解析肿瘤HiC多组学研究策略,IF≥10+文章不是梦!

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等数据进行联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。 今天,小编以一篇经典文献带您了解Hi-C技术在疾病发生机制中的应用。 题目:Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells 期刊:Genome Biology 影响因子:......阅读全文

解析肿瘤HiC多组学研究策略,IF≥10+文章不是梦!

   Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Se

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

研究提出单细胞多组学新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/INDEL)及染色质三维构象,实现高分辨率、多维度的联合分析。胰腺癌异质性强、进展迅速,临床面临早筛困

“交换身体”不是梦

  图片显示了身体交换实验的设置   图片来源:Mattias Karlen “当我还是个孩子的时候,我喜欢想象有一天在别人的身体里醒来会是什么样子。”瑞典卡罗林斯卡学院博士后研究员Pawel Tacikowski说,“很多孩子可能都有这样的幻想,我猜自己一直都没有摆脱它——我只是把它变成了

验血测癌不是梦

  一个研究团队朝癌症研究领域最热门的目标之一 ——通过验血及早发现肿瘤——迈出了重要一步。他们的最新测试分析了血液中同癌症相关的DNA和蛋白质,并且在检测肿瘤尚未扩散的1000多位病人所患的8种常见癌症时获得阳性结果的概率在70%左右。对于通用的癌症血液测试来说,这是最好的表现之一。新的血液测试寻

验血测癌不是梦

  新的血液测试寻找肿瘤细胞脱落的DNA。图片来源:Anne Weston/Cancer Research UK/Visuals Unlimited, Inc  一个研究团队朝癌症研究领域最热门的目标之一 ——通过验血及早发现肿瘤——迈出了重要一步。他们的最新测试分析了血液中同癌症相关的DNA和蛋白

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

也许长生不老不是梦!

  加州大学圣地亚哥分校的分子生物学家和生物工程师揭示了衰老之谜背后的关键机制:他们分离了细胞在衰老过程中的两种不同途径,并设计了一种新的方式对这些过程进行基因编程以延长寿命。图片来源于网络  这一研究成果7月17日公布在Science杂志上。  我们人类的寿命取决于单个细胞的衰老。为了了解不同的细

未来-心脏再生或不是梦!

  【1】eLife:心肌细胞为何不能再生?  DOI: 10.7554/eLife.05563  人类和其他所有哺乳动物在出生后不久,大部分心肌细胞复制能力就消失。这个过程是如何发生以及是否能够恢复这种能力甚至再生心肌细胞,这些问题的解答都仍然未知。最近发表在eLife上的一篇研究中,德国的一群科

Science新文章:解析肿瘤的复杂异质性

  来自Broad研究所和麻省总医院(MGH)的科学家们完成了一项开创先河的研究,描绘出了来自患者的胶质母细胞瘤内部的细胞多样性特征。这项研究检测了来自患者肿瘤的单个细胞中成千上万基因的表达,揭示出每个肿瘤的细胞组成比以往预测的更具有异质性。这些在线发表在《科学》(Science)杂志上的研究结果,

-NIBS董梦秋研究组-解析衰老机制

  北京生命科学研究所董梦秋研究组致力于衰老过程及其调控机制等方面的研究(专访董梦秋:学科交融,思想交融的结晶),近期其研究组与其他研究组合作接连发表文章,分别解析了秀丽线虫衰老有关的两个蛋白:PUD-1 和 PUD-2的生物学功能,以及钙离子/钙调素依赖性蛋白激酶II(CAMKII)和蛋白磷酸

植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

穿上外骨骼,摆脱轮椅不是梦

  过去,很多人一瘫痪就要一辈子依靠轮椅。外骨骼的出现,改变了重症肢体残障人士几乎无法行走的困境。当人体骨骼、肌肉的功能缺失时,外骨骼提供了如骨骼一样的支撑、像肌肉一样的驱动源。  近日,借助自研的人体外骨骼,身患脆骨症的“扭扭车男孩”张亮第一次站起来了!他走了16米,花了大约5分钟。“视角变高带来

