Genomeresearch：不同RNAm5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH（IF=11.922）上发表一篇题为“Statistically robust methylation calling for whole-transcriptome bisulfite sequencing reveals distinct methylation patterns for mouse RNAs” 的文章。在本文中，他们运用了综合的甲基化分析方法检测了小鼠胚胎干细胞中tRNAs、rRNAs和mRNAs的m5C修饰。 文中指出，基于重亚硫酸盐转换的技术是检测m5C修饰的经典方法，而二代测序为此提供了检测......阅读全文
我国首次发现RNA甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟
我国科研人员在国际上首次发现脊椎动物的配子成熟需要甲基转移酶ｍｅｔｔｌ３催化的ｍ６Ａ甲基化修饰，从而揭开了该甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟这一此前尚未为人所知的秘密。（2018（第二届）模式动物与重大疾病动物模型研究与应用研讨会） 记者１３日从中国科学院水生生物研究所了解到，该所科研人员以模
研究揭示叶绿体核糖体RNA甲基化修饰的机制和功能
核糖体RNA（rRNA）的甲基化修饰是生物界中普遍存在的一种转录后修饰机制，可以改变rRNA分子的局部空间结构，从而优化核糖体的蛋白翻译效率。不同物种之间的rRNA甲基化程度存在明显差别，是rRNA进化的标志性事件之一。叶绿体是高等植物中重要的细胞器，由蓝细菌经过内共生过程演化而来，具有自己的核
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（二）
那么，病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢？ 首先，提取病毒RNA 无论您是从细胞，组织还是病毒等样品开始实验，高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要，因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（三）
随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性 如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用，我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒（OP-0002），该试剂盒可以快速提取核蛋白，同时可确保提取后的酶活性保持完整。 收集了核提取物后，进行甲
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（一）
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话，那么要数对RNA修饰的研究了，此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能，显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力？还是研究从细胞和
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3
总结： 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式，越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用，而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP（云序生物提供此服务）等多种技术联合分析，揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等，在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里，来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程，最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
不同等级的砝码在使用上存在的差异有哪些？
标准砝码分为多个等级，不同等级的砝码在精度上也是存在较大差异，在使用上也是有差异的，那么它的差异性主要体现在哪里了，下面我们来看看；1、各等砝码按检定系统表的规定使用。一等、二等砝码使用实际质量，各级砝码用标称质量。2、暂不使用的砝码需要放在砝码盒内。不锈钢砝码盒放在洁净、干燥而无明显温度波动的房间
研究揭示不同树种对干旱的生理适应性存在差异
广东鼎湖山森林生态系统国家野外科学观测研究站（以下简称鼎湖山站）刘菊秀研究团队，研究揭示了亚热带四个树种在干旱处理下的生理特性和响应策略。相关研究发表于《环境与实验植物学》。 干旱导致全球森林树木出现大面积死亡。不同树种对干旱的生理适应性存在差异，这将进一步导致森林群落结构发生改变。 研究人
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物，HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA，circRNA作为一种新型环状RNA，具有共价闭合环状结构，在组织和血液中具有
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
抗甲基化干扰的小分子RNA芯片研究取得新进展
小分子RNA，包括siRNA(small interfering RNA)、miRNA(microRNA)、piRNA(piwi- interacting RNA)等，多次被美国《科学》杂志评为“十大科技突破”和“十大科学进展”，是当前生命科学研究的前沿热点。大量实验证据表明，这些小分子
云序高分文章利器：ctDNA（羟）甲基化测序案例分享
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science，预示着m6A等RNA修饰
《Genome－Research》：DNA成环损伤与HPV相关癌症之间相关联
根据最近一项利用全基因组策略和超级计算机系统的研究表明，异常的HPV“looping(成环)”可在人乳头瘤病毒DNA插入位点引起宿主染色体的特殊损伤。这一研究结果最近发表在国际基因组研究权威刊物《基因组研究》(Genome Research)。 众所周知，某些人类乳头状瘤病毒(HPV)
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
Cancer－Research：RNA编辑与食管癌
科学家们首次在食管鳞状细胞癌中发现，负责编辑RNA的酶发生过表达，促进了癌症的发展。 食管鳞状细胞癌ESCC(Esophageal Squamous Cell Carcinoma)是食管癌的一种主要类型。新加坡国立大学NUS的科学家们发现，RNA 腺苷脱氨酶1(ADAR1)可以作为
Cell：表观遗传新关注点—mRNA修饰
表观遗传学研究关键点是修饰DNA及其蛋白质支架的化学标记，越来越多的研究表明这些化学标记能告诉细胞，哪些基因是表达，哪些是沉默的，因而也决定了个体的表型性状。 mRNA即信使RNA，在中心法则中扮演了重要角色，但此前一些科学家们认为这种RNA只是完成传递的作用，把细胞核中编码的信息传递给蛋白翻
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
文章导读 2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表
营养所发现小鼠肝脏小RNA存在多种修饰并和糖尿病相关
近日，Analytical Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所翟琦巍研究组的最新研究进展：A high-throughput quantitative approach reveals more small RNA modifications in mou
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
何川教授新发Nature综述：mRNA修饰介导的基因调控
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译，以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次，研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义，该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一
陈建军/杨建华/何川/黄刚－揭示RNA－m6A由组蛋白修饰决定
近年来，RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰，特别是m6A甲基化修饰，在哺乳动物的转录组中广泛存在，并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能，引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1，2】。理论
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化（一）
文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucleic Aci
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23.3