蛋白质一级结构的测定方法(二)
2)末端分析 其方法较多,这里我们只介绍较常用的几种。 (1)N-末端测定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要贡献之一。 DNP-氨基酸用有机溶剂抽提后,通过层析位置可鉴定它是何种氨基酸。Sanger用此方法测定了胰岛素的N末端分别为甘氨酸及苯丙氨酸。 B.氰酸盐法:1963年Stank及Smyth介绍了一种测定N末端的新方法,步骤如下: 由于乙内酰脲氨基酸不带电荷,因此可用离子交换层析法将它与游离氨基酸分开,分离所得的乙内酰脲氨基酸再被盐酸水解,重新生成游离的氨基酸,鉴别此氨基酸即可了解N-末端是何种氨基酸。 C.二甲基氨基萘磺酰氯法:1956年Hartley等报告了一种测定N-末端的灵敏方法,采用1-二甲基氨基萘-5-磺酰氯,简称丹磺酰氯。它与游离氨基末端作用,方法类似于Sanger的DNFB法,产物是磺酰胺衍生物。 丹磺酰链酸具有......阅读全文
关于蛋白质结构的一级结构介绍
蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(sequence),也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。 迄今已有约一千种左右蛋白质的
蛋白质一级结构介绍临床生化
蛋白质一级结构介绍:蛋白质的一级结构就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。迄今已有约一千种左右蛋白质的一级结构被研究确定,如胰岛素,胰核糖核酸酶、胰
蛋白质一级结构介绍生化检验
蛋白质一级结构介绍:蛋白质的一级结构就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。迄今已有约一千种左右蛋白质的一级结构被研究确定,如胰岛素,胰核糖核酸酶、胰
蛋白质的一级结构的特点
一级结构是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序,也称为蛋白质的化学结构。它决定了蛋白质的二、三、四级结构。
蛋白质一级结构的测定方法(二)
2)末端分析 其方法较多,这里我们只介绍较常用的几种。 (1)N-末端测定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要贡献之一。 DNP-氨基酸用有机溶剂抽提后,通过层析位置可鉴定它是何种氨基酸。Sanger用此方法测定了胰岛素的N末端分别为甘
蛋白质一级结构的测定方法(一)
研究蛋白质的一级结构从确定组成蛋白质的单元结构棗氨基酸算起,已有150年的悠久历史,直到1955年,Sanger首次阐明胰岛素的氨基酸排列顺序,为研究蛋白质的一级结构开辟了道路。这在分子生物学的发展进程中是一个重要突破。目前关于核酸的一级结构研究,由于Sanger等发明了加减法,可以得到了突
蛋白质一级结构的测定方法(三)
2)酶解法 酶水解法较化学法具有更多的优越性,使用也更广泛。因其具有较高专一性,而且水解产率较高,所以可以选择各种不同专一性的酶进行专一性的断裂。 常用的酶有胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶和嗜热菌蛋白酶。 胰蛋白酶专一断裂Lys,Arg的羧基侧肽键,如果对Lys,Arg,CysH进行化学修
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验
实验方法原理 将 SDS-PAGE 上的蛋白质样品从凝胶上分离出来是很困难的,目前流行的方法是将蛋白质电印迹(electrobloting) 至 PVDF 膜上,直接进行序列分析或直接在膜上进行酶解,后者称为原位分析。实验材料 蛋白质样品试剂、试剂盒 PVP-40HAC酶解缓冲液蒸馏水仪器、耗材 E
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验
一、蛋白质的纯化和肽段氨基酸序列分析 二、引物的设计 三、用 PCR 扩增目的 cDNA 片段 四、cDNA 的克隆及测序 五、cDNA 序列的分析及蛋白质一级结构的确定
蛋白质的一级结构及空间结构主要取决于结构基
一、氨基酸是构成蛋白质的基本化学成分 有20种由遗传密码所决定的标准氨基酸,根据侧链的化学性质,可分为疏水氨基酸〔Ala(A),Val(V),Le u(),lie(互),Phe(F),Pro(P)和Met(M)」、带电氨基酸[Asp(D),Gin(E),Lys(K)和Arg(R)]、极性氨基酸[
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验1
蛋白质和多肽是由 20 种氨基酸按照一定的顺序通过肽键连接成一长链。再通过链内、链间的离子键、疏水作用等多种作用力进行折叠卷曲形成一定构象而产生其特异性的活性作用。蛋白质的一级结构即氨基酸的排列顺序,决定了蛋白质的高级结构及功能。因此。测定蛋白质的一级结构是进行蛋白质结构与功能研究中不可缺少的部分。
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验2
二、引物的设计实验步骤在得到蛋白质部分氨基酸序列的基础上通常采用设计简并性或偏性引物,用锚定 PCR 的方法来获得该蛋白质的 cDNA 部分或全长序列。现在许多公司推出的 RACE(rapidly amplication cDNA ends)系统的技术核心便是如此。简并性引物的设计一般遵循以下几个原
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验3
实验方法原理PCR(polymerase chain reaction)作为一种常用的分子生物学实验手段,已非常成熟。各个公司推出了各种高保真和高效率的聚合酶及成套的 PCR 试剂盒,使得 PCR 技术简便而且有效。实验步骤1. 方法的选择:对于两端序列已知的情况,可根据两端序列设计引物,选用普通的
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验4
实验材料cDNA试剂、试剂盒载体感受态细菌仪器、耗材核酸自动测序仪实验步骤1. cDNA 片段与载体进行联接反应(多在 4℃下进行低温联接);2. 使用两次 CaCl2 沉淀法制成的感受态细菌(如 DH5a 或 Jm 109 等菌株),进行转化;3. 结合载体抗生素抗性特点,进行菌落的蓝白斑筛选;4
cDNA-法推断蛋白质的一级结构实验5
实验材料cDNA实验步骤1. 首先是对所得 cDNA 进行同源性的比较。通常是在 NCBl 的 GenBank 数据库中来完成,利用 Blast 程序,比较其与已知基因的同源性。2. 判断是否为完整的 cDNA 序列:如有无 polyA,有无起始和终止密码寻找开放性阅读框架(ORF,open rea
什么是DNA的一级结构?