Nature:摆脱过敏,或不是梦

  来自美国斯坦福大学医学院和瑞士伯尔尼大学的研究人员在新研究中证实一种人造分子可破坏引起过敏性反应的复合物,并揭示了相关机制,这一研究发现有可能导致开发出针对许多急性过敏性反应高效、快速的干预治疗。这一研究在线发表在10月28日的《自然》(Nature)杂志上。   新的抑制剂通过分离急性过敏的

三维基因组(HiC)技术解析

  Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq

三维基因组(HiC)技术解析

  Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq

三维基因组(HiC)技术解析

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

华裔研究组最新文章解析哮喘

  来自马里兰大学马里兰病原体研究所等处的研究人员发表了题为“Inhibition of CD23-mediated IgE transcytosis suppresses the initiation and development of allergic airway inflammation”

研究提出多组分钙钛矿结晶同步化调控策略

全钙钛矿叠层太阳能电池是下一代高效光伏技术的重要发展方向。该类电池由宽带隙和窄带隙钙钛矿子电池组成,吸光层体系包含多种卤素离子或金属离子。多组分特征使不同前驱体物种在成膜过程中容易出现成核和结晶速率不匹配,导致垂直组分分布不均、晶格应力积累、缺陷形成和非辐射复合增强,制约器件效率和稳定性提升。近期,

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

复旦大学等处发表Nature文章-解析肝癌蛋白质组学研究

  肝癌是全世界造成癌症死亡的第三大杀手,更是有中国特色的一种癌症。诱发肝癌的因素很多,包括病毒、环境和遗传因素的共同作用。在我国,肝癌发生的最大危险因素之一是乙肝病毒感染。  来自复旦大学附属中山医院,军事医学科学院的研究人员发表了题为“Proteomics identifies new ther

我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络

近日,中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者,通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》(Plant Cell)。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状,其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来,穗发育过程中基因表达动态、代谢变

北大教授最新文章解析癌症表观遗传学

  来自北京市肿瘤防治研究所,北京大学肿瘤医院病因研究室的研究人员在之前研究的基础上,展开了胃癌发生发展相关DNA甲基化组扫描,进行了所获90余个基因的DHPLC大规模研究,在中日韩三国验证队列中证明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等恶性肿瘤的转移标志物。就此

地质氢:未来的绿能不是梦

提取地下氢气用作清洁燃料,这一尝试得到了美国能源部的大力推动,能源部下属高级能源研究计划署(ARPA-E)9月初宣布,将提供2000万美元资金用于推进地下矿物生产氢(所谓“地质氢”)的技术。英国《新科学家》杂志网站在近日的报道中指出,短短一年时间,地质氢从科学边缘走到清洁能源的舞台中央,引发了不少初

Google高管:活到500岁不是梦

  风投机构Google Ventures一直投资诸如Ube和Nest之类的高科技公司,但占其投资比例最大的是科学,尤其是肿瘤学。Google Ventures的合伙人兼总裁Bill   Maris在接受彭博社的采访时说到:“如果你今天问我,人类是否有可能活到500岁?我的答案是Yes。”  

8周“年轻”3岁的不是梦!

  近期,一项发表在抗衰老研究领域知名期刊Aging的随机对照研究表明,通过平衡DNA甲基化,特定的饮食和生活方式干预可能逆转健康成年男性的表观遗传衰老,8周内受试者的生物学年龄年轻了3岁以上。  图片来源:Aging官网  该研究由美国功能医学研究所(The Institute for Funct

地质氢:未来的绿能不是梦

提取地下氢气用作清洁燃料,这一尝试得到了美国能源部的大力推动,能源部下属高级能源研究计划署(ARPA-E)9月初宣布,将提供2000万美元资金用于推进地下矿物生产氢(所谓“地质氢”)的技术。  英国《新科学家》杂志网站在近日的报道中指出,短短一年时间,地质氢从科学边缘走到清洁能源的舞台中央,引发了不