

  Autodock、Autodock Vina与Dock6   A:有没有关于分子对接结果解读之类的文章呢,有些时候结果出来了不会分析不会看。   殷赋科技:《【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究》的最后就有分析,解读无非就是看图说话,再结合一些实验数据、相关文献

黄病毒重要蛋白NS5晶体结构研究取得突破

  中国科学院武汉病毒研究所龚鹏学科组在乙型脑炎非结构蛋白NS5的研究中取得突破,相关结果于8月8日在线发表于病毒学期刊PLoS Pathogens上,题为Crystal Structure of the Full-Length Japanese Encephalitis Virus NS5

涂层测厚仪如何选择

涂层测厚仪如何选择涂层测厚仪如何选择?涂层测厚仪分磁性测厚法和涡流测厚法,磁性是在磁性的基体测试非磁性的涂层,好比钢上的油漆,钢是磁性,油漆非磁性,涡流是在有色金属的基体测试非导电的绝缘涂层。好比铝上的油漆,铝是有色金属,油漆非导电。在选择产品的时候,许多客户不知道自己需要哪款需要哪个来测试自己的产

如何选择保护柱?

怎样选择保护柱,但又不影响分离分析?通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就应该选用2cm或3cm的保护柱,保护柱越长自然所装填的色谱填料就越多,则其

如何选择保护柱?

怎样选择保护柱,但又不影响分离分析? 通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就应该选用2cm或3cm的保护柱,保护柱越长自然所装填的色谱填料就越多,则

如何选择保护柱

保护柱是高效液相色谱仪中,安装在进样器和分析柱之间,通过流动相和样品溶液。怎样选择保护柱,但又不影响分离分析?通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就

如何选择超滤管

你看你要截留那部分物质,就选择比最小分子量小的,如果你要截留26KD的,你要的超滤管就要比26小。但两者也要有一定的差距,比如,选择20-25KD之间的就不合适,因为26的也可能会出去(这是由制造工艺决定的)。所以选择20KD以下的超滤管比较合适。

如何选择水分仪?

全自动卡尔费休水分仪广泛适用于石油、化工、电力、制药、商检、科研、环保等领域。水分仪又分为半自动卡尔费休水分仪,全自动卡尔费休水分仪。如何选择水分仪?沛欧是怎样保证水分仪数据的准确和精确的呢?01手动的水分测定仪需要试验者对玻璃滴定管中的试剂进行目测,在达到终点后也需要手动关闭,因各人动作习惯不同迟

洗板机如何选择

一、什么是洗板机?洗板机是专门清洗酶标板的医疗器械,一般和酶标仪配套使用。主要用于清洗酶标板检测后的一些残留物质,从而降低后续检测过程中因残留物导致的误差。它已经被广泛地用于医院、血站、卫生防疫站、试剂厂、研究室等存在酶标板清洗工作的实验室。图一、博科洗板机二:教您如何选购洗板机1. 关键指标:残留

涂层测厚仪如何选择

涂层测厚仪如何选择涂层测厚仪如何选择?涂层测厚仪分磁性测厚法和涡流测厚法,磁性是在磁性的基体测试非磁性的涂层,好比钢上的油漆,钢是磁性,油漆非磁性,涡流是在有色金属的基体测试非导电的绝缘涂层。好比铝上的油漆,铝是有色金属,油漆非导电。在选择产品的时候,许多客户不知道自己需要哪款需要哪个来测试自己的产

如何选择涂装测厚仪?

可用于现场检测的涂装测厚仪涂装工艺中一般都会规定漆膜的干膜厚度,因此在生产中必须对漆膜厚度进行检测,并以此调整喷涂 工艺或可用于现场检测的涂装测厚仪涂装工艺中一般都会规定漆膜的干膜厚度,因此 在生产中必须对漆膜厚度进行检测,并以此调整喷涂 工艺或进行返工、修补以达到工艺要求的厚度。作为一 种质量检验

如何选择保护柱

怎样选择保护柱,但又不影响分离分析?通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就应该选用2cm或3cm的保护柱,保护柱越长自然所装填的色谱填料就越多,则其

如何选择保护柱

何正确选择保护柱怎么样保护柱,但又不影响分离分析?通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就应该选用2cm或3cm的保护柱,保护柱越长自然所装填的色谱填

如何选择层析方法

当目标蛋白的物理特性如分子量、等电点等都不清楚时,可用PAGE电泳方法或层析方法加以测定。分离范围广阔的Superose HR适合测定未知蛋白的分子量。用少量离子交换介质在多个含不同pH缓冲液的试管中,可简单地测出pI, 并确定纯化用缓冲液的最佳pH。选择层析方法在对目标蛋白的特性或样品成分不太了解

如何选择色谱柱

如何选择色谱柱  在选择色谱柱之前,先多了解自己的样品和杂质,他们的类型结构、极性、酸碱性、分子量大小等等。   1.样品是极性的且弱酸性的;就可以选择C18在100%酸性水溶液条件下检测,即要选择承受100%纯水且对极性化合物保留很好的色谱柱。  2. 如果样品极性太强,或酸性太强;可以选择CN,

如何选择阳性对照?

阳性对照的使用是一个实验中确定抗体及检测系统是否正常工作的依据,也是确定待测标本中是否存在待测蛋白的一个依据!尤其是检测的标本是不确定是否有待测蛋白表达时。因此当实验没有阳性结果出现时,最好的选择是实验合适的阳性对照。大部分Abcam的说明书上都有推荐的阳性对照。但是如果说明书上没有推荐时,请参考以

如何选择涡流探头?

