使用GWAS研究鸡攻击行为的相关基因

研究背景 攻击行为是很多物种共有的进化属性,它可以帮助雄性物种快速建立生存空间或社会主导地位。然而可想而知,这种属性在禽类的饲养中是十分不利的。之前已有一些研究表明鸡的攻击行为可由遗传因素导致,并估计了遗传力大小约为0.57,说明群体中一半以上的攻击行为是由遗传导致的。研究人员试图使用GWAS方法来探究攻击行为背后的遗传因素,以期改善养殖效率和动物福利。本文是第一篇使用GWAS方法来研究鸡攻击行为的文章。 研究思路 研究结果 研究共使用了265只雄性家鸡,在出生第60天时开始测量攻击性状,共4个,分别为T1:在记录期间(16天)内打斗的次数;T2:每天打斗的次数(超过4次则被记录);T3:打斗的天数;T4:超过4次打斗的天数。基因分型工作由上海伯豪完成,使用了Affymetrix Axiom平台的高密度芯片,型号为600K Affymetrix Axiom HD chicken genoty......阅读全文

Nature:GWAS寻找对花生过敏的答案

  近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究论文中,来自约翰霍普金斯大学的研究人员通过对美国儿童进行全基因组关联性研究(GWAS)分析,鉴别出了其对花生过敏的特殊基因簇;Xiaobin Wang教授说道,我们一直猜测存在某些基因使得个体对花生过敏,而如今我们通过进行

心理所发现与精神分裂症相关的生物通路

  全基因组关联学习(Genome-Wide Association Study, GWAS)已被广泛应用于包含精神类疾病在内的多种复杂疾病的易感位点挖掘与研究。然而,由于常规的GWAS分析方法通常只关注单个SNP(single nucleotide polymorphism)的统计显著性,而忽略了

我国复杂疾病全基因组关联研究取得重大进展

  全基因组关联研究(GWAS)作为揭示复杂遗传性疾病易感基因的一种行之有效的方法而备受关注,中国科学工作者利用GWAS已经成功获得了海量的遗传学数据,为揭开人类疾病的发病机制奠定了坚实的基础。   近年来,在中国人群中开展的GWAS迅速增长,中国俨然已经成为医学遗传学研究领域中的“中央王国”。首

研究掲示鸡苗“开口药”无效且有害

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506009.shtm

Nature子刊:头围多大,竟然与TP53基因有关

  近日,一项覆盖数万名儿童和成人的全基因组关联研究(GWAS)确定了与头围相关的遗传变异,涉及到TP53及其他癌症相关基因。  有一项评价宝宝身体发育的指标,就是头围大小。头围的大小不仅与颅骨的生长有关,还与大脑的发育有关。不过,这些性状背后的遗传因素还不大清楚。近日,一项覆盖数万名儿童和成人的全

健康所等研究发现多个复杂疾病的基因易感位点

  全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是一种对全基因组范围内的常见遗传变异基因总体关联分析的方法。GWAS为全面系统研究复杂疾病的遗传因素掀开了新的一页,为了解人类复杂疾病的发病机制提供了更多的线索。目前,科学家已经对糖尿病、冠心病

阿兹海默病相关的全基因座分析

2009在nature genetics的第10期同时发表了两篇阿尔茨海默氏病 (AD)的全基因组相关性研究(GWAS),两项研究集中了欧洲和部分美国的AD研究中心的大量病例,期望能检测到除APOE以外与AD相关的基因。这两项研究都发现CLU基因的一个单核苷酸多态性位点(cluster, 作用与AP

跨越精神分裂症研究的鸿沟—从基因组研究到疾病机制

  精神分裂症等精神疾病症状复杂,对其发病机制的研究较为困难。近年来,全基因组关联分析研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)报道了百余个精神分裂症显着相关的遗传位点,指向数百个基因。然而,这些易感位点大部分位于基因组的非编码区域,且由于连锁不平衡效应的存在,易感

日本研究人员发现川崎病相关基因

  日本理化研究所研究人员日前宣布,他们发现了与川崎病发病有关的基因,这一基因只要出现微小差异,川崎病的发病风险就会大幅提高。   理化研究所基因组医学研究中心发布公报说,该中心研究人员此前依靠全基因组扫描,发现有10个基因组区域与川崎病相关。在这次研究中,他们重点调查了其中的4号染色体上的区域,

美国研究发现:帕金森氏症或与免疫基因相关

  美国研究人员15日说,一个与人体免疫系统相关的基因可能在帕金森氏症病情演变过程中扮演重要角色。这项发现有可能为有效治疗这一疾病提供指导。  研究人员借助对2000名帕金森氏症患者和2000名身体健康志愿者的临床研究得出这项结论。他们发现,一个位于人类白细胞抗原基因区内的基因与帕金森氏症

