退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

研究背景 土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生态系统功能的反馈机制仍知之甚少。本文通过基因芯片与16S/18S rDNA多样性测序结合的方法研究退化土壤中微生物类群和功能基因的转变。 研究思路 样本的选取 5个正常土壤:烟草生长情况良好,没有病原菌感染的土壤。 5个退化土壤:发生酸化、烟草生长情况不好的被R. solanacearum感染的退化土壤。 选取的土壤深度为0-20cm,分别取自20个样点混合后分成2份,1份用于DNA抽提,1份用于物化指标的测定。 烟草生长120d后,测定株高、茎粗、R. solanacearum感染率及发病......阅读全文

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

  研究背景    土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

  研究背景    土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

研究背景土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生态系统功能的反

鲜乳中有哪些微生物类群及微生物类群的作用?

  一)能使鲜乳发酵产生乳酸的细菌  这类细菌包括乳酸杆菌和链球菌两大类,约占鲜乳内微生物总数的80%。它们可进行同型乳酸发酵,产生大量乳酸,使鲜乳均匀凝固。  1、链球菌类:较为常见和重要的有:乳酸链球菌、乳酪链球菌、粪链球菌、嗜热链球菌、液化链球菌。  2、乳酸杆菌类:较常见的和重要的有嗜酸乳杆

南京地理所湖泊沉积物中氨氧化微生物类群研究获进展

  氮素是影响湖泊营养状态的关键元素之一,氮素的生物地球化学循环在湖泊营养盐循环中占有重要地位。硝化作用(NH3→NO2-→NO3-)是氮循环过程的关键步骤,而氨氧化(NH3→NO2-)是硝化作用的限速步骤。氨氧化微生物是氮循环过程的重要驱动者,其群落结构、丰度和活性等会受到温度和营养负荷等环境因子

植物功能群丧失对土壤微生物群落影响研究取得进展

  人类活动引起的植物功能群的丧失对生态系统性质和功能的影响是生态学研究的重要问题之一。由于生态系统地上部分与地下部分紧密相关,植物功能群的丧失必然会影响地下群落的特性和功能。但是,植物功能群的丧失如何影响土壤微生物的群落结构和功能往往被忽视。因此,开展相关的研究对生态学理论和人工林经

研究揭示不同植物功能类群对土壤水分和养分的影响

  土壤水分和养分资源的可持续利用是实现农林复合系统健康发展的基础。然而,关于间作植物对土壤水分、养分影响的报道往往莫衷一是、评价毁誉参半。这使得复合系统内间作植物的选择面临着较大的不确定性,难以对农林复合系统的建设和管理提供可靠的指导。因此,认知不同植物功能类群对土壤资源的影响是探索适宜林下间作植

研究发现薯草轮作助力马铃薯连作障碍土壤改良

马铃薯是广泛种植和消费的粮食作物之一。然而,集约化的马铃薯种植造成土壤退化、水资源枯竭以及微生物污染风险增加等环境问题。特别是在半干旱地区,由于水资源短缺,脆弱的生态系统加剧了农业活动的环境足迹,上述环境问题被进一步放大。同时,过度依赖化肥和农药导致土壤和水体污染,对人类健康和生物多样性构成威胁。因

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段(二)

二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性,或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group),通过某一功能群中物种的分类

浙大团队绘制土壤基因组基因相关性网络-解码土壤“黑箱”

  土壤微生物是元素生物地球化学循环过程及其他土壤生态过程的关键驱动因子。由于土壤结构和组成的复杂性,土壤微生物生态过程在研究中一直以来都被作为“黑箱”看待,要清楚阐明土壤生态功能是土壤生态学研究当前面临的一个重大挑战。  近日,浙江大学环境与资源学院徐建明教授团队在微生物学顶级期刊《国际微生物生态

深圳华大基因研究院揭示女性生殖系统中微生物群

  近日,深圳华大基因研究院贾慧珏研究组在《自然—通讯》发表文章,报告了女性生殖系统(从阴道到输卵管)中存在特殊微生物群。这些发现挑战了人类胚胎发育在无菌环境下开展的传统观点。该研究还表明这些微生物群落中的变异与某些子宫病症相关,或许能用作某些疾病的生物标记。   已知阴道中有大量微生物,但在无感

在肠道菌群结构和功能与血脂改善研究中取得进展

《临床营养》(Clinical Nutrition)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所研究员李亦学研究组、林旭研究组与中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员曾嵘研究组合作的题为Effects of gut microbiota and fatty acid metabolism on dysli

退化土壤培肥改良

退化土壤培肥   底肥黄腐酸生物菌剂10公斤+秸秆基质170公斤/亩。结果土壤耕地质量得到明显提升,土壤疏松、保水保肥能力增强,土壤有机质含量提高,连续使用土壤地力可上升0.5个等级,土壤退化情况得到有效修复,因土壤退化造成的养分固定、流失,土壤重茬病害等现象得到明显改善。作物长势恢复,植株健壮,叶

454高通量测序研究土壤微生物的新手段

在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环

地上下生物多样性关系与这个相关

近日,中科院植物研究所研究员黄振英、副研究员刘国方等通过开展地上下生物多样性关系的研究发现,植物多样性(物种多样性和功能多样性)与土壤真菌多样性存在较强的耦合关系,与细菌多样性没有关系。相关研究成果发表于《全球生态学与生物地理学》。 植物与土壤微生物之间的相互作用在调节陆地生态系统的功能和稳定性

