miRNA与表达谱芯片联合应用揭秘IFNa抗病毒作用新机制

复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生部医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏课题组,联合应用Exiqon miRNA芯片和Agilent表达谱芯片,发现干扰素-a诱导细胞分泌外胞体传递具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,从而发挥抗病毒活性的新机制。该成果2013年7月7日正式发表于国际权威期刊Nature Immunology,引起世界同行关注。 研究背景: 干扰素-a(IFN-a)通过细胞间通讯,诱导病毒抵抗力从不易受感染的细胞传递到允许病毒复制的细胞,放大细胞抗病毒效率;外胞体(exosome)是细胞间通讯的中介,可在临近的细胞间水平传递有活性的分子。外胞体介导的细胞间功能分子的转移,很有可能是干扰素介导的抗病毒反应的机制。 研究思路: INF-a介导的抗病毒活性可以通过外胞体在细胞-细胞之间传递 In vitro 外胞体将INF-a的抗病毒活性从LNPCs细胞转移到病毒感染肝细胞 In v......阅读全文

miRNA与表达谱芯片联合应用揭秘IFNa抗病毒作用新机制

   复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生部医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏课题组,联合应用Exiqon miRNA芯片和Agilent表达谱芯片,发现干扰素-a诱导细胞分泌外胞体传递具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,从而发挥抗病毒活性的新机制。该成果2013年7月7日正式发表于

miRNA与表达谱芯片联合应用,揭秘IFNa抗病毒作用新机制

复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生部医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏课题组,联合应用Exiqon miRNA芯片和Agilent表达谱芯片,发现干扰素-a诱导细胞分泌外胞体传递具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,从而发挥抗病毒活性的新机制。该成果2013年7月7日正式发表于国际权

microRNA-芯片与表达谱芯片的联合应用

microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前, 国际上许多科研

Stem-Cells发表利用NimbleGen表达谱芯片研究肿瘤干细胞-文章

  中山大学生命科学院肿瘤与干细胞研究室创建人张雁教授,带领其研究小组发现TGF-β信号和缺氧信号会诱导骨肉瘤细胞去分化,成为肿瘤干细胞,并利用NimbleGen表达谱芯片分析肿瘤干细胞和肿瘤细胞的基因图谱,寻找与肿瘤干细胞等相关的关键分子。该研究成果发表于Stem Cells。   研究背景:

表达谱芯片的介绍与应用

基因表达谱芯片可使是科研工作者实现在MRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。 它与传统的研究基因表达的方法(如差异cDNA文库筛选、Northern blot和PCR)相比较,可为使用者节省大量的研究经费和时间并获得范围更广、更具有关联性的研究结果。它的主要用途是用于大规

表达谱芯片的介绍与应用

  基因表达谱芯片可使是科研工作者实现在MRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。 它与传统的研究基因表达的方法(如差异cDNA文库筛选、Northern blot和PCR)相比较,可为使用者节省大量的研究经费和时间并获得范围更广、更具有关联性的研究结果。它的主要用途是用于大规模分

Agilent表达谱芯片研究茉莉酸调控南芥抗冷害反应和作用

   中国科学院西双版纳热带植物园余迪求课题组致力于研究改良农作物抵抗外源逆境因子胁迫的重要功能基因及其信号分子。最新研究发现,植物激素茉莉酸能够提高拟南芥抗冻害反应,并利用Agilent表达谱芯片,挖掘茉莉酸通过多条信号通路提高植物的抗冻害反应。该成果发表于顶尖杂志The Plant Cell。

RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较

  心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA)已在患粉丝性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在

表达谱基因芯片实验

表达谱基因芯片可应用于:(1)疾病诊断;(2)新药开发;(3)环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记,在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号

揭秘致癌蛋白作用新机制

PTB蛋白(多聚嘧啶串结合)是一种在癌中起重要作用的蛋白,在癌细胞中高表达。家研究证明,PTB蛋白可以通过结合特定的RNA序列,而抑制靶的可变剪接,从而控制靶基因产生的种类。这一结论已被写进许多教科书里了。 然而,武汉大学生命科学学院教授张翼和付向东联合指导的研究组发现,PTB蛋白不仅能直接抑制

miRNA的表达与肺鳞癌的诊断与预后

世界上每年有超过160万例肺癌新发病例,超过137万人死于肺癌。中国每年有52万例肺癌新发病例,超过45万人死于肺癌。80%肺癌是非小细胞肺癌,非小细胞肺癌中40%是鳞癌。ⅠA期肺鳞癌患者的5年存活率约为60%,而Ⅱ-Ⅳ期肺鳞癌患者的5年存活率为5% - 40%。因此,发现新的标志物并应用于早期

表达谱基因芯片实验操作流程

一、试剂1. TRIzol2. 异丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 无水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 杂交试剂110. 标记试剂I11. 杂交试剂212. 标记试剂II13. 反转录酶14. 

