关于蛋白与分子的结合在微信学术群里的讨论结果
Docking相关 A:新手想问一下,docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀,形成了疏水键或氢键吗? B:打分越低越好,一般会设置一个已知的配体用来做参照,或者说用来检验参数是否合理。 A:我是选择了有配体的蛋白,处理了蛋白和分子后进行docking,得到这个结果。 B:只要比这个配体的打分低,那肯定就更有可能结合在那里呀! E:新手想问下,配体和蛋白对接的时候怎么确定对接盒子的位置和坐标? D:选中ligand。 B:根据前期文献调研,需要大体知道结合位点的位置。否则就得进行全局docking。 E:下载pdb的蛋白的原文献吗?全局docking感觉不准啊。 D:你得先知道ligand结合口袋。 B:不一定,比如一些突变研究会告诉你大体结合位点。 D:可以用氨基酸残基定位结合口袋。 (提示:更多干货见《如何确定对接口袋?》) F:我......阅读全文
关于β2微球蛋白的基本介绍
β2-微球蛋白是由淋巴细胞、血小板、多形核白细胞产生的一种小分子球蛋白,分子质量为11800,由99个氨基酸组成的单链多肽。它是细胞表面人白细胞抗原(HLA)的β链(轻链)部分,分子内含一对二硫键,不含糖;与免疫球蛋白稳定区的结构相似。广泛存在于血浆、尿液、脑脊液、唾液以及初乳中。 正常人β2-
关于尿微球蛋白的分类介绍
微球蛋白分为β2-微球蛋白和α1-微球蛋白。 β2-微球蛋白是一种低相对分子质量(11 800)蛋白质,因电泳时位于β2-区带而得名。β2 -M为细胞膜上完整组织相容性抗原(HLA)的一部分,存在于有核细胞的表面,除成熟的红细胞和胎盘滋养层细胞外,其他细胞均含有β2-M。由于代谢和HLA的降解
关于尿微球蛋白的基本介绍
尿微球蛋白分为β2-微球蛋白(β2-M)和α1-微球蛋白(α1-M)。β2-微球蛋白(β2-M)的相对分子质量仅11800,是体内除成熟红细胞和胎盘滋养层细胞外,所有细胞特别是淋巴细胞和肿瘤细胞膜上人类白细胞抗原(HLA)的轻链蛋白组分,因电泳时出现β2区带而得名。正常人β2-M因其相对分子质量
关于发布973计划2010年结题项目验收结果的通知
国科发基〔2011〕71号 各有关省、直辖市科技厅(委),国务院各有关部门科技主管单位,各有关单位: 按照国家重点基础研究发展计划(973计划)管理办法的有关规定,2010年8月至11月,我部组织了对2005年、2006年批准立项的973计划项目研究任务的验收工作。 按领域和专
过度沉迷微信与成瘾相关的脑区出现结构变化相关
据《科学报告》发表的一项初始研究Internet Communication Disorder and the structure of the human brain: initial insights on WeChat addiction显示,与物质成瘾和行为成瘾相关特定脑区的结构变化,也
人肠道菌群多样性降低与结直肠癌有关
结直肠癌(CRC)是发生在人体下消化道结肠或直肠部位的恶性肿瘤。在世界范围内,其发病率和死亡率均位居各种癌症的前三位,对人类健康构成巨大的威胁。近几十年来,流行病学调查和分子、细胞生物学研究都表明,饮食是影响结直肠癌发病率的最重要因素。而饮食成分对癌症的影响,则很大程度上通过人体肠道细菌的代谢活
预测蛋白相互作用软件的学术交流记录
A:想请问一下预测两个蛋白之间的相互作用有什么方法吗? 殷赋科技:用蛋白-蛋白对接方法。蛋白-蛋白对接有好多软件都可以做,比如ZDOCK(Discovery Studio里边也整合了这个软件)、Hex、Rosetta。我们平台将来也会上线这个功能。 B:请问一下大家,做分子对接是怎么
肠道菌群里的核心成员被找到
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/10/531135.shtm 上海交通大学与美国罗格斯大学微生物组与人体健康联合实验室牵头的研究团队,首次找到了肠道菌群里面的核心成员。该研究成果10月7日晚在线发表于《细胞》杂志。 构建“跷跷板”模型
如何科学合理地对待分子对接结果
