质谱法进行高通量蛋白鉴定的主要方法介绍
蛋白质组(Proteome)指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定,可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析(如Edman降解法)费时费力、通量低,存在不容易实现规模化和自动化,结果灵敏度差等问题。当前主流的基于软电离技术的液相色谱-质谱系统(LC-MS/MS)是实现高通量蛋白鉴定的主要方法。 其基本原理是:首先将纯化后的蛋白质用消化酶(如胰酶)水解成肽段,肽段混合物经过除盐后首先进入液相色谱,实现初步分离,以降低样品复杂度。经液相色谱分离后的肽段先经过质谱的第一级--离子源(ESI,MALDI)使肽段离子化并形成分散的离子。接着选择部分强度较高的肽段母离子进入质谱的第二级系统(碎裂源)做进一步碎裂,使肽段离子被打碎成更小的、有规律的碎片离子。理论上蛋白质序列经过酶解后形成......阅读全文
利用化学方法对胶原蛋白进行改性
化学方法比物理方法改性交联度高,且能获得均匀一致的交联,对调节、控制胶原的各性质均有效。已广泛应用于各种化学试剂交联胶原,以提高其交联度、力学性能及生物相容性。化学改性法具体又可分为使用化学试剂交联、侧链的修饰、生理活性物的固定化三种方法。 化学试剂交联法中常用的化学交联剂有戊二醛、己异二氰酸
相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(LacZ的活性分析)
实验方法原理捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为一种稳定蛋
大豆高蛋白主要控制基因的鉴定和分析获新进展
6月1日,一支国际联合团队在大豆高蛋白主要控制基因的鉴定和分析取得新进展,相关研究成果发表于《自然·通讯》(Nature Communications)。中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员张恒友为论文共同第一作者。 联合团队的研究利用经典连锁QTL分析结合基因组测序数据联合分析,鉴定到位于
凯氏定氮法进行蛋白质分析的主要步骤
操作方法 1、 样品处理:精密称取0.2-2.0g固体样品或2-5g半固体样品或吸取10-20ml液体样品(约相当氮30-40mg),移入干燥的100ml或500ml定氮瓶中,加入0.2g硫酸铜,6g硫酸钾及20毫升硫酸,稍摇匀后于瓶口放一小漏斗,将瓶以45度角斜支于有小孔的石棉网上,小火加热,待
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
临床化学检查方法介绍细菌的鉴定介绍
细菌的鉴定介绍: 细菌的鉴定是对细菌进行各方面的检查。例如:细菌对于碳水化合物的代谢试验、吲哚试验、淀粉的水解等各种试验。细菌的鉴定正常值: 胃肠道的正常菌群可分为需氧菌、兼性厌氧菌和厌氧菌。最居优势的是厌氧菌,占菌群总数的99%,其中仅类杆菌和双歧杆菌就占90%,而乳杆菌和双歧杆菌可与我们终
高通量组织研磨器的-主要特点
1、研磨器具有自锁装置可以防止适配器在粉碎过程中松开脱落; 2、当需要低温研磨环境,可将放有样本的适配器浸入液氮中冷却1-2分钟,取出后移至主机快速固定即可开始研磨,不需要进行再次冷冻处理,节省液氮。 3、不易导致交叉污染,使用封闭式一次性离心管; 4、高重复性,同一组织样本设定相同程序,获得
Rh系统血型鉴定如何进行
红细胞Rh表型可用特殊的具有抗D、C、c、E和e抗血清检测来鉴定。虽然Rh血型系统中有许多种抗原,但常规只用抗D血清检查有无D抗原。 1.低离子强度盐水试验:可提高抗D抗体与D阳性红细胞结合率,并提高其灵敏度。 2.酶介质法:木瓜酶或菠萝蛋白酶可以破坏红细胞表面的唾液酸,使红细胞膜失去电荷,
Rh系统血型鉴定如何进行?
