知识分享:去泛素化酶(DUBs)家族专题介绍
去泛素化酶(DUBs),是一类数量很大的蛋白酶类家族。它主要通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来。人类基因组编码近100种去泛素酶,使得它们成为泛素系统酶中最大家族。在人类中的去泛素化酶基因,可分为两大类:半胱氨酸蛋白酶家族和金属蛋白酶家族。半胱氨酸蛋白酶家族包含一些泛素特异型加工蛋白酶(USPs),泛素羧基末端端水解酶(UCHs),Machado-Josephin结构域蛋白酶(MJDS)和卵巢肿瘤相关蛋白酶(OTU)。金属蛋白酶家族只包含MPN(+)/JAMM蛋白酶家族。 去泛素化酶在泛素化途径中扮演重要的角色,在泛素-蛋白酶系统中已泛素化的蛋白底物,通过裂解切断泛素链与底物蛋白之间的连接及泛素化链之间的连接,使泛素分子从蛋白质底物中脱离出来。 А -泛素化蛋白质(在泛素-蛋白酶体系统中蛋白质正在降解),В,D -与完全除去泛素分子的蛋白质,......阅读全文
关于泛素缀合酶的分类介绍
泛素结合酶E2可以被进一步分为四个类:有些仅仅有UBC结构域组成E2为第Ⅰ类,他们需要E3来进行底物识别;除了核心结构域之外,C末端具有延伸部分的属于第Ⅱ类;N末端具有延伸部分的属于第Ⅲ类;C末端和N末端都有延伸区域的归为第Ⅳ类 。
我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制
12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
泛素化的过程
具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(蛋白
什么是泛素化
是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素-蛋白酶体途径是先发现的,也是较普遍的一种内源蛋白降解方式。需要降解的蛋白先被泛素化修饰,然后被蛋白酶体降解。不过后来又发现,并非所有泛素化修饰都会导致降解。有些
什么是泛素化
是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素-蛋白酶体途径是先发现的,也是较普遍的一种内源蛋白降解方式。需要降解的蛋白先被泛素化修饰,然后被蛋白酶体降解。不过后来又发现,并非所有泛素化修饰都会导致降解。有些
什么是泛素化
是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素-蛋白酶体途径是先发现的,也是较普遍的一种内源蛋白降解方式。需要降解的蛋白先被泛素化修饰,然后被蛋白酶体降解。不过后来又发现,并非所有泛素化修饰都会导致降解。有些
泛素化的过程
具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(蛋白
泛素化具体过程
具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(蛋白
去泛素化酶USP3稳定KLF5蛋白促进三阴性乳腺癌细胞生长
10月17日,Journal of Biological Chemistry 期刊以USP3 promotes breast cancer cell proliferation by deubiquitinating KLF5 为题,在线发表了中国科学院昆明动物研究所陈策实组的研究成果。该研究揭
关于U.box结构域家族的泛素连接酶E3介绍
U—box家族的泛素连接酶E3是真核细胞蛋白质翻译后质量控制所必需的。此类蛋白质的c端都包含一个大约70个氨基酸残基的从酵母菌到人类具保守性的U—box结构域,U—box的三维结构类似于RING结构域家族泛素连接酶E3s的RING结构域,是此类型的泛素连接酶酶活性所必需的。U—box蛋白家族的泛
关于泛素化的基本信息介绍
泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。这些特殊的酶包括泛素激活酶、结合酶、连结酶和降解酶等。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用。同时,它也参与了细胞周期、增殖、凋
泛素化的蛋白质降解介绍
泛素-蛋白酶体途径是先发现的,也是较普遍的一种内源蛋白降解方式。需要降解的蛋白先被泛素化修饰,然后被蛋白酶体降解。 不过后来又发现,并非所有泛素化修饰都会导致降解。有些泛素化会改变蛋白的活性,导致其他的生物效应,如DNA损伤修复,机体免疫应答等。
关于泛素化的重要作用介绍
p53稳定性的变化与其功能调解密切相关 ,严密调节p53的代谢稳定性对正常细胞的生长发育非常重要。p53为一段半衰期转录因子 , p53蛋白的转换由泛素依赖的蛋白水解途径调节[3]。本研究结果表明 ,p53N端与降解有关的片段不能与其转录活性片段相分离 ;抑制或破坏泛素蛋白酶体水解通路对转录反应
关于单泛素化修饰的基本介绍
单泛素化修饰是一种调节信号可以引起靶蛋白的活性、定位以及蛋白质结构的改变从而对蛋白质的胞吞途径、膜泡的出芽、组蛋白的修饰、基因的转录以及蛋白质核内的定位进行调节。单独的泛素本身并没有任何生物功能,它只是一种分子标记蛋白,发挥作用必须在ATP提供能量的前提下依靠泛素途径的相关酶类及蛋白酶体。Gua
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应,等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外,甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
