首个核内DNA感受器hnRNPA2B1
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
质粒DNA的限制性内切酶酶切分析
实验目的学习和掌握限制性内切酶的特性掌握对重组质粒进行限制性内切酶酶切的原理和方法并理解限制性内切酶是DNA重组技术的关键工具。相关基础知识限制性核酸内切酶：是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶。它是基因工程中用于体外剪切基因片段的重要工具酶。上世纪七十年代，当人们在对噬菌体的宿主
DNA的限制性内切酶酶切反应实验
[实验目的]通过本实验学习DNA的限制性内切酶酶切反应的基本原理与实验技术。[实验原理]1.限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA 序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP 的
λ噬菌体DNA限制性内切酶图谱分析
实验方法原理λDNA是线状双链DNA,EcoRⅠ在其上有5个切点,产生6个片段,通过琼脂糖凝胶电泳可将这几条片段分离开。如何重建这6个片段呢?可用两种限制性内切酶同时或先后作用于λDNA。例如λDNA经EcoRⅠ切割后在凝胶上分离开来的6条带可洗脱出来,然后分别将这6条片段用HindⅢ切割。结果表明
关于DNA的限制性内切酶酶切分析
限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA，而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然
λ噬菌体DNA限制性内切酶图谱分析
实验方法原理 λDNA是线状双链DNA,EcoRⅠ在其上有5个切点,产生6个片段,通过琼脂糖凝胶电泳可将这几条片段分离开。如何重建这6个片段呢?可用两种限制性内切酶同时或先后作用于λDNA。例如λDNA经EcoRⅠ切割后在凝胶上分离开来的6条带可洗脱出来,然后分别将这6条片段用HindⅢ切割。结果表
Nature：线粒体DNA损伤引发抗病毒固有免疫反应
近日，来自美国耶鲁大学医学院的研究人员著名国际期刊nature在线发表了他们的一项最新研究成果，他们发现在抗病毒天然免疫过程中，线粒体发挥了至关重要的作用。 在正常情况下，每个细胞内的线粒体DNA（mtDNA）有成千上万个拷贝，并且被包装成几百个高级结构，称为类核。大量mtDNA结合蛋白TFA
外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘（一）
文章导读外泌体是指包含多种RNA（环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等）和蛋白质的盘状囊泡（30-200nm）。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体，且外泌体天然存在于各种体液中，包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡，能够参与细胞间通讯。目前，有关外泌体分泌、摄
Nat－Commun：将危险毒素变为生物感受器
某些类型的细菌具有给其他细胞“打孔“并杀死它们的能力。他们通过释放被称为“成孔毒素”（PFT）的特殊蛋白质来实现此目的，该蛋白质锚定在细胞膜上并形成”管状”通道，并最终导致细胞的“自我毁灭”。 除已知的“感染”细胞的能力外，PFT在其它方面的潜力也引起了人们的极大兴趣。例如，它们形成的纳米级孔
Nat－Commun：将危险毒素变为生物感受器
某些类型的细菌具有给其他细胞“打孔“并杀死它们的能力。他们通过释放被称为“成孔毒素”（PFT）的特殊蛋白质来实现此目的，该蛋白质锚定在细胞膜上并形成”管状”通道，并最终导致细胞的“自我毁灭”。 除已知的“感染”细胞的能力外，PFT在其它方面的潜力也引起了人们的极大兴趣。例如，它们形成的纳米级孔
研究揭示光感受器外段蛋白转运新机制
近日，《美国科学院院报》发表了中山大学中山眼科中心刘春巧团队最新研究成果，首次揭示神经视网膜光感受器纤毛膜蛋白复合体在Rhodopsin（视紫红质）和其他外段蛋白运输中起重要作用，从而为致盲性色素视网膜炎（Retinitis pigmentosa，RP）的病理分子机制提供了必要补充。该项研究同时对纤
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nat
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nature，Cell
智核生物获NMPA首个重组人促甲状腺素临床试验批件
SNA-001在临床核医学科用于分化型甲状腺癌碘治疗前准备与随访复查检测，在国内尚无同品种上市或同类临床批件，临床上无药可用。智核生物SNA-001有望成为中国大陆首个rhTSH药物。SNA-001是一种重组人促甲状腺素类药物，可安全并快速提升人体血清促甲状腺素水平，极大减轻患者治疗过程中的痛苦
全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组
10年前，当遗传学家Ronald Davis首次提出，他的同事正在尝试创造人工酵母染色体，并将其放入活细胞时，Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院，是一个有远见的人。他提出，实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过，Boeke并不理
科研人员发现调控胶质瘤胆固醇稳态新机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515329.shtm近日，空军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室吴元明教授和申亮亮研究员团队，基于对胶质瘤数据集进行系统生物信息学分析，发现胆固醇稳态的重编程受到m6A阅读蛋白hnRNPA2B1
首个DNA材料制成的纳米马达面世－有望用于驱动化学反应
