我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制

12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substrate Specificity of KDM5 Subfamily Histone Demethylases为题,在线发表在The Plant Cell上,该研究利用结构生物学、生物化学和细胞生物学等手段,揭示了KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制。图片来源于网络 组蛋白修饰在生物体生长发育过程中发挥着重要作用,与基因沉默、基因激活、肿瘤生成、染色体形态建成以及遗传物质修复等生物学问题密切相关。对其分子机制的研究为探索生命本质以及开发相应的靶点药物提供了理论依据。 以往研究表明,拟南芥JMJ14是一个含有jumonji结构......阅读全文

我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制

  12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr

去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制

研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制   11月10日,Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。   人和酵母等真核生物中存在一类含有

上海生科院揭示甲基化酶TrmJ对底物tRNA的识别机制

  7月21日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组题为tRNA recognition by a bacterial tRNA Xm32 modification enzyme from

研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制

活性氧作为重要的信号分子,在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中,过氧化氢具有较长的半衰期,可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程,但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用,共同调控植物发育过程却不甚清楚。中

遗传发育所发现植物组蛋白去甲基化酶招募的新机制

  核小体作为真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白N端存在多种共价修饰,这些翻译后修饰通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及发育中起着重要的调控作用。实验室前期研究

伊成器等学者解析去甲基化酶底物特异性的分子机制

          核酸的可逆化学修饰对细胞命运的调控具有重要作用。E. coli AlkB蛋白是首个核酸氧化去甲基化酶,通过识别并作用于1-甲基腺嘌呤这一类型的DNA/RNA损伤来维持基因组的稳定性。目前已发现9 个AlkB的人类同源蛋白,其中许多蛋白对细胞生命活动的维持都起到重要作用。例

研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能

  3月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3

DNA去甲基化酶催化作用介绍

DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应,等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外,甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。

DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制

  7月14日,国际学术期刊《细胞-报告》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果:TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。

DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制

  9月28日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting

郑辉课题组揭示阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用机制

  3月17日,中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d

DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制

  国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DO

阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用新机制被发现了

  3月17日,中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d

我国学者揭示去甲基化酶KDM6家族调控人神经作用机制

  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院潘光锦课题组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为JMJD3 and UTX determine fidelity and lineage specification of human neural progenitor

面部识别的机制

  一项研究提出,面部识别是由专门用于面部的大脑机制执行的,而且一套不同的机制则可能被用于处理一个人学会识别的其他对象。人们已经提出了面部识别机制的两个假说。面部特异性假说提出,面部识别机制仅由面部激发,而专门技能假说提出,个人熟悉或者获得了专门技能的其他视觉刺激也可能让面部识别机制发挥作用。对这个

中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构

  2014年3月10日,在百年老牌杂志《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemistry)发表的一项最新研究中,中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员,报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教

上生科院揭示DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制

  7月14日,国际学术期刊《细胞-报告》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果:TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。

揭示重要免疫识别机制

揭示重要免疫识别机制  我们的免疫传感系统可通过病毒核糖核酸的某些特定的特征来检测到诸如流感一类的病毒。但以往并不清楚免疫系统防止病毒穿上分子伪装来逃避检测的机制。  现在由波恩大学医院和伦敦研究所的研究人员组成的一个国际研究小组发现,我们的免疫传感系统在分子水平上对病毒发动了攻击。通过这

科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理

   11月21日,肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题,解析了组蛋白去甲基化酶(KDM4B)在肿瘤中所扮演的新角色,从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular

Oncogene:组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解

  糖酵解途径(glycolysis)是肿瘤细胞中重要的能量来源途径,然而,目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解,还十分有限。来自厦门大学生命科学学院,南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶,它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平,从而影响酶

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用

  文章导读   表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

我科学家发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理

陈德桂研究组发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理  继4个月前生化与细胞所陈德桂研究组与景乃禾研究组合作发表一个新的组蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的发现及其在胚胎干细胞神经分化过程中的功能,及两周前陈德桂研究组与基因敲除与转基因小鼠平台合作发表另一个新的组蛋白去

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(二)

4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内,发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组,并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低,敲

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(一)

文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK

研究人员揭示ALKBH1对非配对DNA-6mA去甲基化的结构基础

  DNA 6mA(N6-甲基腺苷)作为DNA的第二种修饰形式,是哺乳动物基因组表观遗传调控的重要组成。基因组6mA的水平在生物体内具有调节组织发育、性别比例、基因表达、X染色体失活等多种作用,阐明其调控机制是解码这一新型修饰碱基生物学功能的关键。2016年,耶鲁大学Andrew Xiao首次报道A

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

简述熊去氧胆酸的作用机制

  胆汁淤积性肝病与鹅去氧胆酸、去氧胆酸和石胆酸的积聚有关,这些胆酸由于去垢作用而引起肝细胞损害。UDCA是一种无毒性的亲水胆酸,能竞争性地抑制毒性内源性胆酸在回肠的吸收。通过激活钙离子、蛋白激酶C组成的信号网络,并通过激活分裂活性蛋白激酶来增强胆汁淤积肝细胞的分泌能力,使血液及肝细胞中内源性疏水胆

概述熊去氧胆酸的作用机制

  1、熊去氧胆酸(3α,7β-二羟基-5β-胆烷酸,UDCA)是一种二羟基胆酸,在人类总胆汁中占3%。最早由日本冈山大学的Shoda从中国熊胆汁中分离而命名,1985年Leuschner等用其治疗合并肝炎的胆结石时发现血清转氨酶降低,此后大量临床研究也证实了UDCA对一些肝病有确切的治疗作用。现将