研究揭示水稻抽穗相关基因促进病害越冬机制

近日,华南农业大学植物保护学院教授张彤和教授周国辉团队在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下,研究揭示了水稻条纹花叶病毒(Rice stripe mosaic virus,RSMV)劫持水稻抽穗相关基因促进其介体叶蝉越冬的机制。相关成果发表于《植物学报(英文版)》。RSMV调节水稻抽穗促

新研究确认35个慢性肾病风险相关基因

  英国曼彻斯特大学新发布的一项研究说,研究人员已发现了35个与慢性肾病发病风险相关的基因,基于这一成果未来有望开发出更好的诊断和治疗方法。图片来源于网络  鉴于肾病本身涉及很多遗传因素,长期以来学术界对相关遗传机制的不了解限制了这类疾病诊治技术的发展。由曼彻斯特大学学者领衔的国际团队所完成的新科研

美国研究人员成功解码学习能力相关基因

  生物探索网站报道 据外媒报道,有科学家称,他们组合了一条更完整的基因链条,这个基因链条可以控制鹦鹉模仿主人和其他声音的能力。   研究者用一种新技术分解了鹦鹉的基因组中的某个区域,进行了单分子测序,并用来自较早的DNA解码设备的数据对其进行了纠错。研究者还解码了来自玉米和细菌的难以测序的基因物

研究发现小细胞肺癌扩散与基因缺失相关

  在一个癌细胞数以百计的基因突变中找出导致癌症扩散的最主要基因是癌症生物研究者面临的一个主要难题。据美国物理学家组织网7月19日报道,日前麻省理工学院的科学家利用全基因组分析技术,发现了导致小细胞肺癌扩散的新基因。  小细胞肺癌是较为严重的一种肺癌,占肺癌患者的约15%,约95%的

不一样的疾病,一样的遗传变异

  在分析基因与性状之间的关联时,人们往往采用全基因组关联研究(GWAS)。不过,纽约基因组中心和23andMe的研究人员似乎并不满足于GWAS分析。他们收集了大规模研究中研究过的所有性状,想看看这些看似无关的性状之间是否存在关联。他们果然有收获,还发表在《Nature Genetics》上。  “

基因调控网络深度解读2型糖尿病发展,RFX6基因关键引领早期胰岛细胞缺陷

研究人员通过包括基因表达、遗传风险和功能数据在内的分析,已经开始揭示2型糖尿病(T2D)背后的基因调控网络,强调了转录因子编码基因RFX6的关键作用。《自然》杂志上周一报道称,研究人员依赖于细胞分类的胰岛细胞的转录组分析,再加上胰腺组织成像和胰岛细胞功能分析,对20名早期患有T2D的基因分型个体和1

黄麻耐盐适应机制和驯化历史获揭示

记者10月11日从中国农科院麻类研究所获悉,该所联合国内外3家单位,通过基因组、转录组、表观修饰组联合分析的手段,揭示了黄麻耐盐适应机制和驯化历史,并通过全基因组关联分析发现黄麻11个重要性状的候选位点。该研究为黄麻未来的耐盐等抗逆性和纤维育种提供了宝贵的遗传资源,对回顾早期作物育种的遗传基础具有重

白天爱小睡?是基因在“捣鬼”

有些人在白天会打盹,有些人在白天却如何也睡不着。近日,马萨诸塞州总医院(MGH)研究人员领导的一项发表于《自然—通讯》的最新研究表明,对于会在白天小睡的人来说,其小睡频率在一定程度上受其基因的调控。 这项新研究是类似研究中规模最大的。MGH团队联合西班牙穆尔西亚大学和其他几个研究机构的同事,确定

荟萃分析加拿大头发颜色的基因信息

  在一项针对加拿大人的新基因研究中,研究人员已经确定了许多影响金发、红色和棕色头发的候选因果变异。  人的头发颜色和其他色素沉着特征是人类基因组中的数百个区域的基因共同控制。在Communications Biology上的一项新分析中,由密西沙加多伦多大学的研究人员领导的一个团队使用与加拿大有伙

Cell颠覆干细胞认知:鸡生蛋or蛋生鸡?