科技日报讯 （记者刘霞）德国科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称，他们首次成功使用DNA折叠法制造出了一款分子马达。这种由遗传物质制成的新型纳米马达可以自我组装并将电能转换为动能，可以开关，还能通过施加电场控制其转速和旋转方向，未来有望用于驱动化学反应。 汽车、钻机等机器内的马达能帮人们完成
Nature－Methods：分子动力学，首个实现DNA精确运动模拟的技术
分子动力学是能够实现DNA运动模拟的一种技术，这些运动包括折叠成双倍、三倍或四倍的DNA链，以及DNA与蛋白质和药物的相互作用。分子动力学是用来处理那些发生时间从皮秒到分钟的运动过程，也适用于不同尺寸的分子系统，从几纳米到一米。 巴塞罗那生物医学研究所，分子模拟和生物信息学实验室的Modest
FDA批准首个非侵入型大便DNA肠癌筛查试剂盒
Exact科学公司8月12日宣布，FDA已批准非侵入型、大便DNA结直肠癌筛查试剂盒Cologuard。而在同一天，Exact公司也收到美国医疗保险和医疗补助服务中心（CMS）提议的医疗保险覆盖备忘录，提议将Cologuard进行全国医疗覆盖。 Cologuard是FDA批准的首个非侵入性结直
首个DNA编码的单克隆抗体疗法有望进入临床试验
近日，来自威斯达研究所和Inovio制药公司共同宣布，FDA已经批准了他们首个人类临床试验，调查新型合成型DNA编码的单克隆抗体（DMAb）疗法在预防寨卡病毒感染上的安全性和耐受性。图片来源：wistar.org DMAb并不像所有已知的常规治疗性抗体，其是在人体内制造出而并非由工厂制造出来的
世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
记者25日从北京大学第三医院获悉，该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作，绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》，影响因子达38.597。 据介绍，哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞，父母的表观遗传记
目的基因在真核系统中的表达及细胞内的定位实验
实验方法原理 将氯化钙，DNA和磷酸缓冲液混合，形成包含DNA且极小的不溶的磷酸钙颗粒（沉淀）。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 HBSCaCl2TE质粒DNA仪器、耗材 CO2培养箱实验步骤 1. 转染的前一天在35 mm培养皿中植入
研究揭示豆科植物共生互作中核内钙信号的编码机制
8月16日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所/中科院植物分子遗传国家重点实验室谢芳研究组撰写的题为Constitutive activation of a nuclear-localized calcium channel com
研究揭示豆科植物共生互作中核内钙信号的编码机制
8月16日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所/中科院植物分子遗传国家重点实验室谢芳研究组撰写的题为Constitutive activation of a nuclear-localized calcium channel com
上海生科院构建细胞核内长非编码RNA的新型表达载体
11月5日，国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于研究细胞核内长非编码RNA的新型表达载体。该研究首次构建了一种可以将外源过表达的RNA滞留在细胞核内的载体（snoVector），而且过表达的RN
研究揭示Gabija复合物抗噬菌体侵染的分子机理
为了应对噬菌体的入侵，原核生物演化出多种精巧的免疫系统以实现自我保护。对原核生物免疫系统的深入研究催生了多种具有里程碑意义的分子生物学工具，包括在分子克隆实验中广泛应用的限制性核酸内切酶系统，以及在基因编辑领域中大放异彩的CRISPR-Cas系统等。然而，细菌和古菌基因组中还有一大批功能尚不明确的原
卵子独特表观遗传状态机制获揭示
中科院生物物理研究所朱冰课题组发现了卵细胞基因组DNA甲基化水平正常建立的首个保障因子Stella。相关论文近日刊登于《自然》。 雌性哺乳动物的一生中只能提供有限数目的卵子。卵子的DNA甲基化水平很低，只有精子和绝大部分终末分化的体细胞的DNA甲基化水平的一半左右。然而，人们对卵子的这种独特的
美科学家发现－DNA－内“空间语法”－或重塑基因调控理解
美国科学家发现了DNA内长期潜伏的“空间语法”，这是理解基因活动如何在人类基因组中编码的关键。这项研究或重塑科学家对基因调控的理解，更深入地揭示遗传变异如何影响发育或疾病中的基因表达。相关论文发表于《自然》杂志。 转录因子是一种蛋白质，控制人基因组中哪些基因被打开或关闭，在编码中起着至关重要作
新DNA显微镜“从内到外”绘制生命3D图
美国芝加哥大学的科学家开发出一种名为体积DNA显微镜的革命性成像技术。该技术可“从内到外”绘制生命3D图，科学家通过标记和追踪分子间的相互作用，构建出复杂的遗传物质3D图，进而提供前所未有的生物体内视图。相关研究成果发表在新一期《自然·生物技术》杂志上。一种新的3D基因成像法可能为癌症、免疫和发
微软计划未来三年内实现DNA存储数据的计划
如果我们我们能够像今天用磁带存储数据一样，利用DNA进行数据存储，那么理论上就能够利用两个车库大小的地方存下人类有史以来所有的信息。 最近，微软得问计算机工程师与MIT技术顾问们联合起来共享了"利用DNA进行数据存储"的计划，他们计划在下个10年之内建成以DNA为介质的开放性存储系统。 可能
质粒DNA的限制性内切酶消化酶解
原理 限制性核酸内切酶能特异地识别双链DNA中的碱基序列，通过“切割”双链DNA中每一条链上的磷酸二酯键使DNA断裂。利用它可方便地按需要对DNA进行“剪切”加工。限制性核酸内切酶单位的定义为：在限定的温度和反应环境中，1小时消化1μg DNA所需的酶量为一个酶单