生物芯片技术应用与基因表达水平的检测

用基因芯片进行的表达水平检测可自动、快速地检测出成千上万个基因的表达情况。谢纳(M.Schena) 等用人外周血淋巴细胞的cDNA文库构建一个代表1046个基因的cDNA微阵列,来检测体外培养的T细胞对热休克反应后不同基因表达的差异,发现有5个基因在处理后存在非常明显的高表达,11个基因中度表达增加

蛋白质芯片技术应用与基因表达的筛选

基因表达的筛选AngelikaL.等人从人胎儿脑的cDNA文库中选出92个克隆的粗提物制成蛋白质芯片,用特异性的抗体对其也进行检测,结果的准确率在87%以上,而用传统的原位滤膜技术准确率只达到63%。与原位滤膜相比,用蛋白质芯片技术在同样面积上可容纳更多的克隆,灵敏度可达到pg级。

生物芯片入门(三):基因表达谱芯片实验操作1

待检测样品制备生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应,必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度,但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰,杂合癌基因的检

测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢率明

Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用(二)

3. 细胞样本细胞作为常用的实验材料,在生物及临床研究中被广泛应用,尤其是对于癌症的研究具有重要意义。细胞培养技术可以把来自机体的组织经分散成为单个细胞,放在类似于体内的体外环境中生长、繁殖或传代,从而用于观察细胞的各种生命现象。细胞可以用于细胞工程与细胞癌变等重要问题的研究。癌细胞体外培养是研究癌

Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用(一)

1.新鲜组织样本新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机制具有重要的

Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用(三)

 其他案例:大肠癌血浆miRNA标志物:Wang S, Xiang J, Li Z, Lu S, Hu J, Gao X, Yu L, Wang L, Wang J, Wu Y, Chen Z, Zhu H. A plasma microRNA panel for early detecti

中山一院:RMVD患者左右心耳miRNA表达谱比较

  心房颤动(Atrial fibrillation ,AF)是临床上最常见的持续性心律失常,其发病率和死亡率十分高。目前, AF相关的microRNA(miRNA) 已在患风湿性二尖瓣病(RMVD)患者的右心房(RA)和左心房(LA)中发现。然而,大多数的研究只关注RA;与LA相关的miRNA在R

应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应

中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基

JVI:首次报道病毒miRNA调控对虾抗病毒

  病毒,尤其是DNA病毒,会产生自身的microRNA(miRNA)来调控宿主和病毒基因的表达。由于其在病毒—宿主相互作用中的重要作用,近年来病毒miRNA已引起了广泛的关注与研究,然而人们对无脊椎动物病毒 miRNA的了解却十分有限。至今,大多数对病毒miRNA的研究是在细胞系中进行的,但是

内蒙古大学哈达组:miRNA在大豆感染SMV病毒中的作用

  植物通过几种不同的防御机制保护自己免受病毒感染。RNA干扰(RNAi)是一个突出的抗病毒机制,需要AGO(Argonaute)和Dicer / DCL(Dicer-like)蛋白的参与。效应物触发免疫(ETI)是由抗性(R)基因介导的抗病毒机制,其中大部分编码NBS-LRR家族蛋白。microR

microRNA-芯片联合应用探究胃癌细胞株原发性耐药分子机制

  microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制    药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前,

案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

四川农大:揭示miRNA调控玉米穗发育机制

  microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA,在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用,包括代谢,激素反应,转座子的表观遗传控制,胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中,胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而,关于miRNA参

调控I型干扰素表达和抗病毒反应的新机制

  病毒是严重危害人类健康的杀手之一,I型干扰素是调节抗病毒免疫的关键因子。Toll样受体TLR3/4、RIG-I样受体和胞内DNA受体cGAS在感知病毒感染后,通过激活TBK1和IRF3,诱导I型干扰素的表达,但I型干扰素表达失调也会引起红斑狼疮等自身免疫性疾病。因此,深入了解机体对I型干扰素表达

中海大:测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制

  海参(Apostichopus japonicus),是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物,以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临,上层海水由于太阳光强烈照射,温度上升。此时,海底的小生物都浮到海面,进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参,迫于夏季食物中断,进入夏眠,此时,其基础代谢

MiRNA的异常表达与子宫平滑肌瘤的发生有关

美国西北大学研究人员在新近出版的Fertility and Sterility期刊上发表了题为“Differential expression of microRNA species in human uterine leiomyoma versus normal myometrium”的研究论文。