华中农业大学连发两文-揭示重金属汞与微生物相互作用

  华中农业大学资源与环境学院土壤环境微生物团队刘玉荣教授课题组关于重金属汞污染与微生物群落相互作用研究新进展分别以“Consistent responses of soil microbial taxonomic and functional attributes to mercury pollu

学者发现半索动物类群新物种

近日,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)(以下简称广州海洋实验室)魏辅文院士团队在科技部、国家自然科学基金委和广东省科技厅等项目的资助下,在海南发现了一种新的半索动物,并命名为魏氏舌形虫(Glossobalanus weii)。相关成果发表于《动物之谜》(ZooKeys)。魏氏舌形虫外部形态。研

逆境中求生存,药材get道地性

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497727.shtm新会陈皮产于广东省江门市的新会区,是中国药典指定的广陈皮道地药材,其品质显著高于广东周边和其他区域种植的陈皮。    ?茶枝柑果实         受访者供图    ?

减缓土壤碳排-退化泥炭沼泽中“谁”最稳?

  12月10日,中国科学院成都生物研究所研究员陈槐及其团队以“退化泥炭沼泽中有氧层、过渡层和厌氧层土壤二氧化碳排放对增温的响应”为题,在国际期刊《通讯地球与环境》上发表论文。该研究发现在退化泥炭沼泽土壤剖面中,受有氧厌氧循环影响的过渡层土壤二氧化碳排放潜势最低,且对增温不敏感,指出过渡层是退化泥炭

减缓土壤碳排-退化泥炭沼泽中“谁”最稳?

12月10日,中国科学院成都生物研究所研究员陈槐及其团队以“退化泥炭沼泽中有氧层、过渡层和厌氧层土壤二氧化碳排放对增温的响应”为题,在国际期刊《通讯地球与环境》上发表论文。该研究发现在退化泥炭沼泽土壤剖面中,受有氧厌氧循环影响的过渡层土壤二氧化碳排放潜势最低,且对增温不敏感,指出过渡层是退化泥炭沼泽

青藏高原植物根际土壤微生物生物地理学驱动机制研究获进展

  根际微生物在保护植物健康、提高植物生产力和次生代谢产物积累方面发挥着重要作用。植物根际土壤微生物群落构建过程一直是人们研究的热点问题。非生物因素,如土壤理化特性和气候因素,以及生物因素,包括植物种类、基因型和植物免疫系统,已被证明在驱动根际微生物组成方面起到重要作用。植物根际是一个丰富的生态系统

高寒荒漠和草原土壤固碳微生物的研究

  固碳微生物是一类与植物相似将大气CO2转化为有机质的微生物。土壤微生物固碳功能的重要性最近几年才逐渐被认识,但土壤固碳微生物群落特征、固碳潜力及其环境因子驱动机制尚未被认识。干旱半干旱生态系统约占全球陆地面积的41%,该生态系统植被生长受到包括土壤水分在内的多种环境因子限制,凸显土壤微生物固碳的

青藏高原所高寒荒漠和草原土壤固碳微生物研究获进展

固碳微生物是一类与植物相似将大气CO2转化为有机质的微生物。土壤微生物固碳功能的重要性最近几年才逐渐被认识,但土壤固碳微生物群落特征、固碳潜力及其环境因子驱动机制尚未被认识。干旱半干旱生态系统约占全球陆地面积的41%,该生态系统植被生长受到包括土壤水分在内的多种环境因子限制,凸显土壤微生物固碳的重要

肠道微生物群影响小鼠骨骼肌的质量和功能

  一个国际研究小组发现,小鼠肠道微生物群在骨骼肌质量维持和功能方面发挥着重要作用。在发表于《Science Translational Medicine》杂志上的论文中,该小组描述了他们在野生和实验室饲养的小鼠上的实验,以及他们的最新发现。图片来源:https://cn.bing.com  在过去

酸性土壤中硝化作用和硝化微生物研究取得进展

  硝化作用是氮素循环过程中非常重要的一个环节,它包括将铵态氮氧化成亚硝态氮的氨氧化过程和将亚硝态氮氧化成硝态氮的亚硝酸盐氧化过程,参与这两个过程的功能微生物分别是氨氧化微生物和亚硝化微生物。传统的观点认为,酸性土壤的硝化活性很弱,这是由于在酸性条件下,氨氧化微生物氨单加氧酶(AMO)的底物——NH

微生物的类群和形态结构

微生物种类繁多,人们研究得最多、也较深入的主要有细菌、放线菌、蓝细菌、枝原体、立克次氏体、古菌、真菌、显微藻类、原生动物、病毒、类病毒和朊病毒等。现择要介绍如下:  细菌 放线菌 霉菌 酵母菌 病毒 

有关肠道菌群结构和功能与血脂改善的研究

  《临床营养》(Clinical Nutrition)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所研究员李亦学研究组、林旭研究组与中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员曾嵘研究组合作的题为Effects of gut microbiota and fatty acid metabolism on dys

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段

  在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环的

基因测序找出肠道核心微生物群

  人类肠道中有数以万亿计的微生物,也称为肠道菌群,与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近,比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文,通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群,为进一步建立生物标记体系,评估肠道菌群是否正常提供了线索。   肠道微生物组能产生维生素

PNAS:从基因到植物微生物群

像人类和动物一样,植物也有微生物群。一个由芝加哥大学领导的研究小组,包括INRAE,研究了一种植物物种内的遗传变异是否控制其叶片微生物群的组成。研究人员在两年多的时间里在四个地点的实验装置中种植了3万多株植物,以分析一株模型植物的200个基因型的叶片微生物群的变异和繁殖成功率(通过种子产量估计)。7