根据被检对象的几何形状选择。如测面材时选择点探头;管、棒、丝材的在线探伤常选择外穿过式探头或平面组合探头;电力、石化等在役管道的检测常选择内通过式探头。 根据检测目的选择。如测量电导率可选用绝对式或差分式点探头。根据特定的测试对象及其检测部位选择特制专用探头。如检测蒸发器传热管的一般弯管则使用填充系

如何选择汽车弹簧?

 通常原厂车型使用了渐进型弹簧,这种弹簧采用了粗细、疏密不一致的设计,好处是在受压不大时可以通过弹性系数较低的部分吸收路面的起伏,保证乘坐舒适感,当压力增大到一定程度后较粗部分的弹簧起到支撑车身的作用,而这种弹簧的缺点是操控感受不直接,度较差。线性弹簧  线性弹簧从上至下的粗细、疏密不变,弹性系数为

如何选择涂层测厚仪?

相信很多人在选择测厚仪的时候,往往只拿着一些参数,然后就在百度上找测厚仪的产品,接着就是挨个核对参数或则是打电话问销售人员该产品是否合适,到最后是可以找到符合参数的测厚仪,但是肯定不是最合适的测厚仪或则是同品牌的测厚仪会更加适合你的要求。建议大家选择正确的测厚仪,首先需要先了解目前市面上的几个类型测

洗板机如何选择

一、什么是洗板机?洗板机是专门清洗酶标板的医疗器械,一般和酶标仪配套使用。主要用于清洗酶标板检测后的一些残留物质,从而降低后续检测过程中因残留物导致的误差。它已经被广泛地用于医院、血站、卫生防疫站、试剂厂、研究室等存在酶标板清洗工作的实验室。图一、博科洗板机二:教您如何选购洗板机1. 关键指标:残留

如何选择二抗

二抗选择(1)种属来源。主要根据一抗种属来源而决定二抗来源,如一抗是小鼠来源,那二抗就买抗小鼠的即可(羊、兔等均可)。(2)标记物的选择。有HRP、Biotin、荧光素等标记物。免疫组化,WB二抗主要选择HRP,Biotin标记的二抗,而免疫荧光染色可按实验需要选择不同荧光素标记的二抗,如FITC、

如何选择保护柱?

怎样选择保护柱,但又不影响分离分析?通常,在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁,对于大部分分析工作者来说,一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是,如果样品非常不清洁,或工作中发现经常要更换1cm的保护柱,那么就应该选用2cm或3cm的保护柱,保护柱越长自然所装填的色谱填料就越多,则其

如何选择汽车弹簧

通常原厂车型使用了渐进型弹簧,这种弹簧采用了粗细、疏密不一致的设计,好处是在受压不大时可以通过弹性系数较低的部分吸收路面的起伏,保证乘坐舒适感,当压力增大到一定程度后较粗部分的弹簧起到支撑车身的作用,而这种弹簧的缺点是操控感受不直接,度较差。线性弹簧  线性弹簧从上至下的粗细、疏密不变,弹性系数为固

如何选择臭氧设备?

臭氧主要应用在水处理,烟气脱硝,空间消毒几方面。需要根据不同的工况来选型。又分氧气源臭氧设备与空气源臭氧设备。1、我的臭氧发生设备主要应用在水处理,该如何计算用多大的臭氧设备?水处理臭氧有医院污水、实验室污水、化工污水、养殖废水、自来水厂、泳池等。需要了解①哪种污水②水量每小时多少③是否要除COD,

如何选择流式荧光

这个问题有点不好说,每个荧光都有自己在某个波长的最大吸收峰,原则上最大吸收峰差的越远补偿越小,FITC PE APC 最常用的三个荧光,一般一管染三种抗体就选这三个颜色,便宜,而且好染。如果再加的话可以选PE-cy7或APC-cy7,个人觉得可以,一管不宜染太多种抗体,到时候很难分析,补偿也大,结果

如何选择同型对照?

同型对照的主要目的是确定一抗的结合是特异性的,而不是非特异性的Fc受体或与其他蛋白的相互作用。同型对照要与一抗的来源、Ig分型和标记完全一致。例如:一抗是FITC标记,其抗体分型是小鼠的IgG1,则同型对照要选择是FITC标记的小鼠的IgG1。Abcam提供各种种属和Ig分型的同型对照产品,可以在A

如何选择超滤管

你看你要截留那部分物质,就选择比最小分子量小的,如果你要截留26KD的,你要的超滤管就要比26小。但两者也要有一定的差距,比如,选择20-25KD之间的就不合适,因为26的也可能会出去(这是由制造工艺决定的)。所以选择20KD以下的超滤管比较合适。

如何选择电极材料

应根据被测液体的腐蚀性来选择电极的材料,请查有关防腐蚀手册,对于特殊流体应作试验。  含钼不锈钢(0Cr18Ni12Mo2Ti)  硝酸、室温下<5%的硫酸、沸腾的磷酸、蚁酸、碱溶液,在一定压力下的亚硫酸、海水、醋酸    哈氏合金C  哈氏合金B(HC、HB)  海水、盐水    钛(Ti)  海

如何选择使用摇床?

摇床选型一般要考虑工作温度、工作方式、振荡频率、精度、工作尺寸等因素。1、根据温度选择常温摇床,还是低温摇床。市场上大概对恒温摇床的温度定义为两种:常温和低温,常温正常温度是:室温+5~60度,低温:3-55度,这个时候客户可以根据自己实验需要就知道自己要的是常温还是低温,一般低温的恒温振荡培养箱(