红细胞Rh表型可用特殊的具有抗D、C、c、E和e抗血清检测来鉴定。虽然Rh血型系统中有许多种抗原,但常规只用抗D血清检查有无D抗原。1.低离子强度盐水试验:可提高抗D抗体与D阳性红细胞结合率,并提高其灵敏度。2.酶介质法:木瓜酶或菠萝蛋白酶可以破坏红细胞表面的唾液酸,使红细胞膜失去电荷,缩小红细胞间
蛋白质的主要特性介绍
两性蛋白质是由α-氨基酸通过肽键构成的高分子化合物,在蛋白质分子中存在着氨基和羧基,因此跟氨基酸相似,蛋白质也是两性物质。水解反应蛋白质在酸、碱或酶的作用下发生水解反应,经过多肽,最后得到多种α-氨基酸。蛋白质水解时,应找准结构中键的“断裂点”,水解时肽键部分或全部断裂。胶体性质有些蛋白质能够溶解在
利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料:修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒:消化缓冲液 萃取液
利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝 G-250
利用纳升级液相色谱--串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料 修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒 消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材 多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤 3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝
临床化学检查方法介绍血型鉴定介绍
血型鉴定介绍: 血型鉴定是是根据人体血液中含有的血型抗原来分类的,常见的有A型,B型,O型及AB型,此外还存在RH等特殊血型。血型鉴定正常值: 根据现象判断检查者的血型。血型鉴定临床意义: 血型鉴定主要用于: (1) 临床输血:当循环血量不足或大失血或贫血需进行输血治疗,在输血前必须先选择血
实验室分析方法快原子轰击质谱法方法介绍
由子快原子轰击是一种软电离技术,被分析样品无需经过气化而直接电离,所以,快原子轰击质谱法常用于分析 极性强、不易气化和热稳定性差的样品。FAB:是一种广泛应用的软电离技术。快原子轰击利用的重原子一般为 Xe 或 Ar。Ar+(高动能的) + Ar(热运动的) ——> Ar(高动能的) + Ar+(热
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大
质谱法的的方法特点及应用目的
质谱法(Mass Spectrometry,MS)即用电场和磁场将运动的离子(带电荷的原子、分子或分子碎片,有分子离子、同位素离子、碎片离子、重排离子、多电荷离子、亚稳离子、负离子和离子-分子相互作用产生的离子)按它们的质荷比分离后进行检测的方法。测出离子准确质量即可确定离子的化合物组成。这是由于核
关于硫化物的鉴定方法介绍
点滴法是鉴定硫离子和硫氢根离子的灵敏方法,其步骤为:在点滴板上混合可溶硫化物的碱性溶液和1%的硝普酸钠Na2[Fe(CN)5NO](亚硝基铁氰化钠)溶液,若试样中存在S离子则会出现不同深度的红紫色,灵敏度1:50000。其机理是[Fe(CN)5(NOS)]4-离子的生成。 除此之外,向点滴板中加
关于军团菌的鉴定方法介绍
1. 细菌培养法 军团菌为革兰氏阴性杆菌,专性需氧,胞内寄生菌。军团菌最初是从以军团菌病人肺组织感染的豚鼠中分离出来的。这种方法虽然有较高的可靠性,但非常昂贵,而且费时费力,不久就被平板培养法所取代 [3] 。目前标准培养基为活性碳酵母浸膏琼脂平板,也称军团菌生长平板(BCYE)。接种在 BC
关于志贺菌属的鉴定方法介绍