泛素活化酶的基本信息介绍
中文名称泛素活化酶英文名称ubiquitin-activating enzyme定 义编号:EC 6.3.2.19。泛素化级联反应中的第一个酶(E1)。在MgATP存在下,一个分子泛素(Ub)被腺苷酸化形成AMP-Ub,通过非共价键与E1结合,而另一分子Ub的C端甘氨酸(G76)的羧基与E1中的—
泛素化研究取得进展
泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中起重要作用,同时参与细胞周期、增殖、凋亡、分化、转移等几乎一切生命活动的调控。泛素化与肿瘤、心血管等疾病的发病密切相
泛素化的过程问题
泛素化是对特异的靶蛋白进行泛素修饰的过程。一些特殊的酶将细胞内的蛋白分类,从中选出靶蛋白分子。泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部的Cys残基上(在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接
简述泛素化的类型
E1,E2,E3对底物的泛素化可形成几种不同的泛素化底物。有的底物蛋白只能被单泛素化,如H2B;有的底物蛋白有多个赖氨酸残基,在合适条件下会被多位点单泛素化;还有一些蛋白在单个赖氨酸位点会形成多聚泛素链,这种多聚泛素链可以根据连接泛素链的赖氨酸位点的不同可以分为单一、混合以及树枝状的结构。
泛素化的主要作用
泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程。这些特殊的酶包括泛素激活酶、结合酶、连结酶和降解酶等。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用。同时,它也参与了细胞周期、增殖、凋亡、
泛素化的主要类型
E1,E2,E3对底物的泛素化可形成几种不同的泛素化底物。有的底物蛋白只能被单泛素化,如H2B;有的底物蛋白有多个赖氨酸残基,在合适条件下会被多位点单泛素化;还有一些蛋白在单个赖氨酸位点会形成多聚泛素链,这种多聚泛素链可以根据连接泛素链的赖氨酸位点的不同可以分为单一、混合以及树枝状的结构。
我国学者揭示去甲基化酶KDM6家族调控人神经作用机制
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院潘光锦课题组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为JMJD3 and UTX determine fidelity and lineage specification of human neural progenitor
什么是泛素结合酶?
泛素结合酶,也称为E2酶,极少数情况下也称为泛素载体酶 (ubiquitin-carrier enzymes),执行泛素化反应的第二步,该反应可以通过蛋白酶体降解靶蛋白 。
关于泛素活化酶的基本信息介绍
泛素活化酶,也称为E1酶,催化泛素化反应的第一步,该反应可以通过蛋白酶体针对蛋白质进行降解。泛素或泛素样蛋白与靶向蛋白的共价键是真核生物调控蛋白功能的主要机制。许多过程如细胞分裂、免疫反应和胚胎发育也受到泛素和泛素样蛋白翻译后修饰的调控。
知识分享:肿瘤相关基因
癌基因(英语:Oncogene,亦称为致癌基因)是细胞遗传物质的一部分, 它们参与细胞从正常生长状态到肿瘤的过程。它们通过诱导或突变被激活。 致癌基因 原癌基因是参与细胞生长、细胞分裂和细胞分化的正常基因。但当其发生突变后,就会变成致癌基因。它们会在诸如放射性物质,化学物
射频知识分享:调试篇
导语射频产品设计,在经历前期的器件选型,原理图绘制,LAYOUT相关阻抗控制等一系列工作后,当第一版样机出来之后,射频指标的调试,也是整个射频产品开发中比较重要的一个环节。射频指标调试,是基于射频产品开发初期,我们在开发方案射频指标理论值估算的基础上,通过调试让实际测试指标更接近我们理论值,从而实现
知识分享:基因定点突变
实验原理 基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。 定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择3
OTUB6D基因突变可导致智力和身体双重残疾
世界各地的国际研究团体首次报道OTUD6B基因与人类疾病相关。研究发现,一个名为OTUD6B的基因如果突变会导致一连串的机体和智力不足。 文章的第一作者Teresa Sim博士是临床分子遗传学和基因组学的分子和人类遗传学博士后学者。他说,在我们的身体和智力双残疾(智力障碍混合癫痫症和Pitt-
袁钧瑛院士eLife发表新成果
现任职于中科院上海有机化学研究所和哈佛医学院的袁钧瑛(Junying Yuan)教授多年从事于细胞凋亡机制的研究,是世界细胞凋亡研究领域的开拓者之一,并且是世界上第一个细胞凋亡基因的发现者。该发现为世界细胞凋亡研究领域奠定了研究基础,引发了世界上众多的实验室从不同的角度开始对细胞凋亡进行系统的研
“排毒”很重要有的虫全面开启“排毒模式”后,生生延寿21%
蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分,但常言道,“过满则亏,过犹不及”,机体内蛋白质过量的可能会造成大问题,比如增加患癌风险,以及让人们“老”得更快。 顶级期刊《Nature》发布了一篇题为Rewiring of the ubiquitinated proteome determines