康成tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDXPHO53KSN在Trastuzumab（曲妥单抗，一种抗乳腺癌药物）耐受的临床病人中明显上调。结合临床信息分析显示，这两个tRF表达上调的曲妥单抗耐药乳腺癌病人与更差的无进展生存期具有明显的相关性，预示着这两个tRF可作为潜在的不良预后的生物标志物。该研究成果发表在2018年8月的Cellular Physiology and Biochemistry（IF：5.104）。（tRF&tiRNA测序由康成生物提供技术服务） 什么是tRF&tiRNA? tRF（15-30nt）和tiRNA(30-35nt)是由D......阅读全文
康成tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-Z
tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
454测序应用于花生种子败育研究
花生为豆科作物，是我国优质食用油主要油料品种之一，又名“落花生”或“长生果”，在全国各地均有种植，主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中，胚栓插入土壤，膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程，因此，胚栓入土失败、胚轴的膨压
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pent
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pent
tRFtiRNA：为什么以及如何研究它们？
概述 转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一，具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物，而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRNA
tRFtiRNA：为什么以及如何研究它们？
转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一，具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物，而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRNA的ncRNA
广泛成应用于衣领域
拉力机广泛应用适用于寻求材料力与形变关系的实验，可对金属，非金属的原材料加工件、成品进行拉伸、压缩、弯曲等力学实验及分析。拉力机用专业名词来介绍，其就是用来机械加力对材料进行静载、拉伸、压缩、弯曲、剪切、剥离等力学性能试验用的实验分析数据得出一个合格国际标准的数据。 用通俗的话来说，是一个能
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究（一）
2017年1月1日遗传学期刊Genetics（影响因子4.6）在线发表了上海大学生命科学学院祁巍巍老师的有关玉米突变体基因克隆与功能分析新文章，题为：Mitochondrial function and maize kernel development requires Dek2, a pe
mRNA测序应用于玉米籽粒dek突变体研究（二）
dek2是一个保守的线粒体定位蛋白PPR蛋白在植物中广泛存在。研究人员为了确认dek2的进化地位，构建了dek2全长蛋白序列的进化树。结果表明，dek2同源基因广泛存在于被子植物中，而在玉米中没有同源基因（图4）。对dek2的共聚焦显微镜亚细胞定位研究发现，dek2与线粒体marker存在共定位，即
快速发现Biomarker？
SELDI蛋白质芯片系统实现了来自小样本的基于芯片的蛋白质和肽段图谱与一个高通量分析平台的一体化，可从大量复杂生物学样品中快速获得蛋白质分子量图谱，发现Biomarker。ProteinChip SELDI系统用于从大量复杂生物学样品中快速获得蛋白质分子量图谱，发现Biomarker。它使
临床研究之路：NGS上下求索，Biomarker潮流所向
“虽然这方面的临床研究一直很少被关注”但哈佛大学医学院医学助理教授Eli Van Allen在今年美国芝加哥召开的美国临床肿瘤学年会（ASCO）上告诉听众说：“让测序的结果成为临床决策的依据现在已经部分实现。” 事实上，首个相关的概念验证试验：试图根据测序的结果选择患者的治疗手段并没有取得成
tRFtiRNA：为什么以及如何研究它们？（三）
病理应激损伤 由缺氧、营养匮乏、氧化及代谢失衡等引起的应激反应能够损伤细胞，催生疾病。这些应激条件刺激tRNA halves的产生。在毒性损伤、辐射以及缺血再灌注等组织损伤动物模型中，tRNA halves的产生与组织损伤程度呈现相关性，例如，应激导致tRNA构象改变，随后促进ANG介
tRFtiRNA：为什么以及如何研究它们？（二）
人类疾病tRFs&tiRNAs与多种病理状况相关，甚至是致病因素，例如，癌症、神经退行性疾病、遗传性代谢疾病等 (图5)。 图 5. tRFs&tiRNAs 分子功能和人类疾病。癌症tRFs&tiRNAs在多种癌细胞系中差异表达，例如前列腺癌细胞系LNCaP和C4-2等。tRFs&tiRNAs在
tRFtiRNA：为什么以及如何研究它们？（一）
概述 转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一，具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物，而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRN
康芝药业成康恩贝布洛芬全国总代理
22日，康恩贝与康芝药业同时发公告，康芝药业已签约成为康恩贝布洛芬颗粒产品的全国总代理，有效期为5年。康恩贝同时公告称，生产厂因水灾损失300万元。 康恩贝表示，总代理合同的签订对扩大布洛芬的销售、增加主营收入将发挥积极作用，预计5年合作期限内将为公司增加销售额1.5亿元以上。 康芝
TRF是什么意思
荷尔蒙又叫激素：是英语的音译一、定义激素是生物体产生的，对机体代谢和生理机能发挥高效调节作用的化学信使分子。激素是由内分泌腺或具有内分泌机能的细胞产生的。内分泌细胞是一些特殊分化的，对内外环境条件变化敏感的感应细胞，当他们感应到内外环境变化的刺激时，就合成并释放某种激素。激素作为化学信使，不经导管进
MIDASTM确证Biomarker（一）
生物标志物的发现是一个复杂而漫长的过程，AB公司结合QTRAP系列质谱系统的独特功能与扫描模式，创造性地开发出MIDASTM（MRM Initiated Detection And Sequencing）工作流程，满足了生物标志物验证与确认的4S要点，可以准确、快速、简便地完成大样本量
MIDASTM确证Biomarker（二）
鉴定过程共进行两次实验，约30多种蛋白质被鉴定出来，已鉴定的蛋白质如表1所示，其中红色标注的蛋白又通过MIDASTM确认。两次实验结果相比较，重叠率低于75%。许多在第一次实验中被鉴定但可信度较低的蛋白质，第二次实验中并未产生更多的MS/MS图谱，没被再次鉴定出来，增加了鉴定与验证确认的难度。
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究
研究背景 胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究
研究背景 胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移
miRNA测序应用于阿尔茨海默氏症新机制的研究
阿尔茨海默氏症（Alzheimer's disease，AD）是一种神经性疾病。有研究表明，miRNA-Seq和全基因组测序鉴定到了一些非编码RNA可能参与了其中的疾病形成。竞争性内源RNA（ceRNA）是非编码RNA执行生物学功能的一种重要方式。然而，相对于其重要的生物学功能，只有部分
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究－一
研究背景胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移，患者的中位
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究－二
图2. Sanger 测序验证后的非同义体细胞突变，A，B分别代表胃癌原发灶和腹膜转移灶中的非同义体细胞突变。 图3.胃癌原发灶和腹膜转移灶中验证后的SNP分布。参考文献1. Torre LA, Bray F, Siegel RL, Ferlay J, Lortet-Tieulent J an
肿瘤干细胞代谢重编程Biomarker及信号通路研究（二）
3）Imipridones reprogram the transcriptome of GBM cells and suppress glycolysis and oxidative phosphorylation4）Imipridones enhance serine-one carbon-gl
肿瘤干细胞代谢重编程Biomarker及信号通路研究（一）
生物标志物（Biomarker）创新药物（Novel Agents）研发过程中需要一系列敏感的标志物进行药物疗效，作用机制，毒副作用等评价。 美国国家癌症研究所(NCI)药物调查指导委员会(IDSC)生物标记物团队审查了生物标记试验、同行评审的文献、NCI和美国食品和药物管理局(Fda)的指导文
454测序应用于HBV耐药性突变检测
HBV(Hepatitis B Virus)乙型肝炎是一种基因组长约3.2kb，部分双链环状DNA病毒。我国的乙肝病毒感染率约60%-70%，乙肝表面抗原携带率约占总人口的7%，以此计算，全国约有9300万人携带乙肝病毒，其中乙肝患者大约有3000万。由于HBV很
单细胞测序技术应用于癌症无创诊断
2013年12月10日著名学术期刊美国《国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences USA)在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心谢晓亮、白凡课题组与北大肿瘤医院王洁团队合作的研究结果。在题为“Reprod
单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志
2019年即将结束，在这一年中，单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科，单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里，科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术
单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志
2019年即将结束，在这一年中，单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科，单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里，科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术