这不是一个简单的问题,我没有做过系统性的研究,仅说一下经验之谈。欢迎大家留言讨论,各抒己见。将问题分解一下,本文主要回答两个问题:A、如何判断结合模式好坏?B、如何评价结合能力高低? 讨论的重点是结合模式的判断,因为我们已知现有的对接软件的打分函数预测能力非常有限,而且一般情况下是我们不能
关于胆固醇的相关讨论
在对待食物胆固醇的作用方面,存在着两种截然不同的片面的观点。一种观点认为胆固醇是极其有害不能吃的东西。说这种观点片面,是由于持这种观点的人对胆固醇在人体内的作用缺乏清楚的认识。事实上,胆固醇是细胞膜的组成成分,参与了一些甾体类激素和胆酸的生物合成。由于许多含有胆固醇的食物中其它的营养成分也很丰富,如
化合物活性预测相关知识问答
Docking相关 A:新手想问一下,docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀,形成了疏水键或氢键吗? B:打分越低越好,一般会设置一个已知的配体用来做参照,或者说用来检验参数是否合理。 A:我是选择了有配体的蛋白,处理了蛋白和分子后进行docking,得到这个结果。
微流控系统里的响应性
响应性(Responsiveness)通常指功能单元或系统在给定时间内完成指定任务的特定能力。微流控系统里的响应性可定义为:系统流体管路中的压力或流量达到需求值所花的时间,可通过以下三个“时间”来描述微流控系统的响应性:1.响应时间(Response time)2.上升时间(Rising time)
生物学术语叠连群的概念
英文contig 概念contig,就是叠连群,指彼此间可通过重叠序列而连接成较长片段的一组短片段。
网传“微信购食品产纠纷-微信平台将担责”系误读
据中国之声报道,十二届全国人大常委会第九次会议初次审议的《中华人民共和国食品安全法修订草案》本周起向社会公开征集意见。在网购食品越来越普遍的今天,草案中涉及网络食品交易第三方平台的条款引发关注,有媒体解读称,通过微信购买食品发生纠纷,微信平台也要担责。对此说法,修法参与者和权威专家表示,属于误读
心脏支架没有微信传的那么可怕
焦点一:国际上被淘汰的技术,中国人如获至宝? 据广东省第二人民医院心血管外科主任钟志敏介绍,当前治疗冠心病的主要手段是心脏搭桥手术或心脏支架手术。介入治疗(支架术)是一种心脏导管技术,是通过大腿根部的股动脉或手腕上的桡动脉,经过血管穿刺把支架或其他器械放入冠状动脉里面,达到解除冠状动脉狭窄的目
“蓝田生物群”现场讨论会在安徽休宁举行
考察现场 6月17日,由中国科学院南京地质古生物研究所和安徽省黄山市休宁县政府共同举办的“蓝田生物群”现场研讨会在休宁县举行。 中国科学院副院长丁仲礼院士、院资源环境科学与技术局局长范蔚茗等领导出席了本次会议。休宁县县长金涛等热情接待了与会人员。出席本次会议的领导和专家还有:国土资
影响ZBD白度仪测定结果偏差的讨论
ZBD白度仪的光谱特性,由白炽灯、蓝色滤光片。墟泊色滤光片和硒光电池共同组成。通过对zBD白度仪各光学元件光谱特性的测定,求出ZBD白度仪的整机有效波长约为453nm,半波宽度约为60nm,以改变单参量。分别求出目前生产的ZBD白度仪所使用的白炽灯,蓝色滤光片、唬泊色滤光片及硒光电池光谱特性不一
关于微球蛋白的基本信息介绍
β2—微球蛋白(β2—MG)是机体产生的一种内源性低分子量血清蛋白质,广泛存在于血浆、尿液等体液中,其含量极微但相当恒定,检测血浆、尿液中β2—微球蛋白含量的变化情况,可以用于评价有关脏器功能和对某些疾病进行诊断及鉴别诊断。本文就β2—微球蛋白检测的临床应用加以综述。
关于β2微球蛋白的基本介绍
β2-微球蛋白(β2-MG)是人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类抗原的轻链,是由淋巴细胞、血小板、多形核白细胞产生的一种低分子量血清球蛋白,存在于成熟红细胞和胎盘滋养层细胞外的各种细胞表面。β2-微球蛋白极易通过肾小球滤过膜,几乎全部被近曲小管细胞重吸收和降解,不再回流入血。健康人β2-微球蛋白的合成
关于尿微球蛋白的检查方法介绍