  人们通常认为干细胞具有生成或替换特化细胞的内在能力。然而,纽约大学的一个生物学家小组证实,再生植株可以通过重演胚胎发育,用更成熟的细胞自然重建它们的干细胞。  “矛盾的是,这意味着在这一系统中并非干细胞直接生成植物组织,而是植物组织生成了干细胞,”研究的资深作者、纽约大学生物系副教授Kennet

全基因组研究识别出饮酒吸烟相关变异

根据《自然》近日发表的遗传学研究,在一项涉及近340万人的多血统全基因组关联研究(GWAS)中,发现了近4000个与吸烟和饮酒行为相关的遗传变异。这些发现对这类复杂行为的潜在遗传影响提供了见解。 吸烟和饮酒是多种疾病和紊乱的主要风险因素,虽然它们也受文化背景、公共健康政策等环境因素影响,有显著证

GWAS发现犬骨肉瘤的风险位点

  Broad研究院及乌普萨拉大学的研究人员通过对三个犬种进行全基因组关联分析,发现犬骨肉瘤的风险位点虽因品种不同而各异,但许多重叠在与骨形成和生长相关的通路上。这项研究成果于近日发表在《Genome Biology》杂志上。   骨肉瘤(osteosarcoma)是一种恶性程度较高的癌症,主

外显子组测序帮助发现影响总胆固醇及心肌梗死风险的...

外显子组测序帮助发现影响总胆固醇及心肌梗死风险的TM6SF2基因突变最近在Nature Genetics上发表的一篇文章1,介绍了在挪威人群样本中进行的一项外显子组水平的变异分析,发现了TM6SF2基因上的一个异义突变(p.Glu167Lys)与血液总胆固醇水平及心肌梗死发生风险相关,并对该基因进行

鸡PFK2-ELISA试剂盒使用说明

本试剂仅供研究使用目的:本试剂盒用于测定鸡血清,血浆及相关液体样本中鸡PFK2的表达。实验原理:本试剂盒采用双抗体夹心酶联免疫法(ELISA)测定标本中鸡PFK2。用纯化的鸡PFK2抗体包被微孔板,制成固相抗体,可与样品中PFK2相结合,经洗涤除去未结合的抗原和其他成分后再与HRP标记的PFK2抗体

病毒的鸡胚培养

目的意义:了解禽源病毒鸡胚培养的意义及用途掌握病毒鸡胚培养的基本方法基本原理:鸡胚培养是培养某些病毒常用方法,此方法可用于某些病毒的分离、增殖、毒力滴定、中和试验及生产疫苗等。病毒接种鸡胚的途径有多种,主要有卵黄囊接种、绒毛尿囊腔接种、绒毛尿囊膜接种、羊膜腔接种途径等,应根据需要选择适当的途径。器材

病毒的鸡胚培养

实验方法原理 羊膜腔接种主要应用于从临床材料(如患者咳嗽液等)分离流感病毒等。这种接种途径可直接感染羊膜腔的内胚层,也可被鸡胚咽下或吸入,引起全胚胎感染。另外,病毒也可被排泄到尿囊腔中,使尿囊腔中含有大量病毒。因此,在用羊膜腔接种分离病毒时,除可收获羊水以外,还可收获尿囊液。实验材料 鸡胚试剂、试剂

PLOS-Genetics:基因组研究有助于识别疾病的生活方式风险

   一种通常用于确定与疾病相关的遗传变异的研究,也能够用来识别增加疾病风险的生活方式预测因素。这是遗传学研究中经常被忽视的方面。  全基因组关联研究(GWAS)扫描整个基因组以确定与特定疾病相关的遗传变异。这项技术被用于识别与疾病原因相联系的生物学通路--细胞和遗传物质中发生的一系列行动和变化。 

“软骨”会影响你的身高

  你能长多高可能不光是“命”,还与生长板有关。  生长板,即骨骼末端附近的软骨,随着儿童的发育而变硬。生长板中的细胞决定了人们骨骼的长度和形状,并可以影响身高。现在,美国科学家发现,影响软骨细胞成熟的基因变化可能会强烈影响成年人的身高。相关研究4月14日发表于《细胞基因组学》。  作为一名关心骨骼

肿瘤相关基因

癌基因(英语:Oncogene,亦称为致癌基因)是细胞遗传物质的一部分, 它们参与细胞从正常生长状态到肿瘤的过程。它们通过诱导或突变被激活。 致癌基因原癌基因是参与细胞生长、细胞分裂和细胞分化的正常基因。但当其发生突变后,就会变成致癌基因。它们会在诸如放射性物质,化学物质和病毒的作用影响下过渡成引发

西湖大学连发两篇Nature-破解复杂疾病细胞地图与线粒体转运之谜

描述疾病相关细胞的空间分布对于理解疾病病理学至关重要。近日,西湖大学杨剑团队在Nature在线发表题为“Spatially resolved mapping of cells associated with human complex traits”的研究论文,该研究绘制了与人类复杂特征相关的细胞的