DNA的一级结构,是指4种核苷酸的连接及其排列顺序,表示了该DNA分子的化学构成。DNA的一级结构决定其高级结构,如B-DNA中多G-C区易形成左手螺旋DNA(Z-DNA),而反向重复的DNA片段易出现发夹结构等。这些高级结构又决定和影响着一级结构的功能。
转运RNA的一级结构的介绍
自1965年R.W.霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U碱基配对原则,除个别例外。
转移核糖核酸的一级结构介绍
自1965年R.W.霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U碱基配对原则,除个别例外。
简述转移核糖核酸的一级结构和二级结构
一级结构 自1965年R.W.霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U碱基配对原则,除个别例外, 二级结构 tRNA分子
脱氧核糖核酸的分子结构一级结构的介绍
是指构成核酸的四种基本组成单位——脱氧核糖核苷酸(核苷酸),通过3',5'-磷酸二酯键彼此连接起来的线形多聚体,以及其基本单位-脱氧核糖核苷酸的排列顺序。 每一种脱氧核糖核苷酸由三个部分所组成:一分子含氮碱基+一分子五碳糖(脱氧核糖)+一分子磷酸根。核酸的含氮碱基又可分为四类:
丝裂原活化蛋白激酶的一级结构介绍
MKK都是通过双位点,即苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)同时磷酸化激活MAPK。这两个磷酸化位点中间被一氨基酸隔开,构成三肽基TXY。不同的MAPK亚族成员,其双磷酸化位点之间的X残基不同,但是其各个亚族都具有标准的12个保守亚区,这些亚区是区分真核细胞蛋白激酶超家族的标志之一。MAPK家族成员之间具
关于多顺反子一级结构与功能的关系介绍
原核生物mRNA一般5'端有一段不翻译区,称前导顺序,3'端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质。如大肠杆菌乳糖操纵子mRNA编码3条多肽链;色氨酸操纵子mRNA编码5条多肽链。也有单顺反子形式的细菌mRNA,如大肠杆菌脂蛋白mRNA。原核生物mRNA分子中一
原核生物mRNA一级结构与功能的关系
原核生物mRNA一级结构与功能的关系:原核生物mRNA一般5'端有一段不翻译区,称前导顺序,3'端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质。如大肠杆菌乳糖操纵子mRNA编码3条多肽链;色氨酸操纵子mRNA编码5条多肽链。也有单顺反子形式的细菌mRNA,如大肠杆菌脂蛋白
关于多肽链的一级结构加工修饰介绍
⑴N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端甲酰蛋氨酸是多肽链合成的起始氨基酸,必须在多肽链折迭成一定的空间结构之前被切除。 其过程是: ① 去甲酰化; ② 去蛋氨酰基。 ⑵氨基酸的修饰:由专一性的酶催化进行修饰,包括糖基化、羟基化、磷酸化、甲酰化等。 ⑶二硫键的形成:由专一性的氧化酶催化,将
关于蛋白质结构的结构种类概述
蛋白质分子是由氨基酸首尾相连缩合而成的共价多肽链,但是天然蛋白质分子并不是走向随机的松散多肽链。每一种天然蛋白质都有自己特有的空间结构或称三维结构,这种三维结构通常被称为蛋白质的构象,即蛋白质的结构。 蛋白质的分子结构可划分为四级,以描述其不同的方面: 一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸
关于蛋白质结构的结构测定介绍
专门存储蛋白质和核酸分子结构的蛋白质数据库中,接近90%的蛋白质结构是用X射线晶体学的方法测定的。X射线晶体学可以通过测定蛋白质分子在晶体中电子密度的空间分布,在一定分辨率下解析蛋白质中所有原子的三维坐标。大约9%的已知蛋白结构是通过核磁共振技术来测定的。该技术还可用于测定蛋白质的二级结构。除了
关于蛋白质结构的结构预测介绍
测定蛋白质序列比测定蛋白质结构容易得多,而蛋白质结构可以给出比序列多得多的关于其功能机制的信息。因此,许多方法被用于从序列预测结构。 一、二级结构预测 二、三级结构预测 同源建模:需要有同源的蛋白三级结构为基础进行预测。 Threading法。“从头开始”(Ab initio):只需要蛋
蛋白质根据蛋白质结构进行分类
纤维蛋白(fibrous protein):一类主要的不溶于水的蛋白质,通常都含有呈现相同二级结构的多肽链许多纤维蛋白结合紧密,并为单个细胞或整个生物体提供机械强度,起着保护或结构上的作用。球蛋白(globular protein):紧凑的,近似球形的,含有折叠紧密的多肽链的一类蛋白质,许多都溶于水
蛋白质立体结构原则
1.由于C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”,使肽键具有部 分双键的性质,不能自由旋转。 2.与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构,称为肽单元或肽键平面。但由于α-碳原子与其他原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。此单键的旋
蛋白质整体的结构
蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物大分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。 一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,以及二硫键的位置。 二级结构:蛋白质分子局区域内,多肽