免疫比浊法。临床意义β2微球蛋白 1.评价肾小球疾病 (1)对肾小球滤过功能,其敏感度显著高于常规应用的血肌酐测定,部分患者的肾小球功能虽已受损,当血肌酐还不能反映异常时,尿β2-M已显示肾功能的异常。因此,对血肌酐测定处于盲区而肾小球滤过功能已受损害的患者,测定其尿中β2-M有利于
数字化时代的学术不端会让个体学术征信破产
近日,《经济学》(季刊)编辑部在其官网上发布了一则“学术不端行为的处理决定”。事情的起因是某校博士生在向该刊投稿过程中出现了学术不端行为,由此,编辑部震怒,出于“维护学术道德,树立良好学风”的目的,对该投稿人给予严肃处理。 这份处理决定共包括四条处理意见,其中引起
数字化时代的学术不端会让个体学术征信破产
近日,《经济学》(季刊)编辑部在其官网上发布了一则“学术不端行为的处理决定”。事情的起因是某校博士生在向该刊投稿过程中出现了学术不端行为,由此,编辑部震怒,出于“维护学术道德,树立良好学风”的目的,对该投稿人给予严肃处理。 这份处理决定共包括四条处理意见,其中引起
蛋白分离色谱与高压制备液相色谱异同讨论
蛋白分离色谱与高压制备液相色谱异同讨论快速蛋白液相色谱(FPLC)、中压液相色谱(MPLC)、低压液相色谱(LPLC)是近年来从HPLC基础上发展的新型色谱技术,其中FPLC能以极快的速度把复杂混合物分离,可在短时间内大量纯化样品,具有柱容量大、回收效率高及生物大分子不易失活等特性,在生命科学研究及
蛋白合成交流之如何从数据库找合适的化合物?
体系相关A:http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/这个网站的结果怎么比较啊?答:我还没用过呢,只是在网上搜索到的。你那计算完了,有什么结果啊?A:答:没有打分之类的东西?A:只给了结果,但没看到这样排序的依据。答:应该是最上面的是最合适的,那你下载下来就可以用
关于血红蛋白病的分子病理与溶血机理的介绍
异常血红蛋白病种类繁多,临床症状多样化,但归纳其结构变异所导致功能异常,大致可分为以下数类: 1.因分子内部氨基酸替代所产生的异常血红蛋白,血红蛋白分子内部为非极性氨基酸,在血红蛋白分子中构成血红素与珠蛋白链的接触,肽链螺旋段间的接触及血红蛋白单体间的接触,如被不同理化性质的氨基酸替代,会影响
参与细胞移动的微丝和其结合蛋白信号分子介绍
微丝是由肌动蛋白(Actin)组成的直径约为7nm纤维结构。肌动蛋白单体(又被称为G-Actin,全称为球状肌动蛋白,Globular Actin,下文简称G肌动蛋白)为球形,其表面上有一ATP结合位点。肌动蛋白单体一个接一个连成一串肌动蛋白链,两串这样的肌动蛋白链互相缠绕扭曲成一股微丝。这种肌动蛋
什么是同质结与异质结
1、同质结就是同一种半导体形成的结,包括pn结、pp结、nn结。2、异质结是一种特殊的PN结,由两层以上不同的半导体材料薄膜依次沉积在同一基座上形成,这些材料具有不同的能带隙,它们可以是砷化镓之类的化合物,也可以是硅-锗之类的半导体合金。半导体异质结构的二极管特性非常接近理想二极管。另外,通过调节半
郭玥微:在无声的世界里发声
春天的杨凌农科城繁花似锦,静静地走在水保所的研究园区,西北农林科技大学博士研究生郭玥微有时会忍不住热泪从眼中流淌……对一个听力残疾,生活在无声世界的女孩来说,今天能够同其他同学一样走进西北农林科技大学—中科院水土保持研究所读博士,她付出了比别人更多的努力。 1992年,刚出生的郭玥微还没来得
关于myc基因的分析讨论介绍
国内外用于检测N-myc、L-myc及C-myc的方法大多采用各种杂交技术。由于应用放射性同位素,需要各种防护措施,不安全又复杂,且一次只能检测Myc基因家族中的一个基因,临床上很难常规应用。PCR-琼脂糖凝胶电泳技术简单、易行、快速,但由于灵敏度低,不能分开只相差3个bpDNA的L-myc和N
关于密闭消解样品量的讨论
在密闭容器中进行的高温高压反应速度很快,其危险因素主要取决于三点:1)过大的样品量使反应过于剧烈,2)压力罐所能承受的压力较低。3)机器没有反应过程的反馈控制或响应慢、控制能力很差,易引起反应失控。因此在实验初期务请严格控制样品量,首先使用小量样品以建立消化程序。等到深入了解整个反应的过程后,在