Genomeresearch:不同RNAm5C甲基化修饰存在巨大差异

导读 近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(IF=11.922)上发表一篇题为“Statistically robust methylation calling for whole-transcriptome bisulfite sequencing reveals distinct methylation patterns for mouse RNAs” 的文章。在本文中,他们运用了综合的甲基化分析方法检测了小鼠胚胎干细胞中tRNAs、rRNAs和mRNAs的m5C修饰。 文中指出,基于重亚硫酸盐转换的技术是检测m5C修饰的经典方法,而二代测序为此提供了检测......阅读全文

RNA研究热点技术介绍总汇

  头条消息:2019年8月16日,2019年国家自然科学基金评审结果发布,今年国自然重点资助项目743项,总金额达22.184亿,北京大学、浙江大学位居前两位,分别获得37项和34项,总计超过1亿元,而上海交通大学(30项)、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学

2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点

  19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用

如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R

Genome-Research-:3基因或助人类进化成特殊种群

  从人类基因组的30亿个碱基对中寻找进化出人类的基因并不是一件容易的事。现在,一组研究人员寻找到了由非编码DNA产生的3个基因,也许正是它们帮助人类进化成了独特的种群。   人类和黑猩猩在遗传学上非常相似,但是我们不难分辨两者之间的许多不同。据《基因组研究》(Genome Research )杂

揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排

  在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤

细胞化学基础碱基的种类修饰碱基

DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化(methylation)或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶(m5C)。RNA中有许多修饰的碱基,包括核苷类假尿苷(Ψ)、二氢尿苷(D)、肌苷

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

RNA加工修饰

中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。

快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

Nature-|-m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成

  目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。   文章导读:   2018年10月31日,美国芝加哥大学何

Genome-Biology发文介绍RNA印记法

  生物学家们逐渐意识到,RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物,它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控,能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。   宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法,这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Geno

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在

Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排

  在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

王恩多院士两篇JBC文章解析tRNA新分子机制

  tRNA是细胞内主要的RNA之一,是蛋白质合成中的关键生物大分子。在所有胞内的RNA中,tRNA具有最多的修饰,这些修饰对于tRNA在细胞内发挥功能起着重要作用,缺失某些修饰将引起细胞的严重缺陷甚至导致人类疾病。  近期来自中科院上海生科院的王恩多研究组通过质谱、定点突变和酶学动力学等生物化学手

解锁5分m6A甲基化谱文章新思路

1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG

SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:R

不同地物反射波谱曲线特征存在差异的原因

影响因素如下:反射光谱的影响因素:入射电磁波波长,入射角度;不同性质的地物,或相同属性的地物在其成份、颜色、表面结构、含水性(率);时间、空间发射光谱的影响因素:物质种类、表面状态和温度、波长地物的反射光谱有如下特征:(1)不同的地物在不同波段反射率存在差异(如雪地、小麦地的光谱曲线)(2)相同地物

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2

2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能  发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.147发表日期:2018.06.01实验方法: m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供)  上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能

  RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。   近三个月高分文章部分列表:   2月28日

LCMS/MS检测整体RNA修饰水平

核酸修饰概要 : DNA/RNA 修饰是表观遗传修饰的重要层面,指的是在 DNA、RNA 碱基 A\T\G\C\U 及核糖上的各种修饰。目前己发现的 DNA 修饰有十几种,而 RNA修饰有 100 多种,其中甲基化修饰占大部分,目前研究也较为普遍,并且可能具有重要生物调控作用。 实

Mettl3介导m6A-RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞骨质疏松症

  文章导读:   近日,四川大学华西医院的周学东和袁泉研究组,联合中山大学第一附属医院的林水宾团队合作研究共同揭示了Mettl3介导m6A RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞和骨质疏松症命运的新机制。该研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat

解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)

  云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平

  RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...4

2)RNA修饰PCR芯片 new!    云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次性检测6种RNA修饰相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,最全面的RNA修饰相关基因覆盖,RNA 修饰芯片基因列表(68 个基因)-human如图:  3)m6A相关酶预合成的慢(腺)病毒

【Science特刊】RNA中的信号

  6月17日的Science出了一期关于RNA的特刊。RNA与基因表达的分子生物学紧密相关:有形成特定结构的能力;作为信号载体;对自身的调节。例如非编码小分子RNA,已知是基因表达的调控因子,和哺乳动物干细胞基因表达变化相关,而这种变化反过来和胚胎发育过程中细胞命运的决定有联系。  DNA甲基化是

全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(三)

       随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性        如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用,我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒(OP-0002),该试剂盒可以快速提取核蛋白,同时可确保提取后的酶活性保持完整。        收集了核提取物后,进行甲

全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)

       那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢?        首先,提取病毒RNA        无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。