挑选可疑菌落3~4个先用志贺菌属多价诊断血清作试探性玻片凝集试验。将试探性凝集试验阳性的菌落至少接种2~3支KIA和MIU,经35 ℃培养18~24h,凡符合;KIA:K/A、产气-/+、H2S-;MIU:动力-、吲哚+/-、尿酶-,并结合试探性玻片凝集试验阳性结果可鉴定为志贺菌属。
关于操纵基因的鉴定方法介绍
DNA上蛋白质的结合部位,如一种操纵基因,如何能够鉴定出来呢? 原来操纵基因是靠阻遏物的专一结合以免除核酸酶(nuclease)的攻击的,通过DNA片段的分离与序列测定,即可确定其结构。但是这是一件极吃力的工作。利用限制性内切酶可以确切分离出蛋白质所接触的部位的片段,就可以鉴定操纵基因的结构,
高通量新方法鉴定二甲双胍作用的关键细菌效应因子
微生物在宿主健康的调控过程中起着关键作用,诸如药物和饮食等环境因素可以改变微生物的生态和功能,进而对宿主健康产生重要影响【1】。二甲双胍(metformin)是治疗2型糖尿病最常用的药物,另外二甲双胍还可以增加2型糖尿病患者的生存。它以一种进化上保守的方式与微生物互作,进而调控宿主生理【2】。另
细菌鉴定仪的主要特点
◇快速读取结果 鉴定板由读数仪自动读取吸光值,软件将该吸光值与数据库对比,就可在瞬时给出鉴定结果。试验结果可由系统进行自动分析、记录和打印。 ◇强大的数据库 Biolog微生物鉴定数据库容量是目前世界上最大的,可鉴定包括细菌、酵母和丝状真菌在内总计1973种微生物,几乎涵盖了所有的人类、动
应用原代细胞进行高通量复杂炎症分析(二)
抗炎化合物抑制黏附分子潜在抗炎化合物比较多通路炎症实验高通量实验评估抗炎化合物效力总结- 我们通过检测标记抗体与粘附分子的结合,可以有效的评估抗炎化合物的效能。- 我们已经测试了多种炎症因子和抗炎药物组合对HUVEC细胞的不同处理条件下,细胞炎症标记,如VCAM,E-selectin,HLA-DR,
应用原代细胞进行高通量复杂炎症分析(一)
前言炎症反应的一个重要步骤是细胞表面抗原与血管中免疫细胞的特异性结合。因此,对这些分子变化的及时监控,如VCAM,E-selectin,以及内皮细胞上的HLADR等等,可以为细胞水平的炎症模型提供有效的生理指标上的支持。我们用多通道荧光读取人原代细胞表面的炎症标记,并在此基础上评估不同介质对炎症反应
关于皮肤干细胞的标志鉴定角蛋白的介绍
角蛋白是表皮细胞的结构蛋白,随着分化程度的不同,表皮细胞表达不同的角蛋白,因而可用于鉴别表皮干细胞、短暂增殖细胞和终末分化细胞。表皮干细胞表达角蛋白19;短暂增殖细胞表达角蛋白5和14;终末分化细胞表达角蛋白1和10。一般认为皮肤基底层、毛囊隆突部干细胞角蛋白19表达阳性,但有毛发皮肤基底层的表
中科院Nature开源性刊物发表蛋白质研究新技术
来自中科院大连化学物理研究所的研究人员开发一种新型的同位素标记策略,可对6种不同的蛋白质样品进行可靠标记并进行同时定量。并证实这一策略适用于高通量检测蛋白质周转(turnover)动态。这一研究成果发表在国际著名刊物Nature旗下开源性刊物Scientific Reports上。 中
蛋白质分离纯化主要方法
分离纯化某一特定蛋白质的一般程序可以分为前处理、粗分级、细分级三步。1.前处理:分离纯化某种蛋白质,首先要把蛋白质从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出来并保持原来的天然状态(如果做不到呢?比如蛋白以包涵体形式存在),不丢失生物活性。为此,动物材料应先提出结缔组织和脂肪组织,种子材料应先去壳甚至去种
M蛋白的检测与鉴定
一、M蛋白的基础知识 M蛋白是浆细胞或B淋巴细胞单克隆大量增殖时所产生的一种异常免疫球蛋白,其氨基酸组成及排列顺序十分均一,空间构象、电泳特征也完全相同,本质为免疫球蛋白或其片段(轻链、重链等)。由于它产生于单一克隆,又常出现于多发性骨髓瘤、巨球蛋白血症、恶性淋巴瘤病人的血或尿中,故称M蛋白。这