使用GWAS研究鸡攻击行为的相关基因

研究背景 攻击行为是很多物种共有的进化属性,它可以帮助雄性物种快速建立生存空间或社会主导地位。然而可想而知,这种属性在禽类的饲养中是十分不利的。之前已有一些研究表明鸡的攻击行为可由遗传因素导致,并估计了遗传力大小约为0.57,说明群体中一半以上的攻击行为是由遗传导致的。研究人员试图使用GWAS方法来探究攻击行为背后的遗传因素,以期改善养殖效率和动物福利。本文是第一篇使用GWAS方法来研究鸡攻击行为的文章。 研究思路 研究结果 研究共使用了265只雄性家鸡,在出生第60天时开始测量攻击性状,共4个,分别为T1:在记录期间(16天)内打斗的次数;T2:每天打斗的次数(超过4次则被记录);T3:打斗的天数;T4:超过4次打斗的天数。基因分型工作由上海伯豪完成,使用了Affymetrix Axiom平台的高密度芯片,型号为600K Affymetrix Axiom HD chicken genoty......阅读全文

中国科学家Nature子刊发表GWAS研究新成果

  来自昆明医科大学第一附属医院、中国科学院昆明动物研究所等多家机构的研究人员,通过全基因组关联研究(GWAS)鉴别出了中国汉族人群重型痤疮(severe acne)的两个全新易感位点。相关论文于1月7日发表在国际顶级专业期刊《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

中国科学家Nature子刊发表GWAS研究新文章

  来自天津医科大学、南京医科大学、复旦大学等10多家机构的研究人员,采用全基因组关联研究(GWAS)筛查了与中国汉族妇女上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)相关的易感位点,研究结果发表在8月19日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志

基因检测产业在中国的发展及其在GWAS发现和复现中作用

  近年来,面向消费者的基因检测(DTC-GT)行业呈爆炸式增长,由美国的市场先驱者发起,欧洲和亚洲的公司迅速跟进。除了向客户提供祖先和健康信息这一主要目标外,DTC-GT服务已经成为大规模人口和遗传学研究的宝贵数据资源。  来自中南大学、深圳WeGene临床实验室Gang Chen教授课题组研究了

美国批准转基因鸡加入制药队伍

  继转基因山羊和转基因兔之后,转基因鸡也于8日获得美国食品和药物管理局(FDA)批准,加入了制药队伍。这种鸡的蛋中含有一种工程酶,可用于生产治疗罕见遗传病的药物Kanuma。该药物也由此成为美国市场上为数不多的利用转基因生物制药的产品之一。   据《自然》杂志网站报道,Kanuma是溶酶体酸性脂肪

抗禽流感转基因鸡即将出世

  据英国路透社1月22日报道,英国科学家正在积极探索通过转基因技术培育出抗H5N1型禽流感病毒的转基因鸡。科学家们希望这项研究成果有望阻止人类致命性流感疫情的暴发。  英国伦敦帝国理工学院病毒学教授WendyBarclay表示,科学家们计划使用CRISPR基因编辑技术,该技术可以改变鸟类和家禽的一

研究发现鸡白痢防控新靶标

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491002.shtm 鸡白痢,是由鸡白痢沙门氏菌引起的传染性疾病,世界各地均有发生,是危害养鸡业最严重的疾病之一。 目前,鸡白痢的发生较为严重, 致死率达10%~60% , 特别在育雏阶段危害更

研究发现鸡白痢防控新靶标

  鸡白痢,是由鸡白痢沙门氏菌引起的传染性疾病,世界各地均有发生,是危害养鸡业最严重的疾病之一。  目前,鸡白痢的发生较为严重, 致死率达10%~60% , 特别在育雏阶段危害更严重, 往往会给养鸡业带来巨大经济损失。在鸡白痢防治方面,传统的方法是使用抗生素类药物。但由于耐药性的产生, 抗生素在体内

最新研究:-H7N9系东亚野鸟和中国鸡群基因重配

  中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室近日对H7N9禽流感病毒进行基因溯源研究显示,H7N9禽流感病毒基因来自于东亚地区野鸟和中国上海、浙江、江苏鸡群的基因重配。而病毒自身基因变异可能是H7N9型禽流感病毒感染人并导致高死亡率的原因。  研究结果初步显示,H7N9禽流感病毒暂未发现在猪群中的进化

Benchmarker一种可靠的对GWAS数据进行挖掘的算法

  全基因组关联研究(GWAS)针对大量人群寻找有助于常见的多基因特征(如身高或肥胖)的基因。这些综合性研究经常发现大量微小的遗传变异,这些变异在高龄,肥胖等人群中更常发生。但这种相关性并不一定意味着因果关系的存在。  虽然有许多计算算法可用于帮助提取GWAS结果,但很难知道选择哪一种。研究人员在《

贺林、张学军:中国GWAS发展现状、意义、挑战及展望

  大部分常见疾病和遗传性状受多基因和环境因素的相互作用所影响。近年来,人类疾病遗传性定量分析主要依赖于利用GWAS来识别常见的变异体,通过GWAS分析许多新的易感基因特定生物学通路得到确定。截止2016年5月,已开展的GWAS研究共有2437项,确定了16617种疾病相关的SNP(单核苷酸多态性)

动植物基因变异表型关联知识库(GWAS-Atlas)正式上线发表

  近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的国际上首个动植物基因组变异-表型关联知识库(GWAS Atlas)正式上线发表,该项研究成果以GWAS Atlas: a curated resource of genome-wide variant-trait associations in plant

上海交大文章:GWAS研究揭示玉米直链淀粉含量遗传结构

  来自上海交通大学的研究人员发表了题为“The Genetic Architecture of Amylose Biosynthesis in Maize Kernel”的论文,通过全基因组关联分析系统研究了玉米籽粒中表型直链淀粉的含量与单核苷酸多态性的基因型的连锁研究,筛选出了与直链淀粉合成相关

南京医科大学Nature-Genetics发表GWAS研究新成果

  来自南京医科大学的研究人员通过全基因组关联研究(GWAS),鉴别出了中国汉族人群先天心脏畸形(congenital heart malformations,CHM)的两个全新易感位点。相关论文于5月16日在线发表在国际顶级专业期刊《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

张学军,贺林Nature撰文:中国GWAS研究取得重大进展

  在全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)方法提出以前,人们主要利用连锁研究方法开展复杂疾病/性状遗传易感性研究,发现了一些疾病和性状的易感基因(位点)。但是复杂疾病/表型具有明显的遗传异质性、表型复杂性等特点,使得以家系为基础的“全基因组连锁

中国农大、中科院Nature-Genetics携手发布GWAS研究新成果

  来自中国科学院植物研究所、中国农业大学等处的研究人员证实,ZmVPP1基因遗传变异有助于玉米幼苗抗旱性。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。  中国科学院植物研究所的秦峰(Feng Qin)研究员,和中国农业大学的杨小红(Xiaohong Yan

《自然—遗传学》发表我国科学家水稻研究成果引关注

  由中科院上海生命科学研究院、北京基因组研究所、中国水稻研究所等单位合作的研究成果《水稻地方品种重要农艺性状相关基因的全基因组关联分析》,日前在线发表在《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上。  该研究报道了中国水稻地方品种的全基因组的遗传多态性和单倍体型图谱,并对籼稻

智能型基因扩增PCR装置的研究相关

  以聚合酶链式反应(PCR)为基础的 离体 基因扩增技术对 基因工程的研究和应用产生了革命性影响。提供自动化的PCR专用仪器则是推广 PCR技术的关键。为解决国产PCR装置的更新换代并替代大量进口,中科院 发育生物学所最近完成了以智能化 仪表控制系统为核心的干式基因扩增PCR装置,经多种对照引物和

科学家质疑全基因组关联研究意义

   外围遗传突变对疾病影响甚微  全基因组关联研究通过大量人群寻找与疾病或性状相关的DNA变异  对于某种疾病而言,当比较足够多的患病与不患病人群基因组后,与疾病相关的遗传变异便有可能脱颖而出。这也是全基因组关联研究(GWAS)背后运行的哲学——十多年来,研究人员利用它来寻找包括精神分裂症和类风湿

研究人员发现小型恐龙-体型如鸡

体型如鸡的小恐龙被古生物学家发现   11月26日,中外科学家团队在北京宣称,他们在河北丰宁地区发现了一个美颌龙类新物种,对理解恐龙的演化有重要意义。该研究由中国地质大学(北京)副教授邢立达领衔,英良石材自然历史博物馆执行馆长钮科程、美国芝加哥大学宮下哲人博士、加拿大埃尔伯塔大学菲利普·柯里院士等学

基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展

与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联  日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema

新发现112个基因证实与肥胖有关

  由日本理化学研究所等机构组成的联合研究小组通过对17万日本人大规模全基因组关联分析(GWAS)和1.5万日本人重现性验证,以及对32万欧美人进行跨民族分析,发现了人类基因组上193个与体重调节相关的基因变异,其中112个是新发现的。  肥胖是引发各种疾病的危险因素,其原因不仅是由于过食或缺乏运动

华中农业大学Nature子刊发布GWAS研究新成果

  来自华中农业大学的研究人员报告称,他们通过对玉米粒进行基于代谢物组(Metabolome)的全基因组关联(GWAS)研究获得了一些新的生物化学见解。   植物生成大量结构各异的代谢产物,它们在植物的生长、细胞补充、全株资源分配以及植物的发育和应激反应中发挥着重要的作用。此外,它们还为人类提供了

新研究发现一批多动症相关基因

  一个国际研究团队近日宣布,他们发现了一批与“注意力缺陷多动障碍(俗称多动症)”发病风险有关的基因变异。这为探究多动症背后的生物学机制提供了新见解,有助于对该病的诊断与治疗。  多动症是多见于儿童期的一类心理障碍,主要症状包括注意力不集中、多动、冲动易怒等。研究团队在新一期英国《自然—遗传学》杂志

植物表型研究文章TOP10(三)

TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。

Science:RNAi活体研究揭示癌症发展的未知相关基因

  由美国霍华德休斯医学研究所和西奈山伊坎医学院的研究人员组成的研究团队发现,在缺失基因和肿瘤生长之间存在一种以前未知的关系。在2014年1月17日的《Science》杂志上发表的这项研究中,研究团队描述了利用RNAi技术进行的研究,以及如何发现癌变肿瘤的一个以前未知的遗传关联。   在过去的几年

PLOS-ONE:研究发现与严重肝损伤相关的基因

  天普大学、盖辛格肥胖研究所和希望之城附属的转化基因组研究所(TGen)合作完成的一项研究表明,一种名为AEBP1的基因可能在肝病的发展、严重程度和潜在治疗中扮演核心角色。研究结果在科学期刊《PLoS One》上发表。  研究结果表明,AEBP1的表达增加与非酒精性脂肪性肝炎(nonalcohol

澳研究人员发现与“吃不胖”相关的关键基因

  “吃不胖”是许多人的梦想。澳大利亚弗林德斯大学日前宣布,该校参与的一项国际基因研究有望在不久将来让这一梦想成为现实。  弗林德斯大学日前发布公报说,该校研究人员领导的国际团队发现,将小鼠体内名为“RCAN1”的基因移除后,小鼠长时间摄入高脂肪食物也不会增肥。此外,该基因缺失的小鼠代谢速率较野生小

研究揭示与肥胖相关的年龄特异性基因

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507883.shtm

Nature:GWAS寻找对花生过敏的答案

  近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究论文中,来自约翰霍普金斯大学的研究人员通过对美国儿童进行全基因组关联性研究(GWAS)分析,鉴别出了其对花生过敏的特殊基因簇;Xiaobin Wang教授说道,我们一直猜测存在某些基因使得个体对花生过敏,而如今我们通过进行

肯德基回应“怪鸡”论:只提供“长相周正”的鸡

  自网上出现肯德基“多个翅膀的怪鸡”图片后,有关肯德基的鸡是由变异鸡和激素催生而出的言论一直未停。22日,在百胜餐饮有限公司举行的“百胜成都开放日”上,百胜餐饮中国事业部高级公共事务经理曹敬衡表示,肯德基的鸡都是长相正常的白羽鸡,“怪鸡论”纯粹是无稽之谈。  记者了解到,在“百胜